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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s259 | supercontig | LSalAtl2s259:367862..460405 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004930 >EMLSAP00000004930 ID=EMLSAP00000004930|Name=EMLSAP00000004930|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=996bp
MNGYGNHHSPDSSQLSGSNLGGDLETTLISRTQKQHTTQQVTTTTKTVRE VQYLGPDGTPLSYIPQQAAGNNGNGYRIGGNSTYEPVNTYSSPPSNSSHT YGSGGGDYESHRFNGSGDPPRPHSSLHHSTLHLNDGSGEEIPADYPHRPP XPPXPSXKSNSPPPQYREPDYLRSQNNSGSYXPPRSGYDELDXXXXPPST LQQYSSNGGGRVARYSSVDESIVQGSLHSYNPNESVFEDPLEVSPNFSYH QHPHYHQPSHSGGSGGGGGGEEPPRALFDDELDEPISSQSLSIQQPIYSS HQASPLPQMSRPDPRVTGVHWRDPDLHEVIEFLSNPNSVIKANAAAYLQH LCYMDDPVKAKTRQLGGIPPLVALLANDVPEIYRNSCGALRNLSYGRQND ENKRAIKNANGIVNLVRLLRKTPDDEVKELVTGVLWNLSSCDDLKRNIID EALSVLVNVVIIPHSGWSPAMQHAETSWTTVFRNXSGILRNVSSAGDYGR KKLREIEGLVDSLLYLVRNAIEKANIDNKSVENGVCVLRNLSYRAQEIED PNYDKKQFNNMLTENRAGTKPTSDNLGCFGASKHKXKDSPATTSSSSSTS SRGRSSGGGGGPVKGMDLLWQPEVVQPYLNLLSNCSNPEXLEAAAGAIQN LSACYWQPSIDVRAAVRKEKGLPILVELLRMEVDRVVCAVATALRNLAID QRNKELIGKYAMRDLVQKLPGGNAQHDHGTSDDTIAAVLATLNEVIKKHP EFSRSLLEAGGVDRLMNITRQRQRYTPRVVKFASQVLYSMWVHQELRDVY RKAGWKEQDFVTKTVAARNARPNSPTNLNSTLNRPMASQSGTRXEDRXIQ RGGARSVTGPSGVSSSSNNVVAYNPEEVPMENLSLYGSQRTHQMYAGGNH LGGFGGGEPVYAQVNRDRKKNRSDSLVGHPLSSLNNHHHVHHHHNLDYSN HSDHWHMGNASQQQQRGLILDRGNISSTTVIPPGQSSNSVAGDSWV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s259:367862..460405+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004930-700777 ID=EMLSAT00000004930-700777|Name=EMLSAT00000004930|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=92544bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s259:367862..460405+ (Lepeophtheirus salmonis) CTGGCTACTTCATTTCAGTCCACAAGTTCCTCGCGCTTTTTCCTGGAGGC
TCGCCCAATACTTACTTATTATTTTTTGTTGTTGCCTTGTCCTCTTTTTT
TCCTTTTTCCTTTCCATCTTCTTCCTTTTTGTTTCTTCTTTTCTTTTTGT
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TGTCGTTTGTGGGCTATCATATTTAAAATATTTGATTTAAAAAATGGCAT
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TGMGGGCTATCATWTTTAAAATATTTGATTTAAAAAATGGCATCATTGTG
ATTTTAGATTTACATATCCCATGTGAACTTTGACTTTAGATTAACTACAT
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GTGCAAATAAGACAATGAATCTCCATTCATTATCGGGACGACCCATTTGT
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GGTCCAGATAATTTGGGGAAATACTTAAAGACTTATTACGAATGAGCTAT
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CCGGGCGACCTGTGTGGATCCAGTTTTGCCATTGTACTGATTCTGGTTTT
GCATTTTAATTTACATTCCTTGGACAGATGGAGAAACCAAGGAAGAAATT
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TGTTAACAGCCCAGACCTGACGCTATGCGATTATTTCTGGGAGAAGGTCG
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TCCATTACCCGTACAATGGCAAGTTGGATCCGTACTAAATAAATGTAGCT
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TGCTCATAAATTGAATTTTTTGTGTTATATGAAGCATTTTTATTCAACCT
ACATAAGGACACCCATTTGAGCTCTGTACATCAATAAGTTCCAATGTTAT
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TGTGGTCATATATATGATCTTCGTACCAAGTGAAATCAAAATCTATCTAC
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AACCTCTGTTCAACTTCGTAGTCAGAAGTAAAAAGGGCCTTTATTGTTAA
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ATTAAAAGTAAGGGTATTTAAAAAAATAATCATAATTTAAAAATTTTAAC
AGTGATACAAACATGGATTAATTCAATTGGAACTTAATACTTCCTCATTT
TTTATCGAAAAAACATTTTTGGACTATTTCCTCCAAAATATTGTAGAAAA
ACATAAAAGAAAAATAATAGGAAAAACTCGTTACTTGAACTCGGCCGAGC
TCAATTTTTTTTGCCTGGAATCCAACACTAGCTTTAACTGATTTTGAAAG
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GTATGTATGCATTCAAGCTTTCTTTCACATACATATATGATGATGCTATA
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CGATTCCAATTCTTTAATATTTTAAGTAATAGTTAAAAAAATACCATTTT
GCTATCAAGGGCGTCCACAGGATTATAAATATATATATATATATATTTTT
TGAAAAAAAAAAATCCAAAAATTAAATTTCTTTTTGAGAAAAAATCTGAA
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ATTTTTTTTGAAAAATTTTCGAATATACAATTTGATATACATTTTTTTTT
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GCTATTCTCAAAAAATTAATTTTTTTTGATAAAAATTTCAAAAATTAAAT
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ACCTTCCTAGTAAAAAAAATCATACACTTCCTGTATATTAAAATTGGAGC
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AACCAACAACATAATATTATTTATGTATTAAGTATTTATTATTATTTTCC
TCTCTTTAAAAGTGTGTTTTTTCCTGATTGCACGATACTGTAATTTTATT
TTGCTCAAAGAAGATGGGTTGACCTCTGGGTTAATGGCGTTATGTGTATG
TATATACATATATTTTGTATATTTACATTTCGTTATTAGTTTATTGTATT
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GGCAGGGATCGCACACACACACGAAACCACAAAGAAACCATCATCACTAC
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GATGAAATATTTCTAAATATATGTATGTAATGGCACATAGGTATATTTGA
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GTTTAATAATATCATGTGTGTTTATATTACTATGATGATGATATTTAATC
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AACGGCAATGATGGCTTCCAGGCGGCGGTGGAAGTCCTGGCATCAACTGC
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TTTTTGGTACTAAGAGTCTTCATTGATGTCTCTAAAGCTTAAGTACCAGT
CATTCTGCCTGTTCCTCACGGGACCGACGGTCCAGGTCTTCTCGTCTCTG
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ATATATGTGGCTTTTTTAATTATGATMCCAGCCATTTCAATTACCGACCA
TTAATTGATGCTAATGTTTCTTTTTGATGAATACAACTTAATTATTTACT
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AATATGTAGGAATTTATCATCAGATAAATTTAAAATGAAGTMCTCCCTAA
ATTTATTGASCATCCAATATAATTTCAGTGATTGAACAGCACCCATTATA
CATTGCTAGAAACTACACATTGTCACAAGCATTTACTGTCAATTCTATAT
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TTTTTATTTTTTCTTATTTTGTGCAAGAATTAATGAAATTATTATATTAA
GCAGTCTTTAAAAAATAACATTATAATTACTACTACTAGTTCTATCACGC
ATTAAAATAAATCTTAAAATAAGTATTTAATTACTATAATTTGGAGTTTT
GTTTTCCCACAAATACATTGTTGTTTGTATAGAACGTTTTCAAGAATTAA
TAAACCTTTACTCCTTATTAATGAAGGAAAATGATGAATTATTGCCGTGT
ATTTGGATGTCATAAATCATAATAGAAATATAACTATATTTTGCGACCTC
TATTTAACAACCAACTATATTTTTTGAATGAATTTTCTCCTCAACTAATC
ATTTGCTTTTAATTAAAACCAATACCACATGAAGGCTGAATCTAACTCTT
TTTTATTGTTACTCAATATAATCGCGTTTGTGCCGTCAATAACGGCCTCG
ACTGGACCTCGAAAGCAAGAGCATGTCTTAATGACAGTCTCCTTTGGCAG
ATTCCGGATCCTAGACATCACCTTTGATTTTGTGTTGTAAGAGGATCTGT
TGGTGTTTTGCTCAACTGCACCCCACATAAAAGAAGTCTATGGTGTTGAA
GTCCGGTGAGCTTCGAGGCCAAACACTGGTTCCAACAAAATTAAAAAAAA
AAAAAAATTGATAACCAGGTCAACGTTTGTCTTTTGTGTTGGAAGTTGAG
CTCTTCGCATCTTGATTACAAATGATCAGCCTTTCAGAACAGTTGAGATC
CCTGCCAATGCCCCTCATCGAGTTGGGTGCCAGTCTGGCTTCATCTTGTG
ATCAGCACGCTTTGTTTTTAATTCATTATCACCTCTAGACCCTTCCTTTT
TGACTCTCCAGACAAAGGAACTGACACCAAACACGAACAACGTCCTACCG
GAGCACGTGCATGATGTTAATTGTTAAACAATGGCCGCATGTTGAATAAG
GATGATATACAATAAGACACAAATACCTTCACTAAGTTTAGCTGGGATAG
CTTATTTAACATAATATTTAAAAAAATAGTTTTAAACAAAATATTTATAT
GCACCTTTAAGATAGTAGCACGATGTATCCTTAGATCTCTTATTTAAAGC
AACCTCGATGTTGAGAGCTACAGAAGGTTCTATTTTGAGTAGACTTACTG
TTCTTAAATAATTTGAGTTAAGATCGGGTTTAGAGTATTTGGATTCGAGG
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GATTTCATGGGATACATGTACCAGTGGGAGCTACTTTTTAGGGGGGTTTT
ATAACGAAATAAATTGTTGGTACTTCAGGAATAGTTATAATTTTGGGTTT
GGTTTTTTACCATCTAAGAAAAATACATAATCTCTTTACTATATTCCAGA
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TAGAAGCTATGCTAAAGTTTAGTTTTTTTTCAAATTTCCTTCAAATTTGT
TTGCGGGTTAATTTGTCCGTTTTGTTTGATATTTTAATAACTACACTTCT
AATATGGTATTGCTTTCGATTTATTATGCAATATGTGACGAAATGCGTTT
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GTTAACTAAGGAATGTCAAAATGGGAACAAAAAATAAAGACATAGGGCAT
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