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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s187 | supercontig | LSalAtl2s187:347243..393343 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003406 >EMLSAP00000003406 ID=EMLSAP00000003406|Name=EMLSAP00000003406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=125bp
MTTYSDADRRKILESLTTDELATFKEAFTVFDKNQDGTITTKVMMVKKMQ ETDTENEIREAYRVFDKERTGVIAASEMKLILSNLPEKLSEDEIDEMLAT ADKDGNGSFSYEEFRLMIGASLTMK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s187:347243..393343- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003406-699253 ID=EMLSAT00000003406-699253|Name=EMLSAT00000003406|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=46101bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s187:347243..393343- (Lepeophtheirus salmonis) AAGAGTGTTTCTACACCTCACATTTCCCTTTTGTCTATCATCATTTAAAT
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TGTAGAGTTTTTTCATGCTAAAGTATTTTCGCCCAAGCGAAGAATTATTA
ATAGCTGAAGATGAAAATTTGTTTTTATTTTGGGCATATTCAAAAATGGA
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AGGAGGAGGAGAAGGAAATAAACAAGAACATTCAAGAAATAATTCCATGT
GGATCCTCAATTCTACTTTGAGTCCAACAAGTGATTATAATTATAAGAGT
ACAATCAATAAGGTTTTGAATATAATTCAAAGTAGTAGAATGGTAACTTT
GCGACAAAAGAGTTAAATAATAGTTAAAAAAGCTTAGGAAAAGAAAATTC
ATTCTCCAGATTACCAATTCCAAAAAAAAGGGTGAGCTAATAGATAAATT
CGATTTTGATCAAAATTAATACTACAATGCTTACAGTATTGCACATTTTT
TTCTTTAATACATAGAAGAACAGATATTGCCAGTCAATAGGATTACAGCA
AAAGTTATGGATCAGTTTGCATCCAACTTGGTACGAAGATTATATATGGT
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ACACAAAACAAAAAATGCATGATCGACGATAAGTTTAGAATAAATAGCTC
GTTATGTAACTCAATTTGATTTTAGGTGGAAGTTTTGTGCTCTACCGAAT
GTCCATTCTAGTTTATATTAGTAAAATATTTATTTCAAGAAAAAGGCTGA
GGTGGACCCCAGTAATTTTTGTTAGTCCGCTAGATACTTATTTTCGTGAA
CGTTCTGCATCGCTAATTCCACTAATTTTGTAGGGTTCACGAGTGGGCTA
ATGCTAATCCACTAATTATATTATTTAAATGCAATGGTCTGTCAAATGAC
CCTCGGAGGCATAAGATCAGATCAGAGGTTCCCAACAAAGGAGGAATTAT
GAATATTCAGAACACACAGAGGTAGATATGTCGGTTTTTTTAACCCTAAA
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CTTTTATAATTTGTATGTATAGTCTCTCAAATTTCTTCCTCACTTGACCT
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ATATATTCATTGTAAATAGGATCTTGGTGAGCCCATTAAGAACAAAATCA
AAGCGTGTCTGAAACTTCAACAAGATGTAACATATTAATTAACAATAGCA
TTTCAACAAAATTAATATTATTAATAGATGTGTGTCTGAGTTNTCTTAAT
CATTAATGTAGCCGTCCTTAGCGGTAATGATGGCTTCCAGGAGGCAACAG
AAGACTTGGCACACGCTGTGATTGTAGKCTTCTGTCATGGCATCCCMGTA
CATTGTCTTTGAGGGCCTCGATGTTTGGATGACTGACACTGCGGGTCTTC
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GTAGGGGTGCAAAAAAAGTGCCAAAAATGAGTTTAAAAGACTAATTCAAA
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TGGCCTCTCCATCTTCAAAACGCTCTTTCCACTTACTTTTTTTATAGTTC
TCTGAAAAGTTTGGTGTGAAACCACAAGATCTCTTGCATAGGCCCTTATA
CCTGGAAGAGATTGGCTARGACGGTTTTTTTTAACTCAACCGGATCCAGT
TTGGCCTTATTGACAGAGTCCTTCTTCGTCTCCAACTTTTCGGATGTCCT
GACGGCGTAGACGGTGGTCTTGGAGACGCCAAATTGCTTAAAGTTTACAA
ATGGAAATTTGTAATTCACGTTTAAGAGTTATTTTCTCAACTTCTACGTA
AGCTTGAGATCTCAGGTTTGTTTTGTTTTTTAATAAATTGTTTATGATTT
ATATATTACCTTCATTAATTATTAAATTAGTAATTAGTAACAAAATCAAA
GCGTGTATGAAACTTTACTCTCAAATATCAAATCCTCAAAAAACTAGTAG
ATTTCTAATTAAGTAAGGGGCATCTGGAAGATTATATATTGCCTTNNNNN
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TTACGAATAGCTATGAATTTTTCAAGTGTAATTTTCACAACTTGTACGTA
AGGCAGAGAGCTCCGGTTTTTTCTTGCTTTGAAATTAATTTTCTAGGCTT
TAATATAACTAGATATGAACTCATTTCAATTACTCAATTCATTTATTATT
AAATTAGTAATTGTTCAGATTTCAATGGACAACCTGGTACATTTAAACAA
GTACGCGTACGATAGATGTGGTAATCCCTCTTTAAAAATGATTTTATTTC
TGTTACTCTCTCCTTCATCAATTTTTAATTATTAAATAAATCAACAACGT
ACTATGTATTTTTAATATTTAATTCCCAAAATATGTAAAAAGTAATTGGG
CGTAAAATATATAACTTAATCATTTTCTTGAAAAGATAAATAGTAAGTTT
TATTTATTATACCTAAACGTAACATAGGTATACTAATATATAACAATACA
ATATTTTAGTATAAATAATATATTGAGAGAGATGGGAAGACTTCGAGATA
AAGGCTCACAAATACATAGTATGTATTTATCTACCTATTCATATGAAAGT
CAAATATTAAGTTGTTGTTTTTTCCCTCTATTTCACCGAGTCTACGTATG
CAATATACAATCATATTTATCATAGGGTTTTTATTAACAAAAAGAGTTTA
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ATATATATGTATACATGGGTAGGTACACAGGATGAATGAGTTAGAGAGTA
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TAATATACACAAACTTACACCTGGTGATGATAGAAGAAGCTACTCAATTA
CCACATTAGAACAACAAATATTTTAACACTTTAGAAAAGATGAAGTGGAA
AGTGAAAGGATGTCAAGAATACAATATATGTGGATACATAGATAATTATG
AGAAGAAACATTTCTTCAATATCTACGTATGTACAAGAAACGTCAAATAT
CACATTTTGTCGTGTATATGTAGTTTAAAATTTGATAGTAAAATTAAAGA
TTTGTTTCATAAATCTTCATGACATGATAAGGGAAATGAATGTGAATCCT
TTTTTGACTTTTATCCTTTAGAAAATACTGCAGAGATCCTTTTCGTATTT
GAGAAGACTCAAAACGCACATCTGAAATATTATTATGTCTCAAGAAAAAC
TCTCTGCGTTGTTGGCTACAAGAATCCTTTTTTGCTTACTAGGGAACAAT
AGGAATAATAAATTACCCTGAAACTAGTTGCACAACATTAATAAATATAT
CCAAATGAAGACTGCAAAACATGACGTTACAATTATTGGATCACGCAATC
ATTATCATATTATTTCTCCACAATTTTTAAAATAAATTATATATTTTATA
ATATTAAAACCCTATATTTTGTATTATAATATTGTTAAATATTCTGTATT
AAAGGGGTAGATATATATTTATATATGAAAGCCAAAGTTTCCTCATATAA
ATAATAAGATAGTCAACCGACAAGAAACCAACAAGAAACTGTATTCCTGT
CCTTTTGTAAACGGAGCCATAAGTATATTTTAAGTTATAACTTATTACGT
CCGTTTATTTATTAAGATAAATAAATTATAAAATAGCTTTGACATATCAT
CAAGTGAGTCCAAGGAGTCGACAGCTGACAAGAATTTGTATATATGGTAT
TTTTGGGTTAGCGAGGTAACACCCTGAAAAGGAAGAAAACTTTTGTACGT
CCGGCAACATAATCTGTTACCAAGTCTAACCATTACCTTTAGACATTTTT
TGCAGGATCTAATCATATTTAGTTTTAGTAGCAAGTYAATCTAGATTGKA
AGCCATAGTAATAATTAATAAGCACTATCAAAGAGTCTTCAGAAATATAT
ATATTTTTATAAGATATCTTTTTGACTTCGCGTTAATTAATCATTTCATT
ACAAGGTCTGTTGTAATCATTCATCGTCAAATTCATCGTTTTGATTGATT
GCTTTACAAAAATTACCCTAAAGAGTGGGAACTACTTAAATACCACTATA
TTGTTATTATGGTTTTATTTTTGAAAATTATCCCTGAGAGAGCTTCACAT
TGAACTAGATATGATTTTTCATCGAAGTTAATATTCTCTGAATTCAGGAC
TCATGATTCCTTAACCTTAAAACAGGACAAATAAGTATAGTATTACATCG
GTATATCATTTACTTAATGTTTATATTGATACATAAATGGTTGATTTTGG
AAATTAAACGATGTACTTACAAAGGGATGCGGCTCTATAATAACTTCGAT
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TAGTAACATAAATAGATTTCAACATTGCTTTTAGAAATGGATGTTATTTT
TCCTTGAATCAAAATATGATCCTTCACTTCTTGATAAATATAAAGATTCT
GTATCGAATAAATCCATAAAATAGTTTCCTTGCGATCGAGGTGAATGTAT
TTCCTTCCCATAGTATCGTTCAGATGTTAAATGACAGATACTTTGCTCTG
CAGGAATGGGTGATGTCATGTTGCCCTTAACAATCATAGCATAGGTTACA
CTCGAACTCTCTGTGGAATAAGTAAATTGTATGATTACTCAGTTACAAAT
CTTTGTTGTACAAAAGGTACCAATGCCCTCTTGATTTTCTTCCTTTAGTG
ATTCCATTTTATCCGTTGTTCTTTGTGCATCATCATGGTCACACAACCTC
GTGGACTTATCCTGGAAAAAAGTACGTCACAAATTGTATATATTTTTGAG
AGCAAGGATTTTACTAAATAGCGAAATATATCATTTAAAATATGATATTT
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TTCACGGGCCATGGATGAAGGTGTGGAAGGCATTGATAACTTCTGACGGC
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GAAAAGGCGAATTTTTAAAGTAATAATATTCTAAATTATTATTATAACAT
TCAAGATAAGAATACTTATAGTATATAAATCTAAGTATTTATTTATGTAG
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TGTGGTAATTATCAATTAACCTCATTTTCATGTAGCTATAAATCCGTCAA
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CTTTTTATAAAAATAATATGTGCAACTTTTAATGGTGTGTGTACATTGTA
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TTGTTATTCCTTAAGTCTTGAGTAGTGAACTTCCTTTTATAAGACATTTA
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TTTTCCAAACTAGTGTTCTTGTAAGAACTCCATGCTGCTTTTTGATCTGC
AACATTACTTGGTTTTTTTTGTTTTTGACCTCATTGGCATCCAAGATCAT
TCTCGTATTTGAGAGTGTTGATGTAACGATGATTTTTGTCAAAGGGATTT
TTACTTGCTTCTGATCAAGGAATAATTATAAGGCTACTTCTCGTTTCCAA
TAATGATATGTTTTTCCTCCCACGGAAACTAGAGTTTACCTTGTTACTCG
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ACAGTTGATGTAATCTTACCCGATACTAGTGCCATAAAGCAATCAATAGA
AGCTACAGTGAGTCACACCACCTTGCAGATAATGTATAATTTTTAGTTTG
CTCGTATCCTATTGGACAACAAAAAATTTCAATTTTGACAAAATACTTTT
TTTTACGACAAATTTAATAGCATATTTGTAGTTATGGGCCTGGATCTTAA
AGGTATTGTGTCATAATTATTACTTATGTTATTATAACTATTTTAAATAG
TACACAAATAATGGATCTGTGGTGCTTCATATCTTTCTATTTTATAGTCC
AACATGATTTTTAAATTTAATTAACAAAGCTATAATCTTCTTTTGAAAGA
AATCTTCATTATAAATTACCTACATAATGATTGCTTGAGTGGCATGACAT
TCCCACTAAATAATAATAATAATAACACAACAAATCAGTAGGTCATTGCA
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AAGGGGAGTGTTTGCTCTTTCGATCAAGATAATAGAGCTAAATCACGAGG
AAAAGATGACAATTACAGTCCGTTCCAGTGAATTATTGGGAATGGAGCTC
AATTCGAATACCTAGATCAGTTTCACACTCATCGACCACCAGGTGACAAT
TTTGCCACTCAACATGTGTAATGTCACTAGTCAGTTAAAATATCACAGGC
GAAATTTTGTAATTTTCGTTATTCTGTAATTGGTAATATAAAAAATAAAT
TTTCTTTTCCTAAGGAGTTGTCATTGTTATTTGATTCTTGAGTAGAACAT
CCTTTTCTAAATAGATTCAATTATATTCAAACCCTGTTTGAAAATTTGTA
TGTACTCATAAAAGACCCTGAGGATTAGTTGTGGAGTTATAATTGTAAGT
CCTTGTTGGACTCAGAGTAAGAATTGGGGATCGACAGCATGGTAATTCCA
GTAAATGTCCTTGTTTATATCATTTTGTCCCTGCTCCCTTGTCAGATATT
AATCCATATATCTGCCATGATAGCATCTCCTGAAGAAAGTCGATTTTTCT
TTTATATGTCTAATGTTTAGATTATTTTACTTTAACTACAGGAGCCACCA
AACCTTTTTCCTTCATCCTTGTGTAACTGATCTAATGAAATGGCATGAGC
ATTTTTCTTTCTCTCCTTTAAATTGTCAGGGCTACCATGTTAATTTATGT
TTTTTTTTTTTGTTTCTTTTAAACATGCCCTTTCTACACAGGATTTTAAT
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TTTAACAGAATTATATTGATTTCAATAGATCAACAATCAGAACACTAATA
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TTGATGTTATGGATATATCATTAAGATATAACTACTGTCTGTTTCTATAA
AACTTTTCTCGGAATCAAATCTGTTAAAAACATCTAATGCATAATTAATT
TTTTTAAATGACAAAAGTCCTAGTAAAAAGTTAAGAGTTTCGTGAGGGTT
TTTATAAATATTGGACAATCAATTTTTTCTTGCTCAACAATACGGAAAAC
TGAACAACCCGTTATTTATTATTTAGTTATATTTTCTTTTTTGTGATTCA
TTCTTAATATAGATAAAGTTATTATTAGGTACATTACCTTATTTATCTTA
ATATGTTGATTTTCTAATGATTTACCAATTGCAAAGCAAATTGAAATATG
TATACCTGAGTCCAAGAAAAAATAATCTACACTTATACTTTAACATACGA
GTTTTATTCGTTCCTGGATGGAGCTCGTAAGTCAAAACAATTTATCATTG
AAGAAATAATTTTCTTAACATGAAGTGGCTCTTGTCTCCCGTCGCCAACA
CTGGATCAGTAAATACAACTTGTTTGTCTTTGCAACTTTTTGGTCAGAAT
CTAACTCATACGGGGTGGTACATAGAAATCTGAACACTTACTAATTCAAT
AACGAATTAAGATTGAATGATTAAAATTAATTCATATTTTGAAATATTAA
AGCATAAATAATTAGTTACAATATTACAATACATTTGAGCTCTTTAACTT
ATGTAAAAATCGAGAAAATGACACTTGAAAGTGATCGACGAATTTCCAGT
CGCGCACTCCAAACAGTTGGACGACTCCAGGACAACCGTCTACTCCTTCA
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CTGGATCCGGAGGAGTTAAAGAAAACAGCCCGGCGCAATCCTCTCAAATC
CATGAGGGGCATGCAAAAGATCGTGGGATTTAACACCGGATGGTCCAGAG
CACTATAAAAAAATTGGTTGGAAAGAGATTAGTGCGGGTGGAGAGGCCAC
TTTCAACACCAGCAATGAAAGAAACTCATCACCTCTGTTGCAAGACTCTT
TTGAACTCTTTTTTTAGAAAATTGGTCCCCCTTCAGTCCACATACCAAGC
CCCTCAACTATACCTTTTGAGTGGATGTCAAGGAGAGGGCCTGCACTGGC
AGMCCTCCAAACACCGATTCCCTCAAAGCCATTGTTAGCCAGCACTGGGA
CGCCATGGCAGAGGAAATCCACAGTGGGTGAAAGGCCTTCACCGGCCGCC
TGGAAGCTATCGTTGCTGCTAAGGGCATTAATGATTAAGAGAGCTCAGAA
ACCTATCTATTTATTTTAATAATTCTGTTGAAATCTAATATAAATTAACA
AATTATATCTTGTTGAAGTTTGAATTTCAAAGTCTTCACATTTTTTACAG
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CATTATTATAGTGTGGGGCCCAAAATTTAAGTAGTATGACTAAACTACAA
AAAACGGGATTTATATGGATTCAAGAAAAGACAACTAAACCAATTTTTGA
AATGTTTAAATACCATATTTACTTATATGTGTTATCCAATATGTCTTCCT
TTACAAGAAATAACAGCCTCAACACGACGGCGAACAGATTGGCAGSTCTT
GACAATGAAAACTGTGTCCKTGGGGMACCAGACTGTCATGATGGCAGCTC
AGGGTGAATCCAAAATTTAGATGAGAGGTGCAACTGACATTCTTCTCCAA
GACAACCTAAACTGCAAAGTCCAAGAGGTAGAGGTCAAGATGGAGGTAGT
CCTTAAATCAGCCATATTATTTCTGCAGTTTTTTTGGTTCTTCTTGGCTG
TATAGGGCTTTAATTGAATTTTTGATGTTGTAAGCAGACTGGATTGAGAT
AACAACTAGGATTGCCAACCGTCCTTTGAAAAATGGAATCGTAACGTATT
TAGAAAAAAAGCACCAGTCTCGTATTGAGCTGAAAGGGTCCGCACTTTGT
CCCGTAATACTGTGAATTTTAAAAAAGGGTTATAAAATGGCACTGTAAAA
TTTATTTGTGGCATAGATGCAATATTTCAGGATGGATGTTCTTATTTCTA
TCTATTGTTTTAGGTTAATATATACAGTTGTTTTTTGTAAGCAAGACAGG
TTTCTGTTTCAAAAAGATCCTCATTTTATTCAGTTGCTTTTGTTTATTAT
TAACATGAATTGCTGGATAATAATTTGTTAGCCATGTGTTCATGTCATTC
AAAAATATATATCTAATTCAATTCAGGGTCAAATAGTTAAAAATTGGAAA
AAAATGGTTGCCAACTGTCCTTTAAAAAACGGAARCGRCCCGTATTAATA
AAAAAAAASCKCCCGCCCTGKCCCTGCCAATGAATTGTCCCTTATTTACT
TTTCAGAGAGTTGGCAATCCATATGCTAACGGCATCTGCAGTCTTCTAAC
ACTGGCAAGGAGAAGATTGCACAGGCGCGCTCCCTTTTTTGTCGTTGCTC
CGAAATTTTACACACTCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GAGGAAATAAATGTACAAGTAGATTCATACGCACATATATATTCAAATGG
GAAGGACTCATCTCGAGGCAACGTGATATGATAATTATATCATATAATCT
ATGTACTTTGTAGCATACATGTGAAATCACTCGATAGGGAAAAATGATTA
TTGTATACACACATAAGTCGATTTATATACATATATGTTTAGAGAAGTAT
AAGTATATACTATGTACATACATATATGTATATGCCTGGGGTATAAAAAT
TAAGTTTTTTTTTTCTTTCAAAAAAATCTTCTTGATAACTGGTACTTCAT
ATTTTTTTCCCAATATTGTAGGCAAAGTATATACATATTGTCAAAGGGAG
TAAATATATGTATGTATAAATTTACATACAGGGTTGGGCGGAAAAACGTG
GACTCTTGAGCCTCCTGGCCTTCATTACCTCTGACAGGAGGTGGTAAGCA
TGGGATCAGTATGAATGAGAACCATCACAAGTTGTCCTTCATGGACCTCC
TGATGGTCCTAGCAGCTAAGGAAAAGTCGTTTGCGAGGCGATTCATCGAT
TTGGTGGGGTCCTCCTTAATGTTCTTCTCCTAGCTGGACAGGAAATCTTG
ATCCCTTTATAAATTGTACACTCCACTTTATCCTTTCCTGGAGAGGTATT
TTCCATTATTTGTCATCATGGCCAACTTTAAAACTATACTTCTGTAGCAC
TACTCAACGCCCACTATCCTCGCCAGCTGAACTTCAGCATCTAGGAGATC
TAAGATGCTCGACCTCTTAGATATTTGCTCTTTCTTGATGACGAGATATT
TATTATCGTTAGTTTATGGAATAAGGACGCCTGAATCAGAATGTCAAAAA
TAATCACTAAACCTTCCTATATTAATGACAAAATTAACATTAATTAACAG
TCCACGTTTTGCTTCCCAGCCCCGTATGTAATTCGGAAATTGAAGAAAAT
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GTAAAAATGATGCATTGTAGAAGGTATTTTAAAATTGGGGACTTTTTCAA
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TTCAAATTTAAAAAATAAGCTTTACCCTCATGACCATTCTATCTCATTTT
GAATTTAAGTTCCAACTTGATTGTGAGTTCTAATAATCGATTAATAAAAT
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AGGTGATGATGGTCAAAAAAATGCAAGAAACGGACACAGAGAATGAAATA
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