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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s335 | supercontig | LSalAtl2s335:560568..612257 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006143 >EMLSAP00000006143 ID=EMLSAP00000006143|Name=EMLSAP00000006143|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=196bp
MYKLPQDNGMFFSSGCQVHGTSVIMDEDEEDEFNPIDVRSISADDDDLGG LSSPLGNNNXLHSXXTGPPLISPPPYEREVNNPFDHSNCSKNLHKSCACV NFIAEHTRAKEEATKVKEDWKYVAMVLDRLFLWIFTLAVLVGTAGIIXQA PSLYDDRIPIDREISDIASGFDAGVRKKESKGKFRSIQNCYPDQDK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s335:560568..612257- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006143-701990 ID=EMLSAT00000006143-701990|Name=EMLSAT00000006143|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=51690bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s335:560568..612257- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTATAAGTGATAAATAAATATTTTCATGTAACTATTATTATTTTAATT
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TTATGTAGTTCAAATTTTACAGAAGCAAAAAAAAAAGTATTAATGAATGC
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TGTACGATTAAAATTCATTATTCCATTCAAATTGACTCTGTGTAACAGCT
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TTTGTAAAATTACGATACAGAGTCATATATTGAAATGAAATAAGAAAATG
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GTGTCTATACATACAAAAATCCAGTTAAATAAAGAGCTTCACCGTGTGCT
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CGTATCCAAGACCACTGCTTACGCTATCTGCAAGGCCGAAATGTTGGAAA
GGAACAAAAGCTATTTCAAAAGAGGCAGACTAGACTTGGAGGAGTTAAAG
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TAAAAAATCATAAATGAGTCTTTTGAGTTCTTTTGAATTCTTTATTGACT
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CACTCATAGCCAGCACTAGTACACCATGACATAGGACTTCTTCTACCGCC
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CTTGTACTGTTCGGTATAACGATTTTTTTTTTGACAAAAACACTCACATC
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GTACCGATATACCGAACAGCACTATCCTAAATAAAAGGGCAGAATTTAAA
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AATATTTTTTCTTTTGATATACCTACGTATATGCATTCATATTATATCTA
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TTGAAGTTTATAACGCTGGTTGACAGTAGGGAAATATGATAATTAAATAA
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AGAAAAATCTAAATAATTTAGAAATTTTTATTACAAAACTTTGAGACACG
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CTCTTCACCAGACTGTTCGAAATTAATACAGTACTTTGTTCTACATATTT
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ATTTTTTAACCAATCATATTTCCTTTGATTGTTGAAAATTAATTATTTCG
ATTATTTCCTTTCATTCCGTTGAATTTAACTGTCAGTGTTCACCCTACAT
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ATTTGATTCAATTCTTTAAAAAATGAGAATTTTACAATTATAGGCAAAGC
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AAAAATGGTTTTGTGTTTATATGTACATCAAAGCAAGAATATATAAATTA
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TTATATAGACACGTATATATCTTTGAGAGTAAGTTCTTAATTTGATGATA
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TATCCACCATTGCGCTTAATTTATATATATTAGGGTGATCCTGATTCCCA
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ATATGAATGCCTCAATTCTCCCATAAAAAGCTGGCAAGCTTTAATGATGT
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GGGGGGTACTCATGATATTTATCTTTATTAATTGAAAAGTAATGTGGAAT
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CTCCTTACTTGATTTAAATATGTAAATTACTAAAATCAAATATTTGATAT
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ATTCTCTCTAACTTACTGTTCTTAGGTTTGATTGACGGTCGCAACTTGAA
AAGTATATATAAAATTTGTGAATTGTCATTAAAGACCATTCTTGGGTAAG
ATGGAGTAATTGTAATAAAATAATATAACTCAATAGGATCGATTATATGA
AATTGAAAAATAAAAAAGTTATTTGACTGTAATATAAAATTTATTAAGAA
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GTGGAACCCACTTTGATAATCACTGTCTTAGATTGTCATACCAGATTTAG
ATTTGTCATTTTGGCAAATAAAGGGTAGATTTGATTTAAAGAAACACCTC
TTCTTAATTATTAAGTACATGTAACATTGTTATTATTTATACAAGCAAAT
TGTTATAGTTGTAAACAAGACATCTATAATTTGTAATATTAATTTTTCAT
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ATTTTGTTCATATTAAATTTATGAAATTTGTACCGAACGGATTATTCAAA
ATACTACTACAATAAATTTTTATTTGAAAAGGTAATAATATTTTCCATTT
TAAATTTAAACCTCGGCAGGGAATTTATATATATAGAAATAATCCAAAGG
TAAAATAATATTAAACTATGTGTATATATTTTACACACTTACTTATTTAT
ATTTAAGGATTGCATAAAAAAGGGGCCATGATCAACTCTGTAAATTAAGT
GCAAGAATATTGCATTAACATTTTCGAACACCTGTAGAACAAAAAAATTG
GCATCTTTTTCGTCTATTATCTATGTGGATATATTCACATATATTTATAT
GATCTTTTTGTGAGAGCAACTCAACTCCCGATATTATTTATAAATATTTA
TATACAGGGAGCAGGGATCAAATTGTCGCCAAAATATTTTTCTGCAAAAA
ACAACACAAAATATACATTATTTAACTTTTTTATTGAAAATCAAAACTAT
GACGAGCATATAGGTATACAGTAGCCATTCATTCGATATAATCACCGTTT
TCATCAATAACASCCTCAATKCGGCCTCTGAACCAGCCGCAGGCTCTTCT
GACCATCTCATTGTCCATGTTGCCAAATKCCTCCTTGATGGAGTCCATCA
GCCTGGCCTTGGTACTATGGGGATGTCTGTTGGTATGTCTCTCGACATKC
CCCAGACAAAATAGTCCAAAAAATTAAGGTCGGGAGAGTTAGGAGGCCAC
AAATCCTTGGTTACGACGTCATAACAGTTCTCGGTTAACCACTGCATGGA
GATTTTGGACACATGGCAGGGTGCTGAGTCCTGTTCCCACACCCAGGGCC
TGTCTCCGGCCACCCCTTGGATCCAGGGCAGAACCACCTTCTCCATAACA
TCCAGGTAGACCTCTGTATTGACCTTTAGACCCGTTTCAAACATGTGGGG
AGGCATAACATGACCTTCACTGCTGATCATTCTTTTCATCAGATAAAAAC
CACGGCATCCCGAGCTGCTTTGGGTGCTTGAGCTTGTTGAGCAATTTTGT
TGACTTCATCAGCCTGTTGTCCTTTGCCTTCTGGGTCAAGATCTGGCCCA
CCTGCATCTTGTAGCTCCTGCACCTTAAATCCTCAGATACATAGTCCCTT
ATTGCTTTCTCATGGCAGCCCAAATCCCTCGCCATGGCCTTCATGGACCT
GGTAAGGTCATCCTCAACCATCTCTTTCACCTTGTCGACAAAGTCGGTGT
CCCTGACCTTCCTGTCGGCACCCTCTTCCTTGGGTGCCCTCTTTATGGTG
GCAACAACATCCCAGGTGTCCTGTAGCTTCTTACGGATACGCTGAACAGT
CCGTAAATTCACTCCTAAGGTTGAAGCAATCGTTAAATTGGAGATTTCAC
CTCCATTATTAACCAATGCCATGACTACGACGGACCTCGAAAGCTCCTCG
TTCCACTTATAGCTCTTTATATCCTCCTATGATGACGGCATGATGCTAAC
TGAACTACATATCGTCAGCTGACGAGAATAGCTTTCCTATATGGTAACCG
GTTTTTTATTTGATAATGTCGTCTTCAAGTTATCAAGGTTTAAAGTAGGC
GACAATTTGATCCCTAATCCCTGTATATACACTAATACGTCAACTTTGTG
CACACACACACTTAATGTGGTAACCTGCCTCAAAGCATTTCTTATAGAAT
GCCCCATATACTAGGGTGGTCCCTAATGTTTTCTACCTAACAAAGATAAA
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TGCTGTTGTGTGAATTGGGAAATATATTCCACTCTAAATCATCTTAAAAG
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ATCCCAAAATGGCACTTTCTTTTCTTTCAACAATTTTTGTGTCTTGCAGA
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GCTCCCATTAGAAGCAAGGGTAGTGATTCTGATAGGAAACTTGGTTTTAA
GGACGTGGGGGACGTTATTTCTCCTTGTTACCAACCATTTGCCGTTTGGA
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GCCATGGTAGCTTTCATTTTGTCTGGAAGATGAGTCATTTGTATAGTAGG
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CTAACTTGAGGCTTTTTGTTAAGCACGTTAATCAGATTCTTAGGAGATGC
TTTCATGTACTGCGTCAGAGCTACAATAAATCTGAGAAAATGCATTTTTT
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TTTTTGTGTCAACTCGTACATTGGTAGACAATGAGTAATTAATATACTGT
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