EMLSAT00000004168, EMLSAT00000004168-700015 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004168
Unique NameEMLSAT00000004168-700015
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s220supercontigLSalAtl2s220:279505..307528 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004168 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004168EMLSAG00000004168-686934Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000018041EMLSAE00000018041-726969Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018042EMLSAE00000018042-726970Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018043EMLSAE00000018043-726971Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018044EMLSAE00000018044-726972Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018045EMLSAE00000018045-726973Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018046EMLSAE00000018046-726974Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775747auto775747Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004168EMLSAP00000004168Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004168

>EMLSAP00000004168 ID=EMLSAP00000004168|Name=EMLSAP00000004168|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=614bp
MMYSTTAAYEHHTTALSPLKSSPTSSPSNLNHXHGHSLHPHHHLYPSNPS
ADVFQVSMDSSGGGGSGDYSSLLHSHSNLHHHHQALLNNNSHPPHHLGHP
QQQLELDQPPPPHSHSHHPHHLLNPHESLHLHHGLDESNTARSNLITLGP
NSHPGELHPNVEFVDFTPSPSSDSTHRESPLIPGSGSFVPEENNNNIASC
TTPSSSGSCAVSSSNPLHYTGGLTQLHSSSQQHLLQPPLPLQSQDILVVP
PLSSSGALSPETVGHHPIHQSIHVEDLGTSINTSGTSSNNSSSNLLGQSL
NHTLEESPSTSSTTSSSSNNSSSSLNNNNNNTKGSIGIGNRPMDPEFTSH
QIDCICDSLMQRGKINLLEDFIHDWCSHSYHESGKEHSDSVIRAIAYVAF
EKGDFKKFYSIMETKVFDSKYHSKLQEMWNLAHYKEAESIRGRKLGAVDK
YRLRRKFPLPRTIWDGEETIYCFKEKSRKYLKDTYKTNRYPTPDEKRTLS
KKTGLSLTQVSNWFKNRRQRDRTPNNRGESGPLESPTGLDSGELKYPNDC
YSPNKQCLMEQSPVLRSSILWYLRKETEILGSLALSRANIGQESPIMEAI
VIVEXXQXLTQDSI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s220:279505..307528-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004168-700015 ID=EMLSAT00000004168-700015|Name=EMLSAT00000004168|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28024bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s220:279505..307528- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATGTACTCAACCACTGCAGCATACGAACATCACACCACGGCTCTAAG TCCACTTAAATCCTCACCCACTAGCTCGCCCTCCAACCTCAACCATCKCC ATGGCCACAGCCTTCACCCCCACCACCACTTATATCCATCCAATCCATCA GCAGATGTATTCCAAGTCAGTATGGACTCCAGTGGCGGCGGTGGGTCAGG GGATTATTCCTCTCTTCTTCATTCACATTCCAATCTTCACCATCATCACC AGGCTCTCTTAAACAATAACAGCCACCCCCCACACCATCTTGGGCATCCA CAACAACAGCTAGAGCTAGATCAGCCACCACCTCCCCACTCTCACTCCCA TCATCCCCATCACCTCCTCAACCCACATGAGAGTCTACATCTTCATCACG GACTGGATGAATCAAATACAGCGAGGAGCAATCTCATTACCTTGGGCCCA AATAGCCATCCTGGAGAACTCCATCCCAATGTCGAATTTGTGGATTTTAC ACCTAGTCCCAGCAGTGACTCTACTCATCGCGAGTCCCCGCTTATTCCAG GTTCGGGAAGCTTCGTTCCAGAAGAAAACAATAATAACATTGCCTCCTGT ACCACTCCGAGTAGCAGTGGAAGTTGTGCAGTGAGTTCCAGCAATCCCCT TCATTACACCGGCGGCCTTACACAACTTCATTCTTCATCTCAGCAGCATC TTCTCCARCCGCCGCTKCCCCTCCAGTCACAAGATATTCTTGTGGTTCCC CCACTCTCATCCAGTGGAGCCCTCTCTCCTGAGACGGTGGGGCACCATCC CATCCATCAAAGCATTCATGTCGAGGATCTAGGAACAAGTATCAACACAA GTGGAACAAGTAGTAACAATAGTAGTTCAAACCTTCTGGGCCAATCCCTG AATCACACTCTGGAAGAGTCCCCATCCACAAGCAGCACAACATCCTCTAG 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GAACAAAATGAGTAGTTATTATTGTTGGGGTTCGGTTTGAGACAGTTTAT ATTTTTAATAAGAGCGGTCCAAGTTCGGTCTGGACGTGTTTCGTTCAAAA AATCGGTCTTGATCAGTCCCATAAAGTAAGGTTGTTTTAATGTGGCCAAG AAGGAATTGGCTCCCACTTTTGCAATATTTTTGTAGTTATAAAAAAAAAT ATTTTATTAAAAATATTAAATGTCATATTTTTTTGTAACTTACAAATATT GTATAGCAGTACTTTTATTTTAAATTTAAGTTATTACCCCCATTGGCCCC TCCACTTTTAAAACTGGTGTGCGAAGAGCCTGATGACCTTTTTATCAAAA AATAAATTTTCATATTCATTTTTATCGGCCCACGCTTTCCGATCGTCCCA TCATCGAAATAATTTTACCTATATCCGTTTAGAAAAAAAAACCCGGTTCG GTCTCATACTGAGACTTCACTTAACACTATCAGTACCTACATAGTTATGA GCTATATGAAATTATATATTCATTTTGATTGCTCCACGGTTTTTGAGCAC TTCATGATKAAAATATAATTGTCTATATATCCGTTTAGAAAAAAAGCAGC CACTTAGGATCGAACCGGGTTAAAAAAAGTTTGGTCAAGTAGCGAGTCTT CACTGAACACTAGGAGTACCTAGTTATGAGTTACTATTATTGTTTATTTG TTAATAATCACATGATGAGCAAGTATTATCCTCTATTATTTTTACCCCCA AAAACAAATACAAACCTCCCTTCATAAATATTTACCATTTTCACGCCAAA TCCCTAAATTACTTCGTAGAAAATACCTATAACAATAACAATATCAATAT TATAATCTCCCCCCTTACTTGGAGAAAAGTTTGAGCCTTCTAGAACCCCT CCAAAAAAACGTGAATGCAAAACTTTGCCTCTCTAATACACTCTCTCAAC TTTTAAAGGAAAATAAAATTTGTAAAACATAACATGATAATGATAAGAGT GAATAATTCGTCATAAGCGGATCAAGGGTTAAGAGGACGACTCCCGTAAT TTATTTTTATATATTTTATAAATAACAACAATTGATAAGGAGGGAAGAAG ACGGGAACAACTTACTTAGTGATTTTTTGTTGTTCTTTACAGATTTTATG TATGTAGTTAGTTTTTCAAATCCCTGTTTCACATCATAAACCCTTGGCAT GTGGTCGTATATATATATATATGTAATACGTTCATATTATTTAGAAAAAG AAACAGAGAGAGAGAGAGAATTATATATATAAAAATCCTATGTTTGATTA CATATATTATTATATAAATATATTGGTGTTGGATTCGAGTATTAATCGAA GTAAAAAAACAACAACTCAACTTTACGCTCAAGTAGACCATTTTTGCAAC ATTACTATAATTTGTCCCGAAATATTGTTTGGTATACTACAATAAACTCA AGTGATCAAAAATTGAAGTATTCATCAATATAAAAGCTATCTATTGTTTC ACTTCATTTATACATATTTGAGTCTAAAAGAAACATTATTTACAAATTTC TGGGATGATTTAAAATACCCCAATTAGTTTACCTATATATAAAACATTTT GTTTGATTTAAGTGACTGATATTCGCCCCAAAATGCCTCCTTTCAAATTA AACTATTCAATGTTAGGGGTAAGAATAATTATTTGAGATAAAAACGAATG AACATTCTTCTAAGTGTACAAATGTAATTCACACTTATTCTTGAGAATAA TCGTTTGAGCTTTCTTTTATGTTGATACCCACGTATGAAGATATATCTCA TCTCCAGTTATTTGGACATTTTTATTGAGTATGTAATTCCAAATAAATTT CCGTATTATATTTTGGGGGCTAAATTTTTTCTCGGGTCTACTACGCGTTT CTTATTTTCTTACTTTGTTAATTTTTACGAAAAAATAAATCACTCTCATT TTTAATAATAGGCGGTTGTAGAGCAGGGGTCTCTAAACTTTTGTCTGAGA GACAAATAGGGTCCCAATGTGTTCAATGTACCCCACTGCAGCTAAAAGAT TATGAAATAAACTTCACAAAGGAAAAATTTAACGTGTTGCATCCCTGGAA CTTAGTGTAGTAATGAGTATTAACCTTAAGGCTTCCTTGAAAGTTTGGAG ATCCCTGTTGTAGACCTTGCCTTTGAGTAGTAATTACTTTATATATCTCC TAAAATTACCTGTACATTAATCGTTTCAAAATAATAATTGAGTGACATAT TGAGATCCAGTTAAACTCACTTCAGTGTTTTATGAAAAACTGATTTTCCT TTGACTAGATTTAACTCAAAAACTCTAACTTGACTCTATGTTGTTTCAAT TAATCAAACCCGATAGTAATAACTCGAATCCAACACAAATAACCATGTTT TATCATCAAATATTTGTATGTTGAATATGTTATTAGGAAGAGTCGTTCTT GTTTTTGTATTGATAGTTTCATCATGATGATGATTTTGGCTCATTGATTG TCCAAATCAAGTCATGCATCCTCAAATTATCTTTAGTAATATTATTCTTA CTATTATTTAAAGAAGAAACAGAAGAATGCCCCCATCTGCGGGATTCTGA GGAAGGGAGGCTAATCAAGCGGAACTAGTAACTATAAACAATGGTTGAGC ATTCTCTTATCAAATATGCATAATATTTTTATTATTATTTTGTTTTGAGT CGAAGACGAAACTGAAATTGACTCTCTTTGTCTGTCATGCTTAAAATAGT TGGTTCTGCGTACAAATATGTAAATATTTTGAAGGATACTTAATTGTATT ACAAGGTAGGTCAGTCTGTTTCAATATAGGCAAAGCTAACAAACAAATGG 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TCGAGCCACGTATATAGTATGTACGTAAGTTTAGGGCATTTTGCCCCCCC CCCCCCTATTCGCATTTGGGGTTACATATTTCTGTAATCCCTTTTCATTA TTACTATGTTCGCAAAAAAAACCTCTACCCCCTCCCACCTGAGTACGTCC GTACTTTGTGCATGATCTCATCCGATATTACATGCATAATATGGCTATTG AAAAAATAGAGAAAAAAACATTCACTAACCTATTTCCAAACAGTAGGCTA GTGACGACCCATCTATTACTTACATACGCCCCATGCATACCTCATACATG AATAAAAACAACAATACCAACAGGGGGATTTCCGTTGGCGACGAATAGAA TCGTATTGAGAAGGATTTTCACACTTTTTCTTATTCTCATTTCTATTGTT AATTTTTGGGTAGTAGTAGTAGAGGATGATGGGGCTTTGAAAGGAAGGAG AGATTCATATAAACAAGGGGAGGGGGGGGGGGTGACCGCATATTACAACA TAGTACAGCATATTATGAATAATGCACAATACTATAGNCGATACTTATCA ACAAGATGAGTAGTAGCTACTGCTCATTTTTGTCCCTCTCTCTCTCTAGT GATTGTCTGCTCATTTTTTTTTATTATAAGTAGATTTATTAGAATGAAGT AACAACCCCTCAGCTGAATAGATCTCCCCCCCCCCCTCCCTTCCTMCTCC CAACAGGTCACTTGYAACAACAACTACTATTAAAATATAAATAATAAGTG CATTGCACATACTTAATGCACCTGACCTAATTATGACTGACATGAGTGAG TTTGGAGTAGGGTTTCTCATTTCCCGGGAGGTATTCTTTGATCAGGATTC CGGAAAAGAAGTGTTTAAATAACGGGATAATGTTTAAATATCCTGTTATT TATTTTTCAAACTTAGAATTGTTACAAAATAGGAAACTTGGAAGTACGTA 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