EMLSAT00000003288, EMLSAT00000003288-699135 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003288
Unique NameEMLSAT00000003288-699135
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s180supercontigLSalAtl2s180:110870..119453 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003288 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003288EMLSAG00000003288-686054Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000014382EMLSAE00000014382-723310Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014383EMLSAE00000014383-723311Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014384EMLSAE00000014384-723312Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772422auto772422Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003288EMLSAP00000003288Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003288

>EMLSAP00000003288 ID=EMLSAP00000003288|Name=EMLSAP00000003288|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=67bp
MYSLILPSGNAQVFVDQIFRIFDNDGNGTIDFKEFMMATDMTASGSPEEK
LAKKLEIEQKSYLEPWM
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mRNA from alignment at LSalAtl2s180:110870..119453+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003288-699135 ID=EMLSAT00000003288-699135|Name=EMLSAT00000003288|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8584bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s180:110870..119453+ (Lepeophtheirus salmonis)
CCCAGATGGAACGTTGGGAAAAACTAAAATCCTTGATATGTACTCGCTCA TTCTTCCTTCAGGTAACGCACAGGTCTTTGTAGATCAAATTTTTCGCATA TTCGACAATGATGGAAATGGAACAATTGATTTTAAGGTATGATATTAAAA AAAGAACTATATACCCCTAGGAATGTAAGAACATCGTTATTTTGCTTAAG ATTGTAGACCTATCATATTGCGTAGCAGTTTTTCAATAGATCGATCGTTA AACATAGAACTAAAGAATAATTTTAGTCGTCTGTGTCCTAGATAGAAACT CATAAATACATTATAAAATCTTAATGTGAAATATGACTTATAAAAGATTA TTTGACTCAATTTTTGTTTTTGTGCATAAAATTTTATCGATTCAGACAAC TGTTCATAGTGTATTTTTGTAAAATTCATCTGCAACTTTAATCATAAGAT TAAAATACTTTTATGACAAAGATTTTTTATAATATAAATGATTTCCAATA TATTATTTTTAATTTAAATTAAATCAAAACCCCATGGGACAAAACAAATA ACAATCCATCTTAAGGCAGGGAATGATAATTAAGGACGTTACTTATGTAT AGTGCTCGGTGATGGCGAAATCAAAACTTATTTACTTCTAAATTAAAGAC TCTTACTTAAAATAAAAATCTTTTGCCAAAGGTCTTTATATCCTATAGTG CTCCGTACTTGCTTGTATGACTGAATTTTCACAGTAGTAGGAATAATAAA AAAATATAACTAATATTTTTTCTATATAGGGATGGGATTTTTTGTAAACA AAAATACAACAAAGCAAAAAAAGTTGGTGCAGGTTTTCTTTATTTGTGTT GTTCATTCTTCTTTGTGTTGTCATTTAGTTTTGAAGGAAAAATTTGCACT TATCTTTGGTGTGTTGAAAGACACTGGTTAATCAATTATTAATATATCTA CATACATTTTATATAACCATTATGATATGTTGTTTTAAATGAAGAAAGTT CTCCTCCTTATAGTAGTAATTCATTTTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCAATA ATAATAAACAGCTTATGTTAACAAGGGTCTTGATTCATAAATACCCAAAA TCTTGCTCCTGCTTTCTCCTCATGCTCTCTAAAAAAATCAATCTCAACCT AAGTCAACTGATGAGGGTTGTCTGAAAAGTTTCCAACCTAACAAAGATGC AAAAGATAATTAATGATTTTTAATTTTACAACATCGTTTCCATGTGACTC TACACAATTCTTCCAGTGATGTTGCCTTCTCTGTAACCTGTCAAAATAGT ACTCGGCGTTTTTCTCTCTAAAATAATTGTTTGCGAGATCCTTTTGGTTT TTGGTTTAATTTAACTGAATTGGATTGACTTAGACGCGTCAAATTTTAAC AAAACAAACCTGTAGATGACTTTTGTTGTTTGAATCTATTTTAAGGTTAC ACCTTGAAAAACAAACATTTAATGAAATCGATTTTTTCCATTTTCACAAA ACCACTAACAATCAACTCACTGAAACGACTGTTAAATAACAATTGCGCGT CCAAAATGGCTGAAACATGGCTGAGTAACTGTCAACATATGCTAAATAAT TGTGACTAGTAAAGCCATCTTCACGTTGAGGTTGGAAACTTTTCAGAACA CCCTCGTATATTTCTTTTTTATTTTAAATTTACGCTCTCGGGGATTTCGA CCCTTTTCAGATATCTAGTGATAAGTAATTCTTACCAATATTTTTATAGC AACAACAGAGTAAATATGTTAATATGTCCTCCTTTTTTTTAGTTTTCTAC ATAGACACTAACACACGCACGATCCAACTAACAAATAAATAAACTGCACA TACGTTTTTGCCAAAAAAGTTGCAATATTTTGAGTGTGTATATTTGCTAT TCTTATTTAAACTGTATATGTAAATATTATATACTTTCTTCATGCCTTCC CTTTCAAACACTATTTATCTTTCTTTTTTTCATTTTTAGGAGTTTATGAT GGCAACAGACATGACTGCGTCCGGTTCGCCGGAAGAAAAGTTAGCGTAAG TTTAACTACAATCAACTAAAAATAACTAATCTCTTCTTCTTTCTCCTTGT TTCACTTCTTATGTGTATATAAACGCAACAAGAGCCGTTTTATTTAACAC CAAAGTCCCAGTAGAAGTTCTTCTTCAAACATACCTTAAAAAAATAAAGC AAAATATGAAATTATATTAGATATTGACTGACTTATACATATTATTATAT TTATGCAAATATAAATAATGTAATGACTGTTCTTAGAGACCACATATGCA GAATTAAATATGTCTACATAGTACGATAGTTTAACTAGGTCAGAGATAAC GTTTTAAAAATTAGCATAATCCTTTTTTTTTTATCATAAAATTTTCATAC CTTTCTCATAACGTAGTTTCAGCCACATACTTGAGGTGAAAAACAAAAAA AGAAAAAAACAATATGTAAGTGAGTGGATGAGCAAACTTTGCGAAATGCA AATTGGCCTATATCGTGATGATTAAACAGAGGTACTACATATATATTTCA AAGGTTGAATGAATATTTTTTATTAATCATTCCATTCATACCCTTATTTA TTATTATTGGAGATAGGTTAAGAAATCTTAGACGAGACTGAGAACATTAT ATTTTTTGAATAATGGAAAAAATTCGGTCTTGATCGGTCCCACAAAAAAA AAAATTGAATTTAAATATTGGTACAAATTGGTCTTAAAAAACAAACAAAT AAATACTGGTGTTGGATCGCTTCTAGGATTGATTGCCAAATTTGTCTTTT TTTTTATTGGTCCGACCTTTTCAACAATTGATTACAATTCAACTTCCTAA GGACCGACACTTTGGTCCTTCAGTTTTACGGTCCTAGATTTCTTCACTCA TAGCTAGGATTGAATGATGTAAAACGTAGAAAATAATAATTGATATCTAA AAAAACATTTTAAAAAGGTCAAGTCTCTTGAAGGAGGTTATGTTGAATAA CGAAAATTACATAGTTAATAGAGAAATCAAGGTAGTCCATTAAAAGTTAG TAACTGCGTCATTTCAGCTGTTTTTGTTACCATAAAATACCAATAACCAC TGGTCTTGGAGTGACAAATTTTATTAGCACTGTACTGATAGGACTACAGT CTTTTTACGCCAATCCAACACTACTAAAGTCGAAATAGAAGTTTCATATT GACTTTAAAAACTAATATTTATTAGTCCAGCAACTTTTTGGGGGTATTTC AATCACAAGATATTTTTACTCCTCTTTAAAAAAATAACTAATTTTTCTTC ATTATTCTATATTGATAAAGCCTTCTCTGGTGTCTTTGCAAAATTTGTAC AAGTTATGATCAATTATTTAGTTTTTTGAATGTTTCTAATAAAGTTTCTG GAAAATCATTCTCAGGAGTTCAATATGATTTAACTTGAATGGTGCAATTA AACAGAAAAAATTATTAGATAAAAGAAGAATAGTATGCACATATACAGTT TTGACCACAAAACCTCTTCATAATGGAAATATTTAATATTCTAACGAATT TTTAATATTATTAATTACATTAACTTCAATAATATCCTATTTTTTTATCA CAAATCAACCAAAATATTAAATTTAAGTCAAATCTGATGTGCATATTAGT TTGGTAATATAATCTGAAAAACTTTTTTTATGGAACAATATATATATACA AAAGTTGAAAAATGCAAAGAGTGTTCATCGATACGCAAAGAGTGTTCATT GATACGCAAAGATTGACATGGAATATCTTGTAAGAAGAAAATCTTTTTAT TATAATCTTAATTAAACCTTTTGTCTTGTGGTGTTGAAAACCCCTTAGGT AAGTATTCAAATTAGGATTTGAAGGAAAAGTACCAGAGGAGTAAAAATGA ATTAAATGCAAAATTTCAAATCGATATCATTATTCATTAAAAAGATGAAA TACCTTCTAAATTCAAAGAAACAAAATTTTCTTAGTGGTTGAGTATTTTA TTTCAATTCAAAATTTTGTGTGCACCTTTTTGGACACAATAGATTAAGTG TGTAAAATTCTAACTATATAGTTATATTGCTCAAAAATTGGGAAATACAT TTATAAAACAAAGCATCGTTACATTATTATAATTTTACTAAGTTATGTAA CTAATCTTTTTATACGTWTTTTWTTAAAAAAAATACCGTTGTCATCATTG CATTATTTGAAAGAATTTTTTTTTTTTTAAATATTCAAGGGCGATCGATA CAGAATAAAATAAGTATTCTAAAACATCATCGAATAAAAGTTTAAACTAA TTCCTCAGCTACTTATTGCATTTTGGAAGGATAAAAATAGAGGAAAAGGT AAAAATATAGTTTTTGAAGAATCAAACTCTCAAAACATGAAAAACTTGGG CTTGTTGTCGAAACCATGATAAAAAAATCATTTTRCCRTTTTTATAGAAG CAAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTCGAAGGATTTATATTATTCAAC GCCTTTGTCTAGAAAAAAAGTGATCAGAAATGTAACCTTAATACATATGA TTGGTATTTGTTCTCCTTTTTGCTTTGAGTCATTGTTAGTCAATTTGAGA ACCTTAGTAAAAAAAGAATTATAAGGCTGTTTTTCCATGTATATGACTAA TTTCAAATTAAAGCAATCTCACAATAAATACTAATTTTACCTATAAAGAT CACAACCATCCATTTATACTTGTATATTTTATTAAATAAAAAAAACTAAA 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TTTAATACATTCCGAGATAAATATGATATTTTTTTTCCTCAGTCGTATGT TTGTTGGTTCTTTCCGTAGAGACTCTTTAATTATTACAAACTAGGAGAAG GGAACAAATTTGCACTTCTTAACGGAACCTCAAAAGGACCAAAAAATGAA GGGAACCTAAATTTATAGCAACCATGTAAACATACATAAATATATTTAAA ACATAATTAACCTCTAATAAAGACTCTAATGCTCATTCCTGTGATAAATT TAACTTACTAAGATAAAAGTATAGATTATTTATATAAAGTAATTTTAACT ACAATCAGTAAATTTTTTCAACATTATTATACCTAATTTTTTACCTACGA TGTATTTAGTTTTCTAATCCATTAACAGAAAAGTTAATACTTTTTTTTGC CAGAATTAAACTAAATAAGATTTTCCATGGCCTTCCTATAGATAATAGTT ATAATTATTATTTGAATATAAATTCTTAACCCTTTAAAACCATAAATATC AAATTTGATACATTAGTTTTTTTAATCCTGGATTCTAGGAGTTTGACAAT TTTTGAGTCAAAAACTTTATGAAAACAAGTAGTAAGTATGTAATGAATGG TTCATTAAACATAAAAAATAGGTATTTTTTAATTATGACCTTCCATTCTT GCAAATCTATTATATCATTGATAAAGTGCTAGAAGCATGTGTTTTTGAAA GATTACACATCTAATTCAGAGGTGTTATGTGGAAAAAATTATTGTTTAAA AAGCAATAGCAAAAATAGTGAGTTACTCACTTTGAATAAAAAAAAAATCA ATTTTAACCAAAAACTCAAAATCTTCCATGTTGACCGTTTTTCATATAAG ACTACAACTTTTTATAACTGGACTAGGATTGTAATTACTCAACATAAGAA AATCATAGGGTTGCATAGTTTCTATGTATGGGGTTTATTATTGAACTTTA AAAAACATCCCTAATTTAAGAGCCCTCTCAAGAAGGCATTTTTACTATTA CTATAGTAGAATATCTTTGATACACGATAATAGTTTTTCACTGTTACTTT CCTTGAAAATTCTGACCTTGCATTAACTTATTGGGCGATATACATATAGG GTTGAATTTAATTTCTCTTATATGTTTCGAGTTTGGATAATTATTCGAGT TGTAGTTAATATATCACCATTTACAGGAAAAAGCTGGAGATCGAGCAAAA ATCATATTTGGAGCCTTGGATGTGAATGGGGATGGAGAGCTCACTTGTGA AGAATTTGTACGAGGTTGTATGGAAGACCCTGAACTTGTTCGACTCCTTA ATAGTGGAGGATTAGAGGAAGATAATGACGAGGGGGAGGATGAATATGAG GAAACAGATAATCAGGGGTGATTTCTTTATGAACTGCTATAATATGTAAA CCTATATAATCTTAACTTATATGTGAAATATTTAACCATATAATTCAATT TAAATATTATTTTATAAAGTGAGTATTGTTACAATATAAGGAATATTCTA TTGTACATGGATTGTGAACTCTTCTATCCTTTCCTTTTTGACCAACTAAA GATTACTTTTCCAATTTTCTATTAGTCAAATATGACATAAAAACTACAAT ACCTTAACTTTTAGAACACTTTGGTGTCCCTTCGGGTCAAATTGATCCAG GTAGTATTTCATGAATAAAATATAAGTCTAAAGAAATTTCTTACTTCAAA TATCATTAAAGGGAGTTTTTCAATTTTATTCTTTTTGATTTACATTTGAT AGTTTCAAATCTATCATATTATTTCTGTAACACTTTTTTTTTACTATTAG GGACTTATGTATAACAGAAATGCATTGAATAAAGTTTAAAATGATTCATT TTGTGTTGAGCATTTTAAATACAAAAAATAAGCTAAAAATGTCCAGCTTC ACAAAAATAAAATCTATATAATTCGAAATTTTAT
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