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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s257 | supercontig | LSalAtl2s257:197037..211362 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004892 >EMLSAP00000004892 ID=EMLSAP00000004892|Name=EMLSAP00000004892|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=187bp
MASDKSVLNNIAIVWIVGGPGSGKGTHCETIMAKYGFTHLSTGDLLRVEV
MSGSDRGLKLYNIMSGGDKVPNDIVDEILVEAMIAKASESKGFLIDGYPI
NVAQADSFVQDIREPNCLLFLEANNEVLRGRLKARGNFDDTDESIKKRIA
TFNDETRPILSKFNKISKFVNAERKPEECIPTKTKNL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s257:197037..211362- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004892-700739 ID=EMLSAT00000004892-700739|Name=EMLSAT00000004892|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14326bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s257:197037..211362- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCTTCTGATAAGTCTGTTTTGAACAACATAGCCATTGTATGGATCGT
TGGTAAGTTATACTCACATCATAAATAGATTATTAACTGTTACAATGTAC
GTCCAAGCGCCAAGAATATGCCCTAATATGATATATATTTTGAAGCTCAT
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TCCGATTTGGTGCATCCCTTAACCAGTGAAGCCTTCAGGCTCACGAAATT
CTTATGAGGCTTTCCACATTCCTTTGTCTCAAGAATGGGCTAAAGGCATA
CTCTGTAAGATTCAAATAAGGGGAGTTTGGACGTCATTCTTTGACTAAAA
GTTTGGAAAATTCCCTGTGAGCTTGTCTTGTGTGCTCTTGTTGGTATTTG
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TCGGCCCAGGGCTTCGTTGAGCATTGGAAACGTGCTCCAGGTAATTATTG
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TATCATTGTGACCTCAAAAAGCATTTGGTAGCGCTATAACCATCAAATTC
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CTTGTCAATCCTTCGTATCTTCTCTCTCACAGCCTTGATGCCATTTAGCA
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GTGAATATAGATACTAAAAAAATTTTTTTAGTTATATTCTAAGGAATATT
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GATGATCCACGTATAGTGTCCATCATTTTTTATTTTTATATTACATTTTC
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AAATGCAATATATAGTTGTTTATTAAAATGACTGATGTTATTACAATTAA
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TTATATAAATATATTTATAATCTGCGTTATTTGATTAATTAATATTAATT
AATTGGGATTAAAATAAAATCACTCAGTCTTTGGTCTAATAGTTCATTAT
ATGTTTTTTATGAGCTACTTTATAACTTACTAACACACATGACAAATAAA
GGAGGATCAGTGGATTAACGCTTTAAATTTAAGTGAATAGGATTTTCCAG
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TTTTTTTAGTAAATTAAAATTATTGTTGCGTGTGCTCTTATTCTTTTTAC
TTCATTATTTCATCGGTTGTCGTGGTGTTAACTTCTCCCTCTGAAGTAAG
CCTTATTGCCTATCTTTGGTTTAAATTGTTTTAAAATGTATAATTCATAA
CTATACCTAGTGGTCCGTTAAAATCTGAACAGTTTGAATGTCAAACCTTC
AACAAGATATAATTTATTAATTAACAATAGAATTTCAACAAAAGTAATAT
TGTACATGGGTGTGTATCTGAGCTCTTTTGATTATTAATGTACCCATCCT
TAGCGGTAATGACGGCTTCTGGATAGTGGCAGAAGGCCTGGTACCCGCTG
AGGATGTATTCCTCTGTCAGGCGTACCATTGCTGGCTGACAGTGGCTTTG
AGGACCTCGGTGTTTGGATGACGTACAATAGAGGCCTTCCCCTGGACATA
CACCCAAAAGGTGTAGGCTAAAGGGTTGGCATCAGGGTTGTAGGGGTGCC
AAAATTGTCAAATAAGAGTTCAAAAGGCTCGTTCAAAACTAGGTTAAAAG
AGTCTTGCAACGGAGGAGATAGGGTTCTTTCATTGCTGCTATCAAAAGTG
GCATCTCCACCCTCGCAAGGCTCTTTACACCCACTTTTTTGATAGCTCTC
TGGACAATCTGGTGTGAAATGAGACGAGATATCTTGTATGGGGTCTCATA
GACTTGAGGGATTACCCTGGGCTGTTTTCTTAAAATCCTCCGGGTCCAGT
TTGGCCTTTTTGACAGAACCCTTCATCCTCTCCGACGTTTCGGACTTGCT
GATGGCGTAGACGGAATTCTTGAAGACGCCCAGCTGCTTGAAGTGGGTAA
ATGGAGATTCGTCGATCACGTTGAAGTGGCATTATCTCAACTTGTACCTA
AACTAAAGAGCTCAGGTTTGCTTTGTTTTGTAACTACTTGTATATCGACA
TATGAATTAATTTCAATCACTCAAATTTAAGTAATTATTGAATTTGGAAG
TCTTCATATTGTAATGCATATTAACAAAAGTCTTAATTCAGTATTACCAT
ATGTTTTCCTTACACTTTCTCCTTGTACTTTTTTTTCCTTACAAAAATTG
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CAGCTCATAACTATTCAGTTTCAAATATTATTATTATTATTTTTTTTTTT
AATACTTAAATTTAGACCATTCAGGCTATTAAACTGTATAACTTGAATCA
TGTAAAACATGATTGATAGGAGAAATATATGCTTGAAAAATATTAACTGA
AAAAATCCCCCATACTAAAGTTCTTGAAACTCAAACAAAAAAAAAATTCT
AGATTTTTTTGTCTAGAATAATTCAATCAATTAAAACATATAGCTTTAGG
AACAATGAGGATTTGTTTTTCCTATCGAAATTAGGCATCCCAAATAAAAT
CCCTTTTTCTAACGCGGGGTCAAACGGAGCCAAGTCCCCAAAGTAGAGAT
ATTACGGGTCTTGGAACGAAGTTCCTGGGGGTTGTATAAATAAAGTTGTA
TTATCTGAAAGGATCCCAGACCCGAACTGGGTAATCTTAATCCGAATCCT
GTTTTATTTTGGTTTGAGTAAAATACTCCTTTAGTTCGTGACAAGTACAC
GTCTATTTTTAGTTTCGGATGAAGTTTCCTCAAATAAGTACGTCTATAGA
TATGAGCTGATCCGGATCCGAGATGATGTAGATCCATCTTTACTTCAAAT
GGAAAAGTACAAATCATAGACCCCCCCCTACAAATATATTTTTTATTTGT
ATCCTCATGATTAAAGATCCAAGGTCAGAAGCTCATTTTTCCATTAAAGA
TCAATAATTTTAGGAGTTTAATCATGATGTGTGTTTACAAGGCATGATGT
TTTATACATATATACATATAAATATACTCACATACACAGAGAATTTCATT
CTATACTTACAATATGAGGAGAATGTCAAATACTCATTGACTCAATTACT
TTTAAAATCAATATACCAACTAAATAGTTTTGTCCTACGCGGAGGACAAG
ATGAACTAATGTGTGATCTTTATTGAATTCCTTTTCTTCTTTGAGAGTCG
TTTCATACAACAAATGTACATATTCACCGGCCAACACAGGGGTTGAGCTG
GAGGGGATGTAGTTTCCATTAAAACAAAACTTTTACGTCAACACTACTAC
AAATTATCGCTTTTTAGTAAACATTTAAATCATAAAAAGCTAAAACAAGT
TTTTCCAAAAAGTGTTTTGTCTCTTCWAACAAAACAGCCAAAATAAAATT
CTGCAGACGTTGCTAACATAAAGTGCAGCGTACATAAGTCATACTTCGAA
TAGAGAAGTTTATAAKRAAAAAAAAAAAAAGAGTGCGAGGAGAAGGTGCG
AGAGAGACATATGGTAACCCTGAATAAGACTCTTGTTAATAATAGGTGAA
GTAACAAGGTTAATAGAAATACAAGATTAGACCATCATGTAATTGGGATT
GCTAGAATTTTCAATCTGATGTATTGTACTGACTGTTGGGCAAAGCAGAN
CAGATTTTGACAAAACATGCAACCACTCACAGTTTATGACGTCACTATTG
CTAGAATTTTCAATTTGATGTATCGTACCGGCTGSTGGGCAGGAAACACA
GATTTTGACAAAACACACAACCACTCACCTCCTATGACGTCAATATTATA
AGCGTGGTGGCAGTCAAACATTTGTTGTACATGCGTTATGGTATAACCTT
GTATTTCTATTGACCTTGAAGTAAAAAGTTCTGTGCGTTTCTTTGCTTCA
TTTTTGCAATAAAAGTTAAGTTAGTACTATCCAATTTAGATGGTTCCAAA
CGGGTTTCTTGCTGATATTCAGTTCCTGGGCAATGGAATAAGTGCTCACA
TGCCAGTCCAACTTGACGGTTTCCATTATAGTATCGACATCTTTGATGTG
CATATTAGCAGGACAGACTCTTTGGAACCAAGGCTTTGCTGTTGCATTCG
ATACTTTATTGGGTCCATAAAGAGCAAAAAAATATTTGCCCGCCTGCTCC
GCCTTTTCACATTGGCCGTAGTGATGATGAGGAATGTATCGAATTTTCTC
ATTTTTTAGTTCCATTTTGGAACGCTGTAACACAAAACTGGCTTCACCAA
ACACAAAACCGTAAAAGAACTTTTTTTATGTGTACGTTTAACCCTTAGGT
TTACTTTAAGCTTTTTTGATGCAATGAATTAATCGTGAGATATAGCTCCT
AAAATATATCTAGCGGAAACCCTCATCACTTTTTACTTAACGCTAATAAA
TTCTACGGAGGGAGAAGTTAACAAAACGACAACCTAATCAATAATGGACA
AATAAGACGAAGGAGCACACGCAACAATAGTTTTTCTCTTTCTTGGGTTT
AAAGGTAGATTTTATTTATTACAAACTAATCAATTCAAGATATACATAGA
CGGTTATTCCTAAGTTTTAAAGGTTCCATAAAGGTAGGATCCATGCAAGA
GACCTCAGAGTCTCACGCCAGACTGTCCAGAGAGCTATAAAAAAAGTGGG
TGAAGAGGCAAGTTTTGAGGCCAGCATTGAAAAAAAAAAACCATCTCCTC
CGTTACAAGACTCTTTCGAGTTCTTTTGAACACCTTTTTAATATTTTTGG
CCCTTATAGCCCCGATGCTAMCCCCCTTGACTACACCTTTTGGGTGCATG
TCCAGGGAAAGGCCTGCTGTATCCATTATCCAAACGCTCAAGGCCTTCAA
AAGAGCTCATTTAAGAGCGGCTATATTAATAGTTAAGATAGCTTAGAGAC
ACATCTATTTATAGTATTATTATATATATCTTTTAAATGTTATTTTTAAT
TAATAAACTTTATCTTGCTAAAGTTTAAAAGATTTAATGGCCACTCGGTA
AATATAATTTTGTCTGATTCATAATTATATCTCCAAAACTTATGAATAAC
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TCTAATTAATAATATTATTGCTGAACAAATAATGTAGGCGGGGGKGTATG
AATAAATACTTAAAAATGCATAAATGTTTGTATATATGCATTGTGCAGTA
TATATCCATTTGAAACCTTGGATTGTTTGAAAATTACTTGTAAATACATA
AATGATAATAAAATGAGTGATGGCAATTGCTGGAAATAAATAAAATATAG
CCTCCTTTCCATAGTTATTGTCATTCAATTAACGATCATTCTTTTGAGTT
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GCCTAGTTTGTTTTTCTTTCCTTTCTCTCTTGAAGGAAAGGAGTAAAAAA
TAGAGGATGACTCATCTTGTTCTTTTTTTAACCAATCAACCCTTTTAACT
ATATTCCCCTCATGTGGGAATAAACACTCTACGAGATTATTCTGGAATTG
TATGACTAGTGATGGAAATCGTGTGTATTTTGGGGATATTAAAAAAGAAA
TTCAAAAATCAAACTGGTAACCCTGACAATTTGATAAATGCTTTGGATTA
GACCAGCTTAGCTGTCATGACGTTTCAGTACATCAGGTAACAGCAGCTGT
TGCAATTGAGGAGGGGGAGAAGGAAATAAACAAGGGCATTAGCGGAAATT
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CGGATAACTCTGCAACTAATCTTCAAGGTTACTCTTTGTCTTTTATTAGC
ACACACGAATGTTCAATCAAGTTTTGAATATAATAGAAATAAGCNNNCAC
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TCTTCAGATTACCAATTCCAAAATAAAAATAAAAAAGGGGTCAGCTAAAG
AATACACACTATTTACATCACTATGTATGACCTATCTAACTAAGAGTTTG
AATGATGTCACTTTGCATTCGACCTCCATCAAAGTGTTTTGCTCTCATAT
TTACATAATATGTATGAGGGTCTATCCTTTCTTGAGACATGGTCCTTCAG
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AATTCTCAATAAATTATATATGAGGGTTACTCTCCATTTTCCATGAGCAC
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TTAGTATCTTGAGCGCTCCCTGGCGGGGCTTTACCTATACACACTTGCTA
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CTTTTTCTTTTTTAATGAAGATAATTGAGATATAAAATAGATTTTTCGCA
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TGTTATATTATCTGTTATACTATATATCACTCTCAATCTCAACACAGTTA
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TAAAAGTTTTTATCGAAAATGAAATTATAATATTTCAACTAAGAAATAAT
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CCTTGTAAATAGTTTATGTCTCTACATAATTTCTTGTAGGTATAAAACCC
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AAGTAATGAAAATCTAACCCCCACCTCAATCCAATTAAACTATGAACTTA
TACAACTTGACCAAAAATAAATTAATATGGATAGTCCATCATTAAAGTTA
TATGCGATTATTAAATGAGATATATGAATTTGGTGGAATTTTAAGTATTC
TCAAATCTTAAAACTTACAATAACGGGTTATTAACTTAATATTTGGAGTT
TTTTTCATATATAAAATAAAGGTATTACAATATATGTATTAGATATGTAA
AAAAAAGTATGAATTTATTTAACAAACTTCAAAATAATTTTGGTCTGCTT
ATTAATTCATATGATCGTGTCCACTTGCMCTCAAAGCCATAATGGTGATT
AATTTGTAAATCAGGGGCGTCCACAGGATTATATTTTGGGAGGAGCTAGG
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AAATTAGAAAGATTAAATTCTTTTTTCAAAAAAAAATCAAAAATTCACAG
TTCTTCACAAAAAAAAGTTTTCCAAATTAAATTTCAAATGTTCAATTNNA
GGTTTTTAGATTTTTTTGAAAAAAAATCAAAATAACAAAAAATTTTGAGA
AAAAATTAGAAAGATTAAATTCTTTTTTCAAAAAAAATCAAAAATTCACA
GTTCTTCACAAAAAAAAGTTTTCCAAATTAAATTTCAAATGTTCAATTTT
TTGGAAAAAAATTTTAAAATCCACCACTGTTAACACAAAATTAATTTTTT
TGTTAAAAAATTTCAAAAATTATATTTCAAATATTTAATTCTTTGGAGAA
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TTGAAGAATTAAATTAAATTTTAAATATCTAATTATTTGATTTTTTGTTT
CAAAAATTYAATTTTATAGTAACAAGCTGAAATTCCTTAATTTAAGGGGC
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GAGCTTATATTAGTCATAAATTGGACAATAACTACTATAAATTTTCAATC
CATGTACAAATATATATTTATTTATTACATTTATTTCCTAGGCGGCCCTG
GAAGTGGAAAAGGAACACATTGTGAGACTATTATGGCCAAATATGGATTC
ACTCATTTATCAACAGGGGATCTTCTTCGTGTCGAAGTAATGTCCGGCTC
AGACAGAGGACTCAAACTATATAACATTATGTCTGGTGGGGACAAGGTTC
CTAATGATATTGTTGATGAAATCCTGGTAGAAGCCATGATTGCAAAAGCC
TCTGAATCCAAAGGTTTCTTAATTGATGGGTATCCTATTAATGTTGCGCA
GGCGGACTCTTTTGTCCAGGATATTAGAGAACCAAATTGTCTTCTCTTTC
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TTTGATGATACTGACGAATCTATCAAAAAAAGGATTGCAACTTTTAATGA
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TTCTATAGATGAATTTTTTTTATTTTTGGTTCATAATGAAATTTGATTTT
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GTATATCTTTTTATGGTTAAAAATCAAAATGTATAACCTAATTGACTTTT
TACAGTATTACTCTAATTTTTATCATATCAGAAAATCTTTGTCAAGTCAC
GTGCTACAATTAATATCACTTCCACGAAAACCACATTTTTGAACTGAAAT
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GGAGTGGCACAAATATTTCTTTTAACCCTTTTTCAAKAAGTCAATAACAA
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TAAAGTTAGGAGTCATCTTATTGGCAAAGGATGCACAATATTCTACGTAC
CGTTTTCATTTTTCACTGAATATTATAAATTAATTTTGCCTTATATAATA
GTAGCTAGCATATTTACAATGTGTCTTTGAAGAGCTGATTCTAAGATATT
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CATCATAATATTTGGTATATTTTTGAATAAATGATAACCCAAATTTACAT
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GAAAATTTATGATTTTTTTATAGGCACAACTCCATTTTGTTTGATGAAAA
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AAACATCAATGTTTTGTGTCTGAAATTTATATGTAAACGAATTTCCAGAC
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TTTGAATAAATTTAGAAATGTCCTTATTCGTGTAGCTGTTTTTGAGACGC
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ATTTTTTTGTGTTTTGGGTGTAGAATTAGCCACGCTCGTATTATCCTCTC
GAAAATTGGCACCCTGATTAAATTAAAAAGAGGCGCCTATCCAAATTTAA
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AATGAAATCATGCCCTTCCCACTAGTACTTATACAGCTTGAGTGCCACAA
AAGAAACCTGATTGCCTTCAAAAAGAAATTATATTCCCGCAGCCTGGATA
TAACTTTACACTATATGTGATAATATATTTGTAACTATAGAAGTACTATA
ATAAAATTAATAAGTAGCATATGCTTCATCAAACCCCTCGTAAAAGTAGG
GAACATTCACATTGACTGGAGTAAGTTTAAATTGTTTATCACTCAGTGCA
TACCAACGAAAACCAAAAATTTGTGA back to top
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