EMLSAT00000003937, EMLSAT00000003937-699784 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003937
Unique NameEMLSAT00000003937-699784
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s211supercontigLSalAtl2s211:530522..541752 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003937 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003937EMLSAG00000003937-686703Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000017066EMLSAE00000017066-725994Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017067EMLSAE00000017067-725995Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778414auto778414Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003937EMLSAP00000003937Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003937

>EMLSAP00000003937 ID=EMLSAP00000003937|Name=EMLSAP00000003937|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=68bp
MSDLEVKTIGSHQCTKEGITTTTDGSTSPVLTTTPHFQTLNFIEDLVYYR
GILTTFLPFFKTDAQARS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s211:530522..541752-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003937-699784 ID=EMLSAT00000003937-699784|Name=EMLSAT00000003937|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11231bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s211:530522..541752- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTGATTTAGAAGTAAAAACTATAGGATCCCATCAATGCACAAAGGA AGGAATCACAACAACAACGGATGGGTCAACTTCTCCTGTATTGACAACAA CCCCACGTATATAACATTTAATTCATATATACATAGGTACATATTTTATT CATAAATGAATTTACAGAGGGCTGCAGAGATAGATGGAAACACTTTTCCT TCCTTTGTGGTAGAAGAAAAAAAAACTCGCTTCAACTGTATTTAATGTTT GAATAATACAAAATATATAATGCTCTCATTTGATATAAATAGCAACTTAG ATTTAACCTTTCTTTTTCGTCTCAATTACTCTTGAATAGGTAAGTATATC TATGTAATTGAATGGTTTTACTTATTTACATTTTAAATTTATATTAATTA AAAAATGATTTTACTTTTTTGCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGTCATT TTGATTTATTTTGAACTAACAATTGATTCTCGTTTCTCAAATGTTCAATA TAGAATCAATATTGTTTTTTATTTTTTTCTTCTTTTGTCGAAGCTTCAAA ATAAGATTTAAAAAAATAGGAGGCAAGGCTATTTATTAGTTTAGATGTTA GTAAGGTACACAGTACACATTTTGTCTTTTCGTTTATTTCAAAGTCAATT ACATATTCTTAATTTATCTCTCTCGCTCTTTGAAATACAAATTTTGATAG GCTAGAATTGATATTTTAATATATTATATAGCATAAATATACATCAAAGT TTAAGTTTTGTATTATGGAGTAGAATATAATGTATTATAAATATAAAACT AAGAGACTTACATTGAAAGTAAATAAAAACACTAAATTAAAATCAAAACA TAACAGTGAAGAGATATCCTGATCGGAGCTGCAGCCCGATATTCTACCTT CTTCGTTAGGATTCCAAGGACGTATTAGTTTTTCTGGAACTATGCTGTGG GCATATTACACTACTACTACTCATTGTTAGATAAAAACTTAAATTCTTGC ACCATTTAATGCACAATTATAAGAAATTTAAAAGCTCTTCCGGATCTTCA GAATAATTATTATTTAATCCTTTTTATTTACATATTATGTAACGATTACT CATTCTTTTTTATAAAATATTTAGCTATTTTTCGGCTTTGTTTTGTTTAT TTATTTACTGTCGAATTTTATAGAAGGAACGTTCTATAGAAAATGGATTG TTTAGTAACATCCCATACCAGGTGTAGAAAAACTAATAGTACCTTCTAAA AATACAGTATTGAATAATTATTAAATCTTAATGTTCCGACTATTTTTGAA TAGCTTAGATTCTAAGCCATTGATTGATGTACATCTCATAAAATAAAGTT TTATATATGTCGTAATGGAGGGAAAAAGAGCCATCATAGGCAATTTAATC CACGTCGGGAGGACCACCTCGGAAATCAGGACGACCTTTAACATCAGCTA TTCCACATTCTGTCAGGGTCATAAATCTTTTGGCGGATCGGGACAACCTT AAGGATAAACCCAAGAGTGGAAAACCTACCAAAGTGAACCCTGAAGACAT CATGGAGGTCTTTAAGGTCAATCCAACGATGAATAATTCATAGTTATACA AGAAGAAGAAGTGCATCGGTCTACTGTGGGCAAAGCCATCCGAAAGGCTG GAGRAACATAGCTTTGAAGAATTGAGAAGCCACTCTTGTTCCAATGTCAA AAAGAATTCCGTCTTCAGCCATGTCAACAACTCTTTAATGATCTGAAGCA CAACAGCAACCGCAAATTTTTTTTTCTCTGCTCAAAAAGCAAAATGACAA CATAATCAGGACAGTCACCAAGACCAAGCCTCCGGACTGATGTTGGGAGT TGGGGCATCAACTGGAGAAAAAATGCTTCTAATTTGGTTCCTAATGGATA CCTGTTACCCGCGGCCGACTACAAGATGGKGAAGGAAATGTAGTCCCATA GATCACCAAGACGTATTCAAAAAACTATATATTATCCAAAAAGGTCATGT ACGTATTTCAAAAGGTCGGGGCTCCGGCCTATGCTGCTAATATTGTACAA GAGTGGATGGGKAGCACCATTAACTTCTGGTCCAAGAACCTTTGGTCCCC TCAAAGCCTAGATTGGAATATACTGGATTACTTCATTTGGTGACAAATTG AGAAGAAGGCCTGCAAAGTGTGCCATCCGAATATTGATGTCCTGAAGATC TCCGATAACCAACAGTGGAGGATCATGAAAATTGACTACGTTACCAATCT ATACAAGGGGTTCCGGAAGCGGCTGGRGGCTTTCATTGAGGCTTATGGTG GCCAGATTCATAATAAATATGCATTGTTATAGTAAAAAATAAACATTTTT TATGTACAACATCATCCTGATTAATTATGAGTAGTTTAATGACCACTTAG AGACAGGCCTCATTATTTTTTTCTACACCCGGTAAGCAATTTTTCAAGAT ATTTGAATCTGGTAAAGGGAATTAATTTGAATTTAGAATATTTATTTATG TACTTTTTTTTTATATGTAACTTCACCGAATAAATAGAGTCATAAAAAAA AGTAATAAAATTATAAGACTATAGAATGATACTAAGTCATACTATCTTCC ATAAAAATATATATAATTCTATGAACAACAATTCTTTTTTGGGAAGCCAA GGATGTAAGATTATTTATCTCTTCTGTTGCTTTATGCAATGTATCAGTCC CTACTCCCAGGCTTATATTGCTCTTTATGATTTGTTTTCCAACATTACCT CTGATTTTTGAGTATTTCTTCTAGTGGTCAAAATCGATAAAATAACACAT TGAGATTAAAAGAACATAACAGGACATTATAAAACTTATAGAAGCATCTA TATCTGGGATATTTCACAGACGTATATAGACTGACTATAGTATATATAAT AATTTACCTCTCAAAATTTTATAAAATACACCTTGTAAAACAGGGTACTA ATCATTATTTATCCATTTAAAAGTACCATGTCCGTTCACTTTCCTACTTT CTKCTAGTGCTCYACCAAATGCCCATTCCGAAAATTGCCAATTGATATTC ATTACTAATGATTTATGAAGTACTTTTGTGTTCTGGTAATCATCTAGCAT ATTTGCAAGAGTAAAAATTGGTACGGATAACAGTTTTCCAGCAATAACTT TAAAAATCAGATTTATCTTTTCTTGATGTCTCCAGGAGCTGACAAAGACA TAAAGATAGATACCCCTCCTCCYCCCYCCCCCCCCCCCCCNNCCCCCAWT TWAAAAAATAAATGTCACGGAGTCCAGTTAAACAGTTCAATAATACAAGA ATGGATTAAGGAATAAATGCGTGCACACACACTCCTACGTTAATCCTGTC ACAAATTGGAATATGGAGAATGTAATGAACATGATATTTAGKATTGACAK ATATTGATGAATCTTTCTGAAAAATAAATTGGTGTTATTGGCACTAAATA AATATACAGATTTATCTTGTCGCTTATTACACCTTAAACTAGATTTAATA AATAATTAAAATCATTCGTTTAATATTTTATGTTTTAGACAATCAAACAA TAATTTAAAATCACTACGTCAAATATTAATTAATTGATTTGGCTTTGAGG CAAATGACAGTGTACAGATATTTCCCTTAAAAAAAAGTTTGTGTTGATGA TTAATAATCCCTTAATTTTATTTGGTTGAAATAAAGAAAGGTTTTATTTA TTTTTCGTTTTATTAAAAAGATTTGTTTTTAAGAAATCAAATTCGGATAG AATATTGTTCCAGTTTTTTTATGTTGCTATTTCTGTGTTATGAAAGTAAA CCATTAAAATTTTGTAAAATTAGAAGAAAAATATAATAGATCAAAGATTT ATAACCTAGATATACTGGGTTCATATTTTAAAAACTGAATTCTAACAATG ACAAAGATTTTTTTTTTTTTTTTGATTTACAAATATACTTTGCAATAATT ATAAATGAGATATTGGTCTTTATTACTAGGATTATCTAAACATCAGATAA TGTTCATAATTGAATATTTAAAAAAAAATCAAGAATTAAATAGATAATGA AACAAAAATCTAAAAAATATGACTTAATTAAAAAACTTTAATTAAATAGG TATGTTCGTTCTAGGGAAATTGTCCCAGGCAAAACACAAAAACATAAAAT TTTATAAAAATATGTATTGCGAAAAATGTGTCGGAAAAAAAAAGACGGGA TATGTTTTGATATTTTTAAAGACGAATATACATTTGTTTCTTACTCATTC TTTTCTACCAAAACCCTCTTTGAATAAAATTTTCTCCTTTTTTTCTAAAA ATTATTTCTCCAGAGTGTAGTATTTTTAATCAATCACTGAGAGTTCCTTT TTGTAATTTGGATTCAAATGGGAATCTGTTCGAAAAAACAAATGTCTGGG ATTTCAAATAAAATCATGTATTATTTATATTCAATAACTCTTTTTTTAAT AGCATTGCTTTTTCAATAAACATACTTTGGGTACTTCAAAGTCCCTAGAT AGCCTCCAAACCATTCCACAAGGACGTATTATTTTTTAGAAGCCCATATT CGTTTGTTAGAATATATATAACGAAAAATGAATACTTTAACAAATTTAAA AAAAAAGAAAATTTGAAGCTGAGTAGGCTTTGGAACAAAATAACAATTGA GACACAGCTTAGTTTTTTTTAATTCTACTCTTTTTTTAAGAATCCAAAAT ATAATGGCGTTTCTTGTCTTCTATATGAACCTGAGAATGGAATAAAGATG AGATTGTTTTTCTTTTTTGAAAGTTAAATATTAAAATGAATGTTAACCAT CCTTCTTTATTTTCAACCACACGCTATTCAAAAGGGCGTAAAAATATTGC AATTAGAAGCTAAATATTATAAATGAGGCCTTTTAATGATAAAAGTAAAT TTAACTCATATATTTTCAAAAAAATAAATGGTCTTTAAGACCAAAATTTG TTTATTATAGATCAATTCAATAATTTCCTAGGTTTAGTTATAAGTAATTA CGTAAGTTCATAGCAAACTAAAAAATAGGTTTTTCGGTGACAAGATGACA CATCCGTCAATTTTCCGTGGGGGAATTTTTATAGTTTTATTATGTTTTAT TTTAAACATATTCTACTACAACAAAATCTAGACATGCTGAAAATGTCAAT TGGATAAGAAAAAATGCAATGTCATGCTTTATTTTTCTTCTATGTTTTCT CTATGTATTTTATGTTCTTTTTTTGAGCTAATGCTTGAGATGACATGATC AGTTCGTATTAAGAGATGATAGCGCTAATTAGTGACTAGGTTAAAAAAAA AAAGTACATTATTTAGAATTGTTTATTTTAATTATTATATTGTACTTAGA TTGCATTAAAATACTCTAGTTTAGTTATCAGTCACTTGCTATGTTCCAAG AATTTTAAAAATTAGACTTTTGGTGATGATATTACGCAGCAGTCAATTTT TCTTCGGACGTTTTTCCTCCTCAGACAATTTTACTTTAGCCAATTTTCCT AATTCTAGTTTTGACTTATGAACTAAAATAAAAAACTTTGTCCCTCTAAT GTTTTCTTGTATAAAGCTTTATGTCCATCGGCATTTTTTATCTCATTTCG AAAAATAGGGGGTCCTGATATTTTGTCTACAATAGATACCAATGTAAAGT ATAAAATTTACAATGATCAAATCCTCAGAAANGATCTAGTTTAGTAGTAA 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GTAAAAATCTTCAAGTTATAACGTTGTTTTTTTAAATGTCATAGTACCGG GCAATCCTCTTCAACATAGAAACGTATCGAATTATCTATTTATTGTCTAA ATAAAAACAAAGAAAATAATTAATGATGGCTAGAACAACTTCTACTTGAC TTTTGTTCGTTTTWGCCACACGCCTTCTAGGATTGACTAAATTAATCAGG ACCAGACTAAAAGGACTTGAGTTATGTTAGTTTTTTTATACCAATTCAAT GCTATTACTAGTTAATTGCATTCCTTTTTAAGAAAAGTCTTARGACACTA TCATCTTACTGACATGATCATAAAAAACACTATTCCTGATCCTCTTCCCT TGTTTATCTATCTATGTAATTATATATAACTTTCATATATTGTTAATGTA ATTTAAACAAATTAAATGTTTCTTGAAGAGATGCAATCATATATATTATT GTACAAATGATACACTGAAGGCAAATTACAAATAATTATATATATTATGT ACACAGAACACAGAAATAAATCTGCATTGTATCTACTTACATAACTTAAA AAACAAGTCTCAAGCATTCCTACGGTCACGTTAATAATGTAATTACTGCA CTCTGTTCAGTTATTGAGTTATACCGAGTGGGGACCCCAAAACTTGGAGT ATACATTAATTACGATTTATTCCCTTTATTTATAATTACTAGTTTTTGAT AAGAAACGCNCCCTCCAATACAGCCAAGAAGAATCAAAACTTTTGCAGCA ACAATATGGATGACTTCTGGCCTAACTCAATTTGGCCCTCCTTCAGCCCT TTGCACTTTGAGGTGTTTTGTAGAATAATGTCTCCCACAGCTATAATTGA AATTTCGAATCGCTCCAAGCAGCAATCATAAACGCGTTGTACACCATTTA TATTGAATAAAAATTATAGCTAAATATAGTATTTAAATTTTAAACATATC 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TGTAAAGCAATTAATTGTTCCTAGTATAAGAGGTACTTAACTCACATTAT ATAATGCAATCAGAAAAAAGGAAGGAATGAAAAAAAAATATGGTTGTTTA TTTTGGTAGCCAGGGAATGCTTAATACACATAATGTGGACTCTCACTTAG ATGAATGAATGATTATGTTATGAGCTACTCCTTACCATCCATGGTCATTA TATTATATAAAAAATCCAAGGTTGGATTGATTTATTAGCATGGGTCTCAT GTTTTTCTTCTATAAAAATTGTTTTCTTTTTTTTCGAGGGTCATCATGCT AACATGGCTAAAACTGCATCAAATTGATGAATCCGTACTTAATAACTCAA ACAAGTCCGCCTTCTCGATCAAGTAAAACATTCACTAACAAAGGCTAACA CAAGAAGCAAACCAAACAAACCAAATGTGACGAAACAAAACAAATGCTCC CAGGGGGAACGGCTACCCTTTAACTATTTGTAAAATATCAGATGTTAAAA TATTTCGAAATCAGAAAATATCTAGTAGGGCTGGGCAAATTAAAAACATA TATTATCCGTCAGGTGGTGTTAACTAGTTCTTTAAAAAAAATGATACATG AATACAACAATATTTTATATAAAAGAACATTTTAGTTCTAATAGTTGTAG TATTTTGCTGCGAGACAGTACCACTCTCTGCTGCTTTGTCTACAAGCTAA TATAGCTATAACACAACGCGCATTCCCTATTTCTATTAAATGTTTTGTTC CTCTAAATTTTCCTTTTGATTATGAAAGTCGATATTACAAGTGAACCAAA AATATGACCGTAAATCAAAATGTTTGGGAGAGGAAAAAAAAAATAGACAT TCAGCCTCATTTTCAAGGATTCTCTCTGAAATGAATTGTTAATTATAAGC ATTGGCAACCATGGATCTTTCTTTCAAAAACTTTCATTACTGAGTAAGTG GATATTTGTATTTATTCATTATTACCATTCTTATTTTTTTCATTTTCCTG GCAAAGAGTCAAACAAAAAGATAACAAATAATGATTTACAACTTATCAGC TGAAACACAAAGATATTGCATTAACTTAATGATGCCAACTCCTTGAGGAA CAATCTCAAATAAGTATACCTACATACAAGTGTGCAAATATGAGACGGTA GATCGGAATTGAATCGATTTCAAATAGTAGNTCCCAATGTATATGGACTT ATTTTCTCACCTATTCTGATTTATGWATCGTACAAATATAATTTATACAA GACAAAACTTCWTATGCCACTATTTTGCTGATGTTCACAATTTTGAATGA AACATGACGTAATTTAAACTTAATTTATCGACCAAATTTCCTTTCAGGAC TTAATTATTTCCGTTGACTAAAAATCATAACAGTAATCAACGCCAATAAG TATCAGCTTACACATGTGCGTACAAACGAATGTATATTTGTATCACAATA CAAAAAAAAACACATGTTATATACACCTCTCTATTTTAGTATCATTTAAG AACCTGTTTTCGTTATTATTTTGCCTTATTTGTTGAACTTTTCATGTTTT AACAAGCTATTAAAGTATTTTATTAGATATAGACAATACCTATACATAAT ATTTTCAAGTCTAATCTTAATATCTTATAGACTTCCAGACCTTAAATTTT ATAGAGGATCTAGTGTACTATCGTGGTATTCTGACAACCTTTTTGCCCTT TTTTAAAACTGATGCACAAGCTCGATCTTAA
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