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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s233 | supercontig | LSalAtl2s233:93944..109965 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004485 >EMLSAP00000004485 ID=EMLSAP00000004485|Name=EMLSAP00000004485|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=314bp
MMNTYFEQSGFYGQAAGGPDQAYRFPLGLAGMGXSPYAQHQPPRPTPPQE SYDGGTASAPGPGGASPKALYSPLGSGGGGSSDPAPTSSYVKSSSTSSGS NNNSDCSAIVSSGGASNPGGSGGKDGTPNNGYGGLKEANWATSGSTPVRP SACTPDMSRYTPSAADAAAARDRWMNSCSSLSSAASQVAASQPQLQQAAS ANHTFYPWMAIAGGTHLFTGANGLRRRGRQTYTRYQTLELEKEFHTNHYL TRRRRIEMAHQLCLTERQIKIWFQNRRMKLKKEIQAIKELNEQEKQAQAV KQQQQIVHHHDDGR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s233:93944..109965+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004485-700332 ID=EMLSAT00000004485-700332|Name=EMLSAT00000004485|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16022bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s233:93944..109965+ (Lepeophtheirus salmonis) ATATCGGTAAACATACTACATACTTATAGTTGAACATTGTAGAAGGAACG
ACTAAAGATTTTCTGGAAGAAAGAAAGAAAAAATAAAGTTAGTTATAGTA
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TTTTATGTATATTTTATTTGCAATCCTTGTCACATTAAAAAAATATATAT
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TTGGGGGGAGGCTTTATTGATAGTAGAAAGGGGGGGGGGGGGGACGGGGA
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TGTTTTTTAATTAGTTAATACTTTTGGTCATAAGTTGATGACAAAGGTTT
ATTCTTATTCTTAAAGTATAAATTTTTTGTTTTATTTTGTGCAAGATATA
AATGTCTTGATAGTTGACTAGTATCAATTTATATTGATAATTTACGTGTA
TATACATATTAATAGCAAACATATAACAATAAAATTAAGTTTTTTGACTA
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TTATGGGCACGATGATACTCATAAAATATAAAGCTTTATATGAAGAGTAT
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CAGTAAAATTATTTATGCATGAGGGRTTAATTTGATATTTTATGAGTTGT
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GATCATAAAAATTTAAAGAAAAATACATTCATTAAGATAAAAAGTTTGTT
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TGTCATCGAAATAGTTCTGGAATCCGTGATTTTGGCGTGTTTCACTAGCA
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AAAAAGAAGAAGAAGAAAAGAGCCAAACAACAGCTCACGAAACCTATCCC
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GAAATACCCATTTTTTGCTGTAGAATATTTAGTTATATATTTTTTTAACA
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CCGATTATTATTGTTTTATTTATTGTTATTGCTAGTATAATGGCGGMAGC
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GCATTCCACTTTTCTTCTATCGTGTACGCGTTTCAGTTTTTCCTTTAATG
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ACATCAGCCACCCCGTCCGACTCCCCCACAAGAGTCCTATGATGGAGGAA
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TTGGGCAACCTCTGGCTCAACCCCTGTTAGACCCTCTGCATGTACTCCAG
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AGATGGATGAACTCCTGTAGTAGTCTTTCGAGTGCTGCAAGTCAAGTCGC
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AGCCACATGTTGAGGATAGAAGAGACCAGCTGGATTCCATTGCATTTTTA
ATAATATCATCATGAGCTATGCATTTATATGTATATATGCAAGCCCATCA
TGATGATATCATACATACCCCCCCCCCCCATCCTCATCAAAGCCCCCCCT
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TGTTGAAGGAATTATGTTTCATCTGTTTTGTTATATATACGATTGTATGT
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ATACATAATTAGTGACAAGTATACAATTCCAGTTCTATTTTTTATTATCA
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ATCCAAATAACAATATATTTTTCAGTTATATCATTTTCTGCTATCATGGA
AATTATTTAACGGTAATGTAAGAAACGTAATTAGTTTCTACAAGAAGGGT
ATATGTAGATATCCTATAAGCATTTTGATTTGGGGGAAGGTATGGTTAGA
AATGTTTAAGTTGTGGCTAAWGTCAATCCAAATGTATATTTTAATAAGAG
TCGTGAAAATTTAAAAGTATGTTTTGGTTACTTTAAGAAACAATACATTT
GAGGTTTGACTTTTATTGAAGCAAATGAGCTGGCCCATAATTACAATCTG
GCTCTTTGATTTTATTCTGTCAACAACAAGTTATTGAACATAAGTAATAA
GCAATAATGGTAATAGAACTAATCAAAGTGCAAGCACTAATTGTTCTGTT
TCTTTCCTTTCTTAAAATTTACTCTATTTCAACATTTCTCGCAACCCTAA
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CGTTTGAATTGACAAATAGGGGATGAATAATTAATAATATGAAACCAAAA
GTATTGTAGGTTACGAATCTATACATCCAAATATTCAGTTATTTTGGCTC
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AGCAGTTTATAAATATGTGCAAACTATTATATTATTTAGTGGCATGACGA
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GCTTAAGAGCAAAACTTTGACGTGACTTAGATTTATTTGACAAAGAAATA
GGGAAAAAGTTACTGACAACAAGATGCAGCCTTACTGCGATCAAAATATT
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ATCAATTTATCTTTCCTTTAATAGAATCAACTCTCAGTTTCGAGAAAAGT
TATTCTTGCTTGCTTTTGTGTTGAGGAAACATATGTCCATATATATATAA
AGAGAAAATTTGTCAAAAACGAGTTGTTCCATTTAAAATACAAATAAGAT
AATTTATTAGTTTTTGAACTTGATCTCTTTCTCTCTTTCTTGATCCATCA
ATGAATGCTACTGATTTTTATTTCATTGTTTGAGTGTTTTCATCAGGTCA
AAGATGTGCTAATGTTATTTTATAATATCAAACAAGTTTATGTATGTACA
ATGTAACAAGATAGAGGTCGTCTGGTGAAATTGTCACTTGATTTATGCTT
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ATTTTTATTTTTTTGCTCTCTTCTTGAATGAACAATAAATTATCCAAGTA
ATTATTTATTTCGTGTGTATGTTGATATATATATATAAAAGAGTTGATGA
AGCTAGTAGGAGTTCTCTTCTTAAATCATGTCCTTAGATAATGATTTATG
TTATTTATAGCCATTTATGACGCATTCCCATTTGTTTATTATTACATACA
TTTTTTGTTTGTGCCCTTATTAATGCCTTTTTCCCCTTCTTTTTCCTTCT
TTTTTCTCTTCCAGGTGGGACCCATTTGTTCACAGGGGCAAACGGATTGA
GGCGCCGAGGGCGTCAAACCTACACCCGCTATCAAACTTTGGAACTGGAA
AAGGAATTTCACACCAATCACTACCTCACTCGTAGAAGACGGATAGAGAT
GGCTCATCAACTCTGTCTAACAGAGAGGCAGATTAAAATCTGGTTTCAGA
ATCGACGAATGAAACTCAAAAAGGAAATCCAGGCCATTAAAGAACTTAAC
GAACAGGAGAAACAAGCACAGGCCGTCAAACAGCAACAACAAATAGTGCA
TCATCACGATGATGGGCGCTAAATAGTTGCGAATATGTAGAGGATGGATG
YAATYAAGCCGCACCAATAAGTAGCCGAAACTCTTTATTTACTCACATTA
TATATGAATGTTGATAGACAAACTACAGAGAAAAAAAGATATACGTAACA
AGAACACAAGAACAATTATATTATGAAAGTAAAAAAAAAAAATATTATAC
AATGAATAGTTGATTTCAGTTGAACTCTTTGAATAGAAAGCTTAATGTTA
TTAAATTATGAGGACTATTGATGAACGAAAGAAACGTATATATGTTGACA
ATACCAACTGGTTATTCATAAAACCATTTATACGTAAAATAAAACAACAC
AACAGGAATGTAAGAAAATGAAAAAAAAAAATCCAGTAGGGAACGACGAA
CAAATCTCTCTCAATCTCTTCAAAATATACAATTATAATTCACATAACAT
AAATACCAAAACACTTGTCTTTATTTTTATAAATTTAATGAATATATCTA
TATATATACATAAATATCTATATCTACATTATTAAATAATCATTTACATT
TTTTTAATTATTATTATAATTCGTATTGAATTATTAATTAATTCAATATG
ACAATAATTTAAAGATTAAATATAACAAAAAAAAAAATGTTTAGAGTAGT
TTCTCGAATTGTTAATGATTCTCCTTTTAGCTGCCTCAGACCTAAAGGTG
TTTTTTTGAAAGGAAAAACTCTTTCAAAACAAGACTGATGAATCGTTTAT
GTGKAAAAAATCTTAWAAAAACCTTCAAGAAACRCTCTGAAACGTAAAAA
AAAAAAAAAAACAATCTTTAAAATATTTTCAAAATACGTAATTTTTTTAT
TATTCGTAAAATTAGTTAAGGAATTTTCAATCATCGTGTTGTTTACTTTW
TATTACAATTATACTGATTATTGTANACTCTCACCAATACATACGTAATT
ACTTAATGAATCTACCACTTTTGGCTCCCCATTTTTTTGTTAGCCCCATT
CTCTTATTCCCCATCTTCTTCTTGTGAATTCATCAAATCTTATTTAGGCC
AAATTTCGTTTTTTTTGTTTTTTTTTCATTTCTGTCAACCCAATATTTTG
TCTTCATTATTATTATATACCA back to top
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