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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s260 | supercontig | LSalAtl2s260:359402..390099 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005002 >EMLSAP00000005002 ID=EMLSAP00000005002|Name=EMLSAP00000005002|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=234bp
MDTLTPYKILSECSSFKQGNKQFFSGAMNRHNMNRLIMNYLETEGFKEAA EKFQEEAAIEPEXNLNDMDDRIKIRDAVIQGKISEATCLVHRLHPELLDD DRYLFFXLQQQQLIELIRDNRVEEALKFASEQLAERGEEDSSVLEELERT MALLAFEDPNASPFADLLTHSHRQKVASELXAAILKAQHAESTQPKLATV LKLILWSQSELDKKNIXPYXKXXXLATGKVEEAK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s260:359402..390099- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005002-700849 ID=EMLSAT00000005002-700849|Name=EMLSAT00000005002|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=30698bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s260:359402..390099- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGATACCTTAACGCCATATAAAATATTGTCTGAATGCTCATCGTTCAA
GCAAGGAAATAAACAATTCTTCAGGTAATACTAATTAATAATTATAAATG
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TTTACTATAGCATTTCTAAACCCTTGTGTTGAGACTCGGTTCCAGACCTT
TTCCAGTTCGATCTTAAAAGAGGTTCACTGTAAAATGATTACAGACAAAA
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AATTTTTCGGAGAAAAATTTCAAAAATCCATAGCTACTCTCAAAAAATTT
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AAAAAAAAATTCAAATATTAAATTTTCTAGTAAATCCAAAATTTCTTAAT
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GCCTCACTACTCACTTGAAATGGAGCCCCTTAAATGTGAACTGAGTTTCG
ATGATCCCAGTGGTTTTTATCCGGGTACGAAGGACGTCCTGCTGTGTTGG
AACATAATGAGGTGCGGAGATACGATCTAAGGCATTGAGGTAATATGCGG
CACTATCATTTAACTGATATTCATTTGACCTTAGAAAACATGTTTGTAGT
CCTCGGTCGTGCCATAGMCGTTTCATTAATTGACCAACTTCAAATGTGAT
TTCTACTTCTGCATTTTGASCAGCCATTTCAAAGAATTGACGAGCATCTT
CCTATTTAAAAGAAAAAAATAGTGGATTTAATCTCATATTTGTTAGTTGG
GAATTTAAGGTAGGATTTTGAATGTTCCTTTTTCCTTCTCACTTCAAATA
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ATATTCCATCATAATATTAAATATTTGTATAACCCCCGAATAATGTATCA
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CTCCTAATCCCAGAGCCTAATATGCATTACAATGGAAATGATAAGATATT
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AGGGGCTTTAGTCCCACCCAAATTAAGGAATATTTGCTGGTTAATAGTAA
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CCAAAAAATACAATTTTTTATGAGAATAACTGGATTTTCGATTTTTTTTC
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TTATAGTTTTTTATAAAAAAGGGAAATAATAAGGTATTTTTATCTAATTA
TCCTACTTTTCTCGACCCTAATCGATAAAAAAATAGATAATTGTACAAAT
TTAGCCATATATGAGGATTTAAAAATACATATTACTTTGATTTAATTCAA
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CATTTCATCAAGATTACTTGGAAATATGTTCATTTTATGTAGAAAAGTAT
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CTAATAAAATTAATAATATAATTATCAGATAATATGAGAAACCACACACA
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TAAAATGAACTCCCTCGGATTACGAGCAAATAACTTCGTTTTAATATATA
GAAGTGTTCGTAATCCAATATTGCCATAGAGGTGACTAGAGTCCATATTT
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CAAAAATAAATTTAAGGACTCTCAATGCACTCGATGAAAATATTCAAGGA
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CCGACTCTAAAAACTTTGCCTCGGGATCTGATATGGTTTTTGTTAACTAA
ATACAGTTTGTGTTCTGGATCACACGTTATTAAGCGGGTTGAAAAACATT
TACCACCGAATAAAGCAGCTCTAATTTTAAAACAAGGGAATGTTTGGTGG
TTGAGAACGGATTTATTCATTATTTCTTATAATAGAAAATTGATTCGGAA
CTTGGCTGCTGCATCGCTTCTCGACGTTCCTTGCTGAACGAATTAACCAC
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CTTCGAGTTGTAAGTTGTTGGAATAATTCAGTATTCAACAAAAAAAAAAA
ATTAATTGTTTTTGTAATTTAATAAAATTTTAAGGACTTCCCAACAATTT
TATTCTAATTTAAATAGTTGTAGACCTGAAGATATAAGAAAAAGAGGGAT
TATCATTAAGCAATTATAATAATCAACATGTCTTAGTCACTAAAAGCAGA
AGGGATCTTGTATGACTAATTATTCTATGGCGTCTCTTTTTGGAGTAACC
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AATTCAGCCCAGGTAATTGGTTCCACGAATTTAATAGACTTTCAATGAAC
ATTAGTACTATAAACTAGCTAGTTAATTATTTTCGCAAGTAAATGTGGTT
TCCATTACTAAAAGGGGTCTTAAAGTAAACATATCAAGTTGATTTTTGAC
TATTTTAGCTATTGCATATGTCTACTCAGTTGAAGGAGGGAGTGATTTGT
CTTTTAGTGAGTGACTATATGTGGCCCATCAAGACAAAATCAAGCTGAGA
TGCTTTTCTCAAAAGTGTAACTGGATGACTTTTGTACTCTTAATCTAATT
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TAAGATCTTAAAAATGATCGATCAATTATAGAAAAAAACTTAAAATAGAT
TATATTTAGAAGGTCATATCGGAGCTAGCCAAAGTCTTATGCATCAAATA
AAGACTCCGATACTAAAGCTAGTATTCTTAAGTATCTTAACATATCCCAG
AAATTATAATATGAAACCCATAATTGAGCGAAAAAAGTCAATAAAATATT
GGGGCGTACATATTTATGAAGTAAAATAATTAATTTGGCATTTCTCCTTT
TTGTAATTTTTTGGTTATGTTTTTATATTGACACGCCACATATATTAAAC
ATTAGAAGGCTATAATCTAAATACATTACTCATTATACAGATATATAAAA
GAAATTACCTGTTAGTTAAATAGACAGTAAACTCACAAAAACTAAATTAT
ATAAATATTCGCTATCTGAAGTATTTTTTATTCATATTTTAATATGTATC
ATACAGCCCATTATTATTTTTTCTTTATTTTGGGAACGACCTTGCTATCT
TCAAATAACACAAACACTCTTGCACTTTAATCAAGCCATTCCCCTTAAAA
ATCTTCATCACTACCAATGAAGATCTGGTCGTACATCAAATAACATATAA
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TCAAGGCCAATTGTATGTGAAGTGATGTTTTAGCTTAACCACATAATATA
TATTTTTACGCAATCATGTTCCATAAACACATATCCAGTGCAAAACAAAA
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GGCTTGTAATAGATATGGTTAATAGTGTGTGCAACGAAGTATATAATTAG
CGTAGATGAAAACATTATATTATAATTAATCTGGAAGTAAGTGTATATTT
ATATAAATATATATGTTGTGTGCAAGTTACAACCAAAAAATGAGATGAAT
AATTAGGGGCGTCTGCAGGGTTTGCCTGGRGGGGCTGTWTTCTCCCCCCC
CCCCATTTAAGGTTTTTTTTACTAGAAAATTTAATTTTCTGTGAATAGCT
ATGGATTTCTGAAATTTTTCTCCAAGAAAATGTAATATTTGATATTTTCT
ACCTAAAAGTCTATTTTTTTGTAAACAGCTTTAGATTTATGAAATTTTAT
TTCCAAAAAATATATTTTTTTGTGAGCTAGCAGTAGATTTTTGAAAATGT
TTACCAATTTTTTTGTTTTTTTGTGAGTAGCTGTGTATTTTTTTGTAATT
TTTATTYACGAAAAAAAATTAATTTTAAAATTTTTTCAAAAAAATNNNNN
NNNNNNTTTTTATTACGAAAAAAATTATTTTAAAATTTTTCAAAAAATAA
ATATATATAATCTTGCGGACACCCCTGATAATGTTAAATAAAGAATTCAG
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ATATATTAATTATGTAAATTTTGGCTATTTTAATACAAATTACTAAAATA
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AATTAATAACCATGTAATTTTAATAGATGAAAATGATAGCATCAACTAAT
AGTTGGTAAATGAAATAATCAATGTTTTAATTAAATAAGATTATTTTAAA
ACAAAGAAATTGCAACTTGTACAAGTAGAAAAATTAATTTTGTTTTCCTT
CCTCAGATATATTTCCGAAAATAAAAGTGACGTGGTTCTGGATCAAGACC
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AACGCAACTGGAACTTCTCCGTATTTTAACCGGAATGTTTCCTACACGTT
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TAACATTACGTTTAGATTTGTTAAAAGTATTTCATCCCCCCCTTGTAAGT
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GGATAATTGGTAATTTATTCCGTGGCGAAAACAATTTTAAAAACACCTAA
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GAGCTCAATCATAATTGCTAATAATAATAAAGCAAGCAGGACTTAATTAT
TTTTTGTGAATACATTTTTACAGGTCATAAATCAATTTTGTTGGCAAATA
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AATTATTTTTTAACAACTTAACTTTAATATTTAAAAAGATATAAACTTGA
TATCAATGAATAAACTCCTTCAATAGCAAAATAAAAAAGCTTTACTTTAT
ACGGATACTATTCCTTTCAACAACAAATCACTTCAACTAGTGTTAAATTT
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TAAAATGTCGAATTTTGACCCCAAAAATCTAGTATTTTATAAGAATTTAA
ATAAATTTTATTCCGCCAAAAATGGCTTGAACTTTGCCAGTGTTAGTTTA
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CGCWTCTGCTTGACTATCGTGGACTTTCCAGATTCTCCAGCCCCTGAAAT
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GTATTCTTTTTGGCTACTTTAAGTACAATTTGTGGCATACCCTAAGAGTT
AATAAGAATAATCAGAATGGAAAAAAAATTTCAAACGTATGTAAAAGTGT
ATTGATCTTTGTGGAGTATATAATGAAAAGCAATAAAGCCAATTTTGCTA
GTGACTATTTTTTTTTTTTTTCATTATAAGGCCAGAAATATAAACAGCAA
CCTACGTGTAAAACACATTTCATAATATTTATTAGAGGATACATTCATAA
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TATGCACATAATTAGTATATACTTTATTAAAAATGAAATTTAATGACAGT
TCTCCCACTAAACATGCATATAATTAGTGCAAGGAACATATGTTCGTTCC
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TGACATTTAATTTAAAAAATCAAGATCAGACCATGGTTTCAAAGAATTAA
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TTTTCTATACTAATAGTCTTCAGACAAAAGCAGATTTAACTTTTCAAGGC
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AGAATATCATATATGGTGTGTCAACTAAAAAACAATATTAAGTCAAAAAA
AGAGGAAATTAACAATGAATTAATGTTAAATCTCCAATGAAATACATTGA
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GATCAGATACTCAAGAACAATAGCTATATTCTAAAATATTAATTTAATTA
ATGAATACTTTATATGGCCTTTCAAAAGGAATTATATTAACTGGGCGCTT
CCAAAGAATGAATCAGAATAATGGGTTGTAGAATCAAAAGATAGTATTGT
TTAGTTAAATAAGACAAATACAACCAATACATGTTTATAAATAACGCTTG
GACTTGTTTTTATGTTGACGGGCCACATATACACTGCATTAAGTTCATAT
TTCGGCACTTAAGGAATAGAAATTGGGCCTTAATGAGAGTGGTGTAACAA
TGATATATGAATGCAATTATAATGATTGATATAAAGGACACCAATCAGGG
CTATTTGGCTAGAAAGAGTACTGATAATGATTAATTTCAAGACCGAGATT
GAGTGGCGGAGGATGGGAGGGGAAGAATTCAAGAGAAGTGAAGAGAGCTC
CAGCTACCCTACATTAAATTCCTATCCCCTCTGATTTGAAAATCTCTGTC
TCTTTCTGCTTTTGTTGTGTGTTATTCCATTCTCTTTTCTTGKTTCTCCC
TGTTTCTCTGTCTTTCTCTGTCTTTCTCTGTCTTTCTCTCTAGCTTGCCT
AGCTGCTGCTGCTGCACATCACATCATTTTTTCTTCTCTTCTTTTCACTC
TCAGCTTTTAGCAGAAAAAAAGAGAAATTCTCAAACGAAGTTGAAGGCGC
CAAATACAAAAAAGCTTGAGGTATGGATATTTGAATGAGATGCTAAAGTC
CAGAGTCTCAACTTACCCAAAAGGAGAAGTTTGACTTCTTTGGATGCTTT
TTCTCCATCCCGCTTGAGCTCTTGATCAATCTTCTTGCTCCTTTCGATGG
CTTCTTTCTCTAATGAACTCACTGCACACCCCATTCTCAAAACACTGGAT
TTCTGTTTATTTGATTCTATTAAGTGTTAACAACACACACTTTACTCAAT
TCTTCTTCTCGACAAACACCTTAAGCCGGGCTCAGAACAATAAATAACTC
TCGTCCATGACTATGAGATCAGATTCACTTTTTCGTTCTGCTCCTGCTTT
GGAAGAGTCTCCGTTGAGTGAGTCAGTGAGGAAGAGACTCCAAAAGCACA
AATCTGAGATCTCGCACGTACACTGTAGCTTCAATCTTTGAAAAGTAGAC
GGACCTAAGAGGGTCAAACACTCGGATATCTTTCAGATGAGAAAAGCCCA
AAACAAATGAAGGAAGGGAGGATTTGTATTGAATGGAGTAGAAAAAACTT
GAAGGGCTCACCCCGAGCAACTCGAGTCAAAAACTGTAACTGAAAACCAA
CGACAACCCCAGGAAGGAATTCAAAAAATAGCAGAAGAAGAAGAAACGCG
AAGGGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAACGCGAGTGTCACTGGCGCGCTGCTC
TTGAATGAGAAGGGAATCCGTACTCAGCCGCCCAACTTATGTTCTAAGCC
CCGCCGGCATTCAAGGCGGAACCTTGAAATCCAGGGCGCTCACGCCTCAC
GTTTCTTTTCTTTCTTTTCCTCCTTTGAACTCCTTTTTCTTTTTTATTGT
TGGAATAGTCTATTTTATACAATTCACGCTCTTCACATTTCTTATTTGCC
TTCCTCTAAAGCTATCATCTAAGCAGCTTATGTGATGGCTTTTTTTAGAA
GGAGAATAAACTGAAAAAATAATAATATTGTACAACCCTGAGGTTAATGC
CATTTCTACCTTCTTCTCATCTTCACACGGTCCTACAATATACATAATAT
AATATTTATAACTTATGAGTTACGCTTGTTAATCGTCTTTTAATCGCCCT
TCTTGGATAATAAAATAGTCATATAATATTTCATTCCTCCATTAAAAATG
TGCCTAGTATTGACAATATTTTAATTGTATATAGATGACTTGATATATTT
ATGTATGTGTTRCAACTTGTATAAGCAAATTGTACAAGTTGCAACCCAAA
AATGTGATGAGATTAATGCAATAATTAAATATCCTATGGATGATCGATAT
ATATCAATGATGTAATTTTGAACTTCTTAATGATAATTAATAATTCATAA
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AGATTTAAGAAGGCGTTATGAGGGCTACAAGTTGCAACTTGTATAAGGAG
ATTGTACAAGTTGCAATTTATAAAATATCGTTACTTGTACATCACATATA
TGTATATATAATAATTAATAAGTACTATGTATAGTTATCCGCGCCTTGCT
CAGTCATGGTTCATGGGGGCTATACATTCATATTCTGTAACAATCCTCCC
GTGTGGGTTTAGAATACCTACATGACTCATCTGACGACTAAATAGGTGTT
GGCATTATATCCTGATAATGTACTAACTAATATCATAAATCATAATAGAA
CCAACCCTGTTATGATTCTGACTCAAAGAAAATGTTTTTAAACTACTAAT
GTTCGAATACTATGTGAGGAATTTTGTTATTAATTGTGTACCTGTTGAAG
AATTAATACATTTCGTTTCGACGCAGGGTATTTCTTAGTACCTAGCTGTG
TGCACAGTATATTATTATGTTATTTGTGCTGTTCATTCTTACAGGTTGCT
TGAAAAAAATATTTATAAAAAATCAACCAAATTTACGATTCCATTTCTTA
TAATAATCAAGCAAAAGACGGAAGAGTTGATCACTATCTGTATATATATC
AAATAGAGTTTTGTGTGTGTGTGGCCTTTTATGATATAATGGGGGGCTTA
TTCTATACCCAAAATACAAAACCGTTTTTTGGTCCTCAACGAGACGAGAT
AAGTACTTGAATTATAAGTCAAAAAGTAACCGGCGTCTCAAAATATATAT
TTAACTATAGCCGTTTTCTAAATTGCTTCAAAATCAAAAAAGTTATGGGC
AAAAAAAGGTATCTGTGGAAATGACAATTTTATTTTTTTCAGGAGCAAAA
AAAAAATAGATTTTCAATGAAATATTGAATTCAGTGGTGGCAGAACCATC
AGGGCCATTTAGGGGCATSTGAAGGATATATATATTTAGTTTTTTTTTGG
GGGGGGGGGGGTCTTGGATATTTGCGAATTTTTGGAAAATTTTTCATAAT
TAAAATCCAAGCCAATCCCCTGGGGACGCCCCTGGCCATTGGCCCTATTC
TACTTTTGCAGAATTTTTACAATTGAACAAGAAAAAAAAACATTTTTTAT
AAAAAATTATAAATGTAAAAAAATGGATATTTGCTCAAATTTAGTCACAT
CACCAATTTTAAAACTACATAGATTTTATATGGATCTGGGGAAAAAAAAA
AAAATGACACCACTATTATATCATTCCCCCCTCCACATACACACACACTT
GCAAATACATTCTGGAACACGTCATTAGCATAATTGTATCACGCGGGCAT
TCAAACGAAAAGAAACCGTGAGGGGGGAGGACAAATATCAGTTGGTATTT
AAGGAAATCTGGCCAATGCTTACCAACTATGGAAATATTATTCTACAATT
ATTAAAAAGTACCTGTTAACAAAAGCTAATTCGAATTAAACCAATCAACG
TTCAGAACGACGATTAGGAGAAATAAAGCTAAAACATCAACTCCTCACAA
CAAAATACACGGTATATTTTAGTGTTTGTGAGGTAACGCCGTGTCAACAC
CGAGAAAGACAAATATATGTAGTAGTAATAAGTTAGGCAGACAAAGAATA
AACATTCTAATCTTGAAAAGTTTATTACAGCTGTTGTAGTTGCTCTACTT
TGATATATTATAATAAATTTTGAGATATTATTATGAGGAAAATAATGAGT
CTATTCAATTTATGGTTGTTTCTACAAAATACTATTCTTAAAGCATAGAA
AAGTTAACAGCTTGAGGTAATGTAAAAGTCTTTTTGCATGTCTTGCCATT
AGTGTCGGRTCAGTCCTAGGACTGATTGCCTAATCCGGTTTTTTTTTCTC
CTACCCCTTCMTTCTTTTTTTTTATGAGTACGATCTTTTTTAGCACTCAG
CGGTCCTAAGGACTGATACGTCAGTCCTTCAGTCCTAGCTATCTTTATAG
CTATTTTTCATTCATAGCTAAGATTGAATAATATAAAAACGATGGAAATA
ATACATGATACCAAGAACGTATATTTATAAGTTCCAGTCACATACCTCCT
CCTCCTTAAACTTAAGGTATTTTGTCTCTTGAAAGAGGTTATATTGAACA
ACTAAAAGGACTTAGTTAGTAAATACGTCATTTCAGCAGTTGTAATTACC
ATAAAAGACCGATAAGGACCGGTGCTAGGGCTGACAAATCTTTATTAGGA
CCGGACTGATAGGACTGCGGTCATTTTAGCTTTTTAAACCGATTCAACAC
TGCACGCCACCTCTATTGTTTCATTCCTCTATGGTAACACTACATCTTAT
CAAAATTAGGCCCACTATTGACGTACAAATGGGATTAGTTGGGCGGCACT
GATCCCTAAAAATTGTCTTTTATTAWAAAAAACATCTCTCAAATTTGTAA
GCCCCAATSCCCCCCCCCCCCCGAAAAAAAACAAATCTCGTAATTACCCA
TATGTTAGTGGATGTCAACTGCCCTGAACCACATTTTTGTTTATAAATTT
CTGGTCGGATAAAGTATGGAAAAGTACANNNNNNCTGTAAGGAAAATATT
GGTATCGTGACTCCCCTATTTGCTAATAATTTATTAACTATTAACAAGGG
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