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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s172 | supercontig | LSalAtl2s172:319007..348347 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003050 >EMLSAP00000003050 ID=EMLSAP00000003050|Name=EMLSAP00000003050|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=353bp
MSSPLKSITPLSILRKDYWMIEKXGCGGFSKVYLXRHKIDKTYRAAKHQR VTDSNLMKVSRREARVLLHLTEGRAEYLRKHIVNFINYFEGEGQSVILME YLPGGELFQRISSPSYKLTEAKCRDFVRQILLGVEFIHSSGIIHLDLKPQ NVVFTSNNQSSPSGSRESDTLKIIDFGLARYLESDTIPINRCGTLEFISP EVLKCIYAGTFSDMWSVGVIIFMMVSGGYSPFWAGDEYKTTRRIKRCQYA FDPTIFKSVSTQAKNFIDKLLTESTLERLSATQALKHEWMTGSYLETLKV LETTWMRKYLARRRWQRWFNAVKAMNRLTRLLNSDDKSSWDSKIGLEVTN GIS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s172:319007..348347+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003050-698897 ID=EMLSAT00000003050-698897|Name=EMLSAT00000003050|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29341bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s172:319007..348347+ (Lepeophtheirus salmonis) TCTCTGCATACAACATACTTTACCCTTTATGTATTTCATTTTTATTTCTC
TGCTTCTATGTATTTTTTTTAGTCATCGTATTTTATAAATAAGATGTAGT
AGTTTTGAATATGTTTTCATAATGTGCGGAGGGACCGTGTGTGGGTTATA
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ATTTATTCAGTAAGTTAATCTTTTATATTTAGGTATCATATACAAAAAAT
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CTTCAACAAAAATCTTCATACATACAATTATGTACATGAATATTAAAAAT
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TCACTGAATATATTTTCGATGTGATAAAATTGGGTTAATTTCGAGACTTA
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TTCCGTCAAAACTTCGAAACTCCCTCAAGATGTCACGATCTCCTGCACCG
ATAGCAGTGCCTAGAAGTCTGCAAAGACCCTTGGAACNAAAACTTATGCA
GAAACAATATGATTGACTTCTGGCCTACCTTCATGTGGCTCTCCTCAAAC
CCAGACCTCACCCCCTGGGATTCTGCAGTTTGAGACAACTTGAAGAAGAA
TGTCTGCCACACCTCTCATCCAAATTTAAATTTGCTGGGATAACAGTGTG
GTACATCATGGCACGGCCTTAATCGTCAAGAGCTGCCAATATGTTCGCCG
GTGTATCGAGGCTGTTATTGCTATAGAAGAAAGACATATTGAATAAAAAT
ATAGCTAAATATAGTACATAAACATGTCACAAATAGGTTTTGAGTTATCT
GGGTTCCATAAAAATCAAATTTTTCGTAATTTAGTCATCCTACAACAAAT
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CCCTTGGATTGAGATATCTTTTATCTGTATAAACAAGAAAATAACTGTAG
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TAAAACATAAGCAATTAGTTGCAAAACAAAAACAAACTTGAACTCTCTAG
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ATTCGTGCTCTTAAAGCAGTTGGGCGTCTCCCGGACAACTGTCTACGTCG
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GTCCATGAGAGCCCATGCAAGAGATCTTGGGGTTTCACACACGACCGTCC
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CTCAAAGCCACTGTCACCCAGCACTGGGACGCCAAGACAGCGGTCTACAT
CTGCATCTGGTGCCAGGCCATCCGCCACCACCTGGGACCCATGATTACCG
CTAAGGGCGGNTACATTCMTGGTAATAATAGCTCAGACATACATCTATTT
AAAGTATTAAGTTTGTTGAAATTTTATTCTTATTTAATAAATTATATCCT
GTTGATGTTTAAAATTCAAAGTGTTCCGGTTTTAATGGAGCCCTCGTTGT
TTCCTTGGTAGATACGGAGTGGAATTTGTGTTTGTTGATTTCCTTCTACT
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GTCCTCCCAAACATCCTTCAAATTCTTAGGTTATTTTCTCTTTCTTATTA
AAAACATATCAGTAGGTTATCTTTTTTACAACTATTATATATATTATTCA
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TAAAAATGGTTGTTGCAAAGGCTATTTCTCCTTTTTTGTTCATTATTTAA
TAACCTCTTAATAATATGTCGTTGTGGTGTAAACTTCTCCCTCTGAAGTA
GGTATTCTCGCCTATCTTTGATGTAGATTGTTTTAAAAATGCATAATACA
ATAAATATACATGAATACTAGCAAAAGCTTATCTGACAATTATCAGGCCA
AGGAGGAAGAAGAAAATCACATTGAAAAAAATTATTCAGAAAATACTTCT
ATATACTAATAATTATAATATGAATGTTTTGTTGTTGTCGAGATAAATTC
TGATAATTCTAATTCTAATCCACTTGGATTCTTTGTGCTCTATTAATCCG
ATTAAGTAAGATAATCCACGAAGTCTCATCCTAGCAACCCCCTCCCTCAA
AAAAAAAAGAAAAAAAAAGTAAAAACCCTCATTATATTGGCTAATTGTAA
CCTTAATATTATTATTATTAATTAAGAAAAAAAAGTCCTATAAACTCAAA
TAACATAACCAACATATATGCATAAAAATGGTCTAGATAAGAAATCCATT
TTCATTTACTTTAAAATCCCAAATTGAAATTCTCGAAGAAAATTGCAAAA
AAAAAAAAAAAATTGTAATTTTGAAAAAAAGGTGCGAATAGTATTTATTG
GAATTGTAAAGAGAAACACAAATACACCATTATTTTTTTCGTATCTGCAA
AAATAAAACAGTTACGAAGAATAATGTTATCGAAAAAATTACACAGTTAG
AGTCTTAAATTTTATGTCCAAACTGTATCATTTTGTACATTTCTTTTTAA
AAAAATTGAAAATTGATGCTCAATGAAAAAAATAAGAAATAAAAAGAGAA
AAGAAAGAGAATAAAGATTCATAAAATGACAGATATTTCAGTCATAAATC
AATTTTTATGAGTCAAATTTTTATACAAACAAATTTCCAGACAAATAATA
TCTACAACCTTAATTATTTACTGATCCACTATTTCTTTGGAAGTTCCTTT
TTTTGCACCTGAAAGAAACAAAATGAGAATTTTCACCTATTTCTTTTTTT
GCCAATAACTTTTTTGATTTTGAATAAATTTAGCAAACGTAGTTATTCGT
ATAGTTGTTTTTTGAAACGTCAATCTAAGACTAATTATTATTGTTTAATT
TTTGAGGAGGGAACATCTAAGTATAAAGTGCAGGAGCTCATGGATAATGG
AAAGTAACACTGAGGATTTGTTGGATTAACTAAGAGTATAATTGAGGATT
GATATCCGAGTAATYCCTGCCTATATCATTGCTAAATACAGAGGGTCATT
TGTGTTTATTAGTTTACTCCCATAGCTGATCTCAGCTAATTTAATGAAAT
GTATTGACAACTAAGCTGTTCTCCACTCAAAATAATTCAAATCGTCAGAG
TGGCCACGTTAAGGTTCGGTTTCATGTTTTTAAAACTATTATATTTATGA
TTCATGCATAAAATGGAATTTCAATCATTTCATCAAACCTACTTACCACA
AGCCTCTATTATATGTATACTTCATATAAAATGAATCATTTCACTTTTTG
TTTGCAACTTGTACTACAACACAACATATTATATGTATAACGTGAATCTT
TTTTTAGATTTAGTACTTCTCATGCGTCTTACCGTATGTATTTTTAAACA
CGTTAATTCCATAAAGTTTATTATTAGTTTTAAGGTTTTTCATTTACATT
ATAAAATTATTAATATACAGTACACTATGTATTTATATCAGACTTTAACA
GAAAACATGTTGACTTGTTCATAGGAAATAGGTTTTTTTCCCCCCAAGTC
ATTTTTCATAATTATATCAATGCAAAAAGGAAAAAAAAATACTCTGAAAT
GTGGGGGCGTATATACTATGCGGTCTTTCATTGCCTAAGGCTTCAAATTA
AAACTAATAAATGCATGATTTATAACATAAATCTAGTTTAAATAGTAATA
CATATAATGGAATCATTGATATTAATTAATAAGGACATCATGCTTCTTTG
ATTCAAGTTCAATCCTGGATTATAATTGTTATGTAACAACGACGTTTCTT
TTCTTTTATTAATATGACGTGGGATTAGTTTTTAAGCATAGTCGATTAAT
GTATCTTTTAGCAAGAAGAGTCAAATTGTATATATATTTTATTTTCATAG
TGTATGTACATTCTTTTAAATAGTCATCCCTGTAAAATATATCTTAGTGT
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CCGTTACTTCCGTATTTAGGTAGCGTTAGTGGAACACTACCATAATTATA
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CTTGAACAACTTATTTTGCTAAGTTGTTGTCATTATTCTTTAATTCTTGA
GGAAATAAGAGCAAAGTATAAAGTAATCCAACTGTGTGTGCTCATGAATG
ATTAAAGATGGATAAAACATATCCTAGAAAGCGGGAACGGCGTTTTCTAG
TTGGGAATCGGAACATGATTTGCTATTTTCTAAAACTGTTGTTATAATTT
TTTTAATTCTTAAAGACAGAACATCAATGTGTATAGTAATAACAGAGTGG
GAAATGTGTGTTAATTTCCATCCTTTCGCAGCTGCTTGCAGCTGATTTAA
TGAAACGTCATGATAGCTAAGCTGCTCTCCTCCCCAAAGAGTTTTTGAAT
GATGAGAGTAACAATGAGCAGTTTTTGGGGAGATATTAGAGTAAGTCCAT
GTTGGACTCAGAATATTATTGAAGATCAAAAATGGAGTAATTCCTAATTA
TGTCCTAACTTGATATGGAGTGAGGCTTGTGTTTATTTTTTATATGATTT
TTTGACCCAGGGAGTACTTCATCACTTTGCTAGGCCTCTTCTAAATCATA
TTCATTTTTTAAAATGTTATATAAAGTACTTCCCTCTTAAACAAAACGGC
TGCAAGATTTAATTCATTTTATACAGTGATCCCTGTATATTATACTCCTT
TTTTTATCTTTATATTTTATAAGATATACACAGGGAGCACAATATACCTT
CAGATTGTTTTTCAAATGTACATAGATTAATTTTTACTGGCTAGATGGCT
CTTAAGTTGAATCAATGTTACTTTTTAAAGACTTTTTCACGAGAATTGGC
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GCTGCACATTGCTCATTGACGCCGGCCTTCAATGAGTCCAAATTCGGGTG
GCGGGTAGCACAGACCTTCTTCTCAATTTGCCACCACACACTGTAGTCAA
GGGGATTCAAATCAGGTGATTAAGGTGGCCAAATGTTTTTGTTCCAAAAT
GGCATGTTGGCAGCGAGCCAATCCTGAGTAATTCCAGAAGTATGTGCAGG
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ATGGAAGGACGTTGTCCTAGACAGACCTACCGGCGCGGAGGAGAGTGGAA
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CGAGTAAAAAAACTAAAAGCAAAGGCAAAAGATTTACCGAGTTACTTGTG
CTGGAATTTTTTATTTCCAGTCACGGAACCTTGATATATAAACGTTTAAA
AATTAGTCCGCGTATTTATGCAACTATCGGTATACTGTGTTACTTTTACT
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TTTGAGTGATGCTAGAAATTAGACTAAACATTACTCGAATCTTATCTTTA
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ATTTGAAATATTTTAATGGGTTACAGAACCTATTAAATTAAATTTCATGA
AAAATGGCTTCATAAAACAAAATTGTAAAATAAATATTCATTTCAAATTT
AGGCCAAATAAAAAAAAAAGTTACAATCTAATTTTTCAATGCCAATCTTG
TTTTTGCTCTTTCACATAATTTGGTCAAATGATTTAAAATAAAAATCTCT
GTTTTCTCATTAAATTTTTTCTATTTTGGAAATATTGTTCAATATTTGTA
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AAAAATCTACTTGAAGTGAAAATGAGTTGTGGGCCGCACTTAAACATTAA
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GTGGAGTTTTTCTATTCCGAGTAATATTCGAATCCATCACTATTTTTTTA
AATAGTTATTTATTTGATAAAAAGCTATAGTTTTACAATTTCTTATCACT
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ATAAATCGTGTTCAAGTATCATGATTTATTTATGTACTGGAGGTCCCTGC
ATCTTGCGGTTTCAATCACTACGGATTTCGCATAACACGGTGTTTGGAAT
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TCTGTGCTATTTAATAAGTACACTACTCAGGAGGTAAACAATAATGACAA
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TACCTTCATGTGATGTATTAAAAAGTATTAGCACTTAACTCTAACTCACA
ATTTGTTTTGGAAGTTAGAGGCCCTTTTTTGAAAAACTGCAATAGACCAA
TATTTCTTGATGCTCAGGGTAATATAGGGCATCAAAGTTGCATGAGTATA
AATGAAACTAATTGGTTTATTGTTTTTATTTGGCTACTAATTAGGTAGTA
ATGCATAGCCATGGCAATATGGGAAACACCCACTAAGCCAGGGCCAATAT
TACCCCATTTAGTGTGTCTCATTACAGATTCATTTAATAACCAGTGATGA
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AAATGGAGAATGGTATAGCTAAGAATTAATCGGAGTCCAACAAGGACTTA
CAGTTATAAATCTGCAACAAATCCTCAAGGTTACTCTCCGTCTTTTATGA
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CCATATCATGGATTTTATCAATGATTTCTACAGTAGTAACCTCAACAGGA
TGTCCAGAAGGTTCAACAACACTTGTGCCCATATTGCCACTCCGAACATT
TTGAAACCACTTATACACTGTTTAAATCGAAGGACCAGAGTCCCATAATG
TTTATCAAGCTTCTTTTTAGTCTCTTGAGGCGTTTTACCTTTCATAAAGT
AATGTTTAATCAACACGAGAGATAGTCCATTTTTGGAAAATCACTCCACT
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ATACGTCCAAATAGTGCCATCTCTCAGACTTTGCACGGACTCTTCAAACG
ACCCTCTTATATTTTATAATTTTACAAAAAAACTATCATCTTAAAACCGA
TGATTATTACTACATAATTCTACATATTGTATTCTATTTTAGTATTTTAT
CTTTGTTTTGACAATAAATTTCATCCACTAATAAACTTCAATAATAATAT
ATATAAAATCTCTGAAAACACGGGTACTAGAAAAACTGCCCTGGGGAAAA
TTGCCAGTGGAAGATTATCCTGGAGAAAATTGCCAGTTAGGAAAATCGCC
CTTATTTTGTTCAAACTTCATGATGAATAATAACACATTAAAAATGACAA
ATATTTAAGCATATTTGTTTGTTCCATCCCCCAAGGGAGTAGCTTCAAGT
GCGAGTAATATTATTGCAATATAATTTTCTTGAAATTTTTTAAATTCAAT
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GGATAAATAGCTTAGGACCRCTTAAATTAGTTGAATATCTCCKCCCTTTG
ATTGGCCAAGTGGTAGTGMGGGATTACTAAAAGCCACCGCCAATACATCC
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GAGGGCCTAACCTATTTACCCCCCCTCTTATATTATATTAGTATTACTCA
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GTGTCATAAATAATATTAAGGGAATTTTTAATGTGTTAGTATTCATCATG
AAGTTTGAACAAAATATGAACAATTTTCGTCTTAGTCGATTTTCTCCAGG
GCAATCTTCTACGGGCAATTTTCTCCAGAGCAGTTTTCCGCACACGGAAA
AAGTGTACAAATAATAAACACATACCTTTTCACATGAGTAGCCCAATTAG
CTTGAATGCAATATGGCTTAAATATGATGTATTCTATTGTCCCATCAAAA
CAAAGTATCTCTAGAATGAATAGTAAAGTATATATATTCGGGGTTCTTAT
ACTCATTTGGGGGACAAATTAGCCCTACTGTACAAAAAATAATTGTGACT
CCCTTTATTTACATTTTAACCTATCAAATGGCTTTATATTTAAAACGCTC
CATATAATTGGCTACAATTGGGTGAACTACATGGATTGTATGATTAATTA
TACTAGTTTATGTATTTTAAATTCATATTTTTTTATAGATGTCTTTGAGA
ATTGGRAATTTTTTTTCTTTTTCAATAATTTGTCCTTTGGCAATAAATAT
GCAAATTGTACCAATACACATTTTCTACCATATAATGTAAGTAAAGGTCG
AAAATGATACAAAAAGTAAATAAAATTCAAAAAGCAAATCAATCTTATTT
ACATAATTTGAACACCACAAGAAAATACTTCCTGATTCGAACTCAAAAGT
AGCATTGTCCAAAAAATAATAAGGGTTAAAAAGACGGAGGGTAGTTGTCA
AGGGGTAAGTGTCATGTTCCCACTATATATATATATGAACTGGGATTCCA
ATTCATCTACTTCTTTGATGACTCCACAAAAATAATAATTAATTAACGAT
GCAATAAAAGTCAATTATTTCTTTTTTAAAGTCTGTGAATTKCGCTGTCA
TCCGATCCATAATATATTCGATCAACAAAGAAAACTGATGAGTAATTGTT
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CATTCATCAATACTATTTGTGATCAGAACAATCTTTACCCTTTTTATACG
AATAGTATATGCTATACTTTCTGCATTTTTATTTGCATATTTAACTCCAT
TTTAATGCATTATTTGGACATCACTATTAATTACTAAGACATAAAAAGGG
TCAATAAATGTTATCATGTAAATGCTAAATCATTCGTCTCCCTTTCAGAG
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CTTGAAGCTTGGGGGATCACTTTTATATTAAGGTCTTTGCAAAGATAGGT
AATGGGCATTTTATACTATATCAAGTGATCAACCCCGAAGTTTAGAGGAT
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TGGATGTGAGCTTTAAAGTACTCTTTGAGTAGCTCTGAGAATACCCTAAA
CTCTGCCTGTTATAGTTTCATTCATAGAAACGACCTTTTCCATGCTCAAA
TAAATATAAAAAATATTTTTGAAAAAATATATATATATATATAGCTCATA
GCATGAATTAAATTGTAAGCTTTCCAGATCCCAGATCCAATAATAATAAA
GTTTAAATAAATTGCAATGACAAGTGATGACTTCAAGAGAAGTCCGATAC
ATCACTAAAACCTACCTTGTTAAGTTAAATTAATAATTACGTTCGTATCA
TTATTAAAAGATTGAATGTTCATTTCTTAGTGTAGTGTTTAGTCAATGCC
ATCAGTGGCAAGTGTAATGTTGAAGTAAGAGGTTGTTTGTATTGCCATTC
CTCGGTTACGAGTGGAAGATTATGACTGTACTAGCAAGTATATGTAGATG
TAAGTCATATAACTTTTGATTCATTTCATTTGTTGTTCATCATCTTGAAT
AATTTAGATGAAGAAATATTATCTTTATACCTGGCACAATTATTTCCTAC
ATAGAATTACCTATTACTATAAATTAAATCTATATTTATAGTTTATAGAC
TCAAATGACTCAATATTAGGCTGACCGAAAAAAGAAAAAAAAATATGGAT
TATTATGTTACGCCAAAAAATTAACTAATTTAAAAGAGAGTTAGTCTCAA
TCATTGCTTATAAATTATAAGTTTCTTCCTCACGAATTAATGAAAGTGAA
TGACTTTTCTCTTTGGTGTTCTTAAGTCAGAAGAAAAGAAACTAATTTTT
TCTTGTTTACATAAGTGAAAGTATCAAATGTTAAGAAAAGAAAACGTTGA
CCTTCCTCAATTATTTGGATATTATATGTACCATACTTATTGTCTCTATA
AATGCCTTTATAAACTTCAAAGCCTATAAAATGTATTATTGTCAAGTTGT
GTTTTGGAGTCGGGGTAGGMGACATTTCCCAATTATTGGAATATTATGAA
TAGCATACTTATTGCCTTTATTAAATTTATAACCTATAAAATAAACTATT
GTGTGTTGGAGTTGGAGTCGGAGTATGGGACATTGTTCTTGTTTTGTTTA
AAAAAATGAACATAGTTTTTTTCAGAAATAAACGGCTTCTAAGCTCGAGT
AAAATATTTTATTAGATCTATATTCTTTTTAGGTTAATTGCTGTATGTAA
TTGATCAATATGTATACTCATTTCATATTTGATTCATGAAAATTGTCCTA
TTTTAATAAATAACGGTATTACCCCTCTTTGTCAACAGTTATTTGGCGTC
GACGAACATACAAATGTTGTTACGAGTCACATTCATTTTTATAAATTTTA
TATAATGTACTTCCCGCTTTTTTCTTTTTTAATATGTTTTGAACTAAACC
TTTGCGAGATGGCATTCATTTTATAGAGTGCTCCCTGTATATTATACTTT
CTTTCTTTTTCTTTATACTCTATTTGTATCAGGTAGTACTATATCTAGAG
CACCCAGTAACGTAGTTTTATGAATACAGTCATACATAAACTATTTTTTG
CTCAATAGATGACTCTCAATGTTACTTTTTCACTACAAATAGCAAGATAT
TGTNGCAAACATTTTAATATTTTTGACTCAATTTAGTCGAATTGAACTCA
CTGAATACCCAAATTTTATCTCATGGTCACATAAAGATAAAGAAATACCT
TTTAATGGAACATTCTTTTAGATTAAAGGAAGCAAGAGTTGATGTTATTA
TGTATACCTCGGACTGGAACTTTTTTTAAATAATAGAGATTATCTTATTT
AGGTTTATCATGTTTTGATTTCCAAAGAAATGAGGAATGCCTGGGGGGGG
GGGGGTAATTTAAAAATGACATATGAATAAAACTCAAAACATGTTGATAC
TTTTTCGAAAAAGTACTTTTTATATTAGTTACTCAAAAGTTTGAAAGCTC
TGTTACAAAAAAAAAAAACCATTTGTTCAAAAAAGAATTTTAACTTTTTT
TTATTTGGCCTAAATTTGAAATAAATATTTATTTTACAATTTTGTTTTAT
GAAGCCATTTTTCATGAAATTTAATTTAATAGGTTCTGTAACCCATTAAA
ATATTTCAAATGGTAAGACGGCCCATTGTATGAAAAGGATGGACATCCTT
GATCTAAACTATAAAGATTCGAGTAATGTTTAGTCTCATTTCTAGCATCA
CTCAAAAAGAGAGTAAAAAAAACTACAGACGCTCCTGACTTATCAAAAAT
AAAAAAATAAAATTAGAAGAAATTACACAGCATATCGGTAGTTGCATAAA
TTTTTAAACGCTTATATCTCAAGATTCCGTTACCGGAAATAAAAAATTCT
AGCACGAGTAACTCGGTAAATCTTTTGCCTTTGCTTTTAGTTTTCTTACT
CGCATCAAACAAAGTCGTTTACGATGAATGAGGAGGCCAAACGTCATATG
GTTTCCACTCTCCTCCGCGCCGGTAGGTCTGTCTAGTTGGAGATTTTGAA
GGACAAGGTCCTTCCATAGGCCCTCAAGATCTCTAATGGGGCCCCTTTAT
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