EMLSAT00000003883, EMLSAT00000003883-699730 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003883
Unique NameEMLSAT00000003883-699730
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s210supercontigLSalAtl2s210:174298..203123 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003883 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003883EMLSAG00000003883-686649Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016875EMLSAE00000016875-725803Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016876EMLSAE00000016876-725804Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016877EMLSAE00000016877-725805Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016878EMLSAE00000016878-725806Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016879EMLSAE00000016879-725807Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016880EMLSAE00000016880-725808Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016881EMLSAE00000016881-725809Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016882EMLSAE00000016882-725810Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016883EMLSAE00000016883-725811Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773865auto773865Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003883EMLSAP00000003883Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003883

>EMLSAP00000003883 ID=EMLSAP00000003883|Name=EMLSAP00000003883|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1608bp
MPSMMNLVPHQMMENYEALKSIITQWNANRLDLFELSLPNEQLEFHGVMR
FYYQSQDADDTGQKVATKCIRVSSTATTKSIIETLIEKFRPDMRMLEVPE
YALYEIHESGERRLNPEEKPLLVQLNWHKDDREGRFLLRRIDEASRMPEP
TKEDSSFKRKLSKREKKQLKKQEKMNKIKDKENSKDESVAEKLYTELPDT
SFTRSISNPEAVMRRRRQQKLEKKLQQFRSKDGGPDTGGTLKIYGEALCR
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SGTLPREYFLDDDDCPLAILMNHPSSKGTVTFHVIRKPADFQPRKRKKKL
SPDNIVINGPYPSPPEDSRLPVLVELNPDGSEMEHSFVFQLNISVTKIGS
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ITILQHGSVVRFGRGNYFRFIDPMFEERMRTSTTQINPPQNINHNNNNIS
RHTPTNDSYNSNLNHSNYVHYGPPQQQSQLFPGKHAPPPMGRDHILPAVL
EFSEDTENDFFDSITMNLDVNSVQFKLAPTYTIYMATRFRASTHYRPELI
PQERAVRLTDMLSRVAEKIFAVIRTYPRDAPILAFWMANSSECLHFLKSD
RHITAFSIEAQDILAETVHSSFKQLVIRLQADLELVMPQIFALESPDFPD
ATVGIVKVLSSAMSLLRKCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWTFNRIVVGTG
TNYCTHYWGVLLKKRIAKVEQWAEKQGLELAADCHLARIIQAAHLLMARK
NSAEDIASVSSICFKLNSLQLRTLLKRYEPGPDESPISIDMIDTIVRVAE
NTVDELTNSEGREVRLEEDFLLQLPFLLPEDGYSCDIVRGIPGGLTEFLA
PLQRMGLCVMTPQPTSSGLWTIYMDSAHVMSTASSPQRSPSQLSQIIPQG
YNNIDHRXANEPEIQIIKLSKSNSGMGLSIIAAKGVGKDKLGIYIKAVVE
GGAAYHDGRLQAGDQLIKVDGQSLIGITQEKAAEIMMHTGKVVELEVGKQ
GAIFHGLATLLSQPSPLMSRPTPTDMRMIPQSKSVPTLAGELHTYQNHKP
GPPPPSRGMVQPVLHSGGGRSSSFQNLNAHQQYVPPPSMGYRQGSIPILN
RYSNQTSSNDDQNYYQNINGYYPPPPPSTRPNHPQYPLNHPQYPISHNNR
FGSQSSLQHPPLGRSPSXPIYNDRIPEEHIHHATPRLVGTPVSSNHQPPY
ISPRPFETDSRIVHFDNAPPASTASSQSSPVRSNTTSTNRVRFQEPQTIS
EPESSPISVTENELETQLDKLRVANVEQEFRRRVNEYENEHGSSEFMENE
SYHHLHQQQQQQFDSSSKRSLLHKKQKELEDTKKAEDRILNDAQNRXVLP
PVPVVPPPASSATPPPSTSGAQRLDQLIGTGGGSNSSGGNGVLKNGRTSS
MEGGTPTKKVSFSTDKLNVEIEDNDEEDPEASFEESSSYYEEHLLSLERV
KQDPNAFINEAESLMNSSDLEARFDFDKSTGHTPSVIGAQEVYRDPRTRR
LQREQEEKAASARNPDGANLSFKEKMRLFAVEAGEDTPKEKAKISRAQRN
ISEPAIED
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mRNA from alignment at LSalAtl2s210:174298..203123-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003883-699730 ID=EMLSAT00000003883-699730|Name=EMLSAT00000003883|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28826bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s210:174298..203123- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCCCTCTATGATGAATTTAGTACCTCATCAAATGATGGAAAATTACGA GGCTCTCAAGTCCATCATCACGCAATGGAACGCGAATCGATTGGATCTCT TCGAACTCTCACTTCCCAATGAGGTCAGGATTTAAGAATTATTTTACGTT TTTATATAATATGTGCAGTTTTACGTGGAATAGATTTGAAATGAAATCAA ATGTTTTTAACTCTAAAGAGTGTGACTTGAAAAAGAAGAATTAAAAAAGG GAGGGAGAGACACAGAGAAGGAAACACAGAAAAAGACAGTGAAATAAAGG AGGGGAACAACTCGAGAGAGAGAGAAAGAAAGGAAGAGAGAGAGAGAGAG AGAGTGAGAAAAAGGACCTCACTGATTTGAGTCTTCCACTCCGGGATGGA TGAGTCAAGAGTGAGTGCTGATCCGCAACAAAAATCYTAGCCGTATTGTT TATATTTCCAAGATCCTCTAATTCACTTTTCTCTTCTTTGATTTCTCTTT TGTTACTCGATAGAATCAAGGATGATTCTTATCCAGTTACTTAATTTAAT GCTGAATACAGAATATTGGATTTCTATACTTTGACGGAATTTTCTGTCCT TTGTTTCATACAGCAAATAAAACGCTCACAATGAATAAATATTCGAGTGT CACTTAATAGTAGTGAACAAAGACAAACACTTTTGTTTTCATGTATAGGG CCAGGGGATGGGACTCAAATAACATGCCTATATTGAAATCTAAAGTATAT TTCCCCTTATAACTTTAAGTGCGATTAGTATTGACTATTTCAACATTTGT TGTTGTTTCTTCCTATTATATTATTTAAGACGTGTAGTTTTAATTATTGA TGATGAATTTGCAAAAAGGTCAAACACAGAGTCATGTAACATTAATAAAC ATATACTTATATATTTGAAAAATAACATTAAAGTCGAAGCCGATCCCCCT ACATGTTTAATTTGGCGTTCGTTCTATTTGTGTTTAATGTGTATAACTCT ATGGAATCACTGAACCTGTTTTTATAGGGCAAACAATAGTTCTTATTAAC TTGCAAAAAATTCAATATGTTATTGATTTATTTTATATATAGATTGCACA CTTATTTGAGTCTCTTACAAGCATAACAAGTTTTTTGCAGGCTATGCCAC CGCTCATGACTCTTCAAAATGCATGTTTCTCAACACTTAATCAAGATCAG AATAAGGACACTTCCTTTTCACTCTGTTGTGATAATAGTATTCCTCTTCT TATATATCATACTATTATTGGACAAATAATGATTGGTCGGTTAGTGAGAG AAGACATACAAAAATATATTCCAATCATGCAGTCACACACTGCTTCATGC CTCCCAAAGTATCATATATTTCTCACGCTATTAAATTGACCATTAAAAAA ATATTTTCTTCCTCATCCTCTCTGTCCCCCATGAAGAATATGTATGGATG ACTCAGGAGAAGACGAAGCGATTTGTAATTTTTATTTATCTGCATTTTTG ATTCATGACTTGATTTTAAATTCCTGGAATTTTTTTATCATTCATGTGAG AACAGTGACGATGAGCATTTGCTTGTAACGTAAATTATATAATATGACGA AATGATCCCCCCCCCCCTTTCCATTTCTACCATTTTAACAACTCTATTAG GACACTGAGTTTAGTAAGTAGTAGTATTTGTTATACGATACCAATATTTT TGAATCGGTTTCGGTACTATCATTTGTATCATCATTTGATATTTTTTCGA TTAAAATAATATAAGACAAAAATACCCGTTGAAGAAATGCATTTACTGGG GTGTCTGCAGTATTTTTGTTGGAGGGATAGTGCTTTTGAAATTGAAGGAG TAGTGTTGTCGCCATACCAGTAATATTTTAGTATAGATTCGTTTTAAATG 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TCGAGTAATAATTATAATTAAGAGTGCAAGTGAGGTCGAATTTTCCAATA AAAATATTTTGGGCGAGTTTGAGTATTAGAAAAGTCGATTTTCCCCCCAA AGATCCATCACTATTATTATATATACATCCTTTATCAGTCTATTGATTGG TAATGGGAAAACAGAATAAACATTTTTTTATTATCCCGTGTAAATTTTAG TCTAATTATAATAATGATTTTCCTTTGAGCCTATTTATTTACTTCTATCT GTAAGTAATTTAAGAACAAGGTTTCTTTTTGAAGTTTTATATATACTTAT GAATTCCGCTGAAAATGGAACACGTACAATATTATAATATAATTAATATG ATATGTAGAAAAAAAAGTAATTATGTTTTATATAATATTATGTAAATATG TTAGAAAATAGAGAAGTCAAGGAAGAAGATCTGACTCTTACTGAGATATT ACTATTTCTCCATTATTATTTAAATGGAAATTATTATAGATTACTTAAGT CAATTATAACAATTCTGCCACGGCTGAAAAGTGGAAAAGCAGCACTTTAT TTGAATGCAATTTTCATCCAATACGATCACGGAAAAGATGGAAGAGGGAC AATTACAATAAAATGGTTTCCCTGCTCACAATATCAATGTGACCCATTGC TTTCTTAGCGATCACATGTCATTTTTGGAAAATATTATTGGTTACCATTT TCACCTGGTACCACCCCATTGGACAGCTGTTTTTATGTGCATGTTGAGAG TAAGTCCTTCTGCACAAGTCACTCACTCCAACATCAATGCTCTGAGTGTC CCAGTCAATACAGTGGGGGGGGGGGGGGGGAGGAGAGATAGTTAAGCCAT GGAATTCTAGACAAATTTGAATTATCACGCAAGCAGCTTAGGTTATTTTT CTTCCTTTCCCTTCATGTGGGAATATAAATTATGCGTGATTATTCCACGT 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TATAAGAAGATAAAATAAACTATGTAGTTTGTACCCCACACTCTCCAGAT TCTTCTTGCAATGCATACTATTTAATTTGATTACGCTAATAATGATTATG ATAATATATACACAATAGAGAGCTCATATCCCTTACATATTACAGTCGCT ATGTACGACGTACGTACATAATATTTGGCAATTCGTGTATCTGTCAGTTA TTCATATAACTTAAATATGACTTTGTCTGTGTCAATTTTTTTTTTTTTGT TATGATAAAACATATAATATGTAATAATATGAAGTTATATCAGTCCAACA ACGCAACTTTACTACACAATTATTTGTCAAGAGGGCGGAATGGGATGAAC TTTTTCTTGAACCTCATTTTTTTTATACATATATTTCTTAAATGTTAAAA GTTATAATTTGGCCTCATTAATAATTAGGCTAATGTATTTTCCTTCAATG AACATTAGATAATTTGATTTCCTTTAGATTTTTTGAAATGTTAGGAGGAA TATAGTCCAAAAAACTTATTTTGCGCAAAAAATTAAGAAATATAATGTTT AAGCCACATTGATCAATGTTTAGAGATTGCGCCCGAGTTTTTAAATTTAA TAAAAATAAAACCTAAAAAATAGTCCATAAATGTCAAAATATAGCAATTT GTAAGACATATTTGATCTATTTTAGATCAATTAACAACCTTTCATACAGT AGTTCCCTCAAAGGATTATTTATTATTAAAAATGACCAATAAAGTTTTTT TGTACAGCGTATGACGTGTAATTTTTGCTATCCCCCCCCCGCTCAAAATG AGGTTATTTGGAAACTTCAAGGATGATGCGCGCAACCTCTAAACAATCAT CCATATGGCTCAAACCTTACATTTTTTCATTAGTTTTAGGAAAAGAAACA TTGACCTTTGCCCCCTCAGAAATAAAATCAGATTTAAGAACCAGTTCAGT 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