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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s204 | supercontig | LSalAtl2s204:382800..443820 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003779 >EMLSAP00000003779 ID=EMLSAP00000003779|Name=EMLSAP00000003779|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=577bp
MKDIVWKLSNLKSVDTSRRYEGLTLLSKNIKPSADLNAFVKTLNIPDSMT ITKHLYFSPPQVTVDHPQPIPLIFRDEIHVDRVSQSSIRNRFENLQAWRI NSIIKSMNCKKTSKELFATKCETSMSGLGTPPSSASGSTAAVNSADLLLR ERKLSSSSGGTTGGASGGMKNKWVKAFKSIKGSSGKDQPTERQRTGNTSA QALLETNHIFQEYTYKKITPCDVCSQILRGHTRQGMKCKLCRLNVHPDCQ EKAAKCQPKTRLLRRQKSASELDPRIGNLVDEDIVRKIENRRSPPEIPRY DTDPNKYDSRSSAQEIVISRAPTLDYGGNNTPYRPSFSRYHPGASNTLTI SGSIKSHIPKSGLYEYYEPEAIIDPGNNNTPGTIPKNNKSLMSKSLSMDN PRSIGSSEKVFIGGSYSASTGCSSNLIDSYRGNNDTPKLANLVAGLIQSH ALMSGGIAIGAAIRPEVAAANLSHLSRYNSKKDITEEVKSPASDAKAKFR QATQALAKQRAGQMLTVIDTSDKDWWKGKCLGSIGFFPSTYIVIRISEEN YQRDGTILIRNSDNIQGHCSSQYLQEV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s204:382800..443820- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003779-699626 ID=EMLSAT00000003779-699626|Name=EMLSAT00000003779|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=61021bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s204:382800..443820- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAAGGATATTGTATGGAAATTATCCAATTTAAAAGTGGTTACATGTAA
TCATAATTATTTGATCCTCTTTTGAATATATAAGTAATGGCGTGAAACAT
GCAAATAAATGTATAAATTGAATTTTTTATATACATACATAAATAATGCA
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GAGCAGCCAGACAACCATGTGCCGCTTGGTGAAGCAAGAGGCAAACTTTA
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TGAAAATATTGCATACTTTTTATTATACATATTTGGCAGTACTAATATTT
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AAATTTCACTCCAAATTCATATGAAATCCATGAAACTAATTTAAATACAT
TTTTATATATCATTTGCTTGTTTAAAAAAAGTTATAAAAAAATTTAATCA
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TCTTTTTCAAAATTTTAGAGTCATCAATTTTTACCCACATGCATATTTTA
AGCTTGTGAGAGCTAAACATTTATAAAATAAGTTTTAAATGTATCTCTAT
AATGTATGGTGTATTTTTCATTTAACTAATTCAATATTTAGAAATTAAAT
ATAATTAAATGTAATAAATCTTTAGAAATACTTTTTTATCTTAGGAATTT
TATCATAGGTCTAAAACCCTCTAAAATCCCCGGAAAACAGATTCCGAGAG
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GAACAGTCGTTTGAGTGATTGATTAAATAAATGTTTTTGAAAGGCAACAC
GCGTACGCAAATTAAAAATGAGTATGGATACTTTGCATTATCACTTACTG
CAGTGTAAATTTTGGGCAGCTGAATCCACCTTATCCTGAATTTGATAAAG
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TATTTTTTATCTAGTAAATAGGACGTTATTACATTCATAAAAGCTACATT
AATCAGAGTATAAAAAAATATTATACATAATCTTCAGGAAAAGCTGAACA
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CATCAATTATATGAGTGGAAAAATTTGGATTATTGATGTAATGAATAGCA
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TCCTAAAATAAGATCCAAGAATCAAAATTTGTGAAAAAAAGAAAAAGCCA
TGCATTTCTTTTCTATTAAAAAATCTTTTTATATATGAGTCAAAAAAACA
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GGGAAAATTTTCACTTAAAATAGTAATATATATTCTGATACAAGGTTAGG
GGTAAGCCTTGCACTAACACTTTGGATGAATATCGTGAAAAGTTGAATGA
ATAGATATTCTTTTATTTTTCTGAAAAAATATTTTCTTTTATTTATATTA
CATAATCATTTTATACATTATGGAATTCATCTAGCAACATAGTTAAAATT
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ATAACCCTTGGCAATTATAATGAGACCTTGTAAAATATTGATTTGTGCGT
CTGCTTCGACGGTTTTAAGATCTTTTGAGCATAATAGTAAATCTTTTAGG
TCCTATTGAATAAAAATGATAGATCTATATGACAATATTTTAATCTACCA
AAAACATAATATTAGCAATCAAAGCTTTTTATTTATATACTATCAGATTT
GGGCAAAACTTACGCCTAAACATGTATACACATTACACAACTATTAATAT
GCTTTAGCAAACGGATAAAGAAAATAATTTGATTGTTACATATTTGAAAT
TGTGGTATCATGTAGGTAACAGGAGATGGGGAGATGTGGATTGAAAAGAT
GTTAATCCAATCACAGAATAAATACATAATGAATGAATGTCAAAAGAAAT
AATACTCTATAAATGTAATTTGAAAAATTTCCTATCGATTTCTTATATAT
GAAGGAAAGAAAGCTTATGTGTGTACAATGCACATGTGTTTGTCTAAAAA
CGAGGCCCGTGATAGAGACTATTATATTTCTTCTTCATAAAAAAAAAATA
AGCAATCATTTCTTTTTAACAAGGCTTCACCAACCATATAGTACACATAT
ACTCATATATATATATGTGTGTATAGCTAGGCACAAGCAATATATCATTT
AAAAAATATTTAAATATTAATCGATCTTACATTACATATTGCGTAGTATG
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ATCAATTTCTTAACACATTCATATCCTACATACCTAAAAACATATGTTTC
ATGGAGATTTTTATTTATAGATATTTCATTTCTCTGTTTCCTGTCTTTTC
TCTGTCATATACACGTATTTTTAACATATCAACATATATATTAATTTTTC
TATATAATCAACGTATTTCTATGTTTTTTTTTTGTATATTTAGAAGCTTG
GAGAATCAACTCTATAATAAAGTCAATGAATTGCAAGAAGACATCAGTTT
GAAGAGATTTGATCTACGCATCGCAAATTTACATTTAGCAGCAATTCAAT
CTCAGGTTTGTGATTTATTAGGACGTTTCAAAAATATGTTCATTTTATTT
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ATAGTCCCATGATACACTGTAAATTGTACTCCCTGATGTATATTGTAAAT
ATATTTTGATGTAAGAAATAGCCATATAGTCGCATTAGTAAAATATTGCA
GGCGTGTGTATATAGCATGGAACGTTTACACCAGGTGCACTGTATATCAA
TTCTATCAGAATATCATAAATATTTTTTTGACTTAAAAAATAACAATGTA
GTTGTATTTATGAAATATTGCCGGTGTATATATGTATTATCGAATATTTA
ACACTGTTTCTATTTACTTTTGTTATGTCCCTCCAATGTATATCATAATT
CATGAAATGAATTGAGGCACAGAGGCGTTGGGAACCCTGGGTTGATTGTT
TTTATTAGTAAACCCTCGAAAGAATAGAATACTCATCATTCATCCCATCA
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GAGAGAACGTCAAAGTATTGAGTAGTTACATTTGTTTGTGTTCATGAAAA
AAAAAAAGAGAGCAACACATATGATTAGTTGGAGAGTTATTTTCTTTATA
TAAAAACAAAAATTGTATTTTAGCCGACGCCTAATTAGTCCGGACATTGT
AGAATACTKCCCCTAGCCAGCTATAAAGGCGGGMTCACACAACGACGGGC
GAGGATAAAATTATACACAGATGCATTTCCCTCCTGTTTTAGAAAAATAA
CTAAATTCTCGACGTAGAATTTTACCTACACTCGTCATTGTGTGAAGCGT
CCTTTACGTCCCCAACATGGCGTTGCTTATTTTGTGTATTACCGAATCCC
TGATTTCCTTCTAAATAGTCTATAACATATTACAAACATACATTTGTTTA
TAAATAGAGATATGAATGCAAATATATTTATTATAGAATGCCATTAATTA
CAAAGGGGAACACTCATTTTGTACAAATGAATTCAAAACCATAAATGAAT
TTATCATTGGGTGCATACTCCAAAATTGATCTTGTTTTCCTCTCAGATTT
TATAGGAGGGATTATAGCACTTTGGGAAGAAAAAAGCATCAATGTACTTT
CTCTAAATTTTTTTTCATAGTGATCCAACTACATTTACCCCTATATTCAT
ATATAGTTGGAGCAACAACAATATGTAGCTTAAAAGCTAAATAAGAGTTC
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CATATGTTTGTATGTTTATATATATTTGGAGCACAGTGACTATATGAATA
TTTTAAAGACTACATGCCTCATACGCTTATGTACTAGTGATGTACAAGAT
CCTTAAAATATATAGTTCCAGCCTCTTTATTAGTTCCCGCCTACTTCTTG
GATGAGGTTGAAGATCCAGTTTTTTCTTGTTTGCTTTCTGCTCCTATGTG
ATACCAGGGACGAGCAGGAGGTGGTAAAGACAGGACCGTCTTTATTGTTA
AAAGCTAGTTGAACGAGCAGTGTCCTTCACCAAATAAGCAATTAATATTT
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AAGCTAGGGGTCGCTACTGGGTAGAAGGTGTTCAGGTGTTTGAGCTGGTT
CCCTCTTATCTGAAGGAAAGAGAAATTACACTAATAATGCATCATTGTTT
TTGATTTTTTTGGTACAAATTCACGGTTCACGAACTGATTCATATAGAAG
GAACGTATTATTTTCTGATTTTGAGCTACGGTTTGCAGTAAATTTTTTGA
TCTCCGTTTATAGCCATCCGAGACATCACTAAATTGCGCATACTTTATTA
TACATAATATTTATTTCAAATAATGGGTTAACACACGGCCATCCTTCGTT
TTTTTTCCCTTTCACTTTTTTGGGAGCCCATACAAAAAGTTTTTTATTTC
TTTTTCAAACTCATCATCCAACAGATGTTAATGTGTGTGGACCTTTAATT
TTTTATGATACGGTAGTATCACTTTTTTTCATCATCCTAAGTAATACAAT
GCTTATGTACATATATGGATATTCTCCATAAAGCTATCAACATAAGTTGT
TGAGGACGAAGAGAGAGAAACAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAAAACTC
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ATGATATTTTGCGATCGTTCCCTTCCCCTTCCACTTTACTTTTATTTACT
TTAATTCCAACTCAGTTTTTACGTTGATTTGCACATGATTGGAACAAAAA
GTAGTGATGGTGGACGGATTAGTGCAGGCATTCGAAGTCTTATCATGATG
CGATCCAATCATCATCATTCCCCACGACGGTCTTCATCAACATCCCATCA
GCCTCGACGGATTGTGAAGGAGTTGGAAGGAAAAGATGAGGAGACTGAAG
ACAACATTGAGTTTTATTTGAACTCCTCTCAACATGGAAAGCTCATTCAT
GCACGAAGGTTTTTCCCCTCGACTAATAAGAGCTCTATTCTAAGACAAAC
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TCTACACAGATGATAATTATTATTATCTTTGTTTTAAATACAAGCCAGAG
ATATATGTTAAATAATAAACAACTTTGTTTAATGTTTACACATGATACGC
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TAAAGTTAATGAATTTATTCATATTTTTGTACATAAAGCAAACTGACTTA
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TTCTTCTGTGCAAAGAAGAACAGCCACCAAAAAGTTTGCTACACATTACT
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TAAATCGCCCAAATTTTTGTTAAAGAAGTTTTTTTTTGGAACCTTTTAAA
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TTAGCTCATATTAGTTTACAGACAAACTATGTAGGCACTAGTATTATGCT
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ATATTATTATAATTCAAGTAGTCCAAATTCGAAACATTCCATAATAATAT
GTCAAATCTTAGTATCGCTCAAATGTACAATAAAAAACTAAATACAAACT
CTTATTTCTAATGTTTGTTGAATTTAAGTTGATGCATTTAAAAATGGAAA
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GTTTACTCTTATCCACCATTAGAACACACTAAATATTAAGGTATATACTA
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CGACATCGGAGTAATTCTTTCCTTTTCCCACTTCTCCCTTATCACAGCTG
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TTTTTAATATGACTGAAATGCCAACAGTTTTCATTATATGAATAATTCCA
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ACGGCTTTAAAAAAAAAGAATGATCAATATTATTTTTACAAAATATTATC
TATTCTTATATTTTGGAGGACCTTGTTTTTAGAAAAGGTAACTTCTTTTT
ATATTTTTATGACCATTTAAAACAAAAATAAATCATTTTCTTATCGCTAT
AGAGAGTCTGCAATAGTTTTGATTCCACTTACCAGGATTTTAGCTCTCTT
ATTGGTGATCGGATAGAACTTTAATGGAACACATTGGAAAGAAAAAAAGT
CTTCCATTTTCCAAAATGTGTTATTATTTGAACATGGCCTAAAAAGTAAG
CATATTTTATTACCAAAAACTAAATGAAGTAGTCTTTATTTTCGGGCAGC
AAGTTTCTAATCCCATCCCTGATATTGACACACACCTATAAGATTTTAGA
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GGAAATATAGTATTTATTTTGGCTTCCTTCCTTTTGTAGTTTTTTTAGTC
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AATATTATTTGAAAAATTGTTAATATATTTTTCCATAAGTAAATAAAGAA
AATGAATAGGCCTATAAAATATTTACACCCTTACCAATAAATATATGTAT
GAACGTACTTACAAGTACATATGAAATTTAAATCCTTTTACAAATAAAAT
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CAATTTCATTCAATGTCCCCTCCTTTGCCCTCTCATTATTTAAGATGATA
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GCCTGGTTATCACAGCGTTACCTCTCTAACAGAACCGTTTACGATTTATT
TTTGCTCTCAGCTGTAAATGTTGTCACTTCCTTTCCCCCTACCAGTGTTC
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TCTCTACAATTATTGTATTTTACAGCTGTATAGAATCGTTTAACAGCTAC
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AGAAACAGTAAGGGTACCTGCATGTGATACTTATAAACATACGCTGAAAA
AATAATTTTATAAATGTAATGTTTTTAAATGTAATTTTAGATCATTGTGA
GCTGTAATAAAATAATTTTTTTATCGATTTTGAGTAAAAGTCGAGCATAA
TACTAGTGCCTACATAGTTTGTCTGTAAACTAATATGAGCCAATATCATT
AATACTATTTGTTCATGCTAAGTTTATTACATTGAGATTGAATCATTTTT
GTGGTAACCCTGTCAATTTGAATAATACTTTGCAGGAGAGGGGCATAGCT
GTCTTGACTTTTTAATTAAACTTCCCAAGGGATCATTAATATAACTCTCT
GTCCTTCATGAGCACACAAACGATTGATTACTTTATACTAAAATGTTGTT
TTCTCAAGTATGAAATGATAATGAAAACAGCTTTAAAAAAACAACAACAC
TGTTTAGTTTGCCAAATACCTGTGAGTGAATTTAAAACTGTACATATGGA
TAATTTTCAACTTCTAGGCAAGGGGTGGACAAACTATGGGCTGCATGTAG
CTCGATAAAAATCTTCTATTAAGTGTTATTAATTGGATAAAGGTAAAGTT
TTCACAGTTAAATAGCTTTAAATATTCATTAATTAAACTTAGCTTTTTTA
TATTTAATAGTATAAAATTGTTCAAAGCAGCTAAATAATAAGTAATTCTA
ATGCAACCAATTAACATTAGTGTCAGTTATAATAACTTTGATTTTCTTGT
ACATATCTATTAGAGTTGTGGTCTGTAAATCCAAGAGCAATCTGAGACGG
TTTTAGTATTGACTACTTTGATCAAAATATAAAAATTGACGAAAAAATGT
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AATAAAAAAAAATAAAAAAAGGGTTATCAAACACCCTCTCATGAATAATT
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AAATGAAATGTAATTTATTAAATTTTTTTTTTACATTTTGATGATGGAGC
AATGACTAGCCTAAAGTGCAGTTGAATATTTTGATACAACATAATATAAA
TATTTTATCAAAGTATATTCAATAATACAATTGTCAAATTTTCCCCAACA
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GTTTCATGTAGATATAACCATTTGCCTTCGTTTTGGATATATGGCTTAAC
CAAACTAATCGGAATCAATAATTGAGATTGAATTCCTTCTTATGTAAGGA
TGATTTAGATAATAGCAAGCGTTGATAAATTTCTACATAACAACACTTTC
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TTGATAAATTTCTACATAACAACACTTTCCCTTTTTTYAAAGAATAACTA
GGGATGGGAATATCGTTTCAAATCAATGTCTGAGAGAATYTCAAAATAGA
TCACATTGAGAGACTACATATCTGCTGGGAGAGAACACTATAAACTATAA
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TTACGCTCACCGCAATATAAACAATATTCCCATCCCTAAGAATAACTTAA
GGCTTGACTTAAAATTTTACGTAGGCACGCTATTGTCTAATCCGAGTCCC
CTCCTTTAAAATGATACTAGAGCGTTTTCACACGACGCTAGTATTGTTGA
AGTCGGTCATCTAGAGAGCATAACCAAATTAATTTTATTAGAATAAAAAG
TCGTATTTTTCATTAAGATTAAGTAAAAAGAGAGGAACAACTGCTTTTTA
TTTTGAGGTTAAAAGTGGATCAACAGATAACAAGACCAAAAACTTTACTC
TCTATCATATTAAATTTTGTAAAGGTAATATATTTTTTTGTAATTCTCCT
ACTTTTCTCGTCTCTAAATAAATCCAAAACAAAAGTAATTCTAAAAAATT
TACATCCCTTTATCTATTAATTTGTTTAAATTCAAATATCACTTGTTTCT
TTAACATAAAACTATATCCCATACAATAGCTTGGTCTTTTTACATATAAA
AAATAATTTGATGAAGTTTTTTCTAGACTATTTAGAAATTTTATCTTATA
AATATATCAACTCTTTGCCTCTTCGAACATATAATTATTTTCAGTTAATA
ATGTAATCTGAAAATGTCAGAGACAACACGCTTTATGAAAATACTTTATG
TTTTCTGAAATGTGCAATGTATTATCAAAATACATTTCATATTCTTTAAT
TTATTATATGAACATAAATAATTTAAGAGGCCGATTGGGGACTTTTGGAG
TCACCTATGCAAATTTATTATAAATTACAGATTTTATGGCCTTGATTGTG
TTCCATTAAATATTGAAACAAATTATTACCTTTTTCGAACTTTTACTGAC
ATTTGTTATTCAATTGTGAACCAAACCATGGTATTGGTGTCCATATATAT
ATTTATACAGACTTATATCTGTCTTTTACATATAGAATTCAATAATGTTG
GATTGATTCAGCTAATTTTGGTTTGTGGGTATCTTGAATCACTTTGCTTA
ACTCAAGTTATATTTTCGTTTACTGCCCCAAGTGTGATTGCTCAAAATGT
TTAGATCCTAGCTAGAAAATTAAAGGCCCTAAGCCTTAATGCATAGTATT
TAGCTTTTTTGATAAATAATTCAAGGAAAAATCTATTTTTTTCGTCCCAA
ACTTTATTCTCAGTACAAATTTTTATTTTAAACCCAAGGATATTATTTTT
TTGTAATAATATACACAGTCATAAATGTATCTCTACTTGCAAAAAATTGT
ATAATGCCAGTACAATATTTATTATTTTGGAAAAAAAAAATATATATTTC
AATAAAATCAAATAATAAAAAGCATGACAAGGGATATAACAGCTGATATT
TTTTTAGTGATTTTTGTTTCAAATTTCCAACAACAATGAGTAAATTTAAT
TAAATTTATAAAAAAATATTTAATAAATACACAAAATATTGATAAAAAGA
GTTTAATTGAAATTGGGGAAACTCGAGATAAATTCAATCGTCCTAAAATT
TGGCGTGAAATATTATTTCATAGTATTACGAATTCCCTATTCCTTCTATA
ATGGATTTCTAAAAATCAGTAATTTTTAATGTGCCTTTATTGTTTTGATG
AAGATACACAGAGTAAGTAAATATTATAGGATAACCATTACTCCATCTGA
CCTAAGAATGTTCTTTTAATTCCATTTATTAAGTATATATCCTTCTCTAT
GAAGGAACGAGTATCCAACCTAAGCACATTGGGTTCAAGAGAATAATTTA
TGACCCAATGGTTATCCGTTGGAGCTAAGTCGTTCCAGAATACTTTTCTG
TCTTGATTTTTTCTAGATCATTCTGGACCGATATGTTTCTCTTTTCTAAA
AGAAAAGGGTGAATTTTCTTCAAATTTATTTTCTTAAGCATATGTATTTT
TTTTTTTACAATGAGATTGGTTTAGTTCGAGATTGTAACGAATTATTTCA
AATTATAACAGTTTTTCCAACATGTATAGGATTTAGAATTTCCAGACCAA
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TTATACCGGCCCTGAAAGGTAATTAATTAATTTAATCATAACCAAATTGC
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TATGTTTTGTTTTTGTAGTATATTATTTATAATTCCGTCTGACCAATGGA
GCGTTTTTGTATGACGTCATAATTAATAGACAGCACCACTCATATGTAGT
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TCCATAAAAACGTTTCATTAGAGGGGAAAACAAACCAACTTTGATTAGCC
TTCCTTATTTTACTAGGGTGGTTTCTGGATTATTAAGAACATCAACAATA
AATTTATTACTAAGGTTTAAACACTGTTTTTTAGATTATTTCTATATATT
AGGCTCAACGTTGAATATGAAGATAAATACAGCTATACATTTCCCCGATA
CCCATTTTAACGTTAAAATTGATACACAACCCATAGTATTACGCGCTTAC
GGATTCGAAGGGAAGTAATGAATTGTTAATAAATTATTTTGAGCAAACAA
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GATATGCTCACAGATACACAACTTCCTAATAATCCCCTGAGCCAAATACA
AATCCCATGAAAGTATACGATAACTAAACAATTATGCATCTTTATTGCTA
AGTAAAATTGTTCCCCTACCTATTTAGACTTTAATTTATATTTTTATGTG
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CTTACGTATTTATTCCATTGATAAGTACATTAATTAAACAGAAATATATC
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TCCGTATATTACTCAATCTGATTTGATTTCTTGATTTATTATTTGCTACA
TCAGCAAATGGTTTGTCCCATTCAACCATTGCCCTTTTTTTGCGGATCAT
TGTTCGATTTGAAATAAAGTAAGTAACATAATAATACATATTTACTTCAT
CCATCCATGGAGTAATGCCTTATAGATGATATATTTCTAAATTGAAAACT
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AAAAATCTCTGTTCCATCCATACAGTGTACCTTAACCCCTTAGGGGTTTA
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AGTAATATCGACTTTCAATTATACACTGAGTCCAAAAAGAATCTTCCCTG
ATTATGCTCTCCCACCAATCCTTAGTGTTACTCTTCGTCATTGTTGAACA
CATTCAAATGTGATTATTTAATATATAGATGTTTTTTCCTAAGTACTATA
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