EMLSAT00000003415, EMLSAT00000003415-699262 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003415
Unique NameEMLSAT00000003415-699262
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s187supercontigLSalAtl2s187:667855..694876 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003415 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003415EMLSAG00000003415-686181Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000014878EMLSAE00000014878-723806Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014879EMLSAE00000014879-723807Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014880EMLSAE00000014880-723808Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014881EMLSAE00000014881-723809Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779230auto779230Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003415EMLSAP00000003415Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003415

>EMLSAP00000003415 ID=EMLSAP00000003415|Name=EMLSAP00000003415|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=326bp
MLFRKKMFEVNPTDEGISHKTIATLIASMGYFIGGLARAWSAPGIPSLQG
LDLNETVYALAQAPLSKEMTSWINQAKNNKEGDSKRQRIWDKAMLEPFFI
SLMLMGFQQWSGVNACIFNIVLIFKSAESDISSDLSTVMFGMTLSLTINL
NNSTTSFQGLPSLWIERVRRPLLMISXIXMGLTMGLLGLFFHLKSIGSSD
GYDWIPISXLVVFMIGYSLGFASIPYVLMGEILPTQFKNLFSGIAAFYNL
GNTFLVIKLFSNISSSYGLQGVFWIYSGCSFASVVFVFFCLPETKGKSVS
EIEYLFHCKWASKASRNMENDFITKL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s187:667855..694876+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003415-699262 ID=EMLSAT00000003415-699262|Name=EMLSAT00000003415|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27022bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s187:667855..694876+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTATTTCGTAAAAAAATGTTTGAAGTTAATCCAACTGATGAAGGGAT CTCTCATAAGGTAAGTAACAATCGGTTTAATCATTCAGTTGACATCATTT AATAAATATTATAGACTCCATGTTCAAAAGAAAAACATTACCATGTATAA TTCATGAAACGAAGATATTTTTTTCCCCATTATTGAATAGTATTATTTTC AATCAAATTATACAAATTATATCAAGTTAAAGAATGTAGATCTTTCAAGA GTGTCTTCTATTAATAGAAAAACAATTCAACCAACAATTTCATTGCTTGT CTTGGTATTTTTGCAAAAAAAAAAAAAATTATAAAAACGTTTTTTTCCAA AATAGAAACTTCTCGTAAAGATTTTTTTATTATAATTTAACTTTAATGCA AAATGTGTCTTTTGGAGATGCAATATAGATTAATGCAAATGATATATCTA CAACAATTGTTTCCCTATTCAGTGCCGTCATTACTATTTTTGTTTGGACG GAAGAGAGGTTGTTTCTTTTGGGTTGGAAATTGATAATTTATTTAAATTC AAAGTAACTAAATATCATTTCGTACTGATGTTTTAATGTTTTTCAAATTA ATTATTATGTTAATAAAATAATACTTCTAAAATTAAATATGTAATTTATC AAAAACACGCAAATTTAGAACTTTTTCGATAAAGCAATACGTTTGCAACA CTGGCTCAGGTCATAACTAAGAAATTCGCATTTTTTTCAGGTTGAATGAT CCATTGAGTATAATTTTTTTTGCAATTGCATCGATAAAGTTTTTAAAGGA CAAAAATTGTCAAACTGTTCAAATACCCATACTACGTATGACGTTATAGG GTTGATATTAACTTTTGAACTATCACGTTTGCATTTCACCTAAGTGGACC ATTTGATGTCATCTTGATATCACTCCTAAAAAATAAATAACACCAGTAAT ATAAAAATGACATTCCAAGCTGTTAAAGGTTGTAAGGTGAATAACTTCGT TATAAACAGAGGTGTATAAAATATGTCAAAAAAAGAGAGAATGTCTTGTT TTAGTTGACAATACGAACATTTTTTATTTTGTTCTCAAAAACTGTTGTGA TTAATACTTAAATCTTGAAAGATGGTAACAGTAAGGGGTTGTGAGTGCAT GTCCTTATTGAACTTGGAGTAGAATTGAAGGTCAAAGCGGGAGTAATTTC CCCCTAATTAGTTTTTCAAATTTTCTCCTGGAGAATGGAAAAAATGACTA TAACAGCTTTAGAAAATAAAACACTTAGTTCAAGTTACCAATAGCAACAA AACTCGCACGCAATAAAATGCTTAAGGTTAGGAGCCTTAATTATTAGTGT AAAAGTCAGTTCACAATCAGAGTAGAAATAAAGATCGACATCGGTGTAAC TCCTACCAATGTCTTTGTTTTATCTTTGATTTGTATTTATTTTCTCTCAT CAAAAATTACTTGCACCTTATCCAATATATTTTTTAGTGGTGATTTACAC TTTCCTTAATTTTAATCAAGATGAAGTAATGAAGAAGTCATTTTTAGAAT GCTAAATGTTTGTATCAATTTTTTATTTTCTTTGATTTTCATCTATATAG TTATTTCATGTCGAAATTGGCTCGAAATCGTAGCTATACCTTAAAAACTT TATTTCTAAAAAAGGCTTTGAAGGCCAAAGTTGTATAGGTTGAAAGTTTT AATGGTCATTTTCGTGTTCTGAAGCTTTAATAACAATAATAAATGTGGGG TTCAGCCTACGCAAAAAAATAATGTTGCATGGTGTAATATATATATCAAT ATGTTAGCTGACTGATATAAAAATGTACCCTGTATTTTGTGGATAGCTGT CGATTTATCTGGTTACCCCTCCCTCTATCAGGGTTCCGAACGTTATTAAT TGGTGGAATTCTAATTAAATCTTGTTAATAACTGTGAACAATTAATATTA GGGGCATGAATAACAAAATATGTCATTACATTCGTATTTCTATATTTTAG ACAATAAATTATCAATTACAACAGAAAAAATTTCATATTTTTCTCAAATG GTTGTAATTTTTTGGTCCCTAATCGATTAAAAAATATTAATGGACTAAYC CATCCATAACTTTGATTTAATTTATAAATTAGAGCTTGTCATTGGCATCA AGTAGTAATTAAATATAGTTAGTAAGTCTGTTTTTTTATTAAAGCTATAT GATGAAGTTTTTTTCAATATTTATTGGAAATTCGCTCATTTTATTTAGTA AAAATATCAACTATGAACTCCGAACGGGTTTCTTATTCAACTATGATGTA ATTCAATACGTCAGTGAAACCCCTTTAAAACTATATAGAATTGGCCAAGC ACAAACTGTTTTTGGGGGCCCAGTTTTCTGTATTTTCCTTATAACATACT AGCAAGGAGTAAATTTTTTTGATCAATAAATCCAATATTCCATTGATATC CATTTTTTTTTGCCCCTGAAAAAAAAAAGTGCAATTTTTAACGATTTCTT ATTTTTCCCATAATTTTTCTGATTTTGAATAAATTTAAAAAATGTTTTTA TTCGTAAAGTTATTTTTTGAGACGCCAGTCACTTTAAGGAGGATAAATCA CTTCTATTACTTATCCTTGAGCTTCAAAAACATGTTTAGTGCTTCGGGTA TAGAATAAGCCCCCCTAATATAACCCCCTTCAGAAATTTGGACACCTGCC TCAGCCTGACCAGGTTCAAAAGTGGCACCCATGCAAAAGTTCAACCTCTT ACGACGAACGGTGTGGGCACCAATGAAGGACACACACGCATAAATACTTT TATATCTACAGTTAATAGTTATCAGATGTAATAAAATTAACGACGTGAAC 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