|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s246 | supercontig | LSalAtl2s246:463608..472323 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004695 >EMLSAP00000004695 ID=EMLSAP00000004695|Name=EMLSAP00000004695|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=290bp
AWDGELALEAQTWADQCITDHDCPSCRKLSRFSVGQNLYSFGHIPGIFEG SWKRAISGWYDEVVDFKNNHVDPFKIRKGVLVGHFTQVAWATTSKIGCGR LTYFSEESKTLGYGQQLYICNYGRAGNYIGSKFYKIGTPCSKCPKGSECS SNYPGLCTLDPNLSVIPIDIPTLPPPTVSIFGSNATSFQVTKPPEDENAR CNYEYDIRKTPLQNKESSSKGPDSKTCHYTCKPTGGCSVRLKSSSPLSGN VLGSCFSPVFGGECFGTPKDCGSCLEKCEKNGGESFKESV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s246:463608..472323- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004695-700542 ID=EMLSAT00000004695-700542|Name=EMLSAT00000004695|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8716bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s246:463608..472323- (Lepeophtheirus salmonis) GCATGGGATGGTGAACTTGCACTTGAAGCACAGACATGGGCTGACCAATG
TATAACAGATCATGATTGCCCAAGTTGTCGAAAGCTTTCTAGATTTTCAG
TAGGTCAAAATCTATATTCCTTTGGACATATCCCAGGAATCTTTGAGGGC
TCTTGGAAAAGAGCCATTTCAGGATGGTATGATGAAGTGGTGGACTTTAA
GAATAATCATGTGGATCCCTTCAAGTATGTACTAATTAATCATTATATAT
ACCCTTTCCATATATTCTAGAGTTGTGTTGTAAAAGGGGAATTATTTATC
TTTCAGAATTCGTAAAGGAGTCCTTGTTGGACACTTTACTCAAGTTGCTT
GGGCAACTACCTCAAAAATTGGATGTGGACGCCTCACGTATTTTTCAGAG
GAATCAAAAACTCTGGGATACGGTCAACAACTCTACATCTGTAACTATGG
AAGAGCTGGAAACTACATTGGCTCTAAGTTCTACAAAATTGGAACCCCTT
GCTCCAAATGTCCAAAGGGATCTGAGTGTTCAAGCAATTATCCTGGACTA
TGTACCCTAGATCCGAATCTAAGTGTTATACCCATCGACATCCCAACACT
TCCACCACCCACGGTGAGTATTTTTGGATCAAATGCCACATCCTTTCAGG
TCACTAAGCCTCCGGAGGATGAGAATGCTAGATGCAATTATGAATGTAAG
AACAATCTGGGCTGCTCAGTATCAATTCAAACGACTGGAATCGTAAATGG
TCCAACTCTTGGATCCTGCTTTCCTCCTTTTTTTGGAGGAAAGTGCTCAG
GAACTCCCAAGGATTGCTTAAACTGTTCCTCCATCTGCATAGACTCCAAT
GTGGGCATGAAGGTTTCAATTGCAGTCAAAAGAGCAAGTGAGTAATGTAT
ATATTATGTAACCGTGTTTGATCATACGAATCCTAAAGAGTGGCCCACGA
AACTTTTTCCTTTTGATATCGCTATAAAAAAAAGACAAATGGATATTTTT
CAATAACTTTTTTTCTTTGAAAGCCTCAACATTTCGGTTAATGATGGAAC
ACCACTTCATTCATATGGCCGCTGTAACTGGCCTTACAGTAACCCATTCT
GTCGACCCAATTTTTCAATACATTTTTGATTGTGTGAGCTTCAATAGCTG
CAAAGGCGACTCCATTTTCGTGTTTTAAATCGTCAATCGTCTCTGGATGG
TTGTTGTAACATTTATCCTTGACGGCTGAAACACAAAAAATAGTCCAATG
GAGTCAAATCGTAGCTACAAGGTGGCCAGTTTMCGTTGCTGTTTCGGCTT
ATGATGCGATTGTCGAAGACAGTGCGCAAAAGATCCACTGTAACGTTGGC
TGTGTGGCACGTAGCGCCATCCTGTTGGAAGTAAATGTCGTCGATGTCTT
CCTTTTCCATTNAAGGTGGAAATGTGCCTCATCTGAAAAGATGATTTTTC
GGTAAAAATGTTCATCTTCGATGAAGTGGTCTTCGGCACATTGGGCGAAC
CGAAGACGCATTGGATGGMCGTGTGGCTTCATTTTRTGCACTAATTAGAT
TTTGTATGGCTTCAGGCACAGGACTTTCTTTAAAATTCGTTGCAGAGACG
TGTGAGAAATGTCCAATTCCTGCGAACGGTGTCGAGTTAATGTCGATGGG
TTTTCACTTACACTTTTGTCAAAAGCAGCAATGTTTTCGATTGCACTTTA
CAAACACCGGGAACGCATTGTTTTATCCATTAACGAACTTGTTTCGCGCA
CACACTTCACAAATTTATCCACAAACTGCCTGGATGGCGCTGTATTAAGA
CCGAATTTCGTGCGTAATTTTCTTGCAGTTTCGTTTGTAGACTCTCCCTT
TTGGAAGTAAGTCTTCAGTATTTCTCAATTTTTTTTGAACGTAAACTGAA
CCATTTTGTCAACCAGAGACCTTTTACAAAATATTAGGCACAATGAGAGT
GTTATTACAGCTGTCAGACGTAAAAAAAGGGGTAGTTCAAAATGCAACCG
CTAGATGGGCCACCCTTTACATATGTATGTTACATAAACTTAAAAGCAAC
CATGGAAAAAAATCAAGGAAGGAGAAAAACCCAATTTATTTATTAATGCA
AATGTTAATACCAAGTTTATTTTCGAAATTGCTACATTTAAACTTCTTAC
ATATAATTTTACTTAAATTTTCTGTAACATATAAAAATGTCTTTCGAAAT
AGCCAACTCAAGCCTTTGCCGTTTCCGTCAGACGTCGACATTAGCTCTTG
ACGACGCCACCGACAACTTCATGACCGATTTGGTTCCATGACATAACCAA
TGAAGTCTTCGGGCTATCAAAATTCTTAGGGACCTTTGCACATACCTTTA
CCTCAAGAATGAGCCTCAGAGAGTTACTCATAGGATTTAAATCCAGGGAG
TTTGAAAGTCATTCTAACCTGAACAAAGAGTTTTGAAAATTTGCTTTGAG
CTAGTCTTGCATTACTTTGGAGTTGGGTGAGGGGTCTTGCTGGAAAGTCC
AAGGTTCGGTTGCAAACTCATACTTGTGATTCTTCCGCGTCCTCTGTATG
GGAACTTTGCTAATTTTAATGAGCATGGAAATGACACCATTGGATTTTTT
TTAAAACTAACTGAACCATGACATTCTACTTATTCTCAGTAATTCAGTTA
TTCCATTTACGTGAAATAATGTTTTTATGACTTCACGAGACAGTTTCGTT
AGAATGAATACGAACAAGATGAGCCTGATATCACGAAATATCGACAAACT
AGACACAAATATTTTGTGATTAGCCTAATTTCCATACAATTTTTACCTCT
AGCCCAATATTTCATAGAAGTATTTGAGTCAGTTATAGATTTTGTATTCA
AATTTGTAGGATGAGTTATGATACCCAAGAATTTTAGCTATATTTTAAAA
TCTTTATTAAAAAAATTAAAATAAGGATTTAAAAAACTTATATTAGCCCC
TGATGGCCCCTTTCAAATAAAATCCCTCAAATTCTTATTCTTTTGTTGTG
ACGATCAATTCCGGCTACTTCGAATGCTAGAATCATTCGTCACAATCCAC
CTGCAATTTTAAGGGAAATTATTCTACCTGATTTTTATGTTGACAGGTCA
CATATATAGCAATGTTTTAATCATTATGATAAAATTATTATTAATATTAT
TATGTAGAAAAATATGAATTAATCCTTTAATCCTTTGTGAAAAAACGGAT
TTATAGGATTAACAATTCGTTTAATTTCATGGATTGAGCATATAATTTTT
AATAATAAGGAATAGTTTTGAATAAGACACAAATGCAGAAAATGTACATT
TCACATACATATAAGTATAGATGTAAAAAAATATGACGTGCTGGTATGTT
AAAAAAGAACCCAAAAATTTACTTGGCAAAAAATAATTGAAATATTATAT
TTATATTGAATTTAATTTTCATGAAGAAACGGATTTTAATCAAATTTGGG
ATGTGTTATCATTGATAGTAGTCCTACTCAGAAATGAAATATTGGATGTG
TTACTCAATCCAACTTTTAGTTTTTTTTTGTTTTGTGATATATTGTAAAG
CATGGCAACGAATCGCAAGTAAAATATATAATTGAAAAGCTATCAAATAA
AAAAATAATTTATAAATAGAAAGAGTCATCTTTGACTTAGTTTTTGATCG
TAATTTTTTTTAAATTTTGGTAACTTATGATTTAAAAAAAATAATAATTA
TTTAAATATCTAAGCATATGTTGGATATGTGTTTATTATTGGGTTGCATC
AGTCCTGATTATGGAACTTAAAAAGAGTCCAGCTCCGTTTCATCATGGCT
ATCAGACCATGATAAGGGCCCAAATTGCTCTCGAGAAAGGCATCATTTTT
AATAATATTATACTATAGTATCTCAGTTTACCATTTGAAAATAATACTTT
AAGTGTCTTTCGCAAGTTAATTTTCCCTCAGGACATTTAGCCTTAAAGAC
ATTTGCCTTAAGGAAATTTCGCCTTAATATATAAATAAATGAGATTTCTA
GGTCGTTTTTGTTATTTTTGGTTAAAATGGATCTTCCTTAAGAATTATTT
AATCAAAATATGGAATGTGCATTACTATAAAACTTATTAAATGGTTGTAT
TCTATTTGAACAATGATTGAGTCATACCCCAAAATTTCATTGCATTCACC
AACAAAAAAGCACTATATTATTAATTCGAACCAGAGACAAAATATTTAAT
AAAATTAACATAATTAGAAAGATGTATATAAAAAAGGCAATGATTCGAAT
AGAATAATTGCTAATCACTTTTCCGTTAGTAATTATCATTACACATGATG
GACTAGAAAAGGCTCATGGAATGAAAAACAAGAAAAAGAGCATAATTCCA
ACAGAAACAGATATTTAATGCATTTTATAGTAATCAATCAGTTCCAATCC
AAAATAAGCAATAACTACATATAAATCTCATTTATTTATATAAATTAGGC
TAAATGTCCTCGAGGCAAAATTGTTCTAAGGCAAAATGTCCTTAGGCGKA
ATGGTTTAAAGCAAAATTTCCTGCCGCAAAATAATTTAAGACAAAATAAC
CGGGCACTGTGCATATAGCATCGAACGTGTATTCAGGGTGCACTGTAAAT
AGTGCTCCCTAATATATATATTTTTTATCTAAGAAATAACAATGTAGGCA
TATTAATGAACTATTGCAGACATGTGCCTGTAGCATCGTATAGGTAGTAT
AACTACGTAGCGTTTGATTGGATAAAATATGATACATAGTTATACTAAAT
AGATATTATTGAATAAAGATGATTGTTTATGTCAACCTATGTATGTATTT
TCTGAAAAGAAATGTATATGGTGCTCCCTGATGTAGATGAAGATGTTTCT
GCTTGTTTTGTTATTGTTCTCTTATGAATATCATAATTTATAATTGATGG
TTGTATATGTTAAGATTTGAATAAAAGATAAACACTCCTATGTAAAAATG
AATTAAATCGCGCAGGCGTTTTGTATGTAGCACACAGAGAGCACTGTTTT
TTTTTTTTGTAAGAGAGGGGTCCATAGTACTAATGTAATATCCCTTCATA
TTTATTTTTTTTCGCAGACTTTTATTTTTATTCTTTCATTTGGTAAAACA
AGACATGCCATTTTTTTTGTTATTTAAATATTTATGACTGCTTGCCATAC
ATACATAAAATAAAATTATTTCACAAATGAAAGGCAAAAAACACGACCAC
ACAATAGGATATTTGTGCAACAACAGCAGATTCTAAAACCAAGCTTACAT
TAAAATTTTGTTCAACAATATTTTTTATTTTTTTACATTTCATAAATTTT
AAAATACAAAAAGTCTTCCATTCATTGCTTGATGTTTCTTGTAAGATAGG
GCGGATCATCTATTGATGAGACGGTCTGCACTTTGCAGTTCTTCCATACA
GATATTACACGTTGAGCTCATTTCCTTCCAATTGCTGAGGTGAGCTAGAA
AAGGGCCTTGTTCAATGTAGGTTTGTACAATGAGTCTCAATTTTTCTCTT
CAAATCTAGATACACTTCGACTTCGGCTTATTAAGCATGGTATGACCATG
TTTCATATTTTGATCTTTTTTATATCCATCACACCAATGTTGATAGAAGA
AGTCATGAATTACCTTCTTTATGTAGATTGGAGGCGTCCCAGAACATGCC
AAATGAATTGATAAAAGTATTGAGTTTATGAGTGTACTCAGGGAAAATGA
AGGATAACTCTAAAGATTTCTTAGGGAGTTGTTTTCTACCTTATTTAAGA
AAAGTTTGTCTGTTCTTTGACGCCTAATTAGTTTGGGTACTATCGCTTGT
AACTAATATGTTAAAACGTCATCCCATCCAAACCGCTCTCCTCTCAAATA
TTTTATAAATTATCCAGATTATCATGCTTCTTTTTGAAATCTTTTTTTTA
GCACACCTGTAGGTCATACTTTTTTACAACTCAACATATGATAATGGGAT
CAATAATACAGGTAATGAGTTGTGTTATCCGTTGACATATAAATTAAAGA
AAACGTCTATTATAATGTAAAACTACATGTATTTACTATTTACGTACATA
ATAATGTCCCTTATATGAAAGATATTAATACACTATTTTTTCTGCAATAT
TTTATTGTTATAAATGTCGTTCAATTGTATGAATGTTTGTTTTATTTTCT
CTCGTTTTCTTTTAATTTATGAGTAACGTACACATAACGTCTTAATATCC
TTTTAAAGGGAATAAACGACTCCTAATTTCTCTTATTTATGAGATAATTA
AAAAATATATATAATATTATGTACCGTGCGTGGAGGATTGCGCTCCGGAA
AATTGCCATCAATTGCAAATTGTTTGCAATTATGTAGTGGTATTTCCACT
GATCCGTGCCATCTACAGATGGGTTGGACTCATCTAAGGATACGTATATA
GTTTTTCCGTCTGCAAAAAACCCCCGTAAAACATACAGGGTGAAGAATAA
TTTCGGGAAGACTAAGTTAAAAATTCAATATAAATTTATTAATTGGCATA
AAATTTTGTAAAAATTATCAAATTATAATATAAAATAATTTAAACAAAAA
CTTTTGTTCCAAATATCCACCCTTTGCTCGGATTACAAGGCGGAGACAAA
GAGAAACTTGGGTAGAGGCAGCACAGACAATGTTGTTCACTATTGAGGCT
ATCCACAACGCCCAGAATTGCAGTGTTTTAGTCAAGAAAATTGACAGCAT
CTGTTAGAAGCACCGGGTCATCACCAGATGCCAGAAACATCCCAGTGTCG
AGCTCGGGGCCAATATGATGCCAGACGGGAATAAAAAACCTATCCTTTTC
ACAGAGGAGGGTGTGAAGACACGTCTTCAAGGTCATGTTGGTCGACAATA
TTCTTCCTTGGCTTCAGGAAATATATGTTGATGTCCATTATAACTTCAGC
CAAGAAGCCTTCTCATACTATAAAAAGTGTGCATAACTGTTGAAAAGCAA
ATTTAAAAGGGCTTTTAGGGAAAGTATATGTGACCTCCTAGAAGCTCTTA
CCTGAATCCCATGTACTTTTCTATGTGGTCTATTCTTCAATTAAGGGCTT
GCACAAATCACCACCCCACCAAAGACCCTCTGAAGCGTTCCCTCATATAG
GAATCGACCAATAGCTCTGAAGGAGCTATTCCGTCTCCCCTAAGTGCCAC
TTCGTCTCTGTTATGTGATCTGGGCAWAGGGTGGCAAAACTTTATTTAAA
TTGTAATATATATATATTACGATTTGATCATTTTTACAAAAGTCTATGCT
AAATAATATATTTATTTTGAATTTATGGACTAAAACACATCTTCACAAAA
TTATRCCTCAGCCTGTTGATTGCKCTCGTCGAASCTGCCATTCTAAAAAA
CTTTGAGAAATTAGGAGGGGTTCTTTTATGATTTCTTGAAGCTAAAGTGG
GGTTATGGAACGACGTAGTTGCTATGGATAAATTATTGTCTTGAACTTAA
TCAGTGCAACTCCATCTAACCAATTAAAGGAACATTAAAAAAAGNNNNNN
NNNNCCTTGAGGCCTCAAATTTATACTACACAACCTGGTAACCTCTAGCA
TTTTTGATGTGGCGACGGTGGMTTTWATCTGTCTCKTTMTCACAGTGGTA
TCCGTGTGTCTAGATTGCAATTTTGAAAATTAGGGAGTAATTTTGTTTTC
GCCCATCTACAAAGTTGCTCTTGGCTATACTACATTAATGTTGATTCACC
TAATGWTCTGRCCCATCCACAAAAATATATGTTGATAATTTTCTTATCTT
TAAAATAAGAAAGAATAAAATACTCATTCTAATTTCCACATTTCCATCCC
AAAACACTACAGATAGGAAAAATATCAGTAGACACTTAGATGGATCAGAC
CAATATGTAGATGGGACATATAGTTAGATTAATCACTATAAATATAGTAT
GATTGTGGGCGATTTTTCATGATGGGATTTTTGAAGACAGGCAAAATAAA
TAAAAAATCCTTCCTGATAGCACAAAATAACGCCATGTACGCGGGATTTG
TGTGCAATAACCGTAAAACCCTGKGTCAAGTTAAAAATCTCTSCTGCCAC
TTCAAAGAGCCTTATATATTAGAGCATAGGGTCCATGTCAATTGGTGGTG
CAGTATAACCCCACCCCTGTTTCAAGACCAATAAAGGACCCATCTTAATT
GCTCAATACTTTTTGCAATGGGAGATTTGACGGCGAATATCTATGATTAA
CAGTCTTCTGCAAAGGAAAAAACTATCAACGTATCCTTAAATAGGTCAGT
TCTATCTATAGATGGAATGAATTGATAGATTCTCTCTATATATAGTATTA
ATACGGGCAATTTTTCGCCAATGACAATTTTCTTTTCTGCAATTCTCTAC
ATATGACATTATTCCTTCTGCCAACCTTCCTAGAAACATTATGTATATTT
TATCCCTGTTTAATTATTATTTATTTCTATTTTCCTTCAACCCGTGTTTG
TAAAAGATGACATCCGCAAAACTCCACTTCAAAATAAGGAAAGTTCGTCC
AAAGGTCCAGATTCAAAAACCTGCCATTATACATGTAAACCAACTGGAGG
ATGTAGCGTGCGTCTCAAGTCCAGCTCACCTCTTAGTGGGAATGTTTTAG
GTTCCTGTTTCTCACCAGTGTTTGGAGGAGAGTGCTTTGGAACACCCAAG
GACTGTGGTTCCTGTCTGGAGAAATGTGAGAAAAATGGTGGAGAGTCGTT
TAAGGAGTCCGTTTAA back to top
|