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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s311 | supercontig | LSalAtl2s311:368488..399678 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005792 >EMLSAP00000005792 ID=EMLSAP00000005792|Name=EMLSAP00000005792|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1494bp
MYRRENQRQYELRADSINELVESEKTAKWQYTQHCEELTEEIKKLRNELF SLKKEWRLLPQMSKTSSQEGRSSGNSSVEEEDPDLAKIKKVQSFFRGWLC RRRWKQIVDEYIRSPHAESMRKRNCLVFRMVEAEEEYVEQMEILITCFYR PFKMAASSKNPPCTHDDINSIFLNSETVLFLHQIFLKGLTARMESWPTLV LGDLFDMLLPMLSIYQEYVRNHHYCLQVLTECKQSPSFAQLLNRLEKKPA CKGRSLEIFLTYPMHQIPRYIITLHDLLAHTPPDHVEKKSLEHARDQLED LSRQMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCDILLDVNQVFVRQGTLIQILP SPSSSRPGRSRLNIGREKEREAVRQCFLFSNHLIMTTRTQAGRLHLVEGT GKIPLANVTLIEDPNEDDRNDDQEYPGSSGSLSDEGEGNTPNTGGKNNLN QNEKKDFKIIQEKAAWITDISQCMDNVHFNGLFYNTLPNASSSTLPQCVK SDPSLFKDDVDIRFSKTFNTCKIPQIRYATPERLLQRLTDLRFLNIDFLN TFLLTYRVFTDSITVLEALKNVFNTSEPLESSSSSLSSIENLGEGHTQHV HHQVTSIPSTECEGKRRISTCSGYSTATGIRNNLVCVFHPKYHLESNDSD NNLANLPNVSHHPDTGTNSRHGSLTPRRISGASSVSGYCSDERGSFSTEG GLTPHMKPQHWRYSFRRYEEEQRETTLGVSSNLQNVEVLSRFGSGSGTGG RRKGSYDSICSGRSGSIVSTFRKESVPIIEQTEPISEMDDASSNGTSTTE KMEEEISISHSNVSKDTQXSSSSXSSSXATSSINTDNKSLVKVKSDTGTP YLAVPPHLAASSSAETLTDDPKEKNVQKEVEEGQSSAKVSEKHHGXQPMK RQNSFEEPSKIADLAKTMVNMPKADITLKGIADKAVEEVGLVGLAHKFTR KTGIRTNTSSSSSGSYTTPYTFNLEEGEKDATVASSGGSTGGTSIPGSHH SSFSSTSTTRALFGGITFKDFKSPTREIRKKKGLFHNEFCNSGSSSISGP SGGTSQNPGSNTNTPISSPQHSSKIGVIITSSRQANRRSSSACASIAFAV ATAGSGNPSNNRSPAKKSEDFKELSKRKGSMSSNATTMRVLSVLRHWVTK HPQDFEANPTLKSASIEFLDDINCIPSLLPAEHRASTQILRMLTKDESDK NKMNLEEILKGTETPSKETILSLLALEIAEQMTYLDQKILFAIPCSEFLG QAWTKKDRNIRAPNIVQMTKFFNDFSRLVCSEIISQTCLNSRIMVIEKWT AVADICRCLHNFNGVLQICAAFTNSSVFRLKNTWNRVSKSVRHTIDKLQS LVSSDGRFRNLRDTLHRTDPPCIPYLGMYLSDLTFIEEGTPNFTESGLLN FAKMRMIAHVIREIRQFQQTPYKIERIPKVVNYLLDSGKLMDDEEMYQRS LMVEPXASRLSSSFGXSMAXAAATVAARHSSAQQEKDSHGTTPN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s311:368488..399678+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005792-701639 ID=EMLSAT00000005792-701639|Name=EMLSAT00000005792|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31191bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s311:368488..399678+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTATCGGAGAGAGAATCAACGTCAATATGAACTCCGAGCAGACTCCAT
CAATGAATGTAAGTCATGGATTGACGCAATCAAAGCTGCAAGGTATGTTA
ATTATTTACATTTGTTCATCTCACCACGGCATATGATTCAATTTTTCTTT
TATGAAAATATATACATATTTTACATAAGAGTAAAATAAGACCTGAATAT
TTTATTGGGTCCAACATAACCAATGTTATGTACCTCTTAGTAATTGTTAT
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CTTTGACCTCTCAAAATTTAATAGCTTTTTACTGTGCTCATAAATAAATA
ATCTTCATATCAAATTTAATCCAAATCTATTTGTAACTTTTGCCGTAATC
CTGGTGACCAACAGACAAAATAACTAACAAAAAACAGAGGCAAAAACAAA
ATCGTCGGCAGAGGTAATAACTCATTCGTTATTAAACAAACCCTGTTCTA
CCTACAAGCAGTTTTTACTTTTATTACGAGGGTCGTTGGAAAAGTTCGTG
CAAAGTCCAAGAGATGGTATTACTGGCCTATAACGAGGTAATATTTAGTT
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GAAAAGAAATGTTATCATCTTCTCTTTATCTCTGCTACAGTACCTCCAAG
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GCTTTGTAAGTTTGTAAATCATCATTTGGTCTGCAAGCTTTTGGTCCTCA
AGATCCYGGTTGTTCTTCACGGTTAAGAMTCTKAATTGAATGAAGTGAGG
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TCCCCCTCATCTCTGAAAACTAGCTCTTTGAGACGAGCTTTCAAGCTTGC
TTGACATCTTTCTACAAACGCTTCCTTTAGTTTCTCATAAGACTTACCTG
ATTCACTCACGTCAGCGATTGCATGTTATACTTTAGTGAGGATGGCTGTG
GGTTGGTGTCTGAGGCTTGGCCGAATTTGCTGACACTCCTTGTGGTTGTA
CTTGCTCAGAACCCAATCTCTAGGATATTGAACCATATCTTAGGATCTAG
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TTCGTTAGTAATGTTTTTATAATGTATATCGTTGAGTTGAAGTTGATAAT
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GGTGGMGTTGGGATGGAAAAGAGTACAGAGAGAGGAGGGCTCCACCAAAA
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AACTGGAGCTGGAGCTTCTTGAGCTGTCGGATCTCCCAAATAAAAACAAC
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TATAATTCGGTGGATGAACATCACATTCTTAGAATAAATAAAAAATGGGT
TTCATTTTGCTGGTGTGACAAGGTCTTGCCTTGATAGAAGATGAAGACCG
GCATAATGTGACCTTCGCTGCTAATAACACCAAGAACCATAACTTAGGCT
ATATGATCTAAGCAAAGTTATATGGGCTTTTTGCCAGACATCTATTTTTT
GTCGAGTCAGAGAAGAAGACAAGATCCTTCACGGAGGTTTCTATTTTTAC
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GCTGGGGCTCTTACGTTGTGTATGGAGTGTTTTTCCCATTGATACCTCAA
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TTTTTTCTTTAATAAACAGTAAAATGTTCAAGCTTTCCTACGTTTAAAAA
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AGAAGGGTCATTATTGGCCCAAAACGTCGAGGGCAATTTGGAGGGCATTT
TAAGCTATTAAATGAAGCTGTGTATTGCAGCTTTGCTTGATTTTTTCAAT
ACCAATATAGTTTAAACCTTCTGAAGCATTATAAGGGTAAATTTTTTGTA
AAGTCTTTAAGAAAAAGTCATCAAATTTATAATTTAAAAGATTTACATAT
TTTTGGCATTTTATGCGTCACGAAACTTCATATCGATCAGCTGTTGAGCA
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ATATAGACTCTGATTTATGAGTTTCACAAACCTGATTTAAATATATATGT
ATGTATAATTAGGCATTATATAGAATACCTAGGTAATGTATATAATGCCT
GATGCTGTCATGCAATCAATATAATAAATGACATTTTTTTATACTTTAGC
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TGACAAGGTGGGATTAGAAAACTTTATTATAAATTAGGCATTTGAAATAA
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GAGACGGAAAATGATACAGCTGGAATGGCACGAGTTATTATATTATTCGC
AAAAAAATATTTTGACACTCTGATGTTACACACACATACATCTTTCGATT
AAAAAATCTGATTACATTCAAAGAAACTGGCTTATACCTACATATTACAA
ATATAATATTGCTCAAATTTTCTTTCAAAGAATATACTAATTAGTTCTTA
TTCCCAACTTTCATTACGTCATAATGCTTAAGAAGGCAATTCAGATACTC
TTTGTGTCTTCCTAATGATTACCTTCACTTTTTTCTCTTCTACAATTAAC
ATTTGATATCTAGTTTCAGAAAGAGAAACACTATACACAACAGCAACGTC
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CAAATATTACTTCATTATTATGACGTCGTCAAAAGTTATCCTTATAACTT
TTAATTTTAAAGGATATAAAGCAGATTCCATCCCCAATAATCTAGGTTGG
TCGCATAAAAACTTCAATTTTTGAGGTAAAACTCCATTCTTACATCTTCG
AATATATTTATATAATATTAAGGTTAGGACAATTATTCTTATATTTAAAA
GTAACCCCCCTTTTGTCCAATTTAAATGGTTTAATTCATGCCAGGTTGAA
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ACAAACCGCAATTACCTAGGCACTCTGCTTGGCTTTGTATTGTCATTTAC
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TTATATATAATGCCGGGGTAATTTATAAAATGGCGTATATTATATTGTTT
GCCTGAGACCCTCAGGCACTACACTCATTAACAAGGTATTATTTTATTAT
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GTCGACAGATGGCCTTTGGATTTAGGTTATGTTACTATAGTAATTTTCAG
TTTATCGACGTCATTTGTAGTGGGTGCCCTAGAGAATTTGATTACAGGTT
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ATTTCCCGCTCCCTTTTTGGGCTGAGCAATGCCGGGTAACACTTTATTAG
TTTACTTAATTTTTTTCTTTTCTTTTTAGAAATATAACCAATCATTGAAA
AGAATGAGATGATTGACAAAAATAATTACAATATCAATACAATTAAAGTA
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GTTATAAAATTATTTTTTTCCCCTCCTAATATGATAAATGACGCATATTA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTATTCTTTATTTTTCTGCATTATTTTATATATTTAAACTTGAAGTTTTT
TTTTTTTGCCTCAAGAAGTTTTTGATAGTGAATGTATCTGATTTATAATA
CTGATCAGTAATCTACAGTGTTGAGCAGCTAAACATGGAAATACTTTAAT
ATATATATTTTTTTTTTTGTGATAACAAAAAATAAATCTTTTTTGACAAA
AATTGTAAATAAGCCCTTTGCAAGCTAAGTCACTCAATATGGCCACCTTC
AGCATCAATCACAGCCTTACACGTCGACGGAAGGCCTTGCAGGAATTGAT
AATATACTCCTCAGCCAAGTTGTCCAACTCAGCTACTATGGCGGKCTTCA
GTGAGTTCACATTTGGGTGTGAAGATTTCGTTAGTTTCCCTCTCTAAAGT
GTGCCAAATAACAAAGMCCAGCCAGTTCAAATCGGAACAGGAAGGGGCTA
GATCTTTTTGCTTCTTTACCTCTTGTACCTCCTGGCCTTCATGATCTCTG
TCAGAAGGTGTCGTGGGTATGAGGGCAATCCCAAATCTTCCCTCACGSCC
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TTCCTCCTTGATCTTCTTCTCCATGCTAGAAAGTAACTCCATGTCCATCT
TTGAATTGTTTCCTCCACCTCCTGATTTCCTGGAGAGGTCTTCACCATTC
TTCTTCATCTTCTTGGCCATCTTAAAAACCAGGCTGCTGGAGCACTCCAA
ATAGTCCCTAATCCTCGCCACCTCAAATTTAGCACCTAGGAGATAATGTG
CTGCTTTTTTGGTTTCTTGCTCACTCATAGTGAGGAGATGACGAAATGGT
TATTTTAGTGTGTTTGTGCGCAAAGGATGTTGAAACTGATTACCAGAAAA
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AAACTTAATGTGAAAGTACATAATTTAGAGACATCCGTCCACAACTTTAT
CTATGGAAATTAATGAAATTCATTAAAATCGTTAGGTTGAAGGCAGCTTT
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GATGATGTTGCTGCTAATCTTCCTACAATTAGAACCTTTAGAAGAAATAT
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AATTAATTATTTATTCATCAAAAATATTATTTTGTCTACTTTTCTGAACT
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ATTGCATGATTCAAAATAATATAAATCCAACTCGACACAGAAACTAGTAT
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TTGACAAATTCAATAATTTGCAAGAAGGAATATTAAAATATATATAACTA
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GCATTCTTGCTCGAATTAAGACGACTTCTTCTGTTTTTGGACAAGAAATT
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TTTTTTCTTAGAACTTCAGGAACTCTAATTTAAATACTTTTTTACAAAAT
ATATTTTTGATCCATATATAGTTTTAATAAAACAGATAACCGCTTAAACA
GACATAAATAAACATGTACAGTTTAATGGCCTATGTTATGTTCTATTTTT
ATGTGGAAATTTTATTGTATTTTTAAGCAAAGAGAAAATTGAAATGCACA
AGTTTAACCTAACCAATAATATTCTATGTAAAAACTTGTGTTTGGGACCG
AATTAAATTTTTTAAGACCTAATTTATTAGGTTCAAGTTCTATCTGTATC
GGTTTGCTTATAAAAATCGGTATAAACATAAAAATCGTATTGATCGGTCT
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TTTCAGAAAGCAGTTTTGGCCGAAATAAATCAAAACAAGACCCATCAAAC
AAAAATCGCTCTNGTACCGAGTTTCGACACATTATGTCAAAAAGTACCAG
CAGGAATTGNTTAATATTTAAATTGCCTGTGCTAAAGGGATTTTTTTTTT
CTAAGTCGGCAGTACTGTCTTTCATTATGATGCAAAGTTTGAGCGCGATT
TGTATATCAGTTTGTTAGCAAGAGCTGGATAAGTCAGTCTCCTCACTAAT
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TGGCTTGTTTGTATGTCATACTCATAGACCCACGTCCCATCACAAGTTAT
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TAGAGACTTGCTCATGGTACTCATTTTGAAAAAAATTCAGTTCTTTTGGA
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CTCGTGACTCGTGAGATATGTTAAGGCAATGTTGTAACTCCCTTATGCTT
GTACGCGATTTTTTTGTTGAATAATTTCGTTCACGGTAAAAATAATGGAG
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AGATCGAGTTCAAATATGGCATCATAATGAAAGACAGCCAACCTAAAAAA
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TACTTTTTTGATGGAATGTACTTGAGCTGAGTTAATTATTTATGTTAAGT
GGGATATACGAGTATAGACTTTTCTAATTGTTTTAGTTGTTTGTCCAACT
CTTTAAATTCTCTTTATTTTCTCCCCTTGTAGTCTTGTATTTCGAATGGT
GGAAGCCGAGGAGGAGTATGTAGAACAAATGGAAATCCTGATCACCTGCT
TTTATCGACCCTTTAAAATGGCAGCTAGCTCCAAGAATCCTCCCTGCACA
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TCATCAAATATTTTTGAAAGGTCTCACGGCAAGAATGGAATCTTGGCCTA
CTCTGGTTCTAGGTACATCACTAGGTGGGGACATTTTTAACGAAATATTT
TCTCCAAAAAGAATCAAATGTAACTTTTTCCTCTTTTAAACAAAAAAAAA
TTGAATACGATATCAATCCACACACATACGATTCAGTACAGTTTAAAGGG
ACATAGGGGGCACTTACTTTAGACCCAGATCTCAATCGGTGGCCCTCACG
AGAGATGAAAACCATTTTTTTTTTAGTTACAAAAAACTCATTTGATACAA
ATATACATATCATTTATTTTGGGGAAAAATGTTTTTGAGAACAAAAGTTA
ATGTAAAATGTAATTTAATTGTAAAAAAAGGATTCCTCTTTTTAAAAAAA
AAAATTACAAGTCAAATCTGGATAAAAGAAAAAAAAGTAGATTTTATCCG
GATTTCTTCCTTATCCGATATTATGATTATCCTGAAGTAAAATATTTGTC
TTCAAGAAAAACTTGTTTGTAAGGGAAATTTTCTCTTATCTAGTTTTCCC
TGTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNTTTTCCCTGTAATCAAAAAGAATGTTTTTTTTTTTA
AATCAAACTTTAGAAAAAGAAAAAAAAAGAAAACTGCACTACTGTACATT
TATCTTTGCCCCATTCCCTTCTCACGCTAAAACTGGGCCTGATACAAAAA
CATAAATTTTAAGCTGAGGAAAAATTTGCTCATTTTTTGCTTAATAGGTC
ATCACCAAAAACCTGTCGTCGTCGTTGATGTGCTGTCTGTCCAAATGTAT
TAAAAGTTGAATGTCAATGCCTCTACAGTATCTTATTTAGTTTATTCCTG
GCTTACTAACATATTATTATTATACAAATTTTCTTTACGATCATATTTCT
TTTAAAAACAGAGAATTTGGATAAAATCAATCCGGATAAGAGAAAAGTTT
GCTTAAAAGCAATTTTTTCTCAGACACAAAGAGTTTAACTCCATAAACTA
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TATAGTTCTCACGAGTATTTCTATTCTTATATAACTTATCTATTCTGTTA
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AAATGGAAAATTATCAATCTTGCTCAGCATAAAACAGGGGAAATTATCTG
ACTATATGAAATAAACTTGATTGGAAATTAATACCATTTTTTTTAACTTC
GAATAAGAATAATCCAGATTTGAACCTTCTTTGAGTATTTAATTATTATT
TTAGATGCTAGGTCTCCTGCAAGATTATATATAGTTAGTTTTTTTTTAAA
TCCAACTTTTTTTTTTTTGTAAAAAATCGATTTGGAGTGTAGTCCATATT
TTGAAGACTTGAGAACTTAACTTGACTTCACAATCAAAGACACGTGAATT
GACTTGAAGTTGGCAGTCCCGTGAATACAAGGGTTGATACACTTGACTAA
AAAAATGGCAATTTTTTTTTATGCTGTTACAATTTTGATTTTTAACCCTA
TTTGAAATTTATAATTCATTATTGTTAATTTTTAGTTTTTTACGTCTTTT
CTTGATAAAAAAGATAATTCAAGGTCAATAAAAGTATAATTAAGGCCAAG
GGACTCGCTAACTAAGACTTGAGACTAAACTTGGACTCAGAAGCTAGTTT
ATCTTAAACGAAAGAAGTTCAATGTAAACTTTATAATATACATAATTATG
GGCTTGAAAATAAATCTGAGGCATTGAGCTGGACTAAATAAAAATATTAA
ATGACTTGGAATGGATTAAGGACATGGAATTGACTTGTAGTATGAGGACT
TTCCCCCACCTCTGCTATCAATTAGTTATTCAATTAATTAATGTAAGGAG
AATAGATTCCTTAAGATATCTATATACCACATTATGACATATTATTATTC
ATCACTTCTCTGTCCTGTCATCACGGTTTTTTATTATGGTTCTGATTTTT
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GGGCCGATAAATAATACTACTAAAAAAATTATTTGTGCCCTGGTCCCCCT
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TGTGTAATTGTTTCTAAAATGCCCACCCAATCCAATCAATATTAGAATAT
ATTTTTGTTTGTCGTCTTGTGTCAAAAGAAATTATGTCATTATTTGTTTA
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TCAACTGATTTCGTAAGTCAGACGTATTAAGTGAACCAAGTACGAAAATG
TCAAACTTTTGTTACACATATCATTATGAGAATTGGCACACTAAGTTTAC
TTCAATAATGACTTGACCCTACCTTTGCTATCTCACTAATCCCAAATACT
TTACCTTGGATGCTTTCAAACCCCATTGATAATTATAATAAATGGATTTG
TTGCCAGATTTAACATGCAAGTAATTTAATTGTAGACTATTCTCTTGTAA
TTCTTCCATTTAATTTTCTTCATATTTCGTATCACCTATAGACACCATCT
AAAGAAACTATTTTATCCTTGCTGGCGCTTGAAATTGCGGAACAAATGAC
TTATTTAGATCAAAAAATTTTATTCGCCATTCCTTGCAGGTAATGACAAA
AACTTGGGGTTTTTGTTCCTTCTAATAATTTTGAATTTTTGAATAGTGAG
TTTTTGGGACAAGCATGGACAAAGAAAGATCGGAATATAAGAGCTCCTAA
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TTCAAGATTGGTGTGTTCGGAAATAATATCACAGACTTGCTTAAACTCAC
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