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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s217 | supercontig | LSalAtl2s217:479620..488141 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004100 >EMLSAP00000004100 ID=EMLSAP00000004100|Name=EMLSAP00000004100|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=676bp
MAEDLADXLDDIICSFDKVIPGNFEGVILTLGVWALAGAIVYCISVFVSN
SVKEENEKKLIQNKKQNGDMSQSPIVAKDEQRKKEKEEDLMKETELQPRE
RPKADQMVEQRGEVIEELIIPAKAYVCGSKKIDNPTNGIIPYSTTKADLF
VGEIEEDIILPSFAYKCGDDSIPPPLTSEIEDGDEPAADSLSENTPSISM
KCSGSDKKAVEWVNSCFERLCEAFTLDLLKQNWIENLNDYIKSLEDKVSV
IVTDIVRSTHENKCPIFTNIVSQTQQRDNITVTADINATLILKLSVSESH
SHPRKYYTFNITKLRGRLSISILNCDRIVIIKLDGWPEIQTELDGHDDSH
PFVSDIVVSALLWDIVEGEEQFLGLGIVAIDELLISPSQRHVIPLQGRPF
ASRNDTHNGLLTIQFILSELNKDVALNRSFEQAAVSLNQSSLLGVNEHKT
ILKITKRDGLNAPCEDSEGSEMSMGKRDESPLTRSRNRKKRKLVSTLKKR
ITGRSFSIGSFGDSRDTSSARAKQDALEQSRSISVDRAYSLSNVNVLDGK
SNLGKIQAISTGTFISEESSLVMEVDENNIKKYYLIPAEIAAKEKISMKG
TKLHIFMDHIFVAKHIKRGKMCEVCSSNIPFRLRKQGYICRDCQIVCHKP
CHIQVATHCLESSLPAMDILHIKKDL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s217:479620..488141- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004100-699947 ID=EMLSAT00000004100-699947|Name=EMLSAT00000004100|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8522bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s217:479620..488141- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCCGAGGATTTAGCGGATANACTTGACGATATCATTTGTTCCTTTGA
TAAAGTGATTCCTGGAAACTTTGAAGGAGTTATCCTTACTTTAGGGGTTT
GGGCTCTAGCAGGTGCAATTGTCTACTGTATTTCCGTGTTTGTTTCCAAC
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TGGAGATATGTCACAAAGTCCAATCGTGGCTAAGGATGAGCAAAGGAAGA
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AGGCCGAAGGCAGATCAGATGGTAGAGCAGAGAGGGGAAGTAATTGAAGA
ATTGATTATCCCTGCTAAAGCCTATGTTTGTGGGAGTAAAAAAATAGATA
ATCCTACAAATGGCATTATACCCTATTCCACAACGAAGGCAGATCTTTTT
GTGGGAGAGATCGAAGAGGATATTATATTACCTTCCTTTGCATACAAATG
TGGAGATGATTCAATTCCACCACCTCTTACAAGTGAGATAGAGGATGGAG
ATGAACCGGCAGCAGATTCTCTTTCAGAGAATACTCCTTCAATATCGATG
AAATGCAGTGGTTCAGATAAAAAAGCAGTGGAATGGGTTAATTCCTGCTT
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GTCCTATTTTCACAAACATTGTTTCCCAAACACAGCAGAGAGATAATATT
GTAAGTACTAGCTTTAAAAGTCAGATTGACGTCATAGACTTTTAATTAAT
GCCATATTTTAAAGTAAAAAATAACTCTCTATAACAAAAAACTAACTTAT
TAAAAGATATTGTTTCATCTCCTGTATCTTTAATATTAAATACATATATG
TATACTTTTACAAAGGTCTGACTACATAGATATGTATTTGATATTATTAA
TATGGAATCAAGGTCTGCACACATTAGCTCAAATTGATTCCAAAAGTTGT
ATGCTGTCAAATATAACATACAACATTTTTTATGCGCTTGTGATGAGGAC
TTAGCTCAGTCATTTTAAGTCAAAACAATATTTATCTCCTTAAATCCCAG
CATTTACTTCATTTAAGTGTGCCGTGTGCTACATAGTATATTTTAAGCGT
AGTCCTCTATTAGATAACTCTTTTTACATTCATTATTAGACCGTCACAGC
AGATATCAACGCAACTCTCATTCTAAAATTAAGTGTGAGCGAATCCCATT
CACACCCTAGGAAATATTATACATTCAACATCACGAAATTGCGAGGTCGA
TTGAGTATATCCATCCTTAATTGTGATAGAATTGTGATAATTAAATTAGA
CGGATGGCCAGAGGTAGTACTGAGAATCATTTTGAGATCAATAGCTAACC
ATTTGTTTAATTGTTGTTGTATTTTTAACTAAAAGATTCAAACAGAACTA
GATGGGCATGATGATTCCCATCCCTTTGTGAGTGACATTGTTGTCTCTGC
TCTTCGTGGAACGACAATGACTCTTGATANTGGATGACTTTTTGGAAGGY
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TTTCTGGAAGAAAAAAAATGGAAATATTATATTACATTAAATGTTTCACA
AAAAAAAAATTCCATATTAAGTTTTTTAGTAAAAATCAAGAATTCCTTAA
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TTGTTGCAATTGATGAACTACTCATTTCTCCAAGTCAAAGACATGTTATA
CCTCTTCAAGGAAGGCCTTTTGCATCGAGAAATGATACACACAATGGTTT
ACTCACAATTCAAGTAAGTCTCTCTGACTTTTTTTTTTTTTTTTGCTACT
TAGTAAATAAAATACTAGCACTTAAATATCCTTCCGAAAAATAGTTTAGT
AAATGTCAATTTTGCATTTTTAGAACGTTTTATGTGTTAACAATGAAAAA
CATGTTATTAACAGACTGTGAACGTATTTGATGCCAAAAGATGAAAAATA
AAATAAACACATTCAAACAAACAAAAACTGAAGGAAATATAATTGTATTT
TAATGGAAATAAGTAAATTTACTTTCTTAGTTTGAAATAATACTTTGATT
TTAAGAGGAATAGAGATTTTAAAGGGCTGAACATCTKCTCTRCCCCGCCT
TCCCCCCCACCATATTAAAGTTTAATTAAATGATTTATGAAATCTATATC
AAACATATTCTAGTTTAGAGTTATGCTGAAATTAATGGTGTGTCGGTCCT
TAATTAGGACTGAAAACTGCAGTCTCGTCCAGTTCAGTCATAATCGTTTA
GTACTGTATACCACTTATAAATTTGATACAGTTTGGTCCTTGATTATGTG
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GTATAAAGGGCATGTTAAAAAAAAAAACACCAAAAATCAACATGTTAGCC
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CTGATGTCGATTCCCAATTCTACTCTGGAGTCCAACAAGGACTTACAGTT
ATGTATAAGTCCACCACAACAAATCCTTAAAGATTTACCCTCCATCTTTT
AAGAGCACACATGAATGTTTGATCAGGATTTGAATATAAATTTATCTATT
TATGAAAGGATGTTCATTACTCAGGAATTAGATAATAATGACAACTGCTA
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TTTCATTTCAACGGTTTCGCTCTCGGTTCAGATTTATGGATCTTGGTTCC
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CATAAAACAAGTGGGTTCGGGCCCAGAAAATGATATTAGATACAAACAGG
GCCGTAGCTACCTTATACCCAGAGTATGTAGTGCCCATGTTCCAGTAGGG
TCCCCGAAAGCTAAATTTGCTTAATGCAATGGTTTTCAAAGCGAGGCCCG
TGAGTGGAGGATACGGTGATCGCTCTGCTCCGTTTTTTTCAAAAAAATAC
AGGATGTAATAGACCCCTGTACTGGTTTTGAGACTTAATCAGTAGAACAA
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GATTAATCAAATTGGATTATTTTCATTTTATTTCATAACATAAACATACA
TATATTGTTTAACAAATCTGAATAATTTCTATTTTCTTTAAATATTGAGA
CTTCACCTTTAGAACAAGTCTTCAAAAATTTGTTGAGGATTGGACTATAT
CTAATGTTGGCAAATTAGTAAATCTGAATAATTTATATTTTTTTAAATAT
AGGTTTTAATCACATAGAGTTAGATGCCATATTTTATAATCTGATTGATT
TTTTCACTGGTTTGGTATGCGACCACGGCAATTATCAACTACTTGTTATA
TGTTTTGAAAGTTTTTTCTCGTTTTTGATGTACCTACATAGTTATTGCAA
AGCTTTGCTTCCCTCTCTGCGCCATCATTTAGAACAGATATGTTTTCCAC
GATGGATTTTATATTAATATAACTATTGTTTGATTTCCATTTAGAAACAA
GTGTCTGTAAATATTCAGAATTGATATTTAATATTCGAAATTTATTCCAA
TTATCTGGCATAATGACTTTTGACTAATCAGTTGTATTTTCTTCAGATTT
TCAGTGTGAATTTTTGTTTTCCTAGTTCCATTTATATGGGGGCTTCTATT
TCGAGAATTTTGCTCGTAATCCTCACTTTTGCCGTTTCATCGACTGACAT
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TATGAATTAGATTTAAATCATGTATAGGAGCAGAAGTTAAAGACTGGGTA
GTTATCCACCAAGAAATACAACAATATACAAAGAAATGTTTTTTCAATTT
TTTCGATTGTCCAGGGTAAGAAACAGTTCCTTGAGGCAATACATTTATTC
GAGCTGATAGTAGTATCATTTTAATTGAGTATAGCCTTTTCCCCATCCAT
CGAGTATTTTGAAGAGTTCCAAGTCTTTCATTTTTTTTTTTTTTGAATTT
CAGAGATACGTCACTAAAATAAACAAGTGTGAGCTGAATTAATTCTTTAA
AGCCCTTTCTAGAATAGTCAAACTTTAAAGCTTTCTTTCAAAGTGGAACT
ATCATTTTTTTTTTGTTAGTTTTTTTCATCTTATTCCAAGTTTCTTATTG
AAAGACTAACTGTGTTTTTTTTGTGGTTTAATATTTCAAAACTTTTTTTA
AATTTTCCAAATAAAGAAACTTCAGGAATTTTGGATACTTTAATTTTCAA
TGCATCACAAGAATTTATAAGCAATCTTTCTCCAATATGATATCTACAAG
CAACCCACAACAAATTTCTCTTCAAAAATTGTTGAATTGATATTGAATCT
GCATATAGTTTCCCACAGTTTGATGGTGTTGCGTCAAAAACTATATCCCT
AACATTTTTTGTATATTTCGAATCACTCAATAAATTAAAAGTAGTCTTTG
CAATTCTCTGGCTGAGTAAATCAATTGTTTTGTATTCTAATGCAGGAAAA
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TTCAAAGCAATTCGGATTTTCAAGAGTTTCCATGAGTTTTCTATACCAGT
GCAATGGATGGAGGTTTCCAAGAACTTCTCACTTGTTTTGCAAAATTAGT
AACGGTTTCAATACCATATTTGTAGGATTGAGCATAACTAAAATTAGWCT
TCTTTAAGTAGGCGTTGATTGCTTTGATCACTGCAGACGTTTTTTCTGCC
AATGCTGTGACTCAAACATTATTCCTGACGGAATGATTTGACAAAGATAA
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ACATTGGTTATCACAATTTCCATATCAGTGCTACCTCTCTAACACAAAAA
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TGAACTCTTGTTAATCGTTCAACAATTATTAAATAATAATTCCATTGTTT
AGAAGAATTGGCTATCTACCAACTAAAATTCAAATATTTTATTTTTTTGG
AAAAAAGTTTAAATATCCACAGCTATAGACAAAGAATTTCAAAAATCCAC
AGTTTTTTAAATTAAAATTTTTTGAAATAAAATTTCAATCATTCAATTTT
TTGGAGAAAAATTTAAAAATATATAGCAGTATATAGAAAATTTACTTTTT
TGGAATTTTTTGGAATCATATAAATTTCCGATATATTTTTTTCTTGAATT
TTCCAAAAAGAAAATTCCAAAATTAAATTTCAAATATGAAGTTTTTTGGA
AAAGAAAATTCCAAAATTAAATTTCAAATATTAATTTTTTTTTTTTTGGA
AAAAAATTTCAAATATTCTTTTTAAAAAAAAAATATAAAAATTTAAAATT
AAACTTCGAATATTAAAGTTTTTAAAAATCCACAATTATAAACAAAAATA
TTTGAAAAATTAAAACTAAAATATAAATTTTTTTGGGAATTTAGTTTTTT
AAAATCCACAATTATTAATAAAAAAATTTGAAAAATTAAATTTCAAATAT
TTAAGTTTTTCCGAAAATTTTTTAGAAATCCAAAATTATAAAGAAAAATA
TTTGAAAAATTAAATTTCAAATATTAAAGTTTTTCCGAAAATTTTTTAGA
AATCCAAAATTATAAAGAAAAATATTTGAAAAATTAAATTTCAAATATGA
TTTTTTTTGAGAAAAATTTAAAAAATCCATAGCTTTTCACAGAATATAAA
AATTTTTGGAAACAAAATTGAAAAATTCAATTAAACTTCAAATATTTAAA
TTTTTGTAAAAAATAAATCAAATATTAAATTTCCTAATAAAAAGAAAAAA
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CCCTGCGGATGCTTCTGCTTACGAATAAAAAAACATATGGTTGTTTTTTA
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GTCGACATTTCCAACAAGCTTATCCTTGTAGCCTACATACTTTTTTCAAT
AACGTTTTTTTGACATGTCTCTAAATTACAACACCTTATGTAAATATACC
ATTTAGAATTTAGTAAAAGTTTTTTATTTATTAATAAAGTGTTAAGCTCA
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TTGAATAAAGATGTTGCACTCAATCGGAGTTTCGAGCAAGCAGCAGTTTC
TTTAAATCAATCAAGTGAGTAACGTAACAAAATTATTTTTACATCAATCC
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TGCAATAGGTGATAGATAAAATGTGTAAAATAACCTCTTCTTTATATTCA
TGTAGGATGGGTTGAATGCACCTTGTGAGGACTCAGAAGGCTCTGAAATG
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AATGAATAAGCCAAATTATAGTGATTATGCAGCTAAAAATTCATTCTTAG
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AAGGAAATTGGTGAGCACGCTCAAAAAACGCATCACTGGAAGATCCTTCT
CTATCGGCAGTTTTGGAGATTCTCGTGATACAAGCTCAGCTCGAGCTAAG
CAAGATGCTTTAGAACAATCCAGATCCATTTCCGTAGATCGAGCTTATTC
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TTCATGGACCACATTTTTGTGGCGAAGCATATCAAACGTGGAAAGATGTG
TGAAGTTTGCTCAAGTAATATTCCTTTTCGTCTGAGGAAGCAGGGCTACA
TCTGTCGTGATTGCCAAATTGTGTGTCATAAACCCTGTCATATACAGGTT
GCAACCCATTGCTTAGAATCATCTCTACCTGCAATGGATATGTAATTTCA
CCTTTTTTAAATCAAAATAATCTAAGTTAGCATTTATTTAATTTCAGATT
GCATATCAAAAAGGATCTCTAA back to top
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