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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s18 | supercontig | LSalAtl2s18:1612488..1658105 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003469 >EMLSAP00000003469 ID=EMLSAP00000003469|Name=EMLSAP00000003469|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=237bp
MNFAPLFKERNRHNLARILDVSSTFKHAQTKKQDSFSINDLKNQXAALDI SKNQKKQNSPIIHVTPAKSPKLQLLIAQDAGESLAKLRQDPEQPSQELLP PPPPSVNPFQIVGHVMSSKELISFPDSPMVNISVTSDAHLGGGDPLPSVV GNGRASDEEPHLVGKNALGLPLQLKKVSQNRSPPLIWVSPASLARSPMVS LRRLWDRDFPIRRTLTMSFPDTKRREVLGLASSNNSL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s18:1612488..1658105+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003469-699316 ID=EMLSAT00000003469-699316|Name=EMLSAT00000003469|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=45618bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s18:1612488..1658105+ (Lepeophtheirus salmonis) ATAAACTGTGAGAACCCCTCCTCCGCAACAAATCTCAATACTCATCATTT
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ATAATCAATGTAATATTCGCAATGTATGTATGTGTGATGAGTATAATTAA
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CTTAGTATTTAACTATGTATTTAAACTCTCTAAAGACATTTAAAAATTAT
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AGCATTAGTTTTTACTTTATGCTAATCATAAACAATAATATTTGAATTAA
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TTTTCTTGATCGATTAGGGACTAGAAAAGTAGGACAATTAGAGAAAAATA
TATTATTCTTTCCAAAGTAATATTTCATTTTATCTAGAATATGGAAATAA
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AGTTGTATATTGTATAGGCCTACAAAATGGCTGACATTAATCGTGTTGAC
ATCATATACATCTTAAAATTTTACACGACATGTAACTTAAAAAAAATTTG
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GGATGATCAACATAATAGCACTCTGAAACAAAAACCAAGAAATCAAAATA
TCTTATTCTACTATTTTAATACATCTCAATATTTTATTAACATATTTGAG
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GAATTTTGGGGATTGTTTAAAACCTTTATTTGTTTTAAGAGTCTTATTTC
GGTCCCTATATGATTCAATTTTGGCTACTTATAGTGTAGGTAAAGTGAGT
TTCAAGGGGTCAATGAGAATAATTTATAGATATAAATTGACGATAATTAA
ATCTTAAATAAATCTCTCTCAATTTTATAGAAAAATAATTCTAGCTTGAT
TTTGTGTTGACGAGCCCCATGCTATATATGTGTTGAATATTCAAAAAATA
AAAAGTATCTTCGGTTAATTTACCCACCTACATTTAGTAAATACATAAAT
ACAATTCTGTGTTTTCTTTATTCATGACATTCATTTACAACTTCCTCCTG
TTTGTGTAAAGCTCAAAACTTTACCGTTATTTCATTTCATTTCTATTACC
TTCTTATTTTTTCGTGGGTATCTTTCTAAAAAAACAATTTTAAATCTTAT
TTATATAGACAAATAATTCAATTTAAATACTTATAAGTTGTTCTTAAATG
CGTGTTTGTTCAATAACATTATTCTTATAGATTATTTTTATGCCTATGAT
GAATTCGACTTTTCCCCGAAAAAATACGATTTTGATAAAGGGCTTTTATA
TCGAATATAATATATACATATATTATTAATATCTGAACACTTTCTATTTT
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CAAATGTGTATTCAAGGGGGTAGGCATCAGGGCTTTAGAGGGGCCAAAAG
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TAGGTTTCTTTCATTATTGCTGTCAAAAAAGGCCTCTCTACCTTCCTAAC
GCTCTTTTCAACCCCTCTAAAGATAGTTCTCTGGACAATCTGGTGTGAAC
CTCCGAGATTTCTTGCAGGGGCCCTCATGGGCTTGACTGGATCGGCCTGG
GCAGKATTTTTTGCTCTTCTAAGTCAAGTTTGGCCTTTCTGACAGATCCC
CTCTTCCTCTCTAACGTTTCGGATTTGTTGACGACGTAGATGATGGCCCT
GGGGACACCCAACTGCTTGGAGTACGTGAACTGAGATTTTTTACGTAAGC
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TGTGGGTAGTTTTTCATTATTATTGGATCCCTCCTTAGTGGATATTGATT
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CGTTATTCATCAAAATTTAACAATTCGTTAGACATAAGCTTTAACATAAG
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CGTTGTTGCGTTTTAATATCTGTTTCTATATATTATTATTTTTTTTTGCG
ATTCGTGGATGCTTAAATTTACGGATAATTACATATTAACTACGAAAATA
AAAAAGTGTTTTCACTTTTGACCTCAAATGATTTTCACTCACTCTACAGA
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ATAGATAAGATTCTGTAAGCTTGATTGTTGTTTTTTTTGTTTGTTTTTTT
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GCATAGATGGCATATACAACCTATATGTACAATGTTCATGTTAACACAAA
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TTGCAGTTTCCATTGCATTTGTAAGTGGTGAATGGAAACATAAAATCAGA
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GACTGTATAATGTATATCCTAGATACTTTCTTGTCCTAAATATATATTTA
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AAAAAAGGCCTTTATAGATTCTTGCATTATTGTTTAAACTGTAAGAGTTC
GAGGACAAGTTTATCTTACTCCCCTAATTTGTATACTTACTCCAATTTTG
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TAATATTTCTAATAGGTCTAGTAAAAATAAATCCATTATTTTCCCAATAG
ATAGCTTTAGTAATGTGTAACTTGCATTGTATAAGTGGAAACAGTCAAAA
GTAGATTGTGGTAAACAGATAAGATTTCGTACTTAAAAACTTATAAGACA
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ATTCCAACACTTGTCAGTGTCAGAACAAATAATGAAAATATTGTCATTGG
CTTTATTATATTTTCCTCTTTCCTCTTAGGCCTGAGTTCGTACAAATGAA
KCCCTGCATTGTTCTTCTTTTAGATGTTCCTTATTAGTAACATATAAAAA
AATTATTTAAGTAAAAAGCCTTGTCTACTGAAGTGTACAACATCATACAT
AATTATAAATTAATTATAAGGTACGTAGGCCTATTAATGTTGATAACTCC
TACGTTTCATTACCATTTGTCCACAAAAATTTGTTGTCAATCTGTTCATT
TCTTTTGACAATCCCTTTCCCTGAAATTAATTTCTTTTAAATTAACAAGG
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GGAATTTTGTGCTTGTTGTGAGGTTTCACTGTGTATATAAATTCTACATA
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CATGAATGGAGACACTAAATTTAAAAAAAAAAGACGAAATAAACTAAAAT
GAATATGTACATAAATAAATATATTTAGTTTTTGTAGCATCTGTTAATGG
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TTTTAATACACTAAAACTAGATTGGTCCTAAAGCTAAAAAAAAACAAGTG
GTAAAACAAAGCCCCTTCGATGAATATTAGTCCGAATATAGATCGTTTTT
ATTNNNNNNNNNNNNTGCATTATAAATGAATGAGACTTCCTTTGGGGGAC
TATATGTTGATATTTTAACCACATTTAATAGACAAATTTCAAATAAACCT
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ACGATGTAATATCATAATTTTAATAAATATTASGSTWGARATWTTTAAWA
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TACAAAGTGAAAAAAAAAGGATTTTTTATTTTTTTAAACTTGCTTCTTTA
GATCCCCAAAATGCCTCACATCAACAATACTGACATGAAAACGCTTTATA
GTTGTCTACACAACATTTTCAATTTTTATCTTCTAGTGGCATCGTTTTAT
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TTTTTTTATGAAGTTGCCCTTATTTCACTTTTGAATTGATTTTGTCACCC
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AATATTAGGAAATTAGAAATTATATTTATGTAAAATTTTTGAAAACAACT
CATTATATATCATAAATTATATATTTTCTTGGGTTTGATCCCTCCAAGAC
TTTGTCTGTTCTTGATCTTGGATAGGTGGTCTTGACCACATATCTAGTCG
GCATATTCACGATGCTTAAACTGCAATTTAACCAAGGTTATTGACACCAA
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CAATAAAAAGTTGTTTTATCATGTTGTCATCGTAACTTTTCTCAAAATGG
TAATTGAATTTATATTTTTGAATTAGTCAATATTANAACTMCTTGNGGCA
CTAATNNNNNNNNNNNCTACTTGTAGGCGACTAATAGTACCAACCCCCCC
CCCCACCCCCACCACMCACACRCTGAAGTAGTTTAAATTTWTTYAAWAAA
AACTGCAAAATTGCGTGGACAYTCCAAACTCTTGTACTAATAATCGTTTA
TTTTAGAATATCACCTCAAACCTGTGACTACTGAGGTGTTTAATTATAAC
ATAGATGTTAAACAAATATTATTTTACTGAAATGCAGGATTTTATTTTTA
AAAAATTATAAAAAAATAACTAAAATAACTACATAAAAATGTCAACTTAA
TCTAGTCACTGCCCTAGTGGAATTGAAAGTGAGCCCTCTTAGATAAAGGG
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GAGGTGGTAAAAAGTCTTAGTACTCCAAATCCCAGTTGAGTCTTAAGTTT
TTACTCATAAATCTAAGTCCTTGTCTAATTTTATAGTCTTTTGGTTTCTT
TTGAGTTCCTTTCATTTCCATAATTATAATATAGGATCCCCAGTGTTAAG
CTGGTTTTCTTGAGTTCATTATACACTAACTTTTCGAGTCCAAGTAGAAT
TGTGAGTCTTAGCTATCAAAACGAGCCCTTGATCAAGTCATGTCAGAAGT
MCTCATGTCAATATGMAAGCCTCGAATCCAAGCCTCACCTCTGAAACAAG
GTAAACTATTATACTATAATTAGCAGAACTTGGTTTAACAAGAAAATTAG
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AATATATATGTATTAGAAACATGGCCATGGAATCTCCATTTTTTATTACT
TGCACCAAAGAAGGATTCCACAACAGACGTTGCACGAATTGTAAGTAATA
AAGTGCCATATAATAATCGAAATTTTGTAATAAAAAGTGAAAATGTGTAC
TTTTTTAATTTATGTACTACTTAGATACGTATTAGTGTTGAGACTCGAAA
CAAGACCGAACTTTTTTTTTGGTTTGGTCATACCTGATTTTTCTAGACAA
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ATTTAATTGATTGCAAATCGTTGATCGATTTTGTTTCGGTAACAATCTAT
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ATGCAACATATTGATCCTCATGTGACCTTCTTGTTTCAAAGTTCAAAGTT
TTGAAACGCGCATGACGTCATCAACAATTCATGAATAGAATCAGTCAAGA
CCGAATTTGAAATCAGGCAATTTTTTTTGTATGACCGATCCACATAGAAC
TTCTTTAAAGGACCGAATTAGTTCAGTGCACTAAAAACCATAACGATCTC
AGACCGGTGTAGGATTTTCAATCCGAAACTCAACAAGGATAAGTACATTT
TGTATGACCTGAGCTAATGATTAAGAAGCTTTTGCTTCTCTTTTACAATA
TACTTGTAAGACATTTGAGGGATTTGGGAAATTTCATCGTTTCAAAATCG
TGGACCGATCTTTTTCGGTTGCAATTTAAAAAAAAAAAATACCCTCATCC
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GGTACTCTTTTTGTCCTTACAAAATTATCAACTCTAGGTATAATTATGGA
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GACTGGTCACTTTTTACTTTTTTATTTTCTAAAACCAGGGATACAGAAGC
AAAAAAATATAGCTCACTGCATCCCTCTTTATTGTATCGCAGGATTATCT
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TGTTGAGAACTATCTCTGGGTTTGACCATTTTATTTCAAACCCATATTTC
TGCCACAAAGGAAGGGGACATGCTGCGTCCCCAGTACGATGAAGACAAAT
TTGAGGTAACTGTCATTGTATGTCCTCTTTTTTGCCTTAATAGTATCTAT
CCTTGCAACCTTTGGTATAAACTCATAGCTCAGGGAAAACAGCTCTTATG
AAGTAGGCTTAGACTTTATTACAAAGTCCAGTTCTTGTGGGGCTTTCTTT
TTAGAAAAAGATCGATGATGATATCCAGTGTTCCTTACTCTTTGTGAAAT
CAAATGTATTTTCGCGGTTAAATGATGAAGCAATATGCTTCAAACTGAAT
CTGATAGTCTATTACCATAACGCTTTATTCATAATGGGTACTTGAGACAT
ATTTTTACAGTTAGTTCTAAATATTTATTTATCAAGGATTAATATATTAT
ATACAAATTTATTTGACGTCTGATTTTTTTTTTTTAAATTGGATGATAAA
ATACTTCCCTTTTTTGCAGCACCCCTGAAACGGTCAGGGGCCCCCTGTGT
AGTACCGCAGTACCACTTTGAGAAATGCTGTATTAGAGAATAAATGTTAT
TTACTTGGTTAGACCATCTTGCAGCTATGAATGTTTTGTTACTCTTCTTA
AAGGAAATCTATCTTTCCTTGGTAATTGAATGAAATGAACGAATAATCTT
AACTTTTTATATTTTTATAGATTCATGTGTAAATATTACAATAATATAAT
TGATATCGAATCAATCTCTTTTAACTCACCCAATAATAATAAACCTACCT
ACTTAAGCAATATAATGAGTTTTTAATAGATGATAATAATAACCACTAAC
TGTATATAATATCCATCTTTTTTTATCTTACACCTAAGCACACAGGCTTT
TAAATATAATTATCAATAATTAATATTTAAGAAAAATAAAAAAACAATTT
TGTACCCTACAGATTTGTTGATTATATGAAGTTAATTTCATGGTAAGTTA
ATTGTAAACTCCATCGTCAATAGACAAGATTTACATTGAAGGATACACCA
TTTCTATTGTATAACAGTTCAAGTTAGAATTTGAATATATTTTATCATTT
TAATGAATCAAACAAAGTTTCGCAATTGGGGATTCATAATAATATCAACT
CTGACTTCCTTCAATCAAAAAGGATGTTTCATTTAAGGAATCAAGACATT
TCATTATGTGACAATGAGATACAGCTTGAGTATTTAGTGAGTTGATACAA
TTTTACTAAATTCAGTTCTTCGGCAGAAATTCTTTCTAATTGTTGTTACA
GAGTATTAAAAAAGTAACATTGATTCAACTTAAAGGCCATCTAGCGAGTA
AAAAATAATGCATGGATGTTTATAAATATATCATATATATATTTTTGATC
TTCGAAATAATTTTGTAGTCATACTAATGAAATCTCGATAGTAGGTATCC
ATTGAATATAGGATCGAGCTTGTATACAGGGTGCACTGCATATAATACTC
CTTATATATATATATTTGATTTATGAAATAACAATGTAGTCACGTCAAAA
AAAAAATGCAAGCGTTTTGCACGTAGCATCGATTCCTTTTCATAATTTGA
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AGATCTAAAATTAATGCCTTCAGATCTGATGCCACAGAAAAATATTAAAT
TGGTGAGACTTTTCCAAATCCGGTAATTATAACCGTATATATTTCGGAAA
GTAAGGCATTTTTAATACCTTCGCAGAATCGCAAATTACTAATTATTTAA
TCAATGAATCATCTACAACGATAAAGTAACATCTATTCTCTATAAAGTTT
CAAATATGTAACATAATTATGAAAAAAAAAAAATCTGAAATATATAACTT
CTTTTTTTGCGTTTTAGAAAAAGGAAATTAGGCATTTGCATCCTGTATTA
TAGAAAAGGGAAAAAAGGATTAAACAGGACTGGACAGGTGGAGTTTAATA
AAGTCCATTTTAAGGACTGATACAATCCTTACTAACTGTCACGGATGTTA
TCTCTTTTTGATTGATAGGTTACGAGACATAATTAAAATGTGTACGTGTT
TTATGTTAGTATGATGATGTCGTAACATTTCTTAAAAATGGCTAAAACTT
AATACCCATTTGGAATACTTGCATCAAGAATTTTTTTAGAGCTAGTTAGT
GAAATATTTATAACAAATTAATTTTTAATTGTATATTCCCAATGTATAAT
TTCTACCATACGACGTTGTTAGTAACGACGTCGTTTTAGCGATTGTAGCT
ACCATAAAAGACCGATAAGGATATGTCATAGGAGATACAAATTTTATTTG
GACTGTAGTCTTCTTAGATTTTTAGACCGATCGAATGTTTTAATGGTCCT
TATTTATCAGGTCTTGTCCAGTCCAGTCGTAGGACAGGTGGAGTTTTACT
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TGCGACTGAACTAGACGGGATTGCAAGGAGCAGTCCTTAATTAGAAACGA
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CACAAAAAAGTTCAATATTTCGGAAAAAAAATCAATTATTTAATATTTTG
TAAAAAAAATCAAAAATCTATAGCTGTTCACAAAAAATAAATTTTTTCTA
TTGTTGCATAATTTGCCTGAGAGAAATAATTGAAATCTTAAAAAAAAAAA
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