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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s272 | supercontig | LSalAtl2s272:382289..450901 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005159 >EMLSAP00000005159 ID=EMLSAP00000005159|Name=EMLSAP00000005159|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=488bp
MHPHSLSEDVGSGGRERRGFLCSPSLMVKISKLNVRSGLYKVAGEFGLRE NVYYGLIFVCMTLIVIFCFLVINRTTAHIGFGGFGSGGSLGSGSSQLHAI FDVDQNCELLMDPVHGKVHQTGRNLGDRAIYTCTNGWEIVGVEERXCQXD GHWSNEEPYCKKRVFCMNPPLVQHATHNGPPDTNHFQLETVLKYSCYPGY LTVGFAHAKCFLYNDTAQWFGPDVTCKAIKCSEPEEVLNGDVDRKCQTFG CRISYQCRAGYELQGRQHRYCQADGSWSPRMLPQCVPIQCPLPQNPINGR AVYASVSYNSLISYECNYGYMLIGDSVRRCERNKQWTGTEPHCKEINCGS PGILPNGWLEGTRTTLHAVVTFRCQEGMTFEGPSYRTICQADGRWSHPLP RCFAPCVVPHISHGFVADRASGSSVPHTNTIDVQCLSQFQKTHDATPICK NGTWSRVPKCIPVSRASRCSPEWXGGCSEFGAWNGGQV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s272:382289..450901+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005159-701006 ID=EMLSAT00000005159-701006|Name=EMLSAT00000005159|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=68613bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s272:382289..450901+ (Lepeophtheirus salmonis) CGCCTCCGGGCTACGATGAGGACCCTCATCATTCCATGCATCCGCATTCT
CTTTCAGAAGATGTGGGCTCAGGCGGACGAGAAAGAAGGGGATTTCTATG
CTCTCCGAGTCTCATGGTCAAAATATCAAAACTCAACGTTCGCTCCGGAC
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CGCACGCTTATTGTGAGAGACTTTGATAGTCCTGAACTTTTTGTCTGTGT
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GTTAGGGCACCTTTACCATGGTTTAAGGATTTCATACTGCTTGTGTATAT
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TGACTAAAAATGTAGAAGATAACTACCCATCAAATTTTCAGTGTTACTCA
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TCAAGCAGCTTGGACTCACAATCATGTGGACTCAGACTTGACTTATTATT
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AGAGTATCCAATGAGCACAGTCTATGATATCTACAACCTCTGGTAGGAGG
AAGGGATATATTAAACAATCCCATAAGTCTCGGAGGGATAAAAACACATC
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TTTTGAAGTCCCATGGTAACTGAACATAATTTATCCGGATCAGAGACAAT
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TGAGATCAAGTCTGGTCGTAAGTTTCTAAATATGAACACAAGTTCATGTA
GAGTCATAAGTCTGTTAATTTTTTTTAGCAATATCCTACAATGTTTATGT
AGTCAGTACCAAAATTGTTTCTAAAATTGAATTAGCTCATTTTTATAAAT
TAACAGTCATAGCTGCCCCCAACGGATCTAAAAAACCGCCATTACAGTTA
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CAAAGTTGAAAAGAAAAAATCATTCCTTACTACAAACATGGGTTAATACT
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ATTAGTAAGTGTATTATAAGTATATTGAGTGGTCCATTAAAATCTGAATA
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AAAATCCATACTATAAATTGATGTTTGTCTGAGCTCTCTTAATCATTAAT
GTAGCCMCCCCTAGCAGTGACGATGGCTTCCAGTCTGCGGAAGAAGACAT
GGGACCCACTGCAGATGTATTCCTCTTTCATGGCGTCCCAGTGTTGGCTG
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TGTAAGGGAGGTTATAGTGTCAAAAAGTGTTCAAAATAACTCAAAGAGAC
TCGTTCAAAAGAGTCTTGCCACGAAGGAGATGGGGTTATTTCATTGCTCT
TGACAAAAAAAGGGCTCTTTAGTACCCTTACCAGGCTCTTTCTACCTACT
TTTTATTGTTTTCTGGACAATCTAGTGTGAAATACCGAGATCTCTTGCAT
GGGCCCTAACGAACTTGAGAGGATTAACCTGGGCTGTTTTCTTTAACTCC
TCCGGATACAGTTTGGCCATTTCTATAGAACTCTTCTTTTTCTCTAGTGT
TTCTGACTTTCAGACGGCGTAGACGGTTGTCCCGGAGACACTCAACTCCT
TAGACTGCGCAAATGCAAATACGTATATCACATTCAAGTACCATTTTCTG
GAATGGTACGTAAGTTAGAGAGCTAAGGTTTTTTTTGTAGACAATTATTT
ATGCTTAAGTGTATCAAATATGAATATTATTTTAATATCTCAATCTTAAT
TTATTACTAAATTATAAAGTATTCAGATTTCAATGTACCACCCGGTACAA
GAAGAAGGGTGTATGACTTTAGTGGGTAGTGTTGTGGTCGTCCTTATTTA
GTCCTATATGGTTCGGTCTCGTTCCGGTCCAGTTCAGTCCTGTATATCAG
TGCTAAAAATAATAAGGTTCTGTTTTTGATGGCAGTCCGATTGATTGCCT
CGTCCCCAGGACTGATAGTACCAGTCCAAATACTGTACTGGAGCGAATAA
ATGAACACTGACACAATAATACAATTGGGGAAAGAAAGGAAAACACAACG
ACGTTGATAGACTTCAGTGAATCTAATAAACCCTCATGAAAGCTAAGCTT
ATCTTCACCCAAACATTTTTTCAAATACCATATGCCATTTTTTTTTACAT
ATCGACTGGTCATATTTGATACAGCTCTTCAAAATACAACTGGCTTGAAG
CTCTCAAAATTTCATTTTTTGAGTAAGTCTTCCATTTTTTTTAAGGCAAA
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GAATCATCACCTTTGTTTTAAGAACACAGAGATAGGTACAAAAAAAACAA
AAAACAAAAACATTACAAGGAATATATGAGAATACCATGTTTTGTATGTG
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ACATTGTATTTATATATTATTGCTTTAATGGTATTAATGGTCTCCCCCCC
CCCTCCTTTTTCTTATTTTTGGTTATTATAAATGGTGAAAAGAAGAAGAA
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NNNNNNNNNNGGGGGGGGGGACGAKGCYAMAATTCATMATTATACCCAYC
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AAAAACAGCCTTGACAAGCTGGCGAATAGATTGACAATGAAGGTCGTTTA
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AAATCTCTAGAGTATTTTTCAGCACTGACACTCGCGTGGAAAGAGATATT
GGACGCGATACTTTCTTTGTTCTTGCTCTGATATATATATTATAGAGATG
AGATCAAAACAAAAATTGTTTATTTTTGTTTTAGGTGTCGTTTGGTTGCG
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CTACTCCTAATTTTTGGCCCTTATCTGTCTTTAATGTATATATGCAGGTT
GAATATTATAGAGCAAATTACCAAAATATCCTTTCATTTCCTCTTTTTGT
TCTCAACAATATGGTGAAGACGCCCATCTTATCACTACCTTACAGCTTGT
ACGTAGAATGCCTTTCAAATTTTTGTCTACACAMCTGCCATTAGGGAGTC
CTTGCTGAGCCTGGAATCAGTATTGCCTCTCTTTTGACCATAACCTCCAT
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TGTTGCATTATTTATACACATTCTACTCATAAATTAATAACTTTAAATCA
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TTTGAGTTCCACCACGTTTTTTTATAGTGATGTCGAAGAGTATAATCAAC
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CAAGTTAGTTTTTTCTTTACAAAATACTCACCCCCTGTAATACATGACCA
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AATAGGGTTCTTATTTAAGTATAATATAATTGAATATTATATATTTATAA
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NNNNNNNNNNNNCCTATGATTCACTATAGAAGCGAACTTTGAGTGRTCGG
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ATCGATCGTAACCTCTTGTAAGTCAAAGAAATAAACAAAGGAGAAGAAAA
GTATACCAGTTGTGATCATAAACAAGTATTAATCCTTGGAGAACGAATGG
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AGTTTTTTTATTTGAAATAAACAACAATGCTCATGTCCTATTGAATTGAA
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ATAATAATAAGTTTGGAAGTTTGTGAATGATGTTATACCATGTAGTATAT
GAAAGCACAGGTTTTAAATGTATTTATCATCATTTAGGGTATTGTACTTT
TGTTCGCAATAAATTTCGTAGTAGGTAATGCATATGAATGATGACTTTGA
TTGATCTTGATTCTTTACTAAGTTTGGGGTTTTTTTTGTAGTTGCATGAC
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TGATGATGAATGTTTTGTATTGTCAAATTCTTCCTTTATACTGTAGCTCT
AGGTATGTCAAATATCTTATTCGAAAAATTTGTCATAATTACTCAAGGGG
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TAAGATGCGTGAATGATTAAGAGTAAACATAAAAGCTGACAAAAAAGGTA
TAATATGACGCCACATTTTATTATTTTTCTTATATTAATAATTAATTATA
AGTAATCGACAATTACAACTAGATAAATGATATTTAACACTGATTGACTC
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CCGGCTCNYATTTTGATAAAAATTCGTATGTTGGGGCACTCACTCGTATC
TCAAGATGTTACTGTAAATTATCTTCTACACTTTGACTTAGCTAACGTGT
ACTCCTGTAGACGGAAGATTTTACTCTAGAGCAGCCTTACTATTTCGAAA
TGGCAATTGAAGTTTATTTGTCGTCTCTATGCTCCCAACCTTTCCTCCAT
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CACTCTTAAACTATTTTACATACTAAGAGAGTAATAATCCTGGCTGTGGA
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TCATCAATATGGATGATAATATCATGTGTTTCTTTTATTGTGAGGCTACT
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GTAATCTTTTTTGTCTTTATTTTTTTACGAACTAAAGCCTATATAAGTAG
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TAAAAACAGTTCAAGCATCAAGTTTCAGAATACAAATAATTTGTGATAGC
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AGTGGCATTATCTTGTAATAAAATAATACAACTCCCTGAATGATAATAAA
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AATTCTTCTCAGTTTGCTGCATTCTTTTAAAGACCAAGCTACAGACTGGC
ACACCAACTTGTGGATGCCTCTCTCACCATTAGTTGTTAGATACTCTTCA
CTTTATAAAAATGAAGTATTCGCTGCTTTTTTAAAAAGAGGTAAATTATT
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GGGATAATGCTGTGATACACACCGTTATCAAAAGCAAATCAGATAAGTGA
TATCCTCCATGGTCTATACACTGAGTAAACTAATTTATAGTATTTGATAT
GCCCCTTACCAGCGTATTAGCCGAAATATTAGCAATTTATGCTCGGATGT
TGACCTTCAAGTATTGTAGGCTCCTTGAAAAATTGACATAAACACAGGAT
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GCTGGCCACTTCCAATCGTCCCTTATTGAAATGAGGGGCTCTATAAAGTG
TTTATTAAAAAATTATTAATTCCCTTGAAGTGTAAGCCGTTGTTACGTCC
TGTTGAAACCAAATATCCTCACGCTTCATTTAATCAATTCCGGGATTTTT
TTTTTGATATATATTGTCAATATATATGGACATATTTCAGTCAATTATAG
GTTTTGTATTCAAACTTCTATGATGATTTTAGATAACCTAGAAACTTTAG
TTTAAAAGCTTTGTTTGATTAATGAGACTTGACAACATATGCTATTTTTT
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CCCAACTTCGAGAAAAATCTTTTTAGACTGTCTTTGTTTTTATGGGCTAC
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TGTTATTTTGGAATTGAAGTATTTTGTTTTGGAGGTATTATCTATTATTT
TGTTTTGCAAAAATACTTTCTGATACTAATGTGATTGGATCTCACTTCTT
AATTTTATTTGTGAAGTGTGATTGGATAATAAAGGGTGCAAACTAAAATG
AAAACGAAAGAAAAAAATGAAGGATTATTAAATTTATATTTAAGTAATTC
ACTTAGGAAACTTTTAATATACATTCAAGGGGATTTTTTTACTTTCAACA
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TTAANNNNNNNNNNTTCTTCTTAACTAAAATAAAACACATATTTACATAT
ACAGCGTGCGCTAGTATAACTTCCTTTCTTTTCATGCGTGGTAATTAAGC
TATAGAAGGAGTTTGGTAAAAAACATGGTTTTATTTTAGAGGTGAGATTA
TAAAGTTTTCTTGCTAATGCAGTCAGTTGCTATCAGAGGTTAGAATAGTA
AAGAACGTGCGTTTGCCGTCGAAAATAAAGATTGCGAAGAAATGGCTTKA
GATACAGTATGTTAGAAATTGATGTTCTCTTTTTCAAACACACATAAATG
AAAGTAAATTAAACATTGTGTCATAATTTCATTTTTAATTTATCTCCCTT
AAGTTTTATACATTTTTTAATGCGTTCGGGCATACAAGCAATTAAATTAT
CCAAAGTCTCATCTGAAATTTGTAACAGTAATTTATTGACCAGTTTTTCT
TCTCACGACAAAAAATAAGACGACAAGACATTTATCGATTCATTCATGTG
CTTGCAAACTGTTTTGTGTGACACTAATTGACTATTTGACGTCGATCTGG
TCGCTAATTTCCTCAAGATTTGGGTTTTTTTCGTAAAACTTATGTTGATG
GTTATTTTTTGCAACTCTCGAAAGTTTTTTTCTTCCTTCCACGTACACCC
TTGTTCTCGAAGCTCTACCGGAAAGGTGATAGTTTTATTTCCTTCGAATG
GTTCCGACTGAAACGCTGAGGTCCTGAGCGACCTCAACTTGCCTTTTCCC
GGCCTAAAGTTGACCTAAGGCCTTGCTTCGGTTACTTTAGGAGTACTGCT
TCACTATTCTGGGATATAATATTTTTTGATAGTAATGGGTAAATTAAAAT
TAAGAAAAAAATACATAAAAGTTGCTTCCTTACCATAAATTTGGGTCGAT
ACAGATTTTTAAGAGTCTCTAAGCCCAAGTGCTTTTGTTTTTATTTTTTC
CCCTTTTCATTTTTGAACTTTTTTATGAGAAGCGGCAAAAAGGGACATCA
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GAAACTGAACTTTTGCGTAGGCACTCAAAACAAAAAATGGGGGTTTTGAA
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GGCTTTTCCACAAAAATATCTCTCATTTTCTGAATAATTTGATAAAAATT
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GGACGTTGGAGTCATCCACTGCCTCGATGTTTTGCTCCCTGTGTAGTTCC
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