|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s30 | supercontig | LSalAtl2s30:409926..417639 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005763 >EMLSAP00000005763 ID=EMLSAP00000005763|Name=EMLSAP00000005763|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=287bp
MLSMSIPGEPGVDYPIFDSVQDTGFSCDDKVFGGYYADPAMGCQAYHVCL
SDPIAGSSXPASFLCPNGTIFQQKIFNCDWWYNVXCSEAESFYGLAVNAF
ASNPGENGRAGIAGTCPAIQPRSEAECAGTVSTCWSPGFTDTDCPNFGLC
CFDGGSNILPTAEVTPAPRPRPTPRPTQRPTPRPTQRPTPRPTQRPTPRP
TQRPAPRPTQRPTPRPTQRPTQRPRPTPRPTARPTPRPTTAFNPVFEAVE
EEKEEEEGYYYSTPKNKLTLPTKSTTPANGLYQPPRL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s30:409926..417639- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005763-701610 ID=EMLSAT00000005763-701610|Name=EMLSAT00000005763|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7714bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s30:409926..417639- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCTTTCGATGTCAATCCCTGGTGAACCAGGAGTTGATTATCCCATCTT
TGATTCAGTCCAAGATACCGGATTTTCATGTGATGATAAAGTTTTTGGAG
GTAAGACGTTATTCTTTATTTAATTATTATTATTTTTTATAACTTAAATT
CAATTGTATGGGGTGTCAAAGGTGGAAACTACGACTGTTTCAAACCTTTC
AAGTGTATAAAAAAGTCATTTGTTCACGTCTTTTTTCTTTCTTTTTGAAA
AGAAGATATAACAAAGTTTATGCATAAATTAAATAAACCAAACTATTTTC
AAGGTCATTCTTAATTGAGTACAATATCCATATACTATATCAAATATTTT
TACTAAAAGTGTTGTGACTTGGTCTAGTACTGATTTTTCCACCGGTTCGG
TCTAAAGTCATTTTTTTCTTGACTCATCAGGCAACTGCAGTCTCAGTCTT
AATCATTTANACTGATTTTTCCACCGGTTCGGTCTAAAGTCATTTTTTTR
CTTGACTCATCAGGCAACTGCAGTCTCAGTCTTAATCATTTATCATCGTA
GACCGATAAATGACCCTATTTACATGCTGTTATATAAATATGAACCACCT
TAAACTTCAAAAGACGTCATTCTGTGTAGGTTTTCAATATGGAAACACAC
ATGACATCATGTACAACAATTCCATCACAAAATCTGTATGTTATCGAGTT
TTAAATGAGATCGATCAAGACTATTTTTTTTATTCAGAGGAATCAAGACT
GAATCAATTATATGGGTCTAATAAAGACATATATTTTCTATGAGGTCTGT
ATTAATCTGTCTAGCTAAAAATCTTTTTTATGTTTTAAAAACGTCTTTTG
ATAAATCTGAATAAAATTTTAGTAAAAATAGGGCGATGTTTGTCCCTTTT
TCCTCGATTTAAAACTGGCATTGTACCGTATCACTTTATGGACAATTTCA
ATATAGCTGCGGCTCCCRTACGTAGAGATCAATTGTAGACTTATTCCTGC
TATCAGACCTAAATGTATAAAATATTAAAATGTTGGCTCCCGGGCATTTT
GTATAAATTACTTATTATTAATAACATATAAACATTCATATAACTAAGTA
TTTATCATAATAAAAGTTTTAACCTTTGTAAATATGAGTATATTTATAGT
ATACACTCATTGGCTCSAAAAAWAYCCCATTAATTTTMCTATGATTTTTT
CATTGATACCCTATGCGTTAAAAATAACAAATCCTGATTTTTTTAATAAA
CGAGGAAAAAAAAACAAATTAATCCACAAATATCCTTGATATTTTCATTT
ATACGGGTATAACTATTATTATATATGAAGATTGTACATACCACAGGGTC
AGTCTCAATAAATTAATGCCTTTTCCTGTTTATTTATTGCAAAAATACAT
ATACATTTAAATAAATAATTGAAAATTAGATTTTTGGAAATACAATCATA
ATACATATTATATACATGAGAGCATTTTAAATGTTCATACATACATATGC
AGTAATTTAAAACAAAAATCAAGAAAAGAAGAAGAAATGCCTTAAAAGTT
TTTACATTATATACCGAGAAGTCCATTAAAATCTAAACACTTTGAATTTT
AAACTTCAACATGGTATAATGTTTTAATTAACAAAAGTAATATTATAAAT
ATAAGTGCGTCTGAGCTCTCTTAATCATTGTTCTAGTCATCCTTAGTGAC
AATGATGGATTCAAGGCGACGGCGGAAGGACAGGCACCCACTGCAGATGT
GTCCTCTATCATAATGTCCCAGTGCTGACTGATAGTAGCCTTGTGGATAT
CGGTGTTTGGAATTTGGTCACTGAATGCCTTCCCCTCAACATGCACCCAA
AAGTAGTAGTCAAGGTGGTTGGGCTTCAGTGCTGTAGGAGGGCTAAAAGT
GTCCAAATTGAGTTCAAAAGAACTTAAAATACTCATTCAAAAGAATTTTG
CAACGAAGGAGATAGTTTTTGTTTATTGTTGGTATCAGGAATACCAGCAA
CCCTCACAAGGCTCTTTCCCCTTACTTTTGTGACAGCTTACTTGACAGCC
TGGACCAAAACTCCGAGATCTCTTGGATGGACCCTCATGGACTTGAGAAG
ATTAGCCTACGATGTTTTCTTGAACTCCACCGAGTCCAGTTTGGCCTTTT
TGACAGAGTACTTCTTCTTCTCCAATGTTTCAGACTTGCTGACGGCGTAG
AGAGTGGTCCTGGAGATGACCAACTCCTTTAAGTACGCGAATGGAAAATT
GTGGATGATATTCAAGTATAATTTTCTTGGCTTGTACGTACGCTAGAGAG
CTCAGATTTTATTTATAACTATTTTATTATGCCTTAATATATCGAAATAG
GAATTAATTTCAATCACTCAGTCTTCATTAATTGTTGCATTAGTTTTCAA
CGGACTACCCGGTATATACACATCCCATTATTTATTTGACACATTTAAGT
TATTTAAGGGTTTTGTATTCAAATACCCGAGAATATTAGCTCTAAGGCAT
CCATTTGAATAATTAGAAGGTTAATTAGGTTTGGATCATATAGCCCCTTT
TAGGAGAATAATGTCTCTTGAACTAAATGCGCCTAAGTTCAATGCCCGGT
AGCTTCTAGAAAAAGAAATATACATCAAACTTCAAAGATGTTTCCTAGAT
CAGATGGGGTAAATTATCATGTAGTAGAACTATAATATTCACTTATATTT
TATCAGTGTAAATCCATCGGAACAAAAAAAAAATACCTGAGAATACTAAC
TATAGTTTAAAATCTCCGTTTAGTTTAAAAGAAAATAAATTTTAGCTCAA
TCATATGATCGAANCTCAATAAGAAAATCGATCGATTTCTAACTATGTTT
TTTTGTGACGATGAACTCTTTCTTACTTTAATTATAATTTCCATGCACTT
TAAAAGGGTCTGCCCCAATAGTTAATTGATAGAAATGAAAAAGAATTCAT
GAAATAATATTTTGAGTTTCATCTAACTCATGACACATTTTTTTTAAAAT
ATTAAATAACATCCGTCAACTTATAATTGTGTAAAATTTAAGTGTAATTT
GTGACACCTACAAAGGATTAATTATAATAATTTGTTTATGAAAATGACAA
ATAATATGTCATTGGTAAATGTAACCCAACCTCAATCAGGAGAAAAATCA
TTCTAACATTGTTACGTTTGTATTTAAATCATACATATTATGTGAGTTAA
AGTATCTACAACATCCCTCCTCAACAGCGCAGACAAGGATGTTCAATTTA
CATATTATGGTGAGAAAAGATATGTCTGGAGATGAGAAAAATGATTTGAT
TGGATTAATGTTTGTATTTAGTCAGATGGAACAGTTCAAAAATAATTCTT
TGTTAACCTTCTCGCAGAGTTGAAACATTCATTCCCTCTTTTATAAAGTT
ACTTCTTTAGAAAATGTATAAATTTAAGGGCTCCAAAAGCAAATGGTAAT
AGGAGTTAAACACATATGCATTGGATAAAATACCGAAATATATATTGTCT
AGATTCGAGTTAAAGTTTAGATTCAAGTTCCGTGATGATTATGATTATGG
AAGAAAGTGAGGATGAAGATGTTGAGTGAGATAAACTTTGAAGAAGGAAT
CTTAAGGACAGATATTCGTCTGAAAGGTGTTTTTTTTTTATTATTATTTC
AAGAGCAATATCTTTTTCTATTTATGGGTATATATGCTATATACATACAA
AAATGTACGAGTGTGTACATACCTCAATAATGAAATTAAACAGAGATTTC
ACATCTGGAGAAGGTCACTTCTCCTTCAAAAGGATTCAATACAAAATTCA
AGCCTTTATTTCAATACAAGTACACTAATAATCACTGCATGCAAAACAAT
ATAATAGCATGATGTAGTTTTTATTCGTTGTATCAATATAAATACATGCT
GTTTAGGCATCACATTATTGTCTTCACAATAACAGAACTACTCCCAAGTT
GTTTGGACAGTGTATAAAATATTAAAATTATCACATACAAAGCTATCATC
AGTCCAATTTTCAAGTCGATTCGTGTTTTTAAACAATAGCGGCAAAGTCG
TTTGAATTCAATGAGATAGATACTTTTATTAAAGCGCTTTTTTATTGAAA
CTGCACAACCTTTGATTAAATTATATCCCTGTGAGGGTCATCCAAAGCAT
TGGTAAAGCTTTTCTAGCATAAAGGAGTTTTAGAGGATAATTCAAATGAA
GACAAAGGACCAAGAGGACAGAAAGAATATCATTACAAAGTATTGCTGGC
TCTTTAGCTTCTCCAATCTTAATGTAATCGACTGTTTTATCTGTGGGTAT
TTATAATAACTTATTAAAAGAGCTTTGAATCAAAAAAATCTGTCTTTAAT
CGCCACCGTCTCTCTAGAAACCTTGTGTTGAAGGCTTGAGCAAGTTTCCA
AGACCATATAACAATGATAGATAGTAGTCAGACATAAATATAATCGAAAC
ACTCTGTATATATAAATATAATTGATCAAAGATCACATCTGTAACATGCT
GAACGGTCAAATAAAGTTGTTTTGTTATATAAATCATAATAAATACAAAA
ATAGGATTGGCATTCCTTGTATGATGAACCTACTTTGATGATTCACGCCG
TGTACATACAACGGTTTGTGAACCAATAGAGTCGTATGAGGGTAAGATAT
GTTGGAACCAAATATTAATTTGACAAAATATATTTTATTGATATATATAT
CGTGTACCACAGTTTCCACTAATTGCAAACAAATAATGAACTGAATAATT
TTAAATGACAAATTTTGACATTCTGATAAGGATATTGCAAAAATTGAATA
CTCTCCATGGATGGTCAATGATCTAAGATTATACTTTTTAAATAAAAATT
ACTAATTGATCAGACGAGTTTTTCGGGACATTATAAAGTTCAAATGTCCA
CAGTTATATTACTTGAAATTACATAGATTAAAATGAAATGATAGCATCTA
TAAGTAAATTGAAATGTTGTTCGGTATACCAGTGATTTAGTGATAACAGG
TACACTCCTAAATTGGGATTGGAGTTCATTACATCTACCAATGACACATG
GGCATTTGAAGGACAACTTAAAGACATTTTTGTTTGAAAAAATATGTATA
ACGAATTAAATGTTTATGCCTATTTTGGTACCGGAGTCGCCAATCCCCTA
GTAACTTGTAATTAAAATGAATAATTATGTTTTAAAAAGTGGGTGTTATG
AGACGTATAAATTGCAACTTGTACAGCCTTCTTATATAAGTTGCAACTTG
TACAAATTATATCAATAACAGTGTGGGGATTTTAAATTCGAAGCAAGGTT
AGACCTCAATATCTTGCCAACCCAGAGGTCTATGTTTATAAAAGTGGCCT
CATTGGATTTAGCTGTCAAAACTGTGTATGAAAAAATACAAAATCCTTGA
GATGTTTCTCCAAGCCAAGTGGACACGCAAGGATATAATTGAGTGGACAA
ATTTGTCCCATATTAACTGTTTAATATTTTTCCAAGAAGTCTGATGGTTC
GGGAACACCTGCAATGAAGACTCATAATTTTTTTGAGATAAAAACAGTGA
ACTCCATACCCTTAAATACTATTTGTGCACTTAAGTACAAAGGAAATGTA
GGCTACTAGCTCGCTGGATATTATTGCCTTGTACTACTACCATGTCTGGG
ATGTCTTGGAGATAGAGTCCAATAAACCCCCACATAATACTGTTAAACCT
TGCAGGCTTCCATTCATCGATACATTGGCCAGCATGAACCAGGAGTTCTT
TATCAAGGACTTTTTCAGGTCCTTGCCTGGTTGGAGGGTGTGGTTGAAGG
TGGAAGTGGTTGGTTTGAGGGACTGACTTTACTATGGGCCCCATATGTAA
GAGCAAAATATTACTGAATTAATATTGGGAAATAAATTGCACGTTAGAAT
ATCCTTTAATTTTTCAGATTTAAAATTCCCCACACTATATATTTATATTG
GTTCACATTAATGAAACTTAAAGACTTGTTATTGATATCATCCGATATAT
ACAAAAAATAAAAATAAAGGTCAATGAATAGTATCATTAACCTATGATTG
AAGGCTTACTTTTTAAAAGGAAAGAAATTTGAGTCAAGGAGACAAGGTAG
TTATAGTTTTATATCTACCAATAGGGGACCACCCAATAATGCCTAGAAAA
TTTTTCAACATATACACATAATAAAACAAATGGTTTAACATGCATACCAA
ACTCCATGTTTTATCCAACATTGTTTGACTTTCATTATTAATACTATGAT
CCACCAGGATGATGGCCATATATGTAAATCTAAATATTTATATAAGAAGA
CTATAGAGATCTTTTTATAAATATGAGAAGTTACCACCTTTTTCGTAATT
TAATGTTTGCTTTAATTCCTTTTTGTTTTTGTTAAAATATACACTTTATA
AGAAAAGGATTATTCTATTATATATTCTCCGTTTTATATTTGTTCATGTC
TATTTTTCTTTTCTGATACAGGATACTATGCCGATCCTGCAATGGGTTGC
CAGGCATATCATGTATGTTTATCTGATCCCATTGCTGGAAGTTCCTMCCC
CGCCTCTTTCCTTTGTCCCAACGGCACCATTTTCCAACAAAAAATCTTCA
ACTGTGACTGGTGGTAAGGATACTTCAGATAAAAGAAATATAAATATTTT
CTTCACAAAATTACACATACTTTAGGTACAATGTGGMCTGCTCAGAAGCA
GAGTCCTTCTATGGACTGGCCGTCAATGCCTTTGCTTCCAATCCAGGAGA
GAACGGACGTGCGGGTATTGCTGGAACTTGTCCTGCTATTCAACCTCGTT
CTGAGGCAGAATGTGCAGGAACAGTTTCCACATGTTGGTCTCCTGGTTTC
ACAGATACAGATTGTCCCAACTTTGGGCTCTGTTGCTTTGACGGTTGTCA
AGATATTTGCGTAGACGAAGGTCAAAGTCAAAGTAAGTTGCGAAATAATT
TGGTTGATAATGATACGAATTGCATAAAATATAGACCTAAATCAGGGGCA
AGACTTTTTCTCCAAGTCAATCTGAATAGGTTTTTTAAGATGTTGTCAAA
ATACTTTCATTCTTAAAGGCGAGAAGTATAAAGTAATCCCTTCTCACTTT
GTTCATTAACTTATAAGTTTAAGTCCAATTTGGACTCGGAATAGAATTGA
GGATCTAAATTAGAGTTATTTCTCTCTATGTCTTTACTAGATGCAGGGTG
GGATCCGAGTTTATTTCCTTTCTTTTCTTTTCTTTGAGCATACCGATTGA
TCAAATTTTATTGAACTCCATGAATGAGTATGGTTTTATTCTTTGAATCT
TTCTCTTTAGGTGGATCCAATATTCTCCCAACGGCTGAAGTAACTCCTGC
TCCAAGACCAAGGCCAACACCAAGGCCCACTCAAAGACCAACCCCGAGAC
CCACTCAAAGACCAACCCCAAGACCCACTCAAAGACCAACCCCAAGACCA
ACTCAAAGACCAGCCCCAAGACCCACTCAAAGACCAACACCAAGACCCAC
TCAAAGACCTACCCAAAGACCAAGACCTACACCTAGACCAACTGCTAGAC
CCACTCCCAGGCCCACCACTGCTTTTAATCCTGTTTTCGAAGCCGTCGAA
GAAGAAAAAGAGGAGGAAGAGGGATATTACTACTCTACTCCCAAGAATAA
ATTAACACTCCCTACCAAATCCACCACACCAGCTAATGGTCTTTATCAAC
CTCCCAGACTATGA back to top
|
