EMLSAT00000004639, EMLSAT00000004639-700486 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004639
Unique NameEMLSAT00000004639-700486
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s241supercontigLSalAtl2s241:596930..621161 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004639 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004639EMLSAG00000004639-687405Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000020222EMLSAE00000020222-729150Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020223EMLSAE00000020223-729151Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020224EMLSAE00000020224-729152Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020225EMLSAE00000020225-729153Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020226EMLSAE00000020226-729154Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020227EMLSAE00000020227-729155Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778801auto778801Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004639EMLSAP00000004639Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004639

>EMLSAP00000004639 ID=EMLSAP00000004639|Name=EMLSAP00000004639|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=2824bp
MSEISNINNTTTNNNNNGSTNPQQEPQQHSSNNDETSSSSEEKRPEDEGN
NSASKFCEDVAKFDGRIVYNPDGSAYIIDGDDDDNASIHCQEGSIIEKRS
GSETGDREHNVYPQIAKAIYVHQNRTQQSYEEDTKSPLIHSYRVYSLRGS
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HLQRLNHVNHIKEGGPSNEWRLKFLNVTNPVQLRCNACDYYTNSLHKLQL
HTANQRHEISTVLFAHLKLSENGIPEERRSYSCSLCKFESPGKTGLMVHV
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SLSXLSSPXEPLPAGTALEAALDSSMSPKSLNSSGNSNQISSPNNINSAE
SPRSSPLTHIPPPFYNPPVSSSVQKSLNDLFLPKGGHVGNESFTSQQQQI
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INNSPTEAATTKMSQQTGLPPKVIKHWFRNTLFKERQRNKDSPYNFNNPP
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FLDDKDEAGQPRDKRLRTTILPEQLDFLYQKYQVESNPSRKMLEQIANEV
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LATKHSDQYTRGEINIDALPDAEGGPPSIDEGDSRSILGHPLTPTSSISG
GGPIGGGGSDLEVSMRKYYEDTMKRYMNDLQSNKRTPPLPNVSSSSSLHH
TDVHVEASLPSSNHHSNSNQALDLTGPALDLSGGGPKSENADSWDEGSEN
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PESPGYSLNQVLLSLSDGKQGLCEEKNDSTPPPSGLNNSDPQNNTSPPIS
PSHISSKHSTSLPDNNNPGPHLPQSSAGNRDEMEKTLMQQLYGVGHGISS
YPTGVATANPFLHPAMFSATAIRR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s241:596930..621161-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004639-700486 ID=EMLSAT00000004639-700486|Name=EMLSAT00000004639|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24232bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s241:596930..621161- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCAGAGATATCAAATATTAATAACACTACTACTAATAATAACAACAA CGGCAGTACTAACCCACAACAAGAGCCACAACAACACTCATCGAACAATG ATGAAACTTCCTCTTCCTCTGAAGAAAAACGTCCTGAGGATGAAGGGAAC AACAGTGCTTCTAAATTTTGTGAAGATGTTGCCAAATTTGATGGTAGAAT AGTCTATAACCCTGATGGCTCCGCCTACATTATCGATGGAGATGATGATG ACAATGCCAGCATTCACTGTCAAGAAGGCTCAATCATCGAAAAAAGATCT GGTTCTGAGACCGGAGATCGTGAACACAATGTTTATCCTCAAATAGCAAA AGCCATCTATGTTCATCAAAATCGAACTCAACAATCCTATGAAGAAGACA CAAAAAGCCCTTTAATTCATAGCTATCGTGTTTATAGTCTAAGAGGTAGT CACGAAAAAAATTGTAATCAGGAGGAGGATCCAGAAGAAACACTCAAAAA AGCAGGGTTCGGAGGAGCAGTCACCGTTCCGATCAAGCCCATTCTCATGT GCTTCATTTGCAAACTCTCTTTTGGATTTGCAAAGAGCTTCATCAATCAT TGCTCCTCTGATCATGCCTTGGAGCTTCGTGAAGAAGAGCGGAATATCCT AGACATAAAAAATAGCTCAGCTATAATTCAAATCGTGGGTAAGGACAAGT CTCCCATTGTGTCTTTCCTTGAACCAGATTTGAAGAAAGAGGAGGATACT AAAAAACGATTCTGCAAGGAAATGGATGCTCCTTCATCTCTGTCCGATCC TCAAAGGATGTTAAGTCCTTCAGCAATTAAAGGAATTCTTTCTGCTGCAC TTAGCAATGCTGCCGCTGCAGCTGCGGCTSSAGCAGCAGCTAGTAATGGC CCTACGGATGGGGAGAGCCCTCATCCGATGGAGTTTCCTCCACACTTTCC TCCTTCAAGTTTTCTTGATTCATTAAGCCCAAGTGTACGTAATTCTTTAT TAGAAATGAATCGTCAAGCTAACAATGGGAGATCCTCCATTTCGCCTGTA ACATCAAACTCACTGAGCTGTTCACCCTCGCCCTCCCTTCCTCAATTACC ACCTGGTTTTGGTGTTCCATTAACAACCAATGCCAATATGCTACAAGGTA CAACCATTGGAGCATGCCCTGATCATGTTAATGGACGCCCAACTGGAGTA GAGTGTGGTAAGTGTGATCTCATTTTGAAAGCATCTCATATGCCCGGTGG ATTAGCATGGAATGCCGCACGTAATTCCTGTAAGACTCTTAAATGTCCTA AGTGTAATTGGCACTATAAATATCAAGAAACATTAGACATTCACATGAAG GAAAAACATCCAGAAAATGAAACGACCTGCATTTACTGTATCACAGGCCA ACAACACCCTCGGCTTGCTCGAGGAGAAACTTATACATGTGGATATAAAC CCTATCGATGTGAGGTCTGTAATTATTCCACCACAACGAAAGGGAATCTC TCGATCCATATGCAGTCAGATAAGCATCTGAATAATATGCAAGAGCTACA AAAMGGAGGCGTTMTATCCACTCCGGATGGGAACAACAAACAAATYCCAT CCTCAGTGGGAGGTCCCTTAGGGGGGTCTCCCTTGATTCCTAAACAAAAG CCTTCTTGGCGTTGTGACGTATGTAATTATGAAACTAATGTAGCCAGAAA TTTGAGAATTCACATGACTTCGGAGAAACATACTCATAACATTATGGTTC TCCAACAAAACGTTAAGCAAATGCAGCAACTATCCGGAGGAGGACCTCCT CCACCACCCCCTCCTCATCCTCTCATGTTTGGCCCGGGTNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTCCTGATCCG CAAATGCTCCAACTTCAACTAGCATCTGGTACTCCACCTTTCAATCCTGA TGCTAAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACCCGAAGCTGCAATGGCTGATT TAGCCTATTTTCAAGCTGTCATGATGCAAATGATGACTGGTGGACAATTT CCTCCAGGACCTGTTCCTCCAGAATTTTCTGGATCTCCTAATTCACCTAT GAATGAAGAAGCAATGGAACCCCCTCCAGAGCCTGCTGATCCGAACCCAA AGTATTTATATACATGTTGTGTCTGTAGAGAATTTGGAGCTGATAATTTA GAGCTTCTCTCTCAGCATTTAACTTTGGACAGAACCAAGACTCGGGAACA CGAAGTAAGTTTGGTCATTGGAGGAAACTACATTTGTAAACTATGTTCCT ACAAAACAAACCTCAAAGCGAACTTTCAACTCCATTGTAAAACAGACAAA CATCTTCAGAGATTAAACCATGTGAATCACATCAAGGAAGGAGGTCCATC CAATGAGTGGAGACTCAAGTTCCTCAATGTCACAAACCCTGTTCAACTTC GGTGCAACGCATGCGATTACTACACAAACTCTCTCCACAAACTTCAGCTC CACACTGCAAATCAGCGACATGAGATCTCTACTGTCCTTTTTGCACATTT AAAACTATCCGAGAATGGAATACCAGAGGAGCGACGCTCCTACTCCTGCT CCCTCTGTAAATTCGAATCTCCAGGCAAAACAGGGCTCATGGTCCACGTA CGTTCCATCAAGCACTTACAAATGGAGCAAATTCATCAACTGCAAAAGAA ATCTGAAGGAAACATGAGCAATACGGAGATTGGTGAAATATTTCAGGTAC TGGAGACGATACCAGAGTCATCACTCGAAGARGTAMAAGAGAGNNNNNNN 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AATAGCTAATTGAATAAAGAAGAAGGAGTGAAATTGTGTGTGGGGGGGGG GGAGAAGTGGGGCGTCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNCAAATWAATTGAAGACKCAATTAGATTAKAATGGGSGCTCATTGAA GGAGTATATATTTATAAAATTAARCGTCAATTTTTCAATCAAAAATTGTT ACATGTTATTATGTTTTTTCACTTCTATTTTTTCTTTTACATAGTATTAA TAAATACTGACTTTAGCCCGAATAGAAGAAGTATCATCTCTAATTAAGAG TCTACATATGCAAGGCATACTCAATTAAGAGGAAATACTTATTCACTCGT ATAAGTATGAGCATACAAATTCTAAGGCGTAAAGAGTCTGGAATGAATTA CGAATATAAATAATAATAAAATATTTGTATATACGTACAAATGTGTTATA ATAGCGACCCGTGTTTATTTTATTTTATATTTTTAGAAAGGGGTTCTAAT TTAAATACAAAATAACGTGTTTACATACTTATGTTATATATATATATATA TTGTAGAAATGAGTCCTCATAAATAAATCGAGTTTCATTTAGGAAGGGGG GGGGGGGGAAACGATCCARTTGATTAAAATAAAAAAAGAGTATTCATATA GAGCTTATTTATGTAAATATAGGCATTGATTATTTAAATCTAATTAACCC AAATTAAATTCCTTTCTGAGTTACATACTTGCATGTACAGTGCACATATA TGGAGTTGTATTAGCCACATCCCTTCTTTTTCATCTCAACTAACGTCTAA ACAAGAAGGCATAAGCAAAAAAGAATTAGTCTGATAGTTGATATTTTTTA GTGCATTAACTTTCTAGATATTTATTAGGTCAATAATACCACAAAAACGC TGAACTGTGTGACYCAAAATACAATAAACGAGAAAATAATTGATACTTGG 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GATTTGATCCAAAACTAATAATGAAACCCGGATCAGATTCTAGTTTACTC ATGGACTTGAAGAAACAAATGCCAGGAGGAATCGATCCCAAGCTTTTGAG TATGTTTGTTTCATCTGCATCAAAAGACGGAGGAACTGGAGCCTCCCCAT TTCCACCTCTTCCTCCAAACCATTTACTGAATATGAGATTAGATCCGAAA CTTATGTCGAATCAACCTGGACCTGACCCTAAATTACTTCTTCAATTGGC TCAGGGACTAGATCCTTCAAAACTGTTGCCTGGAAGTGTTGCTAATGCAT CACAAATCCAATCTGGCCTTGGGTCTGATCAATCTCTCGCAATGAACTCT TCGAAAGCAAACACAGTATTCCAACAGCCTGAGCAACAAAAGAGAGCAAG AACTCGGATCACAGATGAACAACTCAAGGTTTTAAGGTCTAACTTTGATA TCAATAATTCCCCAACAGAGGCAGCAACTACCAAAATGTCTCAACAAACA GGACTCCCTCCTAAGGTGATTAAGCATTGGTTTAGAAACACACTTTTTAA GGAGAGGCAGCGAAACAAGGACTCTCCTTATAACTTCAATAATCCTCCTT CCACAATGCTAAACTTGGAAGAATATGAAAAGACTGGTGAATCCAAAGTG ACAACCTTAAATGTTGATGAACAAAAAAAGTATTCACCTCCTTGCTCGGA AAGAAGAATTTCTACTGGAGGGGAATTAGATGATTCATCTAAGCCTGTAA ATGATGAACCCCGTGGTTCTCCAGCACTAACTACTCCCCTTAGCACACCC TCATCCACGTGTACAACACCAAATAGTGGCTCAGACATTCTCCGAGTCAA AAAAGAGGAACACTTAAAAAAGGAGACCGATGATGTTGAGGCACCTCCAG TCTCATCATCCTCACTAACATTATCCAACATCCTCGGATCACAAATGAAT 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