EMLSAT00000004485, EMLSAT00000004485-700332 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004485
Unique NameEMLSAT00000004485-700332
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s233supercontigLSalAtl2s233:93944..109965 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004485 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004485EMLSAG00000004485-687251Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000019503EMLSAE00000019503-728431Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019504EMLSAE00000019504-728432Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019505EMLSAE00000019505-728433Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019506EMLSAE00000019506-728434Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772248auto772248Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004485EMLSAP00000004485Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004485

>EMLSAP00000004485 ID=EMLSAP00000004485|Name=EMLSAP00000004485|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=314bp
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SYDGGTASAPGPGGASPKALYSPLGSGGGGSSDPAPTSSYVKSSSTSSGS
NNNSDCSAIVSSGGASNPGGSGGKDGTPNNGYGGLKEANWATSGSTPVRP
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ANHTFYPWMAIAGGTHLFTGANGLRRRGRQTYTRYQTLELEKEFHTNHYL
TRRRRIEMAHQLCLTERQIKIWFQNRRMKLKKEIQAIKELNEQEKQAQAV
KQQQQIVHHHDDGR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s233:93944..109965+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004485-700332 ID=EMLSAT00000004485-700332|Name=EMLSAT00000004485|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16022bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s233:93944..109965+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATATCGGTAAACATACTACATACTTATAGTTGAACATTGTAGAAGGAACG ACTAAAGATTTTCTGGAAGAAAGAAAGAAAAAATAAAGTTAGTTATAGTA GGCCTGATTATTCTTCTTCTTCTATTTATTTCGTTAAAGAAACCGAAAGC GCACACTCTAGGAGCAGCAGCCCACGACTACCCCTCGTATAATACACACA CACATATGACTGAAAAATAAAAAGCAGAAATAATAATAAAATAATAAAAA TAAAAAATAAAAATGTGTGGTTTCTAGTCTTACTTCATTGTCTATTGGAA ACACTATAAGGTAATAAAATCTATTACTAATTGTTATTAATATATTTAGT AGTTATTTATTAGAGGCAACTCAATTTTATTATAGTTATTAAATATATTA ATTATGATTTAATTATATAATATAATATAGTATGAAAGAAATTACATTAA ACAACAATATATAAGTTTAAAAGTTTATATATAATTTATATTTTTAGAAA CTGAAGGAGTAATCTTGTATTTTTTTATGATAGCTTTACGATTATGACAA TATATATTTTTATATGCTTAAATTATTTGTTATTGTATTGTATGAGGTAA TGGTTTTGTTCTTAATTGCAAGAATAATTAATTAACAGCAATAGTTTTAT TATTTAACTAATTAAGTTTTTTATTACAAAATAAATATTCGGAAATATCG TACGTTATAATAATCAACACAACCTCTTGTATAAGTTAATTTTTCGCTAA GTTTACAATATGTTATCATTCTTATGTCTCATTACTTTTTATTTCACCAT TATATACCCAGTCATTTCAATTAATAACTATTAATTGAAATTATCATTTT TTTATGTTGATCTATTAAAATTATGCCTTCATTATGGTTTTTACAAGTAA TATAACCAATGTGGACATTTGCACATTTCAATGTGCCACGGAATGCTTAT AATTAATTAGTATTTTTTAGTATAAAATTCAGTAATTGCACCATTATTAT ATGAACTATCTAATAAATAATCAATTACTTCATAACTTTAAATTATTCAT CTAATTTTTGATTATTGCAACATGTAGAGCTTGCTTATACATACAAGCTA TAGATTGTACAAAATTGCAACTTGTACATGAACCACATATATCTTATAAT TATTCAATAATCAAATTAAGTTGGATATAAAACAAATCTCACCATAGAAA ACCATGGTATAAGGACGCTCCTTATCAAAACCTTTTATTTTATTTAATCA AATGTACCTCAACCAAATCCCCACCATTCATATGAAACAATTTTAATCAG ATTCAAATAACAATAAATTTAAATAAAAACATAGTGCCCATTTCATAGGA TACGCCTTTGTCTGTTGGGGTGGGGTTTATTTTAAGGTACTTACTTACAT TTAAATGTAATATGCATTCACTATTCAGAATGGGTATGCTCAAAAAYAAA AACAACAAWAACTAAAAGANNNTGGTCAGCAGTGTTCTTGGAAAACAAAA ATCGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGWAATTTAAAATTGAGACATT TTAAGGCGGAATTATTGAGATWTTTGAGCAATTATTGTTWTTTTTTATCA TTATCATTATAGCTTCAAGGGATTTTAAGAGTGCAAAACCATGTTGCTAT TTTTTTTTTTGTACAAAAAATTTACTCATAGTTTTTATTTCTTCCTAAAA AAATAACTAATTATTTTTTAAGGTTTTTTAAATAAAAATTGTGTTTTATT TTTTGTTAAATTAGAAATGATAAGATCTTCATTTATTTTTAAAAGATGAT AATTAAATTTATAACAATATAAATAGGTAAATAATATACTTTTAAAAAAT ACATAAATTAATTTCATCAAATTCACAATATACCTTGATTAAGATTATTT CTTATGGATAAAAAAATAAATTGATGACATACATATATTATTATTACTAA GTTAAATAAAATATTCAAGTAAAAAATATATGACAATAATTAGAGTAAAA ACTTTTTTTAATACAATTTGCAAATTTAAACAACCATATATTTATGTCCT TTATACAAACTATTGAATTATATGTTCAACCAAATTTCATATGTTTTAAA ATACATAAGGAGTTAGAAACTCAAGCAAAGTTATACTAAATGCTAAAAAT CAACTTGTATATTTATAATACATTGATTTATGAACAATATTTGAGTAAGA ACGAATCCCTTGGGTACGTTTTGTCAGCGTTCATAACTTGGCTTATAAAA ATAATTTCTTATTAAATTATAATTATTAATTATTTTCAATATATTAAGTC ACAAATAGAATTGATACAAAATTTTGTTATTTAAGATATATTAAAAAGTA AGGAAACTGTGTTTCAACCCATTCAACTCATCATTTTTTGTTTAAATTGA ACAAGGGAAGTTATACTACAGAATATTCACAATACGTAGTCTGAGCTACA GTAATATCTTATATACGTGTTTGTTTCGTTCCCTGGACGGAGGTCGCAAT TCAAAAAAAGTAGTATTTAAATGCAATTTTTATTTATTTTAAAAAAACTC ATATGCTGGAGTACCAGGGGCATCCACAGGGGGTGGGCTGGAGGGTTGGA GTCACCCTGAAATATTTTTTTTATACAGAACACTATATAAAATTATCGAA AATATTTTTTTTTTCAACTTAAAAAAGCTCATTTTGTCAACTTCAGACTT TTTCTAAAAAAAAATTAGACCTAAAAATTTTACCATAAAGTTTTTTTCTA TTTTAAAAAAAGGCCACCACAAAATATAATCTTCCGGACACCCCTAGGTA CTCGTATTTTAAGTTATTGATGATAATTTAATAACATTGAGTCTGTTTCC TTATTCACATTTAGTCCAATTTGTACATAATTTTATACAAAAAATGAAAT GAAATTTATGAATAATTCACATTAGATAATTTTAGGACAAATAAAATTCG GACTGATAAAGTAGTTCTATCAAGGGTTTCAATTTAATGTATTATGTGAA ATCCAAATATTCATAACGAAATGACGTTTTATAAACTTTTTTAAAGAAGT ATTCTAAAGGACTATCATCTATAAAAAATAAAAATAAAATAATATCTTCA TGCAGAGATCATAATGTCATAAATTTGAACGAAATTCAATCTTCACCATC ACACATTCCCTGTAATAAATAATAAAAAAGTTAGTAAAATTATCATATTA ACATGTTATAAAATGATCACAAATTAAACATCTCTTGTACTATAGTTCTT GCCAATTTCTCTTTATTGTAGATATTTTAATACTTTTTGGCTGAAATGGT CAATTAGTACCTATTGTGGTGTCACGAGCTTATCGTAAAAAATGTATAAT TTATTCACATAATCAAATAAATTGAAATAAAACAGGTTTTAATAAAGGAG AAAAAACTAAGAGNNNNNCTTGCCAATTTCTCTTTATTGTAGATATTTTA ATACTTTTTGGCTGAAAYGGTCAATTARTAMCTATTGTGGTGTCACGAGC TTATCGTAAAAAATGTATAATTTATTCACATAATCAAATAAATTGAAATA AAACAGGTTTTATAAAGGAGAAAAAACTAAGAGCAACCTAAACATTTATA AAAAATAGCGTATATCTACATTAATTTATGACTTAGGTTGCGCGACACAG TAGCTGCAAAAAGTCTATTTTTTATCTCTTACTACTAGTAAACACGTAAT TATAACTCATTCATTTACTTTATGATATTTCCATGTATTAGACTGTCCCG TGTTCGGTTGATGTTTTTTCTCGAACATGAGGACCTTATTACAATATGGG 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TTTTATGTATATTTTATTTGCAATCCTTGTCACATTAAAAAAATATATAT TTCACATAAAAGATTTTAGTACTTTTTCGTACTCTCTCAAACAACTTTTT TTGGGGGGAGGCTTTATTGATAGTAGAAAGGGGGGGGGGGGGGACGGGGA CGGAATTGATGAAATACCCATTATAAAMAATCGGTCATATTGATTATATT TAATCATTTATTACCAACCTCTTCCTCCTCAAAAAATATATTCAAGGTAC ACAAAATCTATTGTATTTTGTTTGTTTGAGTGCATGTAAAAATTTTTTTA GAATTTATGAACATACTCTAATGATAGTAAATATTGTTTAAATGGACAGT AGTAAGAGTACTTTAGATTTGTATACATGTGGGCCGTCAAAACAAATGCA AGCTACAATTACTTTTCTTAAACTTCAGTGTACATTACAATTGTCAATTT CTATAAACACATTTTCCTTGGTAACACTTTTGGTGTCCCGTAAATGGATT ATTACATTTTTAAATTTAAGAACTTTATAGTTTTTATTTGAAAGGTCATT TCAGAGCCTTTACAAGTATCTTAAATCAAAGAAAGGTTTTAAACAATAGT TACAATTCTGGGGATCTTAATTTATACAATGATAATACTAGATGTATAAA GTAATCAAAAAATAAATTGGAATTGTCTTCATTTCTAGTTTTTTGTTCAC AATAAATATATGTTGTTCAAAACTTTAGGTAAAAACTCGTTTTAAATCGC TTAAAAAAAAGTCCTTAATTTTTAAGTGACGGCTATTTAAAGTAAAAAAC TTTTTTTCGTAAAACTTTTACAAACACTTTGGCCTATTTTCAAATTATGA AAATCCGAATTTTCATGTTTTCAAAATAAAAACGTTGATCACTTGAAAGC AGTAATGAAGTATAATAAATCCAACAAATTATTCTCATAAATTAAGCATT 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GTAAAGGAAATTTTTTATGACTTGACACAAAAGAAGAAAAAGAAGAAAGA ACCTTCTTTTGATTTGTTGTTGTTGACATATTTACATATGTTGTTGCGGT TATTGCTATGTTATCTATTTGATTTTTGACTTTATTCAGCTTTTTGTTTT GTTAAGTGCCCTTGTCGTCTCAGCTCCCTGGACATTTTGAACGCAAGAAC CTTCTTCTGAATCAGCAACATCCTTGTTCATCTCCTTCTTAGAAATACAT AAAAAAATATCTGTGATCAGTGCTCCTGGACAATATGATGAATACATATT TTGAACAGAGTGGATTTTATGGCCAAGCAGCCGGTGGTCCAGACCAGGCC TATCGTTTCCCCCTCGGCTTGGCCGGMATGGGAGMATCTCCCTACGCTCA ACATCAGCCACCCCGTCCGACTCCCCCACAAGAGTCCTATGATGGAGGAA CAGCTTCAGCACCTGGACCAGGAGGAGCTTCACCAAAGGCATTGTACAGT CCACTTGGAAGTGGTGGAGGCGGYTCCTCAGATCCTGCTCCAACCTCCTC CTACGTCAAATCTTCATCCACATCCTCTGGAAGCAATAACAATTCAGACT GTTCTGCCATCGTGTCATCTGGAGGAGCTTCAAATCCCGGAGGAAGTGGA GGAAAGGATGGGACTCCGAATAATGGCTATGGTGGACTTAAAGAAGCAAA TTGGGCAACCTCTGGCTCAACCCCTGTTAGACCCTCTGCATGTACTCCAG ATATGTCAAGATATACTCCAAGTGCCGCTGATGCAGCTGCGGCACGGGAT AGATGGATGAACTCCTGTAGTAGTCTTTCGAGTGCTGCAAGTCAAGTCGC AGCCTCACAGCCTCAATTACAACAAGCAGCCTCTGCTAATCATACATTTT ATCCATGGATGGCAATTGCAGGTAAGAAAGTCAAATTAACTCCCCTAAAA 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