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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s254 | supercontig | LSalAtl2s254:290592..303665 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004820 >EMLSAP00000004820 ID=EMLSAP00000004820|Name=EMLSAP00000004820|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=658bp
MYASQGLKLLFNIVFFMSEYRRASCESIGELIEKHPNLTRFHQLLKEDGL HRAFMERSITIFAPSNEALASAQLSHRRNEDLILNHFTNLALKKVQLSKE LTSLVTGNPRLWVKREGNNVFINQGRIINFDIQGVSPRGEQQVLHIIDSV LEPLLPLTVSSGNYFVELDARKLMSKSTLYDLNGHGLRMFNKQAEANRKS GMFSVPGRHTFFMPVDEAFEISPIKPQGLYSHAIKNAPPKTKIQPELISA RVLEGHIVPNQLLFTNMAPTSEYPTVAWXPXGIKVNLSLRESNLDNEVLV RSHTIVGDPAHARGIVIANILRGNIPVENGIVHLIDKPLMIVDKTLFEYV RTEGSEPDNRIRRFADLIRDKGGLFAQTLLEAKDGTLLIPNNEAMDRIEG DKLNYILGTDYLRAEWFGLHFVRELNDNRMSVETRGVNASMTEKDIGTIN GVIHVIDRVLGIPYQSVGEKLSTNPQMSSMFSLLQKWNLEDLFYDNYTRI TLLVPSNSAWAKADAHFSESIDSILSDNTLTKKLIERHLLIDSVACSFEE LVERTRRSPRRKVCMKGSELEFAQIGEIAQLAYRDHIVKWEGDINAKVLR PNLECTNGXIHLIDTVLIDDAPPWVLMSYVSSSSTPGTFSSSCIHTIFSI LFYMRSLL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s254:290592..303665+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004820-700667 ID=EMLSAT00000004820-700667|Name=EMLSAT00000004820|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13074bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s254:290592..303665+ (Lepeophtheirus salmonis) CTCCTATTTTATCACCACATTACATATACTGCTTAAATTATAATGATGAC
TCGGCCTGAGTCATCATCACAACGCAAAGAACTGACATACTTTGTTATTA
CTTAGTCATTGGCAGTCCTTAAATTTATCATATTGTTTATAATAATTAAC
AATTAATTACATCCTTATACCTTACATTGCAAGACATACAATTCTTCTAG
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ATTGGGCTTTATTACGAGGACTCAATGGATTTATTGCAGTGAATTTATTT
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AATAATAATTACTGAATTTACTAAAAAACATTTTATTAAGGTAAAGTAAA
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TTAAAGAAGTAAACATCTTTACTATATTAAAAAAAAAAAAAATAACGTAA
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TGTGTGCCTAAGCCTGGGTTAGTCAGTAATTTATAGAATTTGATTAGTAA
TATTAGCGAAAATACAACACATTTTAATTCTAATATTAGAAATGCTACCA
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ACAAGACCGTTTGAGTCGGTCTAAAAAAGCTAAAAAGACTGCAGTCCTAT
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ATTTTATGGAAATACAACGGCTGAAATGACATAGTTATTACTAACTACGT
CGTGAAATTTCATCAAAATTCATAACCTCTTTCAATGAGATAAGATACCT
GAAGTTAAAACTAGGAGGTGTGTGACTAAAACGTTCTAGCTATCATTCAT
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ATATATTGAAAAAAAGACTGAAAAGGTAGAAAAAAAAGGATTGATTTAGT
TATCAGTCCTAGAACGGATCCTACATAATCTACAATGCATCTTTTTCACT
AGTATAAGTTCAGAATTAATTTCAATTTCTGAATGTCCCGGGCAATGCCG
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TCTCATTATCTTTTTGTGCACACAAGGGTAACCTACTTACTGTCCTTTTC
TAGAACCATGTGGTTTTTTTAACACACTCCACCCAAAAAAAGGGATGATT
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TTTAAGGTTGATCCTTTTCTATTTTTGAAAATGTTTATCGCCTGTTCCCT
ATGACGTCATTTTTTAAATACTGGTATGTTATTCTCGTGGACGTAGTTTT
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AGGCTCCCCCCCCCTCTAAGTGGCCGMATGGTTTGTGAATTTCCCCATAG
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GTTATGTACATATATTTTTAAAAAGATTATAAAAATGTATCTCAATTGTG
GAAGGAACGTGTTTTTACTGGCTGTTATCATTGTCATTGTGCAATACCTC
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TTCTAAACGTTTAAAAAGGACTCTTTGACACAATTCAATAGTATTAATAC
ATTATTCCATTTATCGACTTTAAGTGGATGAACCTTTATATTTTATGTCA
AAAAATGGAGCTTCATGATAAAGAATGAATCAATCAAGAATAAGGTAGTC
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TAAATTCTTTGAAGTATATATTTAACAAAATAGGTTTGTGATAGGAAATT
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TTCTTTTTTTTTAGAACAGAAAGTTCAAATGATAAAATTTAATTCGGATT
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AAGAATTTGAATATACTTTTATTATTTTTCCTGTAATAATGCTATGTCAA
ATGTAGAAGGTTCTCCAATTTATAGCAGTAATTCATTTTCTGCCCCAAAA
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AATAACTTTTTGTCCTTGCCGTTATGTTATATACTTCATATATAAAAGCT
TCTGCGTATTCAATGCTACTGAGATAACATCTTATGGCATATTTTCATAT
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ATACCATGCAATTTTTTAAAATTTTGATGTTGCTTTGTTTTGGATTGATT
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GAATAACGACATTTTCTAAATTTATTGAAAATTAAATAAGTTATTTTCTA
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AGAAAATTCGTTTCTATATAAAATTGACCCAGAACGATGGATGTTTAACT
GAAATACATGTCATTTCTTAATATTTTTTTCAATATTTTTTACTCATTTT
TCTCTCTTTTTCATCAAACGTAAATTTTCCATTCTTAAGAAGAAATACGA
CACAATAATGCATAAATACATTTTGTATGTAAAATTTGTGGAAAAGATAA
AAGCAAAGTCTCCATCATGAGATATAACCAAACCTTTCATTTAAAATATA
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TTTTTTAAATTTAAGATCTAATAAATGTGTTAATGAAATGCACTTTTGAA
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CTTTTACAGTAGCACGAAAATTGACAACTGTTGAATCTTTTATGACTCTC
AGTCGCTTCTTTTTCCTTCCAACTACTATCATATTTTAATTATTATTAAC
ATTTATTTATGACCCTAGTTTCATCAATTACTGAAGGAAGATGGACTCCA
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AATCACTTTACAAACTTGGCACTTAAAAAAGTTCAATTATCCAAGGAGCT
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GTGTCCCCTCGAGGCGAACAACAAGTAGGCTGATACATCCCCATCATTTT
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TGATCTAAATGGGCATGGACTCCGAATGTTTAACAAACAAGCAGAAGCGA
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TGATAAAACAGTGAAACTGCAAGTCATTGAGCACATTTGAGATCCCTTAA
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GATTGGACATTTTCCAAATTAAATATGTAGTGGCCGAGCGCAGGTAGATT
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ATAGAAAATGTCCTATTTTTACATCCTATTTAGAGGGTTCGGAAAATTTG
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TGTATATGAAAATTGTACAAATTTCAACTATACAATTAGATGAATAATTT
ATATGAAGGATTTGGTCTACATGGAATGAGTATAATGCAATAATTGAATA
TTCACTGGATGATCGATATATTAATGGTTTAATTGTAGAGTATTTTAATA
CAAACTTCTACAATATAAGTATTCTGTGGTACAAGTTCAAATGCTCAGAG
TCATTTTACTCATAAATCAGGGGTGTCCGGAGGGGCTAGGCTTGAGTAAC
TGAAGCTCCCCCCAAATTAAAGATTTGTTTATAAATGGAAAATTTAATAT
TGGATTTTTTATTTAAAAAAATCCGATATTTGATATTCAATTTTCCAAAT
TTTTTTATTTTGTGTAAATATTGGGTGGATTTTTGAATATTTTTTCCAAA
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TTGAGAATTTTGTCCGAAAAATTTAATTGCTTGTGAATAACTGTGGATTT
TTGAAATTTCTTTTCAAAAAATTTAATATTTGAAAATTAATTTTTTTAAA
TTTTAATTTTTGAATTTAAAAAAAAGACCAAAAACCCGCCTCCTCCCCCC
TGCCTCCAAATATAATCTTTCTGACGCCCCTGTGAATACATAATACATGT
TGGAATAAAATAATTCATTTTAAGGCAAAACAATTGGTACCATGTGCAGC
CTATACAAGTTCCAAATTTGTATTCAGGAAAAAGGATCCCTCTTCGTCGC
AAGGTATCTGATGGGCAGCATGACTTTGATTTCCCCCGCTTAAATAACAG
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TAATTTCCCCCCTAGCTAACTGTTAAGTGCACATTCCCCCGTCTTTTTAA
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TAATATTGGAAACAAAAATAAAACGTTTTAAAAAGTATAGAAACATGAAA
TTGTAATGTAATGTAACGTAGTTATCGCTCCTCCAGATCAGAAGTCAATA
AATAAAAATCTCTAATGGCATGCGCCATTCACTCCCTTCACGCTTCTTCT
TCTTATTATTATCGCTCTCTTTGCTTTTCTTTTCAGCTCCATGTTTTCCC
TGCTTCAAAAATGGAATTTGGAGGACTTATTCTATGATAATTATACAAGG
ATAACATTGTTGGTTCCAAGTAATTCGGCTTGGGCAAAGGCCGATGCACA
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TTTTTATGTTTTGTTAAATTACTCTTTTACTTATATGTACATATTTCTAA
AGACCAGAAACCACTTTTTACAAAGATTGTTATCTTTGCCCTAGCTAATT
TATGATCGTCGACGACAGACTACTACTTTTGGGGGGAATTTTTCAGAGTA
GTAGAGCGTAGATACAAAAACAATTCAAAAATATTTTCTTTGAAAAAAGA
TTTGACAAGTATTTATGAGGAGGGAGGCTGAAAGGCTGCTGTTGACTCAT
TTTATTTCTATTATAAGCCATATAACTCACTATTCATAAACTTGTTAGTA
GCCAAGTTCTGTCTCATTATTACCATCATCACTACTTTACAGACAAAAAA
ATTGATTGAAAGACATCTACTCATCGACTCAGTGGCCTGCTCTTTTGAGG
AACTCGTTGAGCGTACACGAAGGAGTCCGAGAAGAAAAGTATGCATGAAG
GGATCCGAGCTGGAGTTTGCACAGATTGGAGAAATAGCTCAATGTACGAA
ATAAACTCATAGCTCAACTCTTTTGTAATTTGCATCTCTTCTTTTTAGTG
GCGTATAGGGATCACATTGTCAAATGGGAAGGAGACATCAATGCCAAAGT
CCTGCGTCCGAATCTTGAGTGCACAAATGGCTAMATTCATCTCATTGACA
CCGTTCTAATAGATGATGCMCCTCCATGGGTCCTTATGTCCTATGTGAGT
AGCTCTTCCACACCTGGGACCTTCAGCTCTAGTTGTATTCATACCATATT
TAGTATACTATTTTATATGAGAAGTTTGTTGTGATAATGATTTAAATATA
AATATATAGGATTGAAGAATAAAG back to top
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