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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s242 | supercontig | LSalAtl2s242:491646..501577 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004648 >EMLSAP00000004648 ID=EMLSAP00000004648|Name=EMLSAP00000004648|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=360bp
MCCDRVVDYKASPCNPSSTSTISTSSSPPVHSMHSNVKLEVSYPDNTSVS
SGYVVPPQQGXQTTVTTSSSSSSYLLNRGVEPSTNYGTDPYSTPPDPFLT
SPPTWTXPPPNPPHFNNLHGQXFRYMRTPSNLMKEVTCMWIDPESLKRTP
CSRSFFSMHDIVTHITVEHVGGPEIANHTCYWDNCAREGRPFKAKYKLVN
HIRVHTGEKPFPCPFSGCGKIFARSENLKIHKRTHTGEKPFKCEFDGCER
RFANSSDRKKHSHVHTSDKPYNCKVKGCDKSYTHPSSLRKHMKVHGTDCE
YDTDESEETSASPVSSSGHRSPTNTTIKNNGISNPPVSSPSLPHPPLHSQ
PPLMDCKVII back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s242:491646..501577- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004648-700495 ID=EMLSAT00000004648-700495|Name=EMLSAT00000004648|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9932bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s242:491646..501577- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGTTGTGATAGAGTTGTAGACTATAAAGCATCCCCCTGCAATCCCTC
CAGCACCTCTACCATCTCCACCTCATCATCCCCTCCGGTGCACTCCATGC
ATTCCAACGTTAAGCTCGAAGTGTCGTATCCGGATAATACATCAGTATCC
TCTGGCTACGTAGTTCCACCGCAGCAAGGARCCCAAACCACGGTGACAAC
CTCCTCGTCCTCATCATCGTATCTCTTGAATCGAGGAGTAGAGCCTTCTA
CAAACTATGGTACAGATCCCTACTCCACTCCTCCGGACCCATTCCTCACG
TCTCCACCCACCTGGACTTMCCCCCCACCAAATCCTCCTCACTTCAACAA
CCTTCATGGACAAYCCTTCCGCTACATGCGAACTCCTTCCAATCTCATGA
AAGAAGTCACTTGTATGTGGATCGATCCAGAGTCGCTGAAACGCACTCCC
TGCTCTCGCTCTTTCTTCTCCATGCATGACATTGTCACACATATCACGGT
GGAACATGTGGGTGGTCCAGAGATTGCAAATCACACTTGCTATTGGGATA
ACTGCGCGAGGGAGGGACGACCCTTTAAGGCCAAATATAAACTTGTGAAT
CATATTCGGGTGCATACGGGAGAGAAACCCTTTCCTTGTCCCTTTTCAGG
CTGTGGAAAGATCTTTGCTCGTTCCGAGAATCTTAAAATCCATAAGAGGA
CACATACAGGTGAGTTACTTTTATGTATAATTCATAATATTTTGGGGATG
CTCCGTGGATGTATATAAGGCAGAGAGAGAGAGAGAGACAATGAAAGAGA
GACACTCACGCACAAAGAGATTGTAAATACCGATTTCTATTCTATCAATT
AGGGAGTTCATCCTGAATGACTCTGGAACAATTTGAACATTGTTAGGTCC
TTGAGCATTTTAACATCATTTTTGAGAGTTTTAAATAAAKCATCCATAAA
CATCGGATGGTCTTTTTGCAAGATATTCTAAGAACGGTATAATGTAAAGT
TACCTCCCATCTGCCGGAAATTTAATTGATTGTCGTATAAAAACTGTCAT
CAGTGTTTTAATTAGAGCTCATGTCATGGATGATATCAAAGTATCCTTTC
ATCACCTGCAAATCCTCGTATTCTTATACTGCATCCATATTTTGCCCTTT
AACACAAAAGTAAGCAAGAAGGATTTTTCTGAAAATAGAGTGTGGAATTC
ATTTTTATTCTTCAACCAAGAATTAATTATTGTCAATTTGTATTAACAAT
TTTTTCTTATTTACTCTATGGGTCTGTTGCAAATTTGAACGGGCCATATC
GGGACCAATATAAGTCCCTTAAATCGAATGAATATTCTTAAATATAGCTA
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GTTTTGAATCATAATCAAGACAAATGACCAACAGACAAATAAACAAGCAA
CACAATAGCCCCCAAAATGTCAATAAAAGGTTTGAATTCATTACCATTTA
GAGTGAGAAGGATTTTTCCCTTTTCTTTCCTTCTCTCCAAAATGGAATGT
TTATTAGGAAAGAACCATTTCATTGAGTAAGAATTTTTTTTTTGAGTTTA
TTCTCCTCTTCTATGGATGTATGTAGTCTCATAAATCACTTCCTATAGGA
AGCTGCTGCACTGCTTCTAACGTCAACTCCGGGAAAAAGAGTAATTTAGC
AATTTTTTMTTTTCTTTTTGAGATTGCAATAAAAAATATTATTATTGTGC
CCAAACAATGGGTGTGAGATGGGGATGGAGGGGGAGTGTGGAGTAGGGTG
GGGTGGATGTATTATTCATTCATCTTTCTCTTCAAAAAACTATCAAATAC
ATAGAAGAATATATCTACAAACTATTAAAGAGAGGTTTGTTTAATGTATG
AGTAAATAACGTTTTTACCAAGTTTTATTTCTAATTAAAATGTAAATATA
TATATATATATATGAAGCGTCAATACAAAATAAATCTTGAACAAAAATAA
TATAACTATGAAATGACATGTAACTTCATTAACACCCCAATATTTTATAG
ACAACTTCTGTCCATTATCCGCTTTACATTAATATCCAATTAATTCAACG
GGACAATTGCATAAATCTACGTAACCTCGAGTCTTAATTTTATTACTCCT
TATGTAATTTGTATTACTTTATCTCATTATCTTAACGAACCTTATTTGAT
TTAGTATATTTACTTTTTATCTCTAAGGATTCCTGATCGGGCTTTATATT
AAAGTACTTTTTTAAATTTTCGTTTGTCTACAAGATATGTTTTAATTAAT
TTTTCATGGTATGTTATATTATTAACATATATTTGAATAATCTATAACAA
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CATATTTCTACCAACTATAGGCTTTTTACTCATATTTCTGAGGTGAGTTG
TGATACTTAAAAATAATGTTAACTATTATTTAGAACCTTCATTTTGATTT
ATGGTTCTCAATTTGGCTCCGATATGTTTCCTTTTAATTACATTAAATCT
ATCATTTTTTTTTTAAATGATTTTATTGTAATGATACATTTTTTCAACTT
TCATTTGCAATTTATGTTGTTTCCGAAGGATTAATCATAATAATTTGTTC
ATCGAAATGGATGATAGTTATTCGTGGAAGAATACAAAATATGTGTAATC
AATTATCTATTTCTTGACCAATCATTCTAGCTTGTTTTTTTGTTGACGAG
TTACATACATATCTTGTCTGTAGGTTTTATTGTCAGTTTTTCTTCTTGTT
TGGAACTAAGAGACGTTTGTTGCTGTTGCATTGCTGGAAGAAAAGTCAAC
TATGTTTAACGATGTTGATATTCAACCAAGATGCATTTTTGAGCATCACT
AACATGTTATTCTCATGGTTCATAGCATTATATGTGTGTACTTATTCAAC
TCTTTAATGACCTCTTCTTGAGTTCGGTGCATGTATGTACTCCGTATACC
TACGAAGTAGAAAATGTCTCCAACAGAGACTTGCATTCATAATAGAATAA
CAATAACGCARAGAATACAATCTTATTCTATTGTATTCTTAACGAGTGGC
ACCTCTTCTTCTTCTTCAAGGYTGACCTTGAAGGAGATATGTRATATACA
TATATATATTGTTCGGTATACCCGTTCTACCTATACTGGTACCGGGATAC
TAACGTATTAGAGGTACTTGATTCCTCCAAATAAAGGAATTCTTAAAGTT
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GCGAAATTCAGGCCTGGGGAAAAATTATAACTCTAAAATTATGCAATTTT
TTCCCCCAAATCCCCAAAATAAAAGTCTGCAAACGTCCCTTAATATTCCC
TCAATACTGTCGATTCTATTTTTATGTTTAGTATAAAAGGTACTCCTCCT
TTCAAACATATTTTGACCCATATTTCAGACCAGACTGCGATCTAATACTG
TGGATCGTTTATTGATATTGTAGGCATAAATTTGTTTTCCCGTAAAATAA
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TCCTTTGTGTGTACCAAATTTTATTACAAAACCTCTCGAGACGGAGCTAG
AACTGAATTAATTGAGTTTAAAAAATTATATAATAATGGTGTTAGACCCA
TCTATAATTTTGGACCGAACCCCTGACTTTTTTTCATTTTTTTAAATGAT
TGCATGTGAGATGATTCAAAGTAAGTTGTTAACTTTTGCAGATGTGTTGC
TCCTGCTAACTTTTGTGTGTTTCCAGACGATTGATTTTTTATAATAGAGT
GGAGTCCATGAAATGCAACCTCAAAACACACACAAAAAAGATTATTTCTG
CGTCAATTCCCAATACATAATAATTCCTTCCATTGTTGTGCGGGAATTAA
GTGATGTGTTGAGCTGAAAAATAGTCACAAAAACTCTTTCACCTTTGTAG
GATATTTGATMCCTTCTAGGTAKTATCCAATGGACATTCTTGGGTAGTTA
CATACCCATTATATATATAGGTACATGTCATCTGATAAGGAACTGGAAAA
AGAAAAAAATCTGCCCTCCTCCCTAAAAAAACAACTCCTGTATTTTCGTT
GCACAAGATTCATGTTTAGTACTTCTCATTACACTCGTAATACCCAGAGA
CGATATGTGAAAAAAGGTGGAAATCCTCACGATTGTACATTCAAAAATTA
TTTAGAATGGTTACAAAGCAAGGCTCTTATAAATTATTTATCTCTATTTT
GGGCATTTCAAGCCAAAGCTTTATACAAAGTCGCTAAACGGACCCCTTAG
CTTGAATAGCATTTATATTCTCCCCTTCTGCAAGATATCGCTTTTGATCA
TAGCACAGATAATATCCTATTAAATTTTTCCTACATGACATATACAACTC
TCGTGTCCATTTGCGGAATCAACCTTATTAGTTCAGTTATATAGGTGAAT
TCATGGAGGTTTCAAAGTCAGTTATAGAGTAATATTCAAGTATACTGGAC
CCCCTAGTGGGCAAAAAAATGATTAAGTAGCCTAGAATATTTGGACAAAT
ATTGTTTTTGTGGTCTTTGTTTTCCTACTTGGTTTGATTCAGGAGAAGAT
TCATACAAAAAATTGTTTTAAGGAAATAATGAAAAATAATTGCTGGTACT
AGTACGTTTATCAGTAGTAGGGGCATCTGCAAGGAGTAGGGTTGAGGGGC
AGTAGACCCCCACCCAAAATTAAGGATTTCTTCCTTTTTACTAAAAAATT
TATTATTTGATTTTTTTTTAAATTCAATATTATAATTTTTTTTCCAAAAA
TTTCTACTATTGAAAATTAATTTTTGAAATTTTTTGTGAAGAACTGCGGA
TTTTTGAAATTTTTTTCCAAAAAAAAAAAATTTTTTGTGAATAACTGTGG
ATTTCGTAAATTGTTTTAATTTTTGTATTTAAAAAAATTAACAATAATAA
TCCTGTAGACGCCCCTAACTAGTGTTTATCCTTGATTGTCAATAATATAA
ATAAATAGAAGAAAACTAGGGCATTTGCAGGAGTACTCCCTTACCTCAAC
AGAGGTCACCGCCCTAATAACTATAGTCAGCAGATATGTCCTTTATCAAA
ATATACCAAATATACTTTTTTTTTACATTATGCACTCGTTAGACAATGGT
TGGATCTCTAAACTTGGTTCATGAGGGGAGTGGTGACTGTATGATGGTTG
CAGATTTGTGTCGTTCTCATTTTCCCCTCAAAAGTACAATAAATTATATT
GTGCATTATATTAAAGCATCATCATCCATCATTTTTGAGGACAATGTCTG
TATGTCGTTTGTTTGTTTGTTTACAAATAAATATGAAAAACCGATTCTTT
TTTTTTCAAAAGGCATACAAACATAGATCAAGTGAGTGGTGGTCCTTTGA
CAGATGGCTCCATTCATACGCCCGTCCATAAAAGTTGAAAAAAGGATTTG
ATTACTAGTCATGTTGTATACGTACGCACACGTGACCTCTTTTGATTGAA
TGCCATGCAAAATCCTTATTTATTTTTAACTAGAAAAGCACGTGATATCG
TGTATCCAAAGCTACATATATGGCCACGGCGTTGCCCATTGACGTAGGAA
GAGGTGATCCCTTTTTGGGGAGGACAACTTCAATTTTGCCCGAATATAAT
TAAATAATTCAATACCAATTTGTGGGTAGGGTTTTATATTCTACTAAATA
CATATAAAGAGATATTTGTGAATTTTANTTCACGAATATAGCAAATTAAT
TCCCTCATTTCCCCTAATTTCCGGGACATTCTTTTTTTACACTCATAGCG
TTACCCCACTTATTTAAAAGTGTATATCTCAAATTTGGTTATCTGTCAAT
TTTTTAACTTCTCTTCCTTGTAATAACGGAATACATTATAAGTTGATTGG
TTCAACAATTTGAATAAGCTCATGTCAAGGGCTGTGAACAATTACCACAA
ATGAATTATCAAATAATAATTCCATATTTGAAAAGATTTGCCTAACAATT
ACATACTGATTCCTGGGCCTTTTTTTCTATGGTCCTTTTAAAAAAAGTTC
CTACTACCAAAATAACGACGTGTAGACCTATATAGCTTTTCAATGACCTC
ATTTTAGAAATTGGTCATCTTCGAGTCACAAAAGTCTCAATTTTATTCTA
ATAAATATTCTGTTTGTGAACGGAAAACAGACTAAATTATTGTCAGGAAT
TGATCGTCATAATAATACCTCCAAATGATTTTGAGTCTGCTCATTTTTTT
AAAATTGAAAGGTTACGAGATAACGACCTACTTTGGATATATAGTACATT
ATATGTACGTTTATATAACATATCTACGTCATCTTCATATTTATTATGGT
GATTTCAAGGTGTGGCAGGMCTCTGTTMCTGCGMTGNCTTCTTTCAAACT
TGGATAGGMGCAAGAGAAAAGGCTCCGCCTKGTGAATATAAGCAGMACGA
AGTACTGACTTGCTTCAATCAGAGTTTTTTTTTGTTCTATGTATTCCTCT
TTTAGAAGGAATAAATTTGTATAATTTTTAAATAATCATTTCATGGGTAT
AAATAATAACCAATGATGCCCACGAAAAAACCATACAATACTATACCCAG
AAAATTGAAGAGAGAACGAAAAACACAAAATAAAATAAAAACTAGTTCGT
GATTCACGAAATATATTAAACTTTTCTTTCTTATTTTTTTATTATTTAAA
TAAGTTCAAAGTTAGTATATAGTTCATAATAGGTACTCACAAAAAATGAT
CCGGCAGTGTATATAGATATTTGGTAAATGAAGGGAGGCAGGAAGGAAGG
AATCATACCCGAATTTAATAGCACATTTAATATTATTTAAGTCGATTTTG
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CGCAATCTCTCATTCCTTCCTTGTATAATCTCCCCCCCCCCCCCCCTTCT
TGCAAAGAAAAAATAATGACAATTACGTTGTTTCTTTTTGTAACGTCGTT
GCACGTGTGGAAGTCTTCCTCCGTTCTCTTGTGTTTTTTTTTTATGACAA
TAATCTATAATTCATTGCATCCGGAGATATGTTCGTTCCCGAAAAAATAG
AACGTTCAAAGTGTGTTTGTGTGTGTGTATACGAAAAGGAGATGGAAAAA
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TGTATCACTCTCTACTGAAAAATCAATGGGGGAACTTAGTTAGTATCTTT
ATTAGGCTCATAATATCATGTTTGGATTTTAAAACATTGCATAAAACCTA
TACAAAAACTTAGAAATTCTTGAAAAAATTATTTTCAAACAATGATATAC
AAACTTTATCCTCAAAATAATATGAATACATGAAAATGTATTCATAAAGT
CTTAATTTTTACTTCTGTGGATTTACCCGAATTGGTTCAAAGTGGCAGTG
CTACGAATTAAGGGTACATATTGGTCCTTATAATTACTAAAAGGGTCTTC
AAATGAACCAACGTTAATCATATTGCTCCTTGACCTACTGTACTCTTTTT
CTACAAGACTAACATGTGTTGAAAATTGACTTGAATTGAAAAAAATCAAA
AATTTTAATATTCTAAAACAACATGAATAAAAATCTGTTATTGTTTTATT
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AAAGCAATACACGTCATTCTAAAATATAGCAAAACCTGGAATAAATGAGC
TTTTGGTGTATTATAATATTATATTTTACATGGGTGAAGTGGACTTAAAG
GCAAATAACAGTCCACTTTGTTTTTGCAATAAAAGAAAAATTATATTCTA
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GGATCGTAAAAAACATTCTCATGTCCATACGTCAGATAAACCCTACAACT
GCAAGGTCAAGGGCTGTGATAAGTCCTATACCCATCCATCCAGTTTGCGG
AAACATATGAAGGTAAGTACCTTTGCTATAGTTTAACAATGATGGATACT
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GACACAGAAGTCCCACAAATACCACTATTAAAAACAATGGGATCTCTAAT
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TCCGCTCATGGACTGGTACACTTCATCAACTGGAGGAGGAGCTCCTCTCC
CTCAGKCCCATRCCCTTCARCATCCACTCCAACCCCACGGGTATCAACCA
GGATATCAGCAGAATATGCATCTCTCACATTCCGGCAACAACCAAATTCT
KCTTCCACAGAGTCAGCAAGGTCATCATTTGA back to top
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