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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s215 | supercontig | LSalAtl2s215:377180..391295 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004030 >EMLSAP00000004030 ID=EMLSAP00000004030|Name=EMLSAP00000004030|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=669bp
MGDMNVDNLIQRLLGVRGSHPGKRVNMDEEEVLGLCLKSRAIFLQQPILL ELEAPLKICGDIHGQYTDLLRLFEYGGFPPESNYIFLGDYVDRGKQSLEV ICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRFSVKLWKTFT DCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDTGVCSS VISSITLPHGWLADYYVIYFGPILTKMLKDGVRMIGVLVLHSGRXVVSKF LEKHDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSV DETLMCSFQIIMGEKLAQLGLVSGEVRELNIGSSFRENSTFHTIRYDFKP ASVDPSKMGVLSVGGDSNSSVSVNVPHMNGTGNTHFGQILLKKTRPEKGA PPESIXQXQPPPPPPNHYPSSSFKHSSQHKKHSIHRSKPISPAHRIASPV PSRPKANSSMVPSHHPPPSNHHHHQTPASQYKKAPEEFSLDLDDEFDIMK SLQPVKTSPRANRSNPMQTNTTNNNAFSSSTTSSSSTYHRQQQQAPVRNQ PEKKPPPPPPRPPSPQAQASTGDSSDSSSSDSSSGSDSDSDDEDFQEVVS SENKNSNGGGGSMMMMAPSMPSFSTSPNPHSKENHQQPTCLQSNSGPPSM KAILNDDLQLSSESDDDSD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s215:377180..391295+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004030-699877 ID=EMLSAT00000004030-699877|Name=EMLSAT00000004030|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14116bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s215:377180..391295+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGGTGATATGAACGTAGACAATTTGATCCAGCGACTCCTTGGGGTCCG
TGGGAGTCACCCGGGCAAGCGAGTCAACATGGATGAAGAAGAGGTCCTGG
GACTCTGTCTCAAGTCTCGCGCCATTTTCCTTCAGCAACCCATTCTATTG
GAACTGGAAGCACCTCTCAAGATATGTGGAGACATCCATGGACAGTACAC
GGATCTTCTTCGTCTGTTCGAGTACGGAGGATTTCCCCCCGAGTCCAACT
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ATTTGCCTCCTTCTTGCCTACAAGATCAAATACCCGGAAAACTTCTTCCT
TCTCAGGGGCAATCACGAATGTGCCTCCATTAATCGCATCTACGGATTCT
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GATCTCAATGTATGTCTGATTTTGAGCGCAGTTTGAAAAGTAGGATTTAT
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TTAAATTATAATTTTTAAGAGGGTGGGCTTTTTAAAAAGGAAATTTTGTG
GAGTTGATAATTATCTACTTTTTTAATTATAGATTTTAAAACCCAGTGAA
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AATCCGCGGAATTCCTAATAGAAATTGAATAAATAGTATACCTAATTGAT
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GATCATTCATTCTACTTGCCCTTTTTATTATTATAATTAGTTTCTCTCAT
CTTTTGTTTATTTTGTGTTGAATGATAATTTAAGAAAGGATGGAGACCAT
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GAAAAAATATATTTTTTGTATTATTGTCAATAGTTATATAAAATATAAAT
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TGTCCACATAGCTAAATAATAATTTGTTAATTTATAATTGTTAAGGAAAG
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CAACACTAGGAACTTCAATTGCCGCATATGTGGAACCCTTCCAAAGTGGT
GAAAATTCAGGGAGTACAAAAGGCTCAGGTGAAACTAGGCCATAGGCCTT
GGCGTTTTCTTCTAAGGCAATAGGGTCATAAGGAACTTTTTCATGATATC
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TGGCTTTGCATTCGTGCCAGGTCCTTTGACTTGACAATACTCTTTGGCTT
GGTTGATAGCCTCTTCATAATCTTTWTCATAAAAAGTACATTAGTGTGGA
AATCATGGATATAAATACATAATAATTAGGATTTACTTTTTTGTGCCTCT
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TCCCTGATAGTTGAAAGCCTACGTAAAGAAAAAATATTGTCTTGAATGTA
CAATCATTGCATAAAATTTATACGTTGACATAAATAGTGTGTGGAGCGTC
AGTACAAAAGCAAGTGAGAAATATATGTATTTTTTCCCTTCATAAATAAA
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AATATTCAAGTTTGAGATACCCATGAATGTTAGAAGCCTTCATTTGGCTC
AGATATGGCCTTTAAAATATAATAATTAATCAATCCGACATATTTTTTTT
CTGGAAGTTGTAATTGAAAGCTACGTCGCATTTATTCTAGTCTATATTTC
GCCAAGAAAAGAAAATATTTGTTTTATTGAGACGAAAACTTTCAAAAAAA
TTGTTTCGTTTAGTCATAAAAAAACATTCGTAGACGAATACTTTTCGTCT
ATTCATAGCTGAAGAAATTAACCTTGCCATTAAGAGCAATTTGTAGCAAC
TCCAAAAGATCAATCAGAATAATTTATCCATTAGTATAAATGGAAGATAA
TTGGTTAACTTGTAGTCCCGAATGAATCATACTTCAGAATACCTATTCCT
TCTTGCTTTTCTGTTAACAAACCGTATATACATTGATATAACATACATAA
GCCTGATAAAACATGGATTTGAATTTCAAATACGCTGACCAACGACCAAA
TTTATTTTTATCCAAATGCTCAATAGCATCTCCAGCCGTGGTATACATTT
TAAAGGTCTCATGAGCAAGGGTTGTAATGAGTGCAGCATTATGTTTTAAT
TCAATGGCTCSCGCCKTTGTAACTTCTTMTGCCTCKGCCATACATTGATT
TAAATATGCCACTATCACTTTGGGGTCTAGATCCGTTTCCGAGTCTGGCT
TTTCCACGAATTGTGGTATTAAAACATCTTGGACAAAAACTAGATAGCCG
GCTCCTCTTCTGAGACTCGTGTGAATTTCCTTGGCTTCTTCCATTTGGAG
GCTGAAAAGAATGGAGTTTATTAATCACACACTCATGATGATCTCATGAA
TAATTAATTACTCGTCTTTTGAAGCAAGCATGGAGGCACGTTTCATGTGC
CAAATGGCAACATTAACAAGAAGGTGCCCCATTTCAAAGACAGCATCTTT
TTGTGATGCAGATGGGCCCTTGGGTACGCAGCTTTGGGACCACTTAAATG
ATAAGGAATGACGTAGTTTTGAAGGCCCTCCACTCCCAGGAATTTCAAGA
AACCCCCTTAATAGGGAAAGATAGGAGTTCAAAGCAGTTCCCATACGCTC
CAATTCATGATGGGGATCCGGGATCAACTCCACAATCCGATCTCGAGATC
GCTTTAAGTCGCTTTTGATCTTGATGGAGTCTTCGTCGGAGACGATCAGT
TCTAATGGACCAAAGTTAGCAACACTTCCCTTCAAGGGGTTCCGATGAAA
CCAATAGGCCATAAGTAATAGCTTTATTAATTATCTTATATCAGAATTCA
CAATTATATTTAATTCCTAGATTTTGTATTTTCTCTCTCTTTTTGTCTAT
CTCTCCTTCCCTCTCTTTATGAGACTTTATTACGTCATTACTGTCACTCC
TTCTCTTCCAATTAAAACCCTTCTCGCTGGATGCATGATTTCTGCAGCTC
CRCCACCCATTATTACCAAACCTGCCAAACAGAGCAGACAGTTCTGCAAT
TTTTAATACACCTATTTTCACATCAATAGAGCGTTTTTACGTCACGTCAT
AATTTTGATGTCGTCCATTTTGGGGGCTAAACAGGAAACAACCAAGTTTT
ATTATTTATAAAGCCCCTTTTTCATTTCATTAACATGATTGAAAATAGTA
AACTATTGGATTCTGCCACAATGATAAATACAAATAAAAGGACATAAACT
TAACAGTTTTATAAAAATTTCATCGCCTTGTTTTATTATGTATATGAGCC
TAAAATGTATTTAAAATATGTTATTAAAACCTTATACAATCTTATTTCCG
TGTTGTCGATAGAAATTAACTATTATAACGGAAATAATAAGGACTTTTAC
TCTAATTATCATACTTTGCTCATCCCTAATTGATCTTCAAACAAAATTAA
TTGTACTAGCCATTTTTAGGGATTTTCAGTACATATTACTTTGATTTGTT
TCTAATACCACTGTTTATCATTGGCATTAAGTAGTATTCAATGCAAATGT
TAAGTCTTTTTTATTATTATTAAAGCCCTTTGATGGAGGTTTATCAAGGT
TTATTGGAAATTTGTGTATCTTATGTATTAAAAATATCAACTATGACCCC
CCAAGATGCTCTATTTGATCCCTTCATATCACTCAGCATGGAATATATGG
TCTAGCTAGGATAAAATATTTTAAATTATAGTGTATTTATCCATACTCTA
GAATGATATATAATTGAATTTCCTTTATGCTAATCTTTAATCATTTTTTG
ATGGGCTTCACATAGAGTTTGCTTTTCATTTGATGGCAAAAATATTCTTT
CAGTCAGAATTGCATATTAATATTGACTTAACGTATAATGAAGTTGCCTT
GTTGTTACTATTGWAAWTAAAAATKTATTGACNNNTTAATTAAGAACAAA
TTATCTAAAGAAAAAATAAAACTATGCTATTAGTCCGTAATTTAAGGGAT
TTTTTAAAGAGCGAATAAAAGCTTGATGTTCTCGTATCCACAAATCGGAT
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TAGGTCAAATAATCGAGATAACTGGAAGTCCATATTATTCTATGGATTTT
AAACTCAACAGTTTTCTATATTATTATATGTAGCTTTATTAGTTTAATTA
ATATGATCTTCCATTTTCTCCCAAACACTTCCTTTATTTACATCCTCTAA
GAAGCGTTTGGCGACTTTTTTAACTGGGTTTTTGTGGGGTAAGTCGATTT
TCATTCGAATTAAAGTAAAAGTCAAAATATTTAAATAAGATCCAAATTAT
ACAAAAATCGAAATATTAAAAACAATCTTCCCTAAACTCCTCCACGGGGT
TTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGAGGGAATCCAAATATAGTTATCCAAATT
AGTTTAAGAGTATATTTTCCATCTATTTATATTTAATAAAACTAATTAAC
TAAACATATTTGAGATATTATCATTACTAATACTAATAACCATAATTCAA
TTTGTTTTCAGGATCAAAGGTTTTGAGATCTAAAATAATGTAATATCTTT
TAACGGATCAAACTATATAGTATACCTTGAGCAAAATTGTACATAAGTAC
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CTTTTTAAGTAGGTTATCAATTTATTTTCCTTATAATACCCTATTTAATT
ACAACATCAGTCATTTAAATTAAGTAATAACTATTCGTTCATGCTATAAT
TTCATTTTGATCTTTTAAAGTTACTTCTTTACATAGACATAAATACTTTA
GATTCTGGGGAAAGTCATTTTGATCTATTCAAATTAATGATCATTATCCA
TTTATGCAAATTTGAACTTTATGATGTGTTCCAGAGTACTTATATTTNTA
GTAATTTTTAATAAAATAGTCAAAAAATAGCCCATTAATATATCAATTAT
CCATTAAATATTCAATTATTGCATGATCCTCATCCCAAGTACTGTAAATC
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TTATTAATTAATTATTTTCATTACATTAGTAAGTCAAAAATTACAGCATT
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GGAGGAGACTCCAACAGCTCCGTCTCTGTCAACGTCCCACACATGAATGG
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AAATTGCACTACTTAAAGTAACCCCAATTCATCGCCACATTCAAAGAGGG
ATAAATTAATAGACTTTTTTTTGTTAGGCCATATGGACGGCAAATTAAGT
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TCCACTCCTTCCAGTAATTTGAATATTAAGAATATAATTGACTCAAATAA
GCCTATAAATCATTGGCCTGTATGTATATCGAGAGTTGAGAGGGAAATTG
TCGTAAATCAAATATTTACTTTACCGAGATTAGCTTGTAAACTCAATTGT
TTCATTATGAATAACGTTGTTTTCCAATTATTACAGTAAAATCCATTTCA
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CTCAACTCTTTTAATGTCTTGGTGTCGTTATCAAAAACAAATTATTTGTA
ACTTTTTTGATTTTTTAAGCCCTTTTCTAATCAAAACACAAATTATAAGT
GCAATTATTTTCTTTTGGTTTTGACCACAACACTAGCCCAATCCCTTGAA
AGGCTTGAAATACACTAAAATTATATATCTTATTAATTATTTTCTCAATC
ATAGTAGTTTTTATAAATATGACGCGCATTGATAATTTATTTTTAAATAA
TAGGAATGTTAGTTTCTCTCTCTCTAAATCAGTGATTCCCAACCTTTTCA
TCACTGCTGTACCCTACTCCATTTGAATTATTTATGTTATCCATCTCTTG
CTGAGCCCTTGATGATGCATTGCGAAGCACAAGGGTTCCTAGTATATAAA
TATTTTAAAAATAACCCAGGAGATCTATTTTGAATCATCTTAAAAAATAT
TTGGTGGAAGAATATTGAGCACGAACATATATGAGACATATAAATACATT
TGGTGTTTCAACACAAAAAAAACTATACGTAGAAATTAAGAAAAGGATAA
TTTCCCAATCTACTGTTTGAATTTGTAAATATAAACGCATCATTTTTCGT
TGATTTGTTTTGCTCAAATATGGGACTTACATTCTAATTATTTAGCTCTG
ATTTAATATATGATACTTTTTTTAGCTCCGATATGATATTTCAAATATGA
TCTATCATCCTTTTCCCCTAATTGTCATGCTAGATTGTTTTTGTGTTGAT
GGGCGACTTAATAGATTGATTAATGGAGTATATCCTTTACTATTGTTATT
TATTATAATATCTTTTTGCTTTTAGGGGCCATGCCAAAGAATCCAACAAA
CGAGAATGCATTCTGATCTTCGATGCGGAAACAGGGGAATTTACTTTGGA
AAAAATATCAAGTCAAATTCTGTTAAAAAAGACACGGCCTGAAAAAGGTG
CTCCTCCAGAAAGCATAYCACAGCAMCAGCCGCCTCCACCTCCTCCTAAC
CATTATCCCTCCTCATCCTTCAAACATTCTTCGCAACATAAAAAACATTC
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TGCACGAATCAATTTTGCTATGATTTGTAAGCAGAATCCTATCAACAGCA
CAAATATTTGGGGTTTATACATATATACTCACACAATAGAACTTGCTTAT
GCTGGATCTCTAGGGATCGACAAAATATGTCTGCTTTAATTATATACTCT
ACTTATTTTTATCGTTCCTTTAATTKGTCAGATGGAGTTACACTTATTAA
GTATAAGTAAACATTATAATATTACATTTATTTAATCTGACCTAGGAATC
TGTCAACAGTTCATATACATAATTTATATTTGCTTCTATAGCAAGAACCG
AGACCCGAACCTACGCACTTTGAGTTCAAGAGAATAATTTCTCCCAAGCG
ATTTGTCCATTACTATATACGGGACATTCATAAATTTCAACTATAAACGA
ATATCGGTTTATATATTGGGTTCTACTTTAGTCAAATCCGAATTAGAGCA
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ATCTAATGTCTTTTTTAATACAATGATAAGTACATAAGCGCTTCTATTAT
GAGATAATTCATCATTAAGTTTGAGATGCATTTAGTCAATGAAATAAGCA
ACTTTTCATTAAGTAAGTTTGAGTTAAGACTTCCCCCCCCCCCCCTTATA
TATGGGTGAATGACGGAGTCCAATGTTTGTGGATTAACTTTAAGACTACT
ATGGATGGATATATTTGTATTAAGAATATGTTATGAAATAATTATTTGTA
TATTTGATGAATCTTTGTATACATCTTTTGTTCATAGATTTTAAATTGGA
AAAAGTAGATCTTATTCAGATTTGATAGTGATATATATATATATATATTA
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TATATTATATATGTATTTATTTACGTGGAATGTTATAAATAGCGTTTTCT
CGATGCTTATATTCAAATATTTGGGATGGGTAGAGCTTCGTGGAGTGTCT
TGTGTATTATTTGTTAAAACTAATTATTAATATATTTCGTATTCTCCCTA
TTTCAGCAAAGCCTATATCTCCTGCTCATAGAATCGCAAGTCCCGTTCCT
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CTCAAATCATCATCACCATCAAACACCCGCATCACAGTATAAGAAGGCCC
CTGAGGAGTTTTCTCTTGATTTGGATGATGAGTTTGATATTATGAAGTCC
TTACAACCAGTAAAAACATCTCCTCGAGCTAATCGGTCTAATCCTATGCA
GACGAACACGACGAATAATAACGCGTTCTCATCATCAACTACTTCTTCTT
CATCTACATATCATCGCCAACAACAGCAAGCACCTGTAAGAAACCAACCT
GAAAAGAAACCMCCTCCACCTCCTCCACGACCCCCATCTCCACAGGCACA
AGCATCAACAGGTGATTCATCAGATTCATCTAGTAGTGATTCATCCAGCG
GAAGGTATTCCTTATTTTTTTAATGCATTTTGTATTCATTTTAATCCTTT
TTTTAACGACCCTTAGTGATAGTGATAGCGATGATGAAGATTTCCAAGAA
GTTGTTTCGAGTGAGAATAAAAACAGCAATGGTGGTGGTGGAAGTATGAT
GATGATGGCTCCGTCAATGCCCTCCTTTTCAACTTCCCCAAATCCTCATA
GTAAAGAAAATCACCAGCAACCCACTTGCTTACAAAGCAATTCAGGTCCT
CCCTCTATGAAAGCAATATTAAATGACGATCTACAACTCTCATCAGAATC
AGATGATGATAGCGATTAATTCATGTTGTTGCTATTATTAATTGATTGAC
TAATTAATGTGTGATAATGTTTTCTATTACAAAATGTGACGAACCTTTTT
TTCTGTCATTCTTTATTCTGTGCAAAAAAAAAAAAAATCAAAATCGGATA
AAGATGAAGTTGCGAGTNAGTTGCGAGTATATTATATASTTYGTATWATK
TATGCTCTCGTTCTCTTTTTGTTATTATGAAAATATATCCATGTTGAAAG
TACCTAATTTCCTTGAGAGACTCACTTTTACATTCCTCTACCATAACATA
TTTTAAACGTGATTTACACACATTATTGTCCCAAAATTCTCTCTCCAATA
TATGTAGATCCGTGAACAGTATATGAATGCTACACTTAATTTGTATTTAA
GATTACTTGTTCATACATCATCTTGCAATATTAGCCCATGTCAAACGGAT
TTTTGCACATAGCGATTTGAGTTCAATAAAATTGATTAATATATCCAAAC
TGCATATATTTAATCTCATAGTAGATATCGAGTAACTACAGAAACCCTCT
CACACTGAAAGATTGCGAACCTCTTTGAATTGTAGATAATATTTCATTGT
TCAAACTTCACTAAAA back to top
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