EMLSAT00000003651, EMLSAT00000003651-699498 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003651
Unique NameEMLSAT00000003651-699498
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s199supercontigLSalAtl2s199:289252..321784 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003651 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003651EMLSAG00000003651-686417Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000015881EMLSAE00000015881-724809Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000015882EMLSAE00000015882-724810Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000015883EMLSAE00000015883-724811Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000015884EMLSAE00000015884-724812Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000015885EMLSAE00000015885-724813Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000015886EMLSAE00000015886-724814Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000015887EMLSAE00000015887-724815Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775901auto775901Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003651EMLSAP00000003651Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003651

>EMLSAP00000003651 ID=EMLSAP00000003651|Name=EMLSAP00000003651|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=379bp
MRSRVNVVAWWKEDTLSSTSPVEVHSGGRYLLTSLGDLHIRDVSSADGHM
KYKCQIRDIVTGRTQYSSSGHVIVTEPQGDVLKQPEIPDSMFIVQQGEAL
DLPCVAQGFPVPSFLWMKVNPESGREEVLTATPTLFPRHSVLSLVGARNH
NAGRYICQIENRSGRYKVEHIVEVVSPLHVSMSPQHLVVDHGQTALFNCS
VSGFPIANLIWLKGGDPLDTSSNPRIKSSGNSLYISNVSRKDRDSYQCVA
SNENDVAQGTAELVLGAVPPEFHSIFNEQTLRPGPKVSLKCVASGNPPPE
ISWFLDDEHLSVAVNQRKDSSYRHLRDRLVIGQYLSPSGLVISHLNISDV
QSEDGGYYKCRAQNAVGFIEHQSSLNIYG
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mRNA from alignment at LSalAtl2s199:289252..321784+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003651-699498 ID=EMLSAT00000003651-699498|Name=EMLSAT00000003651|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32533bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s199:289252..321784+ (Lepeophtheirus salmonis)
AATAGAGTTGTTGTATTTTTATCATGTATCTGTACATTCAGCTCCTTCTA ACATCCTTTTTATGTAGTACATTGTATTCTATTATCATGTATAAATATAA GTTGAAATTAAAGTTCCTTTTGTCTCTTTTTTTCCATGCTGCAGTGCTCT CGCTCCCCTATAATGTTCAAGTTTACAACGTGTTTGTTCTACGTGGCAAT GTGGCGGTACTTCGATGTTCTGTTTCAGAGCCTATGAGATCACGTGTGAA TGTTGTGGCGTGGTGGAAGGAGGACACACTTTCTTCTACATCACCTGTCG AAGTTCACTCTGGTGGAAGGTAATTATTCAGTTGTACATTTCCCATCTAA TTTAGTGTCTTCTTGAATCCGCCCTAGGACTGCCCTTTTAACCAGTCTTT TCTCTCTCCCCCCCTTTTTTTTTTAGACTTTTTTTTCCCTAGATTCTACA AATCTTTTCCTCTCATTCAAGAGCCATAGGATTTATTAGTCGGTCCTAAC ACGGAGGAATGAATAGACAGCTGCAAAATAAATTTAAAATCTAATTATGA TTCATGCCTTATAACTGCATTGATTACACTTCAACAGCTAAAATACTAAA ATACCATCAAAGATCGGTTCTAGGACTGATAAAATTACTCAGGAATGAAC TATTATCCCTGTAGTCTTAATGGTTGATTTTGGGTTTTTTTTACTGATCC AACAACCTAAGCTGTGCTGGTATTTGTCCAGTGGTAAAAAGTAATATTTT ACTATATCTAACCCGTTAACACGGATGCTAGCTCTATAATGATTTTGCTC AAAAATATGTCTGCATAAAATTTGTATTCTTTCATGGCCTATCGGCAAAT TCTATCAAAAACTTGTTCTAAATAATTCAAGGCTCATCCTGTAGTTCTGA AGGGCAAATGATTATTGCAGGTAAGAGAGGGAAACTAATTTTGGGTAAGG TTTTTTCTTCCCTTTAAAAGAANNNNATAAATAAATGAGCTTGGATTATA TTTGTACTATACCAACATGCTGTACTGATTAATTAATAGTACCACAAAAT AGCAATGAAATCAGCAAAAAAAAATTCTAGACTGAAAGTTTTGGACATTG ATAGGCTTTATTTAGAAGGCCATAATGTGTCAGATAAAGTATTAAAAATC AATTATAGGTTCTAAACTATAGTGAACATTTTTGAGTATATTAACTCCTC TCAGAAATTTGAATACAATGCCCACAATTGAACAAAATATCCCTATGAAA TATTGAGTTGTATGTACATAAATATCATCTAATAAAATAAATTGGGTATT TTTTCTACCTTCGTTGAAATTTATGTTAACTCATCACTTATTAAAAAAAA CTGCATAGTCTAGAAATTTTAACCTAGTTTTGAAAGATTTAATACAAATT TTTGTGTAGTACTACTAACCAAGAGTCGCCCAACTAAATACTCAGCTCTG GTGTTTCATGTGATTGTTTTGTCGAACAACATATTACAAAAAAATATTTT AGTAATCCAAATATTCGTATAAGGGTAGAATAACAAATTTAGCATTCAAA TGCGKCCCATAGGCTATTGTTTAGTAKCCCCTKCTCTAACGACAAGCCAT TGAATTACTTTTTTAATTATTTTCCATGACATCTACACAAACTGTTCAGC TCTATAATACTAAACTATTTAATCCCTTGCAGGTATTTACTCACATCCCT GGGCGATCTTCATATACGAGATGTCTCTTCTGCAGATGGACATATGAAAT ATAAATGTCAAATCCGTGATATTGTAACGGGTCGTACACAGTATAGTTCC TCAGGACATGTGATTGTTACAGGTAAGATAGGAAAAAAATTAATCAAAAA AGCTTTAATAAGGAAAAGGCAAGGGTGAAATAATATGAACTACGACTACA AAGGTCTAGACAAGGACCTTATATTTTGACATCTGATCTTAAGTTTGAGT TCAAGATCAAATTATATTTTGTCGAATTGAGGTCATTTTTTTTTGTCCTT AATGTCTTTTACAAAATATGTAAATGTTCAAATGATAATTTTTATTTATT TTGGAGATATTTAAATTAAAATTAAAATTAAATACAGTTTCATATATATA ATAAATTTCAAATAAACCATGTGTAAAAATAAGATAAAATAAATTTTAGT AATTACGATAGGCTAAGTTACGCATTGTCGTATATTTCAAATTGTCGGAC ACACAATAGTTACGTCGTAACTATTCGTCAATCCTTCAGCCAATGATATA AAAAGTACTTTTTGTATAATTTTCATACATTTATAAATAATCTTGCTAAA TTTCTAATCAATTGACTATTTAGAGCACACATTTACTGTTAAAATTCAAC AATTCCATATTTTCTAGGGCGTGACAATGTAAGAATAATTCGTCTTCAAT TTGATAATATTACAACAAACTTACTATGTTTTAATTCAAACGAAAATTTG ATTTTTTATACGTTGCATTTTGTTATGTTTTTTTTTTTTTTGTGGAATAA TCGTTGTCTTATAATATGAACCAAATAATTGACATAGTCATATTATTAAG ATTAGTCTGAAATAGTCAAATCAGACAAATTAAATGTTAATATTTTGGAT AGCAGAATAAAATAGCAATTACATTACTAAATAACCAAGAACAAATCATT CAAATAGCTGTTGGTGAGGAATAAGTGACTGAGGAACAGACTCACGGTAC AAAATATATAAATATAAATTAGAAAGAGAAACCTCACTCAACTGGGAATG AAAATTAATTCATACCTAAATTGTATATTATATTAAATGATAAATAAAAC TATAAATTAGAATATTAGAAATGAAATCTTAAATTTTATAAGCAATGAGA AATTGAATTCAGCAACAAAGGAGTGGTAAATTATTTGATCTTAAATCCTG GAGGAGCCAATGATTTTGTATTCTGATAGACATTATGAGCTATCTTGGTG CAAGTCACTTAATCCAAGCAAGTAAATGCTATAGATATCCTTGTTTATAG TTAAGTCAAACTAAATCGAAAAGAGTCTTCCAGGTTAGTGTATGAAGCCT TCTTTGAACAAAGAGGAGGACTTTGATTTTTTCTTCGCTCTTATAAAAAA TATGAAATCCTTAATTTCAAAAAGTACCAAATAATTCGGAATTCCCCTGC CTAAAAGAGTAGATCCGTTGTATTTAGAATTTTCTCCGCGTAAGAGATAT AAGTTTTATATAGATTTTGCACTCATATGTTTATTTTTTCCATATTTTTG CTATTTGATCGTGTTTTAACAAATAATAACTGATTATTTTTGATTTCCTC TAACAAAATCAGATTCATGACTGTACTATTATAATTAAAGTATAAAGGCA TTAAACAGGCATAATATATTATAAATCGACAGTATAATGAAATTGCTTGA TGATCAAAAAAGAGTGTTTCCCAATAATCCCTTTWTCTAATGCAATATCA TGCCCCCCCCCCCCTCCCTTTCCTAAAAAATGTTCATACAAATTAAAAAC AAATAGGTATTAAAAATGATTTTTTTTTAAATCCAAGGTTTTTTTTTTGC TTTTTATTTAGACATAACTTATAGAAAATCAATAAAATTAATGGAACAGC ACATTTTGAATGAAAAATAAAAATAAACAGAAGGAGAAAATCAAGTATGA TAATGACAATGATATCGTAAATTGTTTTTTTATTTCATTTTTTCCCCATT TCTTTTTTTAAATAAAAATCTTTGTGTATCTCGTGCCAAATCGATTCTTT TTTTCATGTCCTTTTTCTTATATTAGAAAACAATAATCTCAACAGAAAAA GAAAGAAGGTTGGTTGGTCTTTGCTATACATATATATGTATGTATGTATG TATAACCACAACCATAGATGCCTTCTTATCCTTTATGAGTTTTTGATATC ACAATTTACAAGACTCTACATATAAAAAGATTGGATTTAATTCCTAGGAA ATGTTGATGAGAAACGGAAGCTCATATTATTATTACTATTCTATAAAAAA ATTCAAACATTTTACTCAAAGAACCTTCAATAATAACTGTATAAAGCCCA GATTCTTCTCCCTAAAAAAAAGTCATTGGAAAACTTTATAATTTTGGAAA ATGAGAGGATGATCAAAAATAATGCTGCATATATGTTATAACATGGCTTT CTCTCGCTAACATCAATATGACTGTAAATTCAAAGCACTTTCTGTAAGTA AAAAAAGAAACCGTTAGTCAACATGTTACCCTTGACAATTTGATTTATGT TTAGAAGGAGAGATGTTTTGCTGCCATGAGGTTTTATTAGATTTGTTTCA ATAAAGGAAGGGAAAAGAAATCAGTTCTACTACTAATTTAGAAAACAACA AAACATAGGTAAGGATTGCCTATGTCACGCCTAAAAAAGGGCTTTCACTT ATAACTCTTCGTTTTATAAAGCTAACAACAGACAATTATGAGTGAAGGAT ACAAATAAGGTGGAAATTACTTCAATGTCGATACTCCATTCCACTCATAT TCTAAAACACACTTCAATTAACAACTCCCAACAGATATTCAGCGCTTTGT CCCGTTGTCTTTCATGAACAAACTTGATACTTGAATTATTTCTCCACAAA AATGGAAGAATAATGATAAATTCTTCGAAAAATAAAATAAAAAAATTCCT ATTCTGAATGACTATTACATACAACTCACACCCTAAAAAATGCTTAGAAT TACAACTTATAGCTTAAACATCAACACTGTACTGTTTGAATGCCAGATGT TGATTTGTCTTCTTATTGCTTTCCTGACATCAGTTAGACTTCAAATTAGC TCATGCTAATCAAGACTAGCCCTACAGTAGGTTATAATCACTGCTTAATA CTGGATAAATTTTTACTGCATTTTCATATAAATATAATATTTATTTTGAG CACAAGGGCAATTAACTTTGAGAAAAATGGGTCTAAGTATTATATTTGAC TAAGATACAATGGTAATATGTAATATGAAGAAAAAAAAAATCATATTATT TTTTTTAGTTATTAAAATATTATTATTTTGATCAAAATATAAGTATTTGT GGCAATATATTTATTAAAGGCAGCTGGATAATTGATAAAAAAAAAAAAAA GAACACAGCCCGACTCTATTTTCTCAAAAGTGAAATTATTTTTTGAATAA ACTTTATTGTAAAAAGAATGAACAGAAACGGGACAGGACATCTTTCCTAG CTCCAGGTTCTCTACTTACTCAAAAACTAGTCCTAGACATGAAAAGTGTG ACATAAAATATTACTTGATGTCACTCGTACTATGATAAAATGTAAACAGT GCCATGTTGATGGATGCAATATGCAGCTATTAATAATATTCATTATGTAA GCCAAATGTATGTACAAATGAGAAATTATGTCTTATACCTAAGATTTTTA TTTGTATAAAATTTGTTTTTTTTATGTTTTCATTAAAATGCCGTCCACAA AGAATCGTTTCTTGAAGAAAATGCAAAATATTTATCCGTTCTACGCTTGC GTCCATACAATGCCGTCGTTCCAATTAAACCTAATACGATATTTTTTGAA AACGGCTTCTAAAGTGAAAGCATCTAACAATGCTGTTTATGTATTTWATA ACATATACAAATATGTAACTTTTATCAGGAAATGGTATAGTTATAGAGAA GCGAATAGTTTTATACTCCAAATGCGGTCATTTACCCTTCTCCAATAGAA 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GCTAATTATGACATCATAGAACACATTATTGTAAAAAATAATCCATTTTT CCACATGTTACTTTTTCTTCCTTCATAGAATTGACCTTGTTAATTCAGTT AAAAGAGTGATTTCATGGAGGTTTTATACTTAGTTTATACTCTAGTATTC AAATATACTAGATGCCCCCCTGTGCACAAAAAGTGTTCCTACCATCACTG TCTTCTACAAATAATGATTACGTGGTCTGTGTTTCGCTAATTTGTTTTGT AGCTTTGGTAGAAACTATTTCAATTACAATTTGAAAGAAAAAAAGGTAGT AAANCTTATTTACATTAGTATAACTTTGTTACTAATAGTAGTTTGAGATC AATGACAGAACCTCTCGTATTGATCTACTTATCACAAATATAATTAATAA ATTAAAAATTATAATTGTAAGCCATTATACTAAAAAATAACCATGCATAT TTCAAAAACTCGGTTGTTATACATTACACCGGAGTTGGGCAAACTAGAAA GGTACACAGGGTTTCAACAATCCTTAAAATTAGGTTCCAGCCAACAGGGC TAGTCAATTTTTTTTTTTTGCTAGTCTAGAATATCACAAAGAAATATTTT ATTCCCTTGGATTCAAAGGGAATACCTAAACAATACTGTTTTGTTCAATC AGAAACAAGGAAATATAGTGCATTACGGAAATATATTAGTTGAAATATTT TTTTTTTTTGAGATTTCCGTGCTTAGAAATGTAAATTTTGTTGAAAAAAC AAAACACTTCTGAACTACGCTGGAAGAGAAATATAACAAATTTCGTCTTT GAAAAATATATTATAGCAAAAATTACCAATGATATTTGTGTTGAATGTCT ATTCGACGTATGAGACACTAATATATTGTGAATTTAACTCAAAATTACCT GTATATATGTGGTGTTTTGGGATCGGCATCACGTAGACAAATAGGCTAGA 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