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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s231 | supercontig | LSalAtl2s231:116449..128829 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004407 >EMLSAP00000004407 ID=EMLSAP00000004407|Name=EMLSAP00000004407|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=310bp
MLLVGVGTFVCFVRPNLNATLNDSVSYFKLQRLNGXYQXIHFGNSYSIPK
SPSHQLEDLSSSVAVLIILDNWTNDTYTMIQSEIICGSGLVECRESPRAL
SPLTSEIFMLENGGGLKGVCGSFSFLSSSDNTHIHLMWSVPYNLNTYDTY
TGVGVTNEVPVEESETSVFQRMYYDSNDMVSFFKRGVAVIIKSYIQPNNY
KPIMSVSITPNERFEFDMEEDNEGNSQLPVQESLIQGKNDVDRGYSGSFN
ESERSHHKRRNFSILEEEINSDTQNETQSSLGENDAPGNGVTLGGIVLTI
FLFILGQSFS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s231:116449..128829+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004407-700254 ID=EMLSAT00000004407-700254|Name=EMLSAT00000004407|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12381bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s231:116449..128829+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTATTGGTTGGAGTTGGTACCTTTGTATGTTTTGTAAGACCAAAGTA
GTTGTAGACCACAGTCTACAGCGAAATACTGGGATCAATTCTAGTATGTT
AACTGTTATTGGGCATTTTGCTCATCATAACTCTTGTTTAATACTGATAT
TGTATTAATTCATCACATATGTCTTGGGGAAAAAGCAGGGTTTTCTGTGC
CATTTAACTATTTGTACCTTCCAAGGGGCAAAGAGTCTTAATTATTTTCC
TTCTTGAATATTTAACTTATTAATTATATCCTTTGGTGACTATTACTTCT
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TAACCATAAGACGTACAGTGCCAATTATGCTGTATATTCTATGACGCAAA
TACGTTTTTTTTTTTGCCACCTTTAGTACATAAATTAAATTCTCTCAAAT
TATCAATTACTTAATAAATTGCGTGACTCAGCATTTAATGTCTGTTTTTC
TTTTGTTTTATCCCCTCGTGAATATAAACAATTATTTGTTCTTATTTACA
GCCTGAATGCCACCCTCAACGACTCTGTCTCTTACTTTAAACTCCAACGT
CTTAATGGCAGSTACCAAARTATTCATTTTGGAAATTCTTACTCCATCCC
AAAGAGTCCATCCCATCAACTCGAAGATTTAAGTTCCTCTGTTGCCGTCC
TCATCATACTCGACAATTGGACGAATGATACTTACACAATGATCCAATCT
GAAATCATATGTGGATCCGGATTGGTGGAATGTCGAGAGAGTCCAAGGGC
ACTGAGTCCACTAACGAGTGAAATCTTTATGTTGGAAAATGGAGTAAGTT
GTATACATAATTAATTATCCATTCTTTAACATTAAACCACTTCCCAGGGA
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ACACCTATACAGGAGTTGGGGTTACGAATGAGGTACCTGTAGAAGAGTCA
GAGACGTCTGTATTTCAAAGAATGTACTATGACTCGAATGATATGGTTAG
TTTCTTCAAACGTGGGGTAGCTGGTGAGGTCATTGAATACTCTACGTGTT
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AAATCGTGAACTTTACTTTAATTCGATTAGGATTACTTTACGGGTAATAT
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CACAATAAAAAAACTTTCAAAAATAAGCAGTTGTGCGTATGGAGGCAAAG
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TCATGAAGGTAATAAAATGCTCTCAAAATCTTTTTACAAGGCTAAAATCT
GTGTGAATTTATGTCAGAGCCTTGAAAGGTCACCTGGCAGCGGTAGATGC
CGGAAAATTGGGATCAKGGAGAACGKGGGAATCACCAGAAGTCTGGCCAA
GTCGAKGAAGCASCCTGCCAATCCTCTTAATAATAGTGATGTGACTGTGA
GGAGGTTTGTGTATAAATTTGGGAAGGCTTCTTATGTACGACACTATTCG
GAACAACAACTAAGGACAACTGGGTCGAGAGATGGCAGAAATTTTTGACT
TTGTTAAAGATTATTTGTTTTTATGGCCATCCTCCTCCCCATACTGTTCC
GCCCTCGACTATGCCATTTAGGGTGTTGTCGAGAAGAGAGCCTGTGCTTC
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AGATTGGAGGCCGTGTTAGCAGCCAAAAGAAATCATTTAAAAATATATAT
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TGTAATAGTTTATCATACTTACTTCATTATAAAAATGTCCATGATTTTAC
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AGTTTTTTTAACACCAGTGATGTTTTCATTTTTTTTGTTTCTCCTTCAGT
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TTTTTGCAAATTTAAAATTACGAAAATGAATTAAAAAATCGTTTTTTTAA
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TATTCCAATAAGTGATAGCAACTGACTTTATTTCCAAGGAAACTTTAAAA
TCTTGACTCTAGAATGAAATCACACCCATCTCTCTACTACTTTCTCAACT
TGATTGTCATGTACTATAAAGTAGGAAGTTATGTTATCCCATCCAAGAAT
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AGAAAAAAATAGTCTTTTAATTTGTCAAAAAGAGAAGAAAAATGTGGATG
TTCCATTTTTAGAGTATTCCTTTGTATACATCGTTTTTAATGGTTTATAA
GTAGTTCCGAGTTGGTAATTGTACAAACTAAGCGCAGAGGCTTATAACTT
ACCTAATTGGTTTTTACAGTTAAAGTACAATAAGTGGCGGAGTGGAAGGK
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AAGTTATACACATATTAATAAAATTCGGATCACATTGAATGAAAAATGTT
GAAAAAATGAATTTTTTTGAAGGTGCTCATATACAGCTCCTTCTTAGTAT
TTTTAGTCAAAACAACTTTAAAATTATATCTAAAATTCTTGTGTATCTGC
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CTTTCATTCCCTACTTGAATCATGGATCCTTCTTGCTCGAGCCGAGACGA
GAGAGGGAAATCCCATTGAGAATGGTCAATGTGTTTAAGGCCCTTCTGTG
CGGTAAAATATTGTAATATAGCGTCTGTATGATGAATGTATTATTATGAA
TTTTTTGTTTTGTTTTAAACATAAAATAACTTACAAAAATATGTATATGT
ATGAGAAAATTTGTTTGGATACGAAGTAAAATCTTTTATATTTGTCAAAA
AATGGTCAAATCGAAATTTGCATATAAATTTGAAAAAAAAAAAATGTTTA
GCACTAATTTTGGTGAAAAAAATAGTTAATATCATTCATTGGAATTGTAA
AAAAGAATACAAAATTACCAATATTCTTTTGTACTTGGAAAAGTTATGAT
GTGGAAAAAATAGCCATGGATAAATGGTTCATTTTTAAAAATATTGCAAA
AATTGTATAATAAATTGTTTACGAAATTGAAAAAAGCAAGTAAGGTTTTG
ATTTACAATTTGTATGTCCAAAAAACAATGTTTTGTGACATTTTTTTTAC
AATTAGAAAATGGACACTTTATGAAAAAGAGAGAGAAAAAAAAAGAAAAA
AATTAATTTAGAAAATGACAATTATTCAGTTAAAAATCAATTTTTATTTG
TCAAATTTATATGTAAACAAATTTCCAAATACATTTCTATATCTACGATC
CAATATTGCATTTGAAATCAATCTTATTGTACCTGAAAAAAAAACAGAAA
TTGTAAATTCATTTTTCAACCATTTCTATTTTTGCCCATTACTTTTTTAA
TCTTGAGTATATTTATCAACGTCTTTATTCGCATATTTGTTTTTGAGACT
TTAGTCACTTTTTTGATGAATAACTCAACCCCTAATCTAGTTTTCTTTGG
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TGGCTMMCGCCATAAAAAAAAAAACRACACCCCGGAGACATTTTACAAAA
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GTAGTTCAAAATGCAACCGCTAGATGGGCCACCCGTTATTAAAAGATATT
TGCAGGAAGTAATGAGTTTTTTATTTACAATTATAAAAATTAAAATTTTG
TGTCCAAAAATATTCTTCAAATTATAGTTTGTAATAATAAAAATTCTAAA
AAATACTAATATTGTTGATGTTAAACTCAATATATTAATGTCTTATATAA
CTGATATATTATTGTATATAATATATATAAAAATGACTCATTTGGAGAAA
AGAAAAATCCCGTGTTTATTCCAGGTATGTAGAAGTTCCATGACTCATCC
TGCAAATTTGAATACAAAGCGTATTATGGACAGAAATATGTTTGTTAAAT
ATTGACCTGTGTGTAACTTAATATGTATATACATATTAAGTTAACAAAAT
ATATTTAGATTTTCTTAATTTTTTGACAATTGATTTTAATTAAATTATCC
CTAAATTATCAAAAAGTCCCTTTTTATAGTTTTTATTTAGGTGTCGATGA
TGCCTCTTAGTAGTAGTGTTATGAAAGTTGACTATCTAAACTCGGAATAG
CTGTTGTTAAGCTGTTGTGAAAAAGTGCCTACTATTAAATTAAGAAAAGT
CCCGTAATTGCATAACTCGTTTTTTTTAGAATATATAAAAATAAGCTCTT
CAGCCTCAAAATAAATAAATTAATAAATTTACAGGTTTGATTCCTCGAAA
ATTTCTTGGTCACTTCGCTACTTTTATTGTGTCACACAACCCTTTTGCTA
AAAAAATAACAGGGATCATCTGGTGGTGAGCCAAATAAGTCAATCACACC
AACTGCTATTTACCACTTAAGTACTTCCAAACTATCGTTCTCATATTAAT
TCTCCACAATTTTTGAAATGAATTAGAAATATATAGTAATATATATTTTG
ATAATACGAAAATCCATCAGAGTATTTTATTCCATACTTAATTATAATAC
TGCTTATTAATATTTTATTAAAAGTGAAGGTATATATTCTGTTTTTCTAC
AGGGTCATTTCTCATAGTTACTCACATCTGATTAAATGAAACACCATAAC
AGCTAAGCTTCTCCCCTCCTAAAAAATCCTCAGTTTATCAAGATTAAAAA
GTAGATTTTCAGTTTATTTCATTTTTAAATACAGGTAGGACATAGTTTAT
ACAACTGAAGGCATATTAAATAATATTAAATTTTTATAAGACCATTAAAG
ACTCATTTTTTTTTATAGACTAAATTTTTCTAAATAGAGGAACTTGGAAA
AAATGAGTTTGGTCTTACAAAAGTTAAAAGATTCTGAGATCAAAACTCAA
AACTAATAGTTACCATAAGTTTTCTAAAATCTTTCTGTTTCTTTTTTTAA
GTTTTTGGAGGAAAGGTGAAGAGATATCTATCATCAGATTTATATGGTTT
TTATTAATTTACTAGGTACAGTACCAGGCATTGCCCGGAGTATTAGGCGT
CGGCTAAAGTACAAATTTTACTATAATAATATATAAGATAACTCAACAAG
AATTACCTGCGTTAATCTCCTCTTATCATGAGCACAGTCCCACGTAATAC
TCAAACCTTATATAAAGAGAAAAGTATGTCATTTATAATGGAATAACACC
TTGTTACTTCTTCCTTTGGGGCCACGTGAAAGATAAGGTCTGCACCAAAA
GCCCAGCGTCGATTCAAGACTMAAAGATGGACTGCTTGAAGTTTTTGAGG
GGGGTATACAMCAGCCACTTTGCGATTTGGTGATGGAAAATTTCATAAAA
AGGGTACGATCTTGTAAGCGTACCTCTGGCATAAATTTGGATGTTAGTGT
TTTCACTTATCAATGGCATCCCTTTACATTGAAATAAACATCCGGTCATT
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TTTTGGAAAAAACCCTATAGTTTGATACTGTGTTGTGTTGTGGTTTTATT
TTACATTTAAAAATGTTTTTAGGATGACCTGCTTTTTCAGAGTGGCTATT
TATCAGGAAAGGTTTAATAAGGACCGGTATAGTGTAGAAACTTATTTGAT
TTAAGAGACTTACGAGTATATTTGACCCCAATTTTTCCCTTTTCAAATAA
AATCTATCAATTTATTTTATTGTGAGGATTCATTTTGAATACTATATCAA
AGTGTAGATACGAATAATTTGCTGAATATTACACACAATTTATTAAAAAA
AAAGTTCTAGCCTGCTTTTCTTTTGACGTGCCATATTTTTAGACTTTTTT
TGTGTCTTTTTTCTCTCTATCTCTTTAATATATTTAGAATATATATTAAT
TCACTTTATATACATTTATTTTTAGTTACGAATTAAGAATGGGTAATTTA
TGTAATTCCTTTTTTACATTTTATGTCCAATGACGTTCAACTGTTATAGT
ACAAAAGTTAGACATCGAACATATGTAAGCATTTTTTCGCACCATTAATG
GATGTAAACATAAGTATAGATTATAATCATACCAAATAAGCTTCAAAAAT
ATCCGAGCAACACGTAAAACGGCAGAGGGCATGCAAYCTCCTACGCCTAC
AAGTTGATCYCCCMCAGCCACATCTCAACCGTAGACTCTGTTCTGAGCAG
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GCCCATGTCTTGCCATAATTGAAGAGCACGTTTCCCAGGGACAACCATGT
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ATCTCATTGTAATGACTCATAGATATTGATAKTACAAAGTATCAAAATTT
AMTTTCAAAAGGATTGAATTTCTAAGCAATTGCTTAGTTATATCATCTCA
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TTTTATGAGCAAGCAGGGACCATTTAAGAAATTAATGAACATTTTTAATT
ATTTATCTATTAATTGTCTATTTTTAAAATAATTAGGCATGAATAAATAG
AGTTTTTAAATTTCCTTAAAACAATTGTTTTAATTCAACTCTTTCATTTG
ATAATCATTTTACAAACAGTAAAATAGCTTTTACTTGGCCTCACATAAAA
TAAAAGAACAAAATAATAAAATGAGCGTTTTATGTTATTTTTGATTAAAC
AAACACATATTTCATTCGAATATTACTTCAACTTATGATTTAAATTATTC
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TGTAACTACGTAAAACATTTAAAATTTGGAAGATGGGACATTTTGAAGTC
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TCTCCTTCCCATAAGTGCACCACACAGCAAAGTCTGTCGGGTTCAAATCC
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TCTTTACAACATACGGAGTGGGATTTGTGTGTATTTACTTCGTTTCCCAG
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CTGAACAATTCCTAAAATTGTCCCCCTGTTAATTATTGGTTTCTTTTTTA
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GAATTTAGGTTCCACTTATTAACTTAAAAATAGTTTAACTTATTTTAGTC
ATGGTTATACGCGTAATTCAACAGTTTATATACATAAGTACCTCAATCAA
TCTTATATTGTATATTATGACATATATATTTTTATTTTTACTGTTTTTTG
TGAACCGAGTTTAAAAAAATATGAAACACTTGTATGTTAAAAAAAACAAA
AAAAATCGTAGTTATCCTGACAATTTGAAGAATTTTTGGGAGGAGAGTTG
TTTTGCTGTCGTGACGTTTATTTAAATTAGCTACAAGCACTAACTCTACT
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CTTGCGACAAATTGATCAGTCACTTTCTTCTTCATATATCTATGAATAAT
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GGTTGTAGTGTTGAGAATCGGTTGAGTCTAAAATATTTTTGTATATCGAA
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TCAAATCCATAACCTATTTTCTCACCCCTCCAAATTGATGTGTTGTACAA
ATATTATTTATGCAAACACTTTCGGTTCATAATACGTTATTGTTAAAATG
TTTACAATTTTGAAAAACAACTGACATTATCAACTATTTATGTTTAGACT
CGATCTAGACCGATTAGTAAATGAGAGCAATTTTTTTTTGTAGGACCTAG
TTAGAGTCAACTTTTCTTTGAGAATAGTGCAGAAATAACTTTGTAAAAGG
ACTGAATTAGTTTGGTTCACCAAAAATCATGCCAGCTTCAGATCCGGTTA
TGATTTTCAGACCTAAGCCCAACACTAGTACCTGCATGGACATTTTGGCC
TAGTACATCCATTAAGTACCACTCTTCTGAGGCAAAAAAGTTAGCAGCAA
CATTAATGGAGGCAAAATGTTCGGGGTAAAATTACTCAGAGCCTGTTTAA
AGATATTAATACTTAATTACCTACTATTAAATAATTAATCATTCTCCGAA
CTTTTTGAATAATTTCATTTTGTTCCTTTTTCACACTACTTTTTAGATAA
AAGCATTATACAATTAATAAAGATTGCCAATTGTATAATTAAACAACACT
TATATTACTTGGATATGGTGATCGAAATATTGATTAATGCCCAAACCGAC
AATTTTTTGGAAGATGATTTCATTCTCAATCAAAATGTACTAATTATTTT
TACTAAAAAATGATTCCCTGAACATTCCAAAATATTTCATTAAGCCAGCG
AGTAATTATTTGTCTTGAAGGTGGGAAAGGCTTACAAATGGATGCTCAGA
TATGTTCAACAATTAATTTTAAATGCCTCAATATTAAAATAGATAGAGTC
GTAATTGTTAAATAATTTGAAGAATCTCACTTTCTAAGTTTGTTCATTTT
TTTTTTTTTATAGTAATCATCAAAAGCTACATTCAACCCAACAATTACAA
GCCTATAATGAGTGTTTCTATTACTCCCAATGAGCGCTTCGAATTCGATA
TGGAAGAAGATAATGAAGGCAATTCCCAACTTCCGGTCCAAGAGTCTTTG
ATACAAGGAAAGAATGATGTCGATAGAGGTTATTCCGGGTCCTTCAATGA
GTCGGAACGTAGTCATCATAAGAGAAGAAATTTTTCTATTCTTGAAGAAG
AAATTAATTCTGATACACAGAATGAAACTCAGAGCTCACTGGGGGAAAAT
GATGCTCCTGGAAATGGGGTTACTCTTGGAGGGATAGTTTTGACTATTTT
TTTATTTATTCTGGGGCAGAGTTTTTCCTAA back to top
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