EMLSAT00000003861, EMLSAT00000003861-699708 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003861
Unique NameEMLSAT00000003861-699708
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s209supercontigLSalAtl2s209:44520..69244 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003861 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003861EMLSAG00000003861-686627Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016797EMLSAE00000016797-725725Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016798EMLSAE00000016798-725726Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016799EMLSAE00000016799-725727Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016800EMLSAE00000016800-725728Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016801EMLSAE00000016801-725729Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016802EMLSAE00000016802-725730Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016803EMLSAE00000016803-725731Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016804EMLSAE00000016804-725732Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770460auto770460Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003861EMLSAP00000003861Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003861

>EMLSAP00000003861 ID=EMLSAP00000003861|Name=EMLSAP00000003861|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=496bp
MYLTLWKGMIFKYSVIWVNIVLMRVSLSEARDYTNYKLLKVEPGSSSDSL
NLLYHQLVEDVDFWTEPSTLKNELQFXVGPHQLSRVMGLLDSFNISSTVL
MENVQDLINKQINEIQDHDCSMDTNKRKKRGIFDDLFNFFSRQDEEELRV
STNEEPSFRSPRKINSFDNSFKNDVTSFFNSSMNWENYQNIDVIHNFLYE
TARKNPSIATIFSIGKSYEGRDLLVFKIGTPQPNYKPAIFIEGGIHAREW
ISPAATTYIIKEFVNNYEKNKEILDVFDFYILPILNPDGYAYTFRKDRLW
RKSRSRNGGLIGAILPGCVGVDLNRNFGYKWLAKNSLFNARGGSRLTCLE
TYAGSKPFSEPETRALSNFLLNNKDKFQGYLXIHSFGQKVIYPYSYTNVK
IKDWKELHQMGNVIANTISKYSGVDAIYDVGTSSDVQYRASGGADDYVRG
ALGIKWVFLIELPDKGRHGFLLPPHLIKQVSFSVFQGIREFAHQIA
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mRNA from alignment at LSalAtl2s209:44520..69244-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003861-699708 ID=EMLSAT00000003861-699708|Name=EMLSAT00000003861|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24725bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s209:44520..69244- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTACTTGACTCTATGGAAAGGAATGATTTTTAAATATTCTGTGATATG GGTAAATATTGTATTGATGAGGGTGAGTCTCTCAGAAGCACGGGACTACA CCAATTATAAACTTCTCAAAGTAGAGCCGGGTTCCAGCTCTGACTCTCTG AATCTCCTATATCATCAGTTGGTTGAAGGTAAGTGACTTAAAATGGAATA TGTTGAGTTTTATCTTTGACTTCATATATTAATAAAACGTTTTAAAAACA TTGATAGTGGGATAGGGGGAAATTATATGATTCCCTATTTTTCTATATAC AATAAATCACCAGGCGATAAATTTATTGACACTGCATATAAATTGCTTAG TTTTGTAAGTAAAAACTACATATCTGATTTTTTAAACTATTTGATTCGTA AAGATACGTCCAAGGTCCTTGCCTTCAAGATTATTTTAAAAAAATACATA AGATTATTTCCAATGTAAAGGTATACGGACACAAACACGAAACTTCTCCA ATGAAAACCATCACATTTGAGTCTTATTTAAGTACATACATAGTGTATTA TACATTAGTATTTTTTTATGTTATGTACAAGTTATGGTTTTTGTACAATT TGTAACTTGTATAAACAGATTGGTCAAGTTACCATTTAACAGTTCATTAC ACTTTATTTGATTAGAACATCCGTCATTATTAATTGATGGTATCATTTCA TTTTGATCCATCAAAATTACGTATTTTTGATGTATCAATAAGAACTGTAG TTGTGATTTGTGTTTTTTAGATCTTTTTTTAGGACGTCTTGTTCAGTTCT CTCTAGGTCGTGTCCAGCTCAGTCTTGCATACAAGTCCTTAAACTTATAA AGTTTGGTCTTAGATAACCTAATTCAACTTCATTTCTTKTTTTTTAAATA GTTGTAACTTAGTGACAGTCCGAAAGACTAGTCCCAAGAACTGAATGGAC CACTTCTAAAACTGAGTTTGACTAGATCAAATAAACAAAGACTAACACAA AACTAATTGTGAACATTTGAACATCATAATGTGTCATGAATAAATATAAT TAACTATAATTATCTTCAGATAAGTCAAAAATTACACCATTACTATATCA ATCATTTATCGTACAATTGGCTTATATAAGTTACAACTTGTTCAACATTG CAGCTTGTACATGACTTATATGTAAATATATTCAGTGTGTACAAGTTGAA ATGTGTCTATCAGTTACAACTTGAATAAGCCAATTGTTCCAGTTACAATT TCTTCAATTTAAAATTAATTATTGAATTACAACATTGACCATTCTTGTTC CCAACTATATAATAATAATATCATTTATTCTTGATCCATTAAGACTATAT AGCTGTTATACATTCATGAGATTTGTGGGCATTTGAACTTTATAATGTAG CACAAAATAGTTAAATACTAGTATTTTTGATTAAAATAATCAAAAATTAG ACCATTAATATGTAGATCATCCAGTGAATATTCAGTTATTGCATAATCTT CATCCCAAGTAATAGAAATCCTTCTTTTACAATTATTCATCTGATTTTAT AGTTGAAATTTGTTCAATCTGCATAAAAAAGTTACAACTTGTACCAAATC ACAACTTATACATAGTTTAGACAACATACAATGGTTATTCTTATAATTTG AAAGAACTTTTAGATAAAAATTTTTTTTGAATAATCACTAAAGGATTTCT TTTTATAATTTTTTCAAGGTCCGGTATTTGTTTTTATTGCGTACATATGC ATATATTTACATAAGTAAATTTTATTCATTCATACAAACAAACTTACACA AAAATGTTACATGAACAAATAAAAAAAAAAATATATATATATAGAAAATA TCCAAATATGTTTACAAAAGAAAACTTTGTGAAAATAGAATATGCATGCT TAGAATTAACCATATTTTTAACTGCATATTACGAGATGACTAACTGTGGT CTCTAATTATTGGTTCTAAATTTTCTCTTAAAAATTGTGGTTAAATTTGT TCGTTAATCAACGCAAAGGACTGAAAAATTTATTTGCACTTGGTTTGTAG TATATCTACGTGTGTATATTAAAATGAATGTCCTATTTTTGTTGAGTATT TTTTTTCTACCCAACAAATACATCTTCGCCTGGGGACTCTCAAAAATTGA CTTTGACAAAATTGAAGGGCCTTCAAACCATTTTGTCTTAGTAAAAACAA TTTTAATTAGAAAAAATTGAATTTTTTTGGTCGAAATTACCACTTTTTAG TATCTTGTACCATTCCAAATATGATGCTAAAAATTGTACATTTTATATTT TAAGTACTTGGCTTTGCAGTAACTAGATGGAGTATCTGGTATTTCTCAAA GTTAATAAAAACCGACAAACAGAGACAAAAAAATTGATTAAATAATATAG ATATGAACATCCCTTGTCATTTTTTACTATGTTGTACTGAGCTTAAGCTA AATGCTCTCATTGCTACATTGTTATTCCATAGATGTAGTCATGCAGTTAT AATATTTGAAGCAATGAAAGGTTATAGGGAACTTTACTGTGAATATTTTT ATAACAGGTAATTTTCCTGCGAATGTTTTTACTTCTGCTTATTTTGCTTC CTAGATTGTTTGTCACATTACATATTTGAATCCTTCTTTTATTTATACTT TTATAAATTTCTGTCAATTAGAAAAAACTGATGTCCTTTTGACTCGTACA CTTACACTAACAAAATATTTTTATGAAAATATTTAGTAAATGACTTTTTC CTATGGATTTCCTTTGTAATATATGTACGTACATATTTTGATTCTAAATT TCGTTTCTATACTACCGGGGCCAATTTGACCTAAGGGGACTAAAAAAAAG TTCTAAATGTTATAACATTAAAAGGGTTAATAGTACATTTCTGGGATCGT TAATTGTGCTAAAAATATTCATCTTGCAAAAATTATCTCCTAAAAATATG AAAATTGAGTGGAAATAAAAATGAATTGTGTTTATAAGAACTACAGAGTA AGAACTGTCTGATTAGGAATTATGAGTCTAATTCGAAAAGAACTTATTGA ATAGTGGCACCATACTCCTAGTCATGATCCTGGTTGAGGCTTGAAGAAAT GCAAGAAAATCAATTGATAAATAAAAATGAATATTTCAATAGTAAAGACT AAAGGTTAAGAGTTAGTATCTATAATATAGCACAATAAATCTCTTAGAAG CGAAATTACCAGAGATGAAAATGTATACGACAAAATTACAGGTAACAGAT ATTAAGTATTAACAACTGTTGTACGATTTCAACTTTTAAAACTGTTTGTA GTTCCTTTGGGTCAAATTGACCCAGATATGTAGTATATAAAAGTAATTTT YAATKAAAACAMGAYSGAGCCATATGACAGAGGAAAGCTGTGAGAAACAT TTACTAAGTCCATTACAATTTGGTAAATATTTCTTTATCATAATTGTAAG GACCAAAATGACCTAAGTTGATTGTGTGTAACATAAAGCCATTAAGTATA ATCTAAAACGATCAATTTTTGTTATAATTTGTTTGGCATGTTCAAATACA AAAACTAAGCAAAGGACAAACAAGTTTATAAAAATGAAAACACCTAAATA TCATTTTAAAGGTGCAAAATTACCCCAAGGTTTTAGCAAAGCATTAGTAA GCGCCGGTCAAAATTCTTGAGCAAAATCGGGAGCTCGTTTATTATTTTGA ATAACAAGTGATAGCAGAAGCGCGCTCGCCATTTTAGAAGAGCGAAAAAT CGCTTGAATTATCCTCATTTACATAAATTTATATTACTTTTTCAGTTTTC TAGCATCCAATGAGATAACATCGAATATTTTTTAAATTTGTATCTGTGGC TCTCTCCTGTAGTTCGGTTGACGAGTTTGCCTCNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCGG TTGACGAGTTTGCCTCTCATGTAGCTGTTCACTCTATGAAGACTCAGACA TTAGTTCCCTCAGAGACACTGCCATCTCCTTCGTGTGTAGAAAATAAAGT TGGAAGATAAATCCTTCTTTTTTGTAAAACGAATTTTCCCAACTGAAATA CGATTTTCMAATATTTTTATMTTGTAAATTGACATAAGATCTCAAAATCT CAAGCAAGCCTAAGTTAAAAAACTTGAGAACCCTGTGTTGTTCTACCATT ATCTATTTGATAAAACCGGATTACAAGGAAAAAAATTGAATAGGATTTTT TTTGTAACTTATATACATAAAGAGTTTTCAAGTTCAAATCTGAGCGAAAA AATGAGCGCCGCTCAATGCTTTACAATACAAGCGGGAACGGGAGCGTGCT CACAAAATTAGTAATTGAGCGGTATCCGGCTCAGGTTTTCTTGAGCGGAC TAACGTTCTTGTTATAAGTATATAAATATTACATGTCATTAATAAATTTT GTTTTTAACATTATATTGTAAATTTTCAAAATATTGAAACAAACATCTCC CCTTAAGAAAAATATTAGTTACGGCTCTATTAATAACACGTATTTCCTAC AAATATTTATGTATTGAACTAGAATTCATGTCTCATATTAAATCACTTCT ATAAATATATTTTTTTTGCAATTAATCCTGCCTTACTTCCCTGAAGTACT TATTCCCTCTAGATACTGAAATATCCTTGTGATATCTTGTACTTATCATA TTTTGAACCCACATTTACCAATTTATTATTTACTTCCTTTATTTATTTTT TAAGGAACTAATATTTTATCAGTTTTTTATATACAGAGCGTTTCCAATAA TGTAACAAATTAATTAAAGACTACACCCTCTTGAGAGCTTATTGTTGANC CATTTATTTCTTAAAAAACTTCATTAAATGAATTTTAAAATAAAACAAGA AATTAACGTGTAATATTTAAACACCAATGAAAAGGTCAAACTATAAAATA TATATTCGATTAGAAATGAGAAAAGTAGGATAATTAGAGAAATATATATG ATCCTTCCAAATAAGTACAATAGTTAATTTAGTGTCAATTCTTTATTTTT AGTCTTAATACATATTTGGGTCTTAATAAAGCTATAGTTAAGAAATATCT ATCTTGTCAGAAGTAAAAACTGAAGTACTTTAATTTATTGGTCCAATTTT GACATCTAAGCACATGGCAAAACATAACAGTTTTCTTTCATATTAATAAA AATAAGTGTTTTATTCTGCTAAAATTTGGTTGCTTCAGTCTCTAAATGTA TGAAAATGAAATTAATGAAAATATTTTATTAAGATTTTAAGGAATGTTAT ACTGTGTTCTTATCATATATCTACTTCAACTATGAATATGGGAACATAAG ATATTGCTTATGTTGTATTAGGTGCGACATCATAACTTTATTCGTCCAAA ATAAATAAAATAAAATTCATAAATCAGAAAAGCTTAATATTTGATTTATA TTAATAGTACAGATTTTAAATTTTGTTTACATAGTTTTAAAAATCCTATC AGATAGGAAACGTCCCCTTTTGTTTTTACATTGAATAAACTTTTAAAGAA GTAGTTTTCTTATACAAAAAAAATCCCACCTAATTGAGTTAAAAKTTTMT TTTTTRTTAGAACTCTTGATGATTAATTGAATAAATAATTAGTTTTTGGG GATTTATAAAATATCATAAAAATGTTGGTTTTTCCCAAATAAATAAATAA ATTTTAGTTACTTGATTTAAACAAATCGCACTTATTTATAATTCTTGCAT AATGCCTTATTTGATAGCACCAGTCAGCTCTTACATTTAGAGATCAAACA AATGCTTTTATCTTCTTATTTTATTATTCTTTGAAAATGTCCGATAATTC TGCTCATGGGTATTTTTTTTTTTTGTCATTAACTTTTTGTATAAATATTT TATTTTATTTACAGATGTTGACTTTTGGACGGAGCCTTCGACATTAAAAA ATGAATTACAATTCRTGGTTGGACCTCATCAACTCTCAAGGGTCATGGGC CTATTGGATTCTTTTAATATATCCTCAACGGTGAGCCTTAGGATAAAATT TCATGCTAGTATTAATTTTAATGATGATAATTATTATTACTCAATATGTT TATATGAATTTTGAGGCGTGAGTTTTCATAAATATTCACTTTGTACAATT GCACAATCTAATTGTAATTCAATTCTATATCGGATAGAGTATTAGTGTAA TTGTAAANTTAATTATAAATGAGTAGAAACTCCTTGAATTTGTCGAGGTT TTTTTTTATAATTATTGAGTACAACGTTGTAAATCTCAATTTTTTTTATG CTAAGAGAAACTAGAGGYATTTGCAACTTTTTTGTTTTATTCACACGTAA TTGATTTAATTCAAAAACGGCAAAATCTAACACTATATAACAACTTATAC CTGTTATTGTTTAAATTTATATCGGGATTGTACTAATCAATAGTTTTTGG CACTAAATGCAATTGAATACGACCTGACTAATACCACAACTATCTCTGAA GCAGGGGATGGCTGCAACAGGCTAACAAAATTGAGCTGGTGGTCGAAATT AAGAAAATTAGACTAAATAATATATTGTTCAGAATAACGAACTATATTTT TATAATTAGTGTTAGATAGGTTTAAAAAAAACTAAAAAAATGAAGTCCTA 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ATTGAGTTGTTTCAGATGTAATATATTATTATTTTTTTGTACATGTGGAA CAAAAAGCATTTGTTGTGTAATTTACAAAAATCTTCAATGAAATGCTATC AAGCTCTACAAATAAACTGTATGATCAATTGGAAAGTTTGAAGGTTTTAA TTTATTTGAGTATTTATTTGGGGACCATTTGCTAAAGATATGCTACATTA TACATATGTATTCAATCAAGAGGAAGAAAATTGTAATCCGGAAAGTAGTT CATAATAGCATGTAATTATTTAAAGATACATATTAATTACATAAATATTA TCCCTTGTTTTGTACATTAAGGTAATTTAAAAACGTATTAAATTAATTAT GTATATATACATATTTAATATATGCATCAATCTCAGAGTTTTAGGTCTAT TATGGATGTAGTTCAACTTAGTATAATCAGAGTACTCATTTTTCAACTTA TTAAATAGCTTATAGTAAGGTTCCCTTTTCCTAGTAGATCATGTCCGGAG CGTCCTGGGGCTTTTTAAATATACATATATATGACATATCCAGTTTTTTT GTGGCTTAAGTTAAGGAATACTCTATACCAGGGATTCTCAACTTATGGCC CGCAAAAATTATCAAATAAAGAATTAAAATTTTAAAAAATATGTACATAA AATTACAAAAAATGTTCTTTATTTTTTTGAATTGATGTATTTGATGTTGA CATAWYTAGCCTATATTGTGATTTTGAAAAATATAACAAAAACAAAAAAA AATAGGGACTGTCCAAAACGCATCTTTATTGTTTTTAAATGATTTTGGGT AGTTAATGTTCAAAAAGCTTAGATGAAACACGCAATTGAATGTTGAAAAA TACATTAAACTAAAATATGATTATTTTTGAGAAATTCTTTCATTTATTTT ATTGTATAAGTATCGAAATTGCACAAATACAATGCAAGTGAAAAGAACAA 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