EMLSAT00000004767, EMLSAT00000004767-700614 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004767
Unique NameEMLSAT00000004767-700614
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s250supercontigLSalAtl2s250:742123..765557 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004767 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004767EMLSAG00000004767-687533Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000020861EMLSAE00000020861-729789Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020862EMLSAE00000020862-729790Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020863EMLSAE00000020863-729791Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020864EMLSAE00000020864-729792Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020865EMLSAE00000020865-729793Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020866EMLSAE00000020866-729794Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779557auto779557Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004767EMLSAP00000004767Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004767

>EMLSAP00000004767 ID=EMLSAP00000004767|Name=EMLSAP00000004767|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=255bp
MLSYTFILLMFVKLSHSQESFGIIPGLVSKCSESEIQEIEVRRKKCVTQK
EQAFQSSQVEKTQGLLCSYIEEIIEDCSEEYNKCYHEQQMKQFKALQIQI
FEQLIGAHKDSGLKLNACDTYEKYKMNSFSGSDICDEKKIKEISIKYGAC
INKTDLFQSKFEKIVSNPKAFKEVEKIFCEFYTILEGCGGILRECYPEEK
LKETSSGQLDIIKTLMQQAGLQLPNNCDKEEHQPAGAGSIIASISLIVPL
IHLLN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s250:742123..765557-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004767-700614 ID=EMLSAT00000004767-700614|Name=EMLSAT00000004767|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23435bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s250:742123..765557- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTGTCCTATACTTTTATTCTTTTGATGTTTGTGAAATTGAGTCATTC ACAGGAAAGCTTCGGAATCATACCAGGTATTTAGTTACATTTAATACATA TAAATATACATAACCTTTTGCTAATGGTCATTTAAAATCCCCATTTTGTC TCAATGTCATTCCATGAGTCTAAGGGATATTCTGATAATGTATAAATACA TATAACTCAGGTATTACCTTTTATTACATTATTATATTCGTGCCGCTCCT TCAAAAGTACTATGTTCTTTACCTATCGTTAGTTTTTATAAATGCAACAT CCTTTCATAATAAGGTGTGGAATCTATTTTTATTAATTAAAGTGGAGTGT ATTAACAATGTTTTTCTTATAAATAAGTAGGTTAATAGTCTCATAAATTC AAACAAACAATCCTCTTACAAAATGCTTTCGCATAGAGATCTATAGCTCA GGTATTAAAGTCCCTCATTAATTCATGATTTGAAAAGGTTAGTCCAATAT CATATTTTATCCTTTTACATAGAATAAAATTATTATTATCCACAGGAAAG GTTTAGTGATAAAAACAGCCCGGTTCTTTTTGTATGAGGATTACGTAATT TTTATGAGGCCTCCAGATTTGGTATTTTCTTATTTCTCCCTTATGAAAGG AATTTTTTATAACATATATCCTATTACGTAGTAGAAAAACCACTTCCAAG AGGCACATATTAATTGAAGCATTTCATAATCCCTTTTACCCGTTGACCAT CATCACTCTGTTGTGGTATGTTTTTCACTTTATAACATGTGAAAATTCAG ACTGTTAACATAAAACAATCGGAAACAAAAATCAAGACAACGAAGATGCT CAATATATTATATATAGGACTTGACAGACATGTTAGCGCGTGGCTAGTTA ATACTTATTCGGGCTAGTGCAGGGMAGTCTGTATCTGGCCTGTTTGGCTA 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