EMLSAT00000004616, EMLSAT00000004616-700463 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004616
Unique NameEMLSAT00000004616-700463
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s240supercontigLSalAtl2s240:453374..473610 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004616 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004616EMLSAG00000004616-687382Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000020137EMLSAE00000020137-729065Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020138EMLSAE00000020138-729066Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020139EMLSAE00000020139-729067Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020140EMLSAE00000020140-729068Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020141EMLSAE00000020141-729069Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020142EMLSAE00000020142-729070Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020143EMLSAE00000020143-729071Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020144EMLSAE00000020144-729072Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020145EMLSAE00000020145-729073Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777819auto777819Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004616EMLSAP00000004616Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004616

>EMLSAP00000004616 ID=EMLSAP00000004616|Name=EMLSAP00000004616|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1069bp
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PYLCYEHGGGSFLVAYVCMLLITALPLFVLELVLGQYVNIGPIKIFNLLC
PALGGMGWCMAIISLFICIYYNVIIAWTFNYMYSSLVLGDLPWKSCGDWS
SPSCFTREQDAICSRGNYSIYWNKTCTSLEGMSCDLFNHTSWNTTHCLNS
TSGFITKIDSLLRKSASEEYYSKVVLGLEEDSSWENLGSIQPHSLLFLTI
SWIVVGSCLMKGIKTSGKIVYFTALFPFLLLAILFVRGITLDGAIDGILF
YITPKWSKLMEPGIWIDAVTQIYFSLGVTLGGLLTLASYNRFDNNCFRDA
IVISFSNCGTSIFAGFVIFSILGHMAYNLGVPIDQVIRSGPGLTFVVYPE
IVTQLPFPQFWSLLFFMMLALLGLDSQRIEWVTVGTCLFCFLCAWPMCLN
GGVYIFQLFNVYSATWSLMVISFFELFISMAIHGFGSMNINIQEMGVKIP
CIVRGYLGLTWQFLTPLTLSWTMVVFSLLPIPLYFFILLLSPNESDDNTL
RGWIDKLFSSRNWIPQYRRPEITLNDDTNIIPDTEDVYEKYERPRRLEKT
RTIQQEINPVFNRIGLRDENEKVDVKTPPTPTTRPQAGQKRILTGTRRRK
PSKIHRKPLVAIQMSTPPIRTLPPQHHRFIQHSTTVSPVTTPLAVKILPS
FKPQNLPSRQRIRVKIPKNTSLPIIRQSVPDNVSPTNKPQIPSNPFIKTT
NYIRQQTTPILFTKSQKTSPSRFIYPSSTSRPFIGIQSIDTNPIFTNSVK
TLPLSSESFLSSKLPRPLSNLRSQSQAPSKGQIISSKPFNQFKKFKKTSS
KIKLPHKSAIKSLPSKTRNVVHHFPRHPLPSPPPPLLPTSPRINGDXPSK
PFKPSPKIIEGNFVPSTQAWTTKTGATNNKVTSGRRPPVVPRVPIIPKTQ
IPKFISTNGISNSGEKYRKGKGLNDDQRVTNNKDLLELYSTPSNFQCTNQ
EYPGLYADLETNCQTFHMCQVGGRQNTFICPVGTLFDQRYLVCNWSNQVN
CRNSVEFYNINRKIYKPTS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s240:453374..473610-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004616-700463 ID=EMLSAT00000004616-700463|Name=EMLSAT00000004616|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20237bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s240:453374..473610- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTAGCTCCTCAAAGAGTAATAACAATAATATTTGTACTTCTAATAA TAAAAAGGATGTTGTCGAGAGAGAGAAATGGGATTCTCAATGGGATTTCC TTCTCTCTTGCTTAGGATTTGCTGTTGGGCTCGGAAATATTTGGAGATTT CCATATCTCTGCTATGAACATGTACGTACAAATTGTGCAATTAAATGAAT CATCAAGAGATTTTTTTGTGCATGCTTTTTCTATTTTGGTTCATGGGTTG TTTGTGGTGGTGGAGGAGGAGGAGGTAGTAGGTCCGAGGACTTTCTTTAG GTAAGAAAGTTTAATTTTTCAACAAAGAAACAAAAGCCGGGAACTCAGAC ACACACAAAAATACAACCAACCATTTGGGATTTTGAAATTGAATAATTAT CAAAATTGACAAAACCTAATTGTATTGAATCATTAATTATCCCAGACACA GACTTACTTCTTTTTTCCTTCTTCCATTTTTGCCCTTTTGTATCAACCAA TATTTTATTGTTTGAGGCTTTCGCATAATGCTTTTTAAAAAAGGAAAAAG AAAGTCTTGCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGGGAAAACTCTAGTA GATTTTGATTTATGTATAATATAATATCTCCATTTTGTCACGTTATATAT TTTCTAAAATTGAGCCTGCTTATGGAACTCAAGATAATTAATGTATGTGA TGTTGTCTCCAGGATTTTGCAAGAAAACAAAAGAACCCCGGCGCAAATGA TTTAGAAATGAAAGCCAGCATGCTTTCTGAATGAAGCTTCATCAATTTCA GATGATTCATTTCATTGCACACCATGTTTATTTATTTTTTACAATTAGGG TGGAGGTAGTTTTTTGGTTGCCTATGTTTGTATGCTTTTGATCACAGCAT TACCCTTGTTCGTTCTGGAACTTGTACTAGGCCAATATGTCAATATTGGA CCCATCAAAATTTTCAATCTATTATGCCCAGCCCTAGGTGGGATGGGATG GTGCATGGCCATAATTTCTTTGTTTATTTGCATCTATTACAATGTTATCA TTGCTTGGACATTTAACTACATGTACAGCAGTCTTGTACTTGGGGATCTT CCATGGAAAAGTTGTGGGGACTGGAGCTCTCCATCCTGCTTCACTCGAGA ACAAGATGCTATATGCTCGAGGGGCAATTACTCAATTTACTGGAATAAAA CTTGTACCTCCTTAGAAGGCATGAGTTGTGACTTATTCAACCATACATCA TGGAATACTACCCATTGTTTAAACTCCACTTCCGGCTTCATAACTAAAAT AGATTCACTCCTAAGGAAGTCAGCAAGTGAGGAATATTATTCAAAAGTCG TTTTAGGCTTGGAAGAAGACTCATCTTGGGAAAATTTGGGGTCGATACAG CCCCACTCCCTACTTTTTTTGACCAGTAAATCCATACAATAGAAATCTGA TTGTAAACAGCATCAACATTTTTATTGTTTCTAGTTTCCTGGATTGTCGT GGGCTCTTGTCTCATGAAAGGGATCAAAACGTCTGGGAAGATTGTTTATT TCACGGCTTTATTTCCATTTTTGCTCTTAGCTATTTTATTTGTCCGAGGT ATAACTCTGGATGGGGCCATTGATGGAATATTATTTTATATCACTCCCAA ATGGTCTAAATTGATGGAGCCCGGAATTTGGATCGACGCAGTGACACAGA TCTACTTCTCCTTAGGAGTTACTCTTGGAGGATTATTGACGTTAGCATCC TATAATCGATTTGACAATAATTGTTTCAGAGATGCTATTGTTATTTCATT CAGGTATTCTATTTTTTTCGGGGGTTATCTTTTAAACGTGGGTTAGTAGT CTAACATCCCTTCATTTTTCAGCAACTGTGGAACATCAATATTTGCCGGA 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ATTTCAATATTATTTTAATATACATAGATCTCAATCCTGTCATATAAAAA TATTATATATATCTCTATACACATATATGTTATATATTCAATTTTGTTTC ATGAAAGAAATAAAAGGAAATTACTCATAAACGCAGAAAACACACACACA CACAAAATAAAAAAAAGTAAACCCTTTACCTTTCAAATACATATGTGGTA CGTCAACATAAAAACAAAGAAAAGGAGACAATTCCAATTAATTTTTTTAA ATTCATACATAATTAGAGCCTAATATTTCATATACATATATGAGTAATTT ATAGGATTTGTATTCAAAGTTCAGATACACGAGAAAATTAGCAAAGGCTT AGTACCTTTGTCTACTTTGAGAGACTTATATTGGCCCTCATACGATCCCT TTCAAACAAAGTCTATCAATGAATCGGCGATCAATTTGGGCTACTTTAAG TAGTATCATTTTGAAGATTGTAATTCTACATAGGATACAAATTTAATTCG GATTCAGTTTCGAGAAAAATCACTGTAGCTTGTTTTTGTGTTGACGGGTC ACCTATTTAATTGTCATTCTATAAGTATACAAATATATCAAACCATTTGT TGTGGTTTATTTTTGATAGAAATGCATTGTCATTCATTACCTGTAAAATA TATGTCACAAGCAGAATAAATGTAGTCATATCATTGTTATATATATTTAT TATTTTTTATAAAATAATTAATAGCTGTTGATTGTATATTTATTGACAAA ATATTGAAATATGAGTTTGCGTCTGTTATTTTAGTGACTCTTTCTCAGAA CTTAATCCTTGTATCAAAGGAAAGAACATATGATATATTCATTTAGAAGT ATTAGTCTAAGGTAGTTGAATAACTACTTAAATGTCTGGAAATCTTCCAT TCTCATAATGATATGGTGGAAATTTTTAATGGAGAGGTGCCAATTTCTTC ATTTATCAAATATGATTCATATCCTTTGTATGAGCAACAAAAAATCCTTT ATACAAATTCTTTGATATCCCATTTTGAGCAAAGCTTTCGCATATAAACA ATTTATTGCAAACATCTCAAAAGGCTTTCTAAAGAAGAAGGTTTTTTCCT TAATTAGTTAAAGTAATTGTTTCTAAGACGATCAAATAAAGAAACATATC CTTAAACCTTATGGCATCCACTACTAGTTATATGTATGATATTAATTGTT TTGATTTCTTTGTGTAGAAATCAGAGCCCTTGTCCATTAGGGTGCATCAA ACTCCCAAAGGTTCATGTATTTTGTTACCCATTCATTCAAATGTGAAGTA TTTATGACAAAAAAAAAAAAAAATCCAAATAGGTCTTGGTCTATAGGAAA AACCAAGCACTAATATATTTTATTGAACCATTTAATACATAAAAAATCTC AGTTTTCTTGTTTTTTAACTAAAAATAGTCATGTTTGATATCAAATTAAA GTTAAATATTCAAAATAGCTTTGACAAATGTAAAAATTAGAATCATTAAA CATTATTTTAGTTCAAAAATTCATAATTACAAACATGATTATTTTTTTTA TTCATAATTTCGTATATTTGGATTTTTTGTTCATTTTTTTACTACTTGCA AGACATTTTGATAGTGTTTTTATGTTGTAGAATCTTATCAAAATCCAGTG TGAGCTTCATTGGTCATTAACAGTATTGATATTGTTAATAATTAACTTTG GTTCCTGAAAATATTCTTCTTTTTTTTCTGCTATGTGTTGATATTTTTTT TAAAAGTCCTATTTGGATTGAAGTGATTTTTTGTTAGCAAAGAATCCTGA AATGTATGTTTTAAAGTATACATTGAATCGTAGCGGTGTATTGGAGTATA TATCAATTTGTCTGGTTGTATGGATAGTAAAGCATCTGCAAGTCTTTGGT AACTTTGTTGCTGAAAAGACACACTATTACCATTTCTGAAATTATATACC ATAATTGCCTATCAAAAGCTTTCAAAGCAACTTTTGAAGAAGCTGAAATG ACATGCCTATAATTAATAAGAGTTTTGTTAAAACACAAATCAGACCATGG AGCGGTTGACGCAGACTGTGAAAGAAGTAACCAATTACAGTATCTATAAA CAATAAATTCATTTTGTTGTTCTTGTTGATACTGTGTTGTAACAGTAAAT AAATTTGACGTTCAAAGAGTCGAACTTTAATCGAGTAAAACATTTTCAAC GTTCATCTGGATTTATGAATTGCTGCAGGGTTATACTCGAATAGTTAGTC CTGTTTTGTTGTATCATTATTAAGAAAAGTTTCCCACAAATATAATTCCT GCAGTACAATGTGTTGGATATAATTGTATTTAATGTATTCGCCTTACAGA GAAATACAGAGAAAATTATTTGCATCTTCATTTTACACAAATATGTCAAT TTTGGGGATATTGTTTTTCGTTGCGTTACATATAATAATTTCCTAATTCT TTTGAAATCATGTGGATAAACTTCAAGATACTGGGATTGCTCAATTTTTT AATGCAGTAAATACATCACTCAAAATTATATAACCAACTCGATGACGACA TGCAGACCATAAAAGAGTACCTTAGATAATGGACTGAATTGTGATACAAG CAGTTGTAATATGTTCAGTAACTGATGCTGTAGTGTCGAAACACATATCT ACGATAGACTCCTAGCATGTTCATTTATTTAAAAATACAAGAGTGTGTTC AGCAATGATTTCACCTGTTGAGCGAGACATTCTGGGGTCACTATCAGGAG AGATTTGCAAAACCTTGAGCATCAAGAGAACTACATATTGGATAACGTTT TATTATATTCTTCAATTTGTTTTTTCTTTTCTATGCTCCTTACTTAACCT TATCCTGTCGACTGCAGCAAACGATTCTAATCTGTCAAACTTCATGGATA ATTAAAAAAACCCTATTTTCTTCGTTATCCTTTATTTTCATTGCCTCTTG TGCRTATATATTGAATGAACTGTCGAGCCGCTAATGCTCTTGTGTCCATT TTTTCAATAAATTATGAGTTGCATGACGAGACACTGGTATTTGACGTAAA TTTTGATTAGCATTAAGAAGGTCGAGTATTCATTTGCAGTAATGTTGGTT TGAGATTATAGGAATATTTGCTTTGTCATAAAAAGCTTTTATCCGAATAA GGACGGTGAAGGCTGATTTCCAATTGTGTTGCTAATTTTTTTTTCCTTTT CCAACCTCTTTCTGTATATGCCACAAACTACATCTCAGAGTCTGACTGCA GAATGTAAGGCGGATTCCTGGCAGTGTTCTATCTTAACAGCATTTCTTAA ATCAAACATAGAACCTGTAGATCTATTCTTTTTAGGTTTCATTGCAATAA TTGAAAATATACTAAACCCATATCACAGATCTTAGAGCTTATTGTAAAAT AATAGTTAGTAAATTAATATAAAATTAATTAGTGAAATAATTTGATGTAT AGTGCATCAAATTAGATGCCTAGTTATTCATTTATTTTTTGAGCTTCAAC AGGACTTTACAAACTACTCTCAAATATAAAATTGTATGATGTTGATTTTG AGATTGATTTTTTTCATATTATGTATATTTTTATATTATTCACGCAAAAA CCTTTAATTTGATAGAAACATTACACATTTTGAAATCTTGTTTTTATTAA AGGCCTTAATAAAGTCTATAAGTCCCGATGGGCCTTATAGACAACCCCCA ATTTGGCTCATTTTTTGTACAAACACTCTGGCACAGAGMCTCACATTTGA GGGAGTAGGTAACAAAATCCAAGGAAATTTTAAAAATCAACGGGCTATTT 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ACATTAATGATTAAGAGAGCTCAAACACACATCTATTTATAGTATTAATT TTGTTGAAATTATATTGTTCATGAATAAATTATATCTCGTTTAAAATTCA AAGTGTTTAGATATTAATGAATCACTCGGTACTTACTTAACGCATTTGCA AAAAACTTTTCACAACGAAAGCATTTTCTTGCTATTTCCTCTTTATACCA AAATATCCGGGCTTTCTTCTATTTCCCAAGTTTTGTCTATAGATTTATTG GGAGCCATATGTTGCAATGCCTTTTAGTAAATTCAACTAGACATTCAAGG AATGGAATATTTATTTTCGATTAATAGTAAATCGTTTTTTACGCTTAAAA AAAGACATGAAATCTCCGTTGTAATCACAAATAACATTCTTATGAAAATA TTGGGAAAGGGATTTTTAAACAAATAAATTTATTCGTGTGTTGAATAGAC TGTCCCGTTTTGGGGTTAATATTTTTTACAATGTTACTTCTCTTTATCTT TGATGAAACAGGGAAACTACAAATCATTGAACACATCTTAAACTCCTTAA ATTATTAAACACAAGCTCTATAATGGTTTTTACGGATAAACAAAAGAGTA ATAAATATATAAAGCACACTTTTTGTACTCATAGCATCATATTTGTGATG GTACTTTGAGTAGTGGGAAAATATTAACCCCAAAAAGGTATATTTTTAAT CTTTTAATATACATATATAGGTTTTTACTATCGCTAACGGTAATTTGTCA AATAAATAAGGCAAAGAGCATATTAACCCTACAAAAACATTCAATCGATG TAGATTGTTTGCTTACATGACCAATCTCGTCTTGCCGTTGCTTTCTTTTA CGTCATAGGTAAATATGATTTTAATTTGTGACGTGTCATGTACAATATTT GTAAATAAATTGGGCTTTGGTGTAGATAGAAAGTAATTTTTAAATTTGAT 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ATTATTTTTTNATCTTTATTCTGCTATAACAACAAATAAAGAAGAGAAAA CTAAATTAAAAGATCCCCTCGGATAATTTTTCATCTTTAATAAAAAAATG ATTTTATTTGTATCTTCATAGGTGAGACATCTGCTTCACCTGAGAATAAA CTTGATTCCAATGTAGATTTAGACCTGAATATCTTTGGACAACGGATAAT ACTGAAAAATAAGAATTTAAAGGCGGATGATAATATTAGAATTCGCCAAA ATGACTCCTTTGGCATTCTCAATGAGCCTTCACGAGAAAAAGGACTCCAA TCCGTTCAAAAACATAAAGATCCTTTTCGACACATGATGGAAATGTTTCA CAATGCCCTCAAATTTGTCAAAATTGACAATATTTTGACACATGAGGAAG ATGTTTATGAAAAATATGAGAGGCCAAGGAGATTAGAGAAAACAAGAACG ATTCAGCAAGAAATTAATCCCGTGTTTAATCGGATTGGACTTAGGGATGA AAATGAAAAAGTAGATGTGAAAACGCCTCCCACCCCCACTACACGTCCAC AGGCTGGACAAAAAAGAATACTCACGGGCACGAGAAGAAGAAAACCGAGC AAAATTCACAGAAAACCCCTAGTTGCAATTCAAATGTCAACGCCACCTAT TCGCACTCTACCCCCACAGCATCATCGGTTCATCCAGCACTCAACAACTG TTAGTCCAGTCACAACTCCTCTTGCTGTAAAAATACTTCCAAGCTTTAAA CCTCAAAATCTTCCATCCCGGCAAAGAATTAGAGTCAAAATCCCTAAAAA TACATCCCTTCCCATTATTCGTCAATCCGTTCCTGATAACGTTTCCCCCA CAAACAAACCTCAAATCCCTTCGAATCCTTTTATCAAGACCACAAATTAT ATACGACAACAAACAACACCTATTCTTTTTACTAAATCCCAAAAGACATC CCCTTCAAGGTTCATTTATCCGTCATCAACTTCAAGGCCATTCATTGGAA TTCAGTCCATAGATACAAATCCTATATTCACAAACTCTGTCAAAACCTTG CCCTTATCCTCAGAATCTTTCCTCAGTTCTAAACTCCCTCGCCCCCTTTC TAATCTAAGGTCACAAAGCCAAGCTCCATCAAAGGGACAAATAATTTCTT CAAAGCCATTTAATCAGTTTAAAAAGTTTAAAAAAACTAGCTCGAAAATA AAATTACCTCATAAGTCAGCCATTAAAAGCCTTCCTTCGAAGACTAGAAA CGTGGTTCATCATTTTCCAAGACATCCACTTCCTTCACCCCCACCGCCAC TMCTTCCTACTTCTCCAAGGATAAATGGCGATMCTCCAAGCAAGCCATTC AAACCTTCGCCTAAGATTATTGAAGGAAATTTTGTTCCATCAACACAAGC ATGGACAACTAAAACAGGAGCAACAAATAACAAGGTAACTTCGGGTCGAA GACCACCTGTTGTTCCTCGTGTGCCAATCATTCCTAAGACTCAAATCCCA AAGTTCATTAGTACAAATGGTATTTCCAATTCAGGTAAGTTATATTAAAG TTTATTATAAGTTTAATTAGGAGGGAATTCCTTTGTAATTTAATGCWCCT GGGAATAAAACAATTCAATCTAATTTTTGAAATTGTTTGAACAAAATTTA TTAATCAACTCGGGGTACTACTCGGTATTACCTGGAGTCATTGGCGTCGG CTAAAAGACAAATTTTGCTTTAATAATATAGAAGCTAACTCCCAACAAAT CGTCAGTGTTACTTTTCCTTTTTTCATGTGCACGCTTACAAGTAGATACA CAATATCCATATCAATTCATATATGTTCTCTCTTCAAGAATGAAAGAATA ATAATAAGAGTTAAAGAAAAACTGTCATAACTGACGAGTACTGTAGTCTC 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