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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s310 | supercontig | LSalAtl2s310:207977..220070 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005779 >EMLSAP00000005779 ID=EMLSAP00000005779|Name=EMLSAP00000005779|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=224bp
MTEYSVRCLINIENWTAWKLKXALAHNHCGYIHSDFQAPNVEPAFREVML
GHKHGGTATGTCGTVSWQIEHLDTRLIVMWSVPFNFNLHDSYFAVGMIFN
RGRFTSSSYWFNQMYYSEKGPYKRGSGGQSVTFQNSAVLVHGYMEPSSYH
PLVNISVIPQVRYKLAPQIWKKLYTADRFKYTGSGNKRTLCNGILPGSSG
PFAITVGISISLCVISNVYSGTLL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s310:207977..220070- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005779-701626 ID=EMLSAT00000005779-701626|Name=EMLSAT00000005779|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12094bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s310:207977..220070- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGACAGAGTATAGCGTACGCTGTCTCATCAATATAGAGAATTGGACTGC
CTGGAAACTTAAAGMCGCCTTAGCCCATAATCACTGCGGATATATTCATT
CAGATTTTCAAGCGCCTAACGTAGAACCGGCTTTCAGAGAAGTTATGCTC
GGACACAAACACGTAAGTGACATATTATTATCACAAACATTTACAAGTAG
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GGGGAGGCAATATTAATATTTCCTACTCTTCATAGGAAAAATAATAAATT
AATATGGGTATATGTTTTTATAACAACCTAATAATAAATTATATTAATTA
TAATAAAAACATACAATTTTTCATATACAAATATATTTATTTAAATTTAA
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GAAGAACGCAATTTATAAATGTTGTGTATTTATAATATTTTTAAGAAAAT
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GTTTTCAAACAAACAACCCCTGCTATCTTTATTTAGAAAAAATTGTAAAA
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AACGCACTTTATACTTAAAAATAGAATGCCCTTTGTATCACATTTGACAC
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TGAAAAAAAAAACACTTTTGTTCTTCAAAATGGACAAGGTTTTAAATTTT
AATAATTAAAAGGTTCTAACTACACATTTATAGCGTTATAGGGTTAAAGT
GATGACGGAATGACGGAGGTTTTGTTGGGGAATTATAAATTTAAGTCCTT
GTTGAACTCACTCAGAGTAGAATTGAGGATCGATATTGTAGTAATTCCTG
GGAAATTTTAGATTTCCTAGATACGAAGTTGAATTCGTATTTCCTTCATT
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GAATACGAACGGTGCGCAGCCATTATTGTGGGTCTTTGTACCGTGCACAC
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TGATGTTAACAGATTCAGTGTCTACTAGAATTTTAAGTTGGTGTAATTTG
TCCAAACCAGGTAACTAGAAACGGATTTTCTCTGGAGAAAAAATCATTTT
TATCACCTTTATGTTTTGGGCAAAGGAAATGTGGCCTCCTAGCACACTAG
ATCTCAATCCCTTGGACTGCTATGTGTGAAACGTCTTAAAGTGAGTCTAA
TAAACATATATATAACACCGTTGATTCCTTGCGGGCATCCCTTCTCGAGG
CAGTGTTCAACAGGGACAATTAGTTCTTCATCAACTCATGTGCCATGCTC
AGGGTGAGGATAGAGGCTGTGGTTGAAGCTGAAAGTGGTTAATTTGATTA
ATTGACTTGACTATGTACCCATATACAAATGAGCAAAAGATATATATATA
TCTGAATTTATTTTGGAAATAAATTGTAATAAACATTATCCTCAAATTTT
CAAGATTTAAAATGTGGTATGTAGTTACGATATTGTACAATATGTAGCTT
GTATAAATAGATTGTGCAAGTTTCCATTTGTACGTCACATAGCGCCTCAT
TTGTTTATATTCAATATTGGTCCTTTTAATTACTAACCAATAACTAATTG
ATGCTCTCTATTTTATTTTYATTTATTRWATTGTCGTATKTTTTTACTAT
TTATAGAAATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTTGCGTACTACCTGCAAAAATATCAAGATCTCCAAGTTATTTAGACTTT
TAAAATTCGACAATCATTGACAAAATGTTTTGCAAAATAAGAACTATTTG
TTTAGTATTTTCAWTWTYAAYAATCATATTTTTTATTAGATTTTGACACA
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ATGTTGAGCAAGAGCTTATTTAACATATTTGCATCCAGCGTCAATCACGG
TCTAGATATAAGGCATGGAAGGAGAAGCAGGCATTTTAGTTCCTTGACAT
GTTGGTCCTTTCCTCCTAGATGAAGGCAATCAAAAAGTCTTTGATGACAC
AAGTTGTTCAATTTGTTTTAGATTCAACATCCAGACAAAATAATCCATCA
AATTCAGATCAGTACTACTGAGGGGCTATATTTCCTTCCCATGAATTCAT
TGCAGTGTTCTCTCAGTCACTTTAGCGGCCTGTCCGATACATGAGATGGM
GAAGATTCTTATTGCCKGATCCAAGTCCTATATCTAGTGATTTTCTAGGG
CAAAAGTACCACAATTTCCATGTTTTTTCCCCCGTTTATCTTGTGTAAAT
CTAGCCTTCTATATAACTAGAGCAACTGTCACCTGATGCCCAAAAATTCA
CTAAAGTTTGTTGATACAACATTGTTTTTCCCAGCAAAAAAAAGATCCTT
TTACACAGTTGTATCATAAAAAAATTTCGGGGCATACAAGCGCCGATTCG
ATTTGAGTATATGGTATACATACAATAAAACAGCAACTTTTATTATTTGG
AAAAATACATATTAAAAAATGCGAAAGCAATAGATAAACAATTATTATTA
TTATTATACAATTTATAGCCCTGCTTTCACTCCCTAATTTTTATTTTATT
TTTATGTTATTCTTTGGTTGATTTCTTAGCCAATGAAATAGATACATAAA
CAGACAGAGTTGTAACTATGTAAAGTTATCTATATTTCTAAATAAATTCA
TTTTAGAAAATGAACAAAATATATTTATATAAATGAATAAGAAGAAAGCA
ACTAATTAAATAGCTCTAAAGTTATAAAAACATTTTAGCAAAATAAAAAT
AAATATATGTAAATTTTTTTTAAATAATAATAATTAAATAAATGGAAATA
AATTGAGACTGAATAGTTTTTTTGTTTTTTTAGAAGCCCACAAAATGGAT
CAGTATTAAGTTATTTATATGTATATTTATTTTTTTTAAAGTCAATTTGT
CCATTTGGATTTTTGAAACAGTTACCAATGGATAATTGGACCTTTCCTAC
ATAAAATATAATAAAAAAATAAGGAGAATTCATGCCTGTAATTTTTGTTC
CTCTCCTTTTTTTTTCTTTTTTCCTTTCTTTAGGCTTCCATTCTCCCTCC
TCTCTCTCTCTCTATTTTCAAGCCCAATTTTTGACTTGCAAGGCTACCAG
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ATTCTCTTATTTTTTTTCTGTTTCTATTAATCCATGGCGTCATTATTAAA
TTATAATTTCGTCCTTCACTTTTTTTTTTTACTTTTGCATTAATTTTTTC
TCGATGAAAATTAAAAGAGAAAAATCACTGGATGCTGACTCATATTTTCA
GTTATCCCCCTGTAGATTGTAGGGGGGAAAGTGTGAGTTAGAGAGAAAGA
AATAGAAGCAATTGATATTTTGCAGAAAGGATTTCTTTGCTTTGTTTTTC
TTTTTTCAAAGTTTAAAAAAAGACTATTTAGCTGGTTTATTTCTAAGCCC
ATGTGCAAAAATAAAATTCATTTTATACCTACAACATTTCCAAATCATCC
TCTTTCGTCAAAAAATGTATTAACTTTCCTTTCAATTTCTTTCTCTATTT
ACATGCCTCTCTCTCTCTACCTACATACACATTGAACGCGCCTAGTTCTT
GACATACCTGACTTAATAATGTATTTCACGACTGACTGAGCATTCATTAT
CTAGTTTAATAATGTTTAAAAAAATGTGTATAAATGGAAAATCTTGGAAA
ATCTTTTCATTTAAAACGCTAAGCAAAAAAAACGTATTCTTTTCATCATT
AAAATATATACTTTATAGAGACAAAAATAAATATAGGGAAAAGGGGGGGT
AAAGGAAGGGGGGTGGATTAGTGAATATTGACACTTTTTTTGCAATTTCC
ATCAATGGTATGTACTATCTATGACGTAGAGATCCACATTGAAATAAATC
ATTTTTATTNGCTTCTACCAGTGAATATTAATTTTTTTATTGCTACATAT
TTATAGTGATTCAAAGGGAGGGGAGGGGGTAGAAAGCAAAGGGGGAAAAC
AGTTCTTACCTATCATACATAGGTTGTACATATGGATGTATTTAGAGATA
ATGATGATGGGATATAACTTAATTATGAACCCTTAAGTGTTCGACAGTTA
TCGTACTAAAGTTAACATCTTTTATTAATCTTTCTTAGTCAATTTATTTG
ACGCACTTTTTTTCCATATACCTAAAGTAAGAATATTATAAATGATCAAT
TATACTTCATTACTAAGCACAGTATAACATATGTGCATAAATACATATAA
AACGAATTATAATCAATCTCATTATTCCACATTATCAATATTCTATACAA
ATATTTGTCTGCCAAACACATCATTTAAATAGCAAATCGATTAAATATGT
GGCCCGTCCATACAAAGGCAAGCTAGTATGATAGTAGAATGATATAGAAT
TAGGATATATTTTTATTTTTTAACTAATTATAATACTCCATTTCTATCAA
CAAATTATTCAGATTAATCCTTAAGAGACGCATCATATTGCACTTAAAGT
TCCCAAAAATCATTGTCACAATGGAGTAAAAAAAAATTGTGAGGTTATAT
TTGCAAGAACATTTCAGGTCCAAATTAAGTATCATATATCTAATAAAGGC
TTTAAATTATACTTATTATTCTTGACTATCTCAACTGTTCCAGAAATTTT
GAATACAAAACCTATAATTGATTGAAATATTTTCATTATGAAGAATCAAA
ATTAGTTTGGAATTTTTCCTTTCCTTGATTATGTATTTCAAAGTTATTTT
TGTATAGACAGATCACATAAAGAGTAGAACTCGACCGATACGGGTTTTTT
TTGGGTGAAAAACGATAACCTGATTTATTTATTTTTATCAATCAAATTAA
GCCTGGAAAATTTAATAATAATAAACACGTTAAGATATTTAATCATCATC
ACTTTGATAATTCCTTAACTTTCCCCATCTGCTAAGATTTTAGGACATTC
AATAATATTTTTTTGGATTATTTCAGAACTAGTGATTCATTTTTGTAAGG
AACAGCCAATTATGTAGGTGTTTTATTCTATTGATGGTTGATATGCCATG
TATGGAATTTTATGCATTTTTTTTAGTCTCTGGATAATTAATGATTAAGT
TATGCTAAAAAATGTATCAAAATTTTAACAATGAAAGGCTAGGTTGTGCC
CTTATCGGTCTAGCGGTTCTAACGGTTCAAGTGGTTTGGTTCTTGAACTG
CTACAACAAGATTCGACAAAGTAAAACTGAGATCACAATATATTGCTTAT
CAGTCTCTGTTCTTCTGTTTTGCTCCTATATAGAATATATAAAGAAAATA
ATATATATATTATAGAAAATAAATTAGCTTCTATCTACAAGTCAATTTTA
TGTGTTTCTTATGGGAAAGTTCAACTTTTTTCCAATTATATTTTTTACGT
CACCAGGGTGATACAGTTGTATCTCAGTTCCAAATAGCTATGGGCTTCTT
ATGGACCCAGTAAAGGGGTTTTAGGCACCAGGCGCTTTAAATAAAAGAGG
GAAGGGATGGGTAGATTATAAATTCAGGTCTGCTACTTAGCTTGTCGGGG
CCCTAAATATTATAAAGATAATATTTCTTAAGCAAGGGTTTCCCATACTT
TACAATGCCAAGGCTCCCCTCGCTACAATAATACATTATTAGCTAAGTCC
CCCTTTATATATAAAACATGTTTATGTGTAGACTGAAAGCAATCCTTAAT
TCTCCATCTTCCTGAAATCGCCCTCCCCTCCATTTTGACTCCTCTCACGG
CCCTCACTATGAAAACAATTGTAGTAAGTAACCTTGTTTTTCGGGGTCCC
TGAGAAAATTTTGGGGCATTACGCACTCTGCGTACTGTTTGTATCAAATA
CCATTTCCTGGGACTAAATTTTCTTGTGGCACCCCTTGTTTTAAGTGTCT
GTTACCAAAATGAGCATGTATAAAGAAGAACCGAGACCGATAAAGTTTAA
CCAACCCCAATAACGAAACCGTTGAAATGAAAAAAACGAGACCGATACAA
CCGCTGAACCTGAACCGGGAACAACCATGGTGAAAGGGGATTGCAATTAT
CTTATATTACGTGCATCATCAGGGACAAAAGAAAGGAAAGATCACTTTCA
AAAATAGCTAACTTGGTTACGTCTAACTTTCAAAGGGTTAAGTTGTATAA
CTTCTCTTCAATCTCATTATTTTTAAATTAAGATTTTGTATTTAGAAATA
ATTATTTAATTTTTTTCTGTTAGTGGAAAAAAATAAATAATAATGTGTTA
ATTTGGCTAATGTTTACCGATTATTATCGAACTGCATATAATTAACCGAC
TTAATTGACACGTTGATATATTGGTCGAGTCCTAATGTAGATTTTTTCAA
TAACTAATGGTACCATAATAATAAAATAAAAATGCGATCCATGGCGTTCG
GTTGCAAAACAATAATCTGCTCGTAATCAATCACGTCTCAATATTATTTA
TTGAAATTATTCCCAATCCTATTAGTGTATAATATAATTCAAAAATAAGA
CTAATTATTTATGTCTTACCAGAATAAGTTTGCCTGGGTTTGCCCAAAAC
ATTAAGAAACTAAAATTATTTCGGAATTCATTTACTTCCTATAAGACAAA
AAATAAAAAGCGTAAAATTCTAAGAACTATTCTCGCTGCATGTTGGTATG
TATCTATGCACACTTTTTTGAAAAGGAGATTAAAAGGTATAGAGAAGAGA
AAATATTCAAGTTGAACTCTCCTTCGCTCAACTATCATATTATTCCCAAA
AATCCTGTGCCTTATTCTCGCTCATTTTTCTTCTTCTCTAAACCTTATAA
TCTCCTTTAAAAAAAGTGTGAAAAGATACAGACCAACATGCAGCGAGAAT
AATTTTTTGAATTTTACGGCCTTTATTTTTTCATATTCATTGTTATCAAT
GTTCTGAATATTAGCTTGTAGATGGTTAAACTACCAACCGATTCTGAGAC
TTTCCCCTGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTGGGATAAAAGGTTGTGAG
ATACAATTAAAGTAACGACGTGATAAACGACTTCAATTCACTTATTTAAA
ACATTATTGTTACCAAATAAACGTTAWAGCACACATACAGAGTCTTACAG
ATAAACTGGGGCATCCACATCAATGAAGACAGCATATATAATAATGTATG
TATATATCAATATAATGTACCGTTTGAGAGGTTATGTTATTACCTTTTGA
TTCAGTTCGTTTTGAATGTATCCAACAATAAGTATCGACGGAGCAGCGAA
GAAAGTTAACAATTGTCAAGCTCGCTGACGCAAGGAGCAACCCTCTTGCT
ATAATGAATCCAGCATTTGAAGGAGGAGGGCAAGTTCAGAGGAAGGCCCA
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AGAAGKCAGTGGAGACATCTCCTAGGACATTAATGTCAACCTTGGCCAGG
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GGCGTCTGATAAACTGTCCTTTGACAATTTCTGTACCTGTGTAGATACAG
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CAGGGACAAAATGGCGTACAAACTTCTTTAAAATATCCATTATACATATA
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GTGTATTATTTTTTTAAGTTGAAACTTTTTTTTTTAGAATATCATATATT
ATTATCCTATGTGAGTGGGTTTTTTGAGAGCTTAGAAATGGCAGCTGATA
GAGTATACATATGTATGTACACATTGATATTTTAATTAGAAAGGATTTTG
CTCGTATATAAAAAGCTTTAGAATTTTAAAAAATATGTAAATACCCGCTA
AATGCTTTAAAATCCTATACAAGGACCTTGTGTCCTTCCCTTTGCCAAAT
ACAATTTATGTGTACGCGTAAATATATGTATATACATATGTGTATAGAAA
CACTTTATGGATAATAATAAAAACATATGAAAAATCGGCTTGGAATCTTT
TCAAATTTATTAATAATATTTTTTATTTTTTTCAGTTTATTGATTGTCAT
TTTTCATAAGATATTTGATAGAAAATTTTATATATATATACCAAACATAT
ATCAAACTACATAGATTGATATTCATCAATTCAGCGAAATAGGGTCCATA
AAGATATATTTTCTTTCTCCTTATGTTTTAAAAAAAAAATTCTTATCCAA
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TATCTTATGTATCCTCTTCAAGGAGAGTTAAAAAAAAGAGAGAAAAAAAA
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ATCATATAGGAGACACACAACCTCATAATATAACAATAAAGTTGAAAAAT
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ATATGGGAAGAATCTTAATAAATATGAATATGATTGTCTCAAATTAAAAT
AAGTTTTTTAACCCCCACGTACGTACATACCCCTCATATATTGTGACAAA
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GTTCTAGAATTGACAGTCTCTAGAACCGGCAGTCTTATGGATCGGTCTCA
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AAGGACTCACGCAAAACTACATTTTTTTTTTACTTTTTTTATATCTCATA
GTTTATAATATCGATCAGGATTTACAAATCAGGCTTTATATAACTTTGGG
GGTTTTTTCTCTCTTATTGTCCAAAAGCTGGATTCTGTCAAGATTTAAAA
TGATATTTTTTGTATTGTACATCCATCAATCATTCTAAATATTTATATAT
ATGTAACATGGATATTTTTTCTTTTTTCTAGGGTGGTACGGCAACGGGTA
CCTGTGGAACGGTGAGTTGGCAAATAGAGCACCTCGACACTCGACTCATT
GTCATGTGGAGCGTTCCCTTCAATTTCAATCTCCATGACTCATACTTTGC
CGTGGGGATGATATTTAATCGGGGCCGATTTACCTCATCGTCCTACTGGT
TCAACCAAATGTACTATTCTGAAAAGGGACCTTATAAAAGAGGCTCTGGG
GGCCAGTCCGTGACCTTTCAGAACTCTGCAGTTCTTGTACATGGCTACAT
GGAGCCCTCCTCCTATCATCCTCTTGTCAACATTTCCGTCATTCCACAAG
TCCGATATAAACTCGCTCCGCAGATTTGGAAGAAACTCTACACTGCGGAT
CGATTCAAGTACACTGGGTCAGGGAATAAACGGACGTTGTGCAATGGGAT
TCTCCCTGGATCCTCTGGACCCTTCGCCATCACTGTCGGGATTTCCATAT
CACTCTGCGTTATATCCAATGTTTATTCCGGAACTCTATTGTAG back to top
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