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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s209 | supercontig | LSalAtl2s209:625539..633615 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003862 >EMLSAP00000003862 ID=EMLSAP00000003862|Name=EMLSAP00000003862|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=648bp
MMFSNVVEIPGIEMDLDSVLSFLRKHNLNKTEDLLKDEFKSDNKSIPKSQ
DSNHPDATTDNHDDVKDQEESDVLRSYKSDEKNPLMYSHVYRELESFVER
SVDLYKPELSQILYPVFVHMYLELVYNGHEGAAMEFIKTFGSKQESFYEE
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EDDGEGDKPKKKKLKRDAHLKRQKNDPNAPVASRMPFPDLRDTDKAEKAR
ALKESLKRITVGPECLPSVCFYSVLNSASSLTAIEITDDSSILGAGFSDA
AIKVWSLLPSKLKVLKSADELGDINRDADDVLHRMMEDNSGVVSRTLYGH
SGPVYGISFSPDKSMLLSCSEDGTIRLWICYRGHMYAVWHVKFSPQGYYF
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VRVWDCVSGNCVRLMTGHKTAVSTLAFSPDGRFLASGGRDSRVLFWDIAH
GHLLADLSNHSQTVTALAFSRDGNILAXSSTDFXLAMWXFQKLINESSLE
DVNVAHNPDVRTDSKNLLVTSYSTKTSPILHLHFTRRNLLLSVGPYCG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s209:625539..633615- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003862-699709 ID=EMLSAT00000003862-699709|Name=EMLSAT00000003862|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8077bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s209:625539..633615- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATGTTCTCAAATGTAGGTATTTAATGTTATTTTCAAACATACAAAAA
CTAGCTGAGATGAATCTTTTTAGATTAATTACTCTGATCTAGTTAACTTT
GTGGGAGGTTCTATAATCATATTTTTTAGAGTATATAATACATAGAGGTA
GATGTTCCCCTCTCATTAACGTTTTATAAGTTTTTGATTCATCCTTCTTC
TTTTTTTTTTATACATTGCTTTTGGCTATTTTCGTCATTGATAATATCTA
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GTCGTTTAGTTGTATTTAAAAAATGAACTGAACTGTCTCTTAAATAATAA
GATTTATCACTTATGGTAGGCTAGTTTTTATCATACAAGTTATAAAATTA
GATTTAGATAGTATATATCACAAATTATAATTAAAACTCAGTTAATATCA
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AGTGTACACGCACAATAGAGGTAACCCACTTTAATTGTGAATTAAAAATA
TAAAATTGGAACCATTTTAAAGCCCCGCTGGTAGCGTTACCTTTTAGTCA
GGACCGGTCTTAGGCCACAAATGGCCCTTTACTTCTAATAGGTCCCTGCT
TGATTTAAATAAAACACTAAAAATATCTGCTCATTGGCAAAAATAAGAAT
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TGATAAATACTCGTATTTTCTTTTAAAAAAAAAGGTGATTTGAAAAAAAT
AAAAGACCTTGTATTCTTATTTTAAATTAAATCAAATATTCAATAATCAT
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GGCCCCACAATAGCTAATGCCGGCCCTGTGTTTAGGCTTTAAATAATTAA
ATGATTTGTTTCCTATTATTGATACATATAAATTAGGAGGCAGAGGTGTG
ATTGCCCCCTCCTCCCTTTCATTTTGGTAAATTWCGTTTTGGTAAATTTC
GGCTTTTATAAATATTTACAAATACGAATATTTGATTTGAAATATATGAT
TACTTTACTTTAATAAATAGGATCAAAAATATCTGAAATAAGACTTTATT
TTTCATACGACAATTATATACCATAATAACTATTCATGAGATAAATTAAT
TTGTTAGTTATTGCCCAAACCCTATTGAAAGTAATAATGATGAATTACAG
ATTTTGTAATGAACATGTAAAATAATAATATTAGAAAGTAAAACGACTAT
AGAGATTAAAAAAATATTTTATCCCCATAATTAAGGAACAAAACATTTGA
AAAAAGTAATATTTTGTTGGGRTGTCTTATCYAATTAATTTAGCATARCC
GCCAATGTCTTGATATACCTTATATATATATTTAAGATGAGGATAATGCA
ATAGTTGAGTATTCCATGGATAATTGGCATTTGACAATTTAAATAAAAGA
AGAAATTGAACTTGTACAATTTTTCTATAAAATTTTTAACTTCTAAAGAC
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TTTGACACCACTCCTTCTTAGATATTTAAAGTAAGCCTCCTCACCCCTCA
GTCTCTGATCTAATTTCAACTGCCTCACAGATTTAAAAAAAATATATACT
AAAGACACTAACAAAAGGTATTTTTCTATTATTTTACTGGTTCGGCCCAC
ATTAGATCAAATGGTCTTGAACTGTCTCCAATTCCTAACGGAATTTTATA
TTCTTGCCCTATAAATTGAAATATGTATTAAACAGTGCTCAATTCGGACT
CGTGCCTTTTTTAATGGACCTGGCATGGATACTGATGACTCGAACTTGAC
TCAGAAAATATGAACTTAAGTTCTGTTGCACCAACTCAACTTTAGTTTAG
ACTTTGAGCTATATTGCATATACATTACACTACCTTAACTTTAAGCTCCA
CTTAAACTTAAATCGAGTTGTTGCAATCGAATTTTGTAATTTCAACGCAT
AATGGCGATTAAAATCATAGGGAATAAGAGACCATTGGCCCCGCACTTTA
GTATAATTTTATATATTTTATAAAAATTTTATATGGTCAAAGTTTTTGAA
GGGAAATACAATTTGTTGAAATCAGAGCCCTAAAACTATTAGGACACTGC
TTCAAATTATTTATTTGGGTCATCCTTCATGACAGTGCCATTAAATATTT
TATACCACTTGCAAATCCATTCCAGCGTCTGTTCTGTGCACCCTAAAGTT
TCATGAGAATAATCCTTGTCCATAAAAATGGACAATAACTCGTCAAAGAA
TACATATTCATTAGTCAAATTTGACAAAAATCATTCTAGCTTATTTTTAT
TTATTATCGTTCCATATTTAATTAATTAATTATTCAGCTAGTTATTCCAA
ACACCGAATTCAATGAATTCAGCAGTGTTTCCTAGTAATAACTGAATAAA
GAATATTGTTGTTTTTTCAGCTGGTTCCCCTGTTTATTTTTCCTTCTTCT
TCTTTTATTTTCTCTTTCTCTCTTTAATTTGTTCTTTTGTATCTCCATAA
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AATAACTTTACATTAAGTGGAGATCCCGGGCATCGAAATGGATTTGGACT
CTGTTCTTTCCTTTCTTCGCAAACACAACTTGAACAAAACCGAAGATCTT
CTTAAAGATGAGTTCAAGTCTGACAACAAATCCATCCCAAAGTCTCAAGA
TTCCAATCATCCAGACGCCACAACTGATAACCATGACGATGTCAAGGATC
AGGAAGAGTCGGATGTGCTCCGTTCCTATAAAAGTGACGAGAAAAATCCT
CTCATGTATTCCCATGTGAGACACGATTGACTCAGACAATTGTTAATTTT
CAACTCTGATGGTCCGTTATGATTCCTTATTTCAGGTGTATAGGGAGTTG
GAATCCTTTGTGGAACGCTCCGTGGATCTCTACAAACCAGAGTTGTCTCA
AATTCTCTATCCAGTCTTTGTTCACATGTATTTGGAACTCGTGTACAATG
GGCATGAAGGAGCTGCGATGGAGTTCATTAAAACGTTTGGGAGCAAACAA
GAGTCATTTTATGAGGAGGATGTTCAAAAACTATCTTATATGACAAAACC
TCGCCATATGAGAGGATCGGAGCTCATTGAAAACTTTCAAACGGCTCAAT
TCACTGTGAGAATGTCCAGAGATACTTACACACAACTCAGGAAAGTTGAT
ATTTTACCACGAAAATATAGTTTAAAAATATACACTTAAAATTATATTGT
TTGTCCTCATTCCTTTATTGAGCGTTTTCATGTGACGTAATCATTTTGAT
CTCGTCCATTTTGTGGGCCTTAACAGACAAGTTTGATAAAAATGAAGTAT
TTTTTTTCCATTAATATTAAGGAAAATAGTGAATTATTGAATTATGTAAA
AAATGGGACAAACAAATACAAGGACCTAAACCTTACAGTATATCAATTTT
TTCCCCCTATATTGTCTTTTCGTTTATTATATATCAGACATTTAAATGTT
TTAAAAATATGTTATTACATTGTCAAACAAACATATTTTGATTTAACCAT
ATTGTAGTTAAAAATTAACCATTAGATTAGAAATAATTGGATATTTTCTT
TAACCTTCCTAACTTTCTTGTCCCTAATCGATTAAAAAAAATTGGCCATA
TTTAGATTTTCAGTATTTTTTACTTAAATTTGATTCATATATCACCGATT
ATCATTGAGATCAAGTGGTATTCAATACAAATGTTAAGTCTTTTTTTATT
ATTCATAACACCATTTAATGAAATTTCACCTAGATGTATTAAAAATTTCT
TCATTTTATGTAGTACAAACATTAACTTTGAGCCCAGAAATTATGATTCA
ATTTATGACTATGAAATGAASAAATTTCTAATAAATCTTTATTAAACTCC
TTCAAATGACTGTATGAATAAAAAAATAAACCAATTATATTGAATAGGAC
TTGATGCCAATCATAAATAGTGATATTTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNTTATATTATATTAAAAGGATAANTAAATCTTTATTAAACTC
CTTCAAATGACTGTATGAATAAAAAAAATAAACCAATTATATTGAATAGG
ACTTGATGCCAATCATAAATAGTGATATTTGAATTATATCAAAGCAATAT
GCACTAAAAATGTCTAGATTTGTACAATTATTATTATTATTTTTTTTATC
AATGAAGTGCGATAAAAGTAGGATCATTAGAAAATATATTTTACTTTTTC
CATTGTAGTAGTCAATTCATTGTCAATGCAATGTAAATAAGATGTTACAA
CGATGTATGAACATATTTTTAGTGCATTCTAGGAGGTGATATGCAATATA
AATAGACAATTAAGGGATACATTTTTGATAGGCATTAAAGTTTAAGTTTT
GTTGGTCCCACTTTCACATTCAATAGTTCTTTATATTCCTTAATATTAAG
GAGAAAAGGGGTTTTATTGGTATAATACTTGATTGTTTAGGCCCCAACAT
AGCAAACATAAACAATCCTGACGTCACATGAAAACGCTTATTGGTTCAAA
CCAACCATAATTTTGTGACTTCGTACCTCTAGGGATTAAATGAATCGTGA
TTTTTTTTATTTCCAAAGTCTAGYATTATATTTTACATATATATACAAAC
ACAAAAACCTCGCATATATTATCAATGGGTCCATTATATAAGTTTGTGCA
ATTATTCACCAAACTAAAAACCTATTATAAGTAATATAAGTTCCCACACT
TAGAAAAAATTCAAAATTTTATCCCCATAAGCTTGAATGTTTCAAGTAAT
TGGCTAGTAGCATGAAATAAAAGAATGCGCTATTACAACGCAATGTCGGG
TTTTTTTTTCTTTTGAATATGAATCAATTAGTAAATATATATGTAATTTT
AATAACCTTTATTATTAATTATGTTTTTCTAAGGAAAACGCTTATGTTTG
TTCCTTGACATGAGTTTAAAATTATTTTATATTTAAAATTTTAGGCAACA
GAAGAAATTCATGTCTGAAAGGAAGCATAGCATACTATGGAATATCATAC
AAGAACATTTGTATCTGGATGTATATGAGGGAATTGCTCGTAATAAAAAA
CAAATTSCAGCCACGTCAGGTGGAATGGTGGGTGAAGCTAATCGGCAGGC
CAATCGACAAAAAGKATACTATGGKCTTCTTCGAGAACCAGACCTTTCTG
CCTTTACGAATACAATATTAATGAACGAACCAGATGAAGAGGACGATGGA
GAAGGTGACAAGCCAAAGAAAAAAAAGTTGAAAAGGGACGCCCATCTCAA
GAGGCAGAAAAATGATCCCAATGCACCTGTTGCCTCTCGTATGCCTTTTC
CTGACCTTAGGGATACAGACAAGGCGGAAAAAGCAAGGGCTCTAAAAGAA
AGCTTAAAGAGAATCACTGTGGGGCCAGAATGTCTTCCTTCCGTTTGTTT
TTATTCTGTTCTTAATTCAGCCTCTTCATTGACTGCAATTGAGATCACTG
ACGATTCAAGTATTTTGGGAGCTGGTTTCTCAGATGCAGCGATTAAAGTA
TGGTCTTTGCTACCTTCTAAGTTAAAAGTCCTAAAATCTGCCGATGAACT
TGGTGACATCAATCGAGATGCTGATGACGTATTGCATAGAATGATGGAAG
ACAATTCTGGAGTTGTCTCAAGGACGTTATATGGCCATTCTGGTCCTGTC
TATGGTATTTCTTTTAGTCCCGACAAATCAATGTTACTTTCTTGTTCTGA
AGACGGAACCATTCGTCTTTGGAGTTTGCAGACGTGGACATGTTTAGGTA
TGTGTTTTTGATTTTAAATTTCACTATTTTTTTAAAGATGTACGAGGTGT
GTTCAATAAGTAAGGTGACTTTTCACATTTAGTGAGTAGTGTACATTTGG
TATACTAGATTTTTTTATTCGAAACGAACGAACATATATACTGTTCCTAT
GTAACATGTTTATTTTGTTTGTGAGAGGCACAACGGTTCGAAGTATTTTG
CCTGTTCGGAGATTTTTTGCTATTGAAAAACATAGATCAAAGAATTTGAA
TCAAATTTTTTGTAAAATATGAGCTTAAATGCTCCAAAACACTTGAAATG
TTCACAATAGCATACAGTGAAACTGTTCTCATTAAACAAAAATGCTTCTA
ATTGGTGCAAACTCTTCCAAGTTGACCAGAAAGATGCCAATGCCAAGCCT
CGCTCTGAACGAGATTTTTTTCGACTACCGTGGTGTAATGCAACGTAATG
CGTAACGGTCAATAAAGAGGTCAAAAATGTGCCACTTGCCAGAAGCAATA
CGAAGAAAACAACCGGAATTGTGGAAAAACCATTCATTGCTTTTGCATCA
CGATAATTTTTCGTCTTTGCTTGTGAGAGATTTTTTGACCAAAAACAACA
CCACAATCATGCCTCAGCTGCCATTTCACAGGATTTTGCCCCTTGTGACT
TTTTCTTCTTCCCAAAACTGAAGAGACCTATTAAAGGACGGAGATTTGAA
AAGATTGAGAAGATAATGAATGCATCGCTGGAAGAATTCATGGCTATGCC
AATAAGTGATTATTAGAAGTGCTTTGAAGATTGGAAAAAGTGTATGAGCA
AGCTTGTTGTATCTGAGGGGGATTACTTTGACAGGGACAACATTGATGTA
TGAATAAATAGATATTTCCCCCTAAAAATACAAAGTTACCTTAATTTTTG
AACACACCTCGTATAGTTTATTTTTTCTCCATTTAATTCAGATATATATA
GTTTTCAATAGTTGGGACTATTTTGTCAAATTGTGGTTCAATAAAAATTT
ATTTTATTTTTGTAGTTTGTTACAGAGGTCATATGTATGCAGTTTGGCAT
GTCAAGTTCTCCCCACAAGGATATTATTTTGCATCTGCTGGACATGATAA
AACTGTTATGCTGTGGTCTACAGAGCAACATCATAGTTTACGAATTTTTG
CTGGGCACTTCTCTGATGTAGACTGTATTGCATTCCATCCTAATTGTAAT
TATATAGCATCTGGTTCAAGTGACCGAAGTGTTAGAGTATGGGACTGCGT
ATCTGGAAATTGTGTTCGCCTCATGACGGGACATAAAACTGCAGTGTCTA
CTCTCGCATTTTCGCCTGATGGACGATTCCTTGCATCTGGGGGKCGTGAC
TCACGTGTACTTTTTTGGGATATCGCTCACGGCCATCTACTCGCAGACTT
GTCCAATCACTCTCAAACAGTTACTGCTCTTGCTTTCTCACGTGATGGAA
ACATATTGGCTTYCTCTTCCACAGACTTTKGCCTAGCCATGTGGGRCTTT
CAAAAACTTATAAATGAATCTAGCTTAGAAGATGTGAATGTTGCACATAA
TCCGGATGTGCGAACGGACTCTAAAAATCTATTAGTTACCTCATACTCCA
CGAAAACCTCACCTATACTTCATTTACACTTCACTCGTCGCAATCTGCTT
TTGTCAGTCGGACCATACTGTGGATAA back to top
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