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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s338 | supercontig | LSalAtl2s338:105537..116654 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006188 >EMLSAP00000006188 ID=EMLSAP00000006188|Name=EMLSAP00000006188|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=165bp
MSINNKLRLNITLEGSRTPNYVSPCNSAPGTPLRGLSPSRSATPSPYDAP
PISPSVRRARELNRDIRRGRNFRENSLSRRTPLRSDSVPRPPGTELXFTI
KPSIGGRKGWKIMPEETESEPITDPVILKRVVDMIKEMEMNGSVIPERLS
IRKVVSRQMVTSTGK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s338:105537..116654- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006188-702035 ID=EMLSAT00000006188-702035|Name=EMLSAT00000006188|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11118bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s338:105537..116654- (Lepeophtheirus salmonis)
TCACTATGTCAATAAACAATAAACTACGTTTGAATATCACATTAGAAGGC
TCCCGAACACCCAACTACGTCAGTCCCTGTAACAGGTAACAACTACCTCC
TTCCTTCAGATAATGTATTTCTTTTGCCATAAATCATATTATTTCAGTGC
TCCCGGAACGCCTCTTCGTGGATTATCCCCATCCCGCTCTGCAACTCCCA
GCCCTTATGATGCTCCACCAATCAGCCCCTCAGTTCGCCGTGCACGTGAA
CTCAACAGAGACATTCGACGAGGTCGTAACTTCCGCGAAAACTCTCTTTC
ACGAAGAACACCCCTGCGCTCTGACTCCGTGCCCCGTCCTCCTGGCACAG
AGTTGAMCTTTACAATCAAGCCCTCCATTGGAGGAAGAAAGGGATGGAAA
ATCATGCCGGAAGAGACTGAGTCGGAGCCCATTACGGATCCAGTCATACT
TAAAAGAGTTGTGGATATGATTAAAGAGATGGAAATGAATGGGAGTGTGA
TTCCAGAGAGATTGTCGATACGAGTTTGAGGATTTTGTCGTCATGTTATT
TAATTTATGATATATTACGTACTCTATAGAGGTGTATTACATATGTAATG
GTGTTACTATGTAAAATACATATATGCTAGTATAAGAAAAATGTTTTATA
TAATAAGGACTCTTCCTTAATTCCACTTTTTTTTTAATTTAGCAGTTGTA
TATGTACATTAGGGTGACGATATTTTATGATATCATATCCTTGAGTTATT
TTACAGATTTTTTTTTTTTTAATTTTAAAGTTATTGCAATTTGAGCAAAA
AACACCGCACAATTGTATCTTCGCATGCTATAAAATACGCACATTTTCCC
ATCCTTTCTCATATTTAAAGTATACATTTGAAAAAATAACAACAAAATAT
TAATTTGTATCTTATATGTTTACAAGCAAAACAAGCCATGGGTAACTGTA
ACCATAAAAAAAAAAGTTTTCAGTATCATTTGTGAAATATTGGATTGGAT
TGTAATATCGAAGCAGAAAATAATTTTATATCAGCGTACCAATTGAGAAA
CACTACTCTAACACGCTTATTAAAAATATTTTATTGATATGAAACAGATA
AATATATCCCTTACATATGTTTAGGAACTAAGGGTGAACTGGGGTTAGGC
ATCCATTGATATTTYTACAAGATATCTTTTTGTTCTGAAATTACCAATTT
AAAAAATAATGGTATTACCATTAAATTTCAACAAGTTAAATATACACTTT
GTTGAATAAGACATGAGCTTTTTTTATTTTTATTTGTTTGAAACAAGGCA
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TATCACACCACCATGCAGATAGTATCGTTATTTTTTTTTATCATACCCTA
TTATGTCGAAAAAATGGTTAAATATGAGATGTATGCAGTTGAACTTACAC
TTATATATGCATAATGTAAATGTCCTTTCTTATGAGAGTATGAACTGCAC
ATTCTATAGCGATAAAATAGGAACATCAGCGCATATTTTCTATGCGTTTA
ATAGAGTGAGTCCTTTGGTAAGAATGTGTAAAGTAAAATTAAAATAAAAA
CCACAAGTCTGGACATCAGAAACGGATTGGGTAGTTGCCACCGATCCGAA
TCTTCCTAGGGCTTTTAATGTTGAGGCCATCATCAACAAAGTGCAGGTAA
TAATATGTTCTTGGAGATGTAAAAAGCAATCCATACCAACAAATTTGGAA
GGGTTAATAGAGCAAAAACTCAACGTTTTAGCAAATTTTTCCGCAAATGG
TCGTTAGTTCGTTTTTTTGGATAGTTGTATAAAAGAAGAAAAAAAGCTGT
GATTTTTATTGTCGTTTTTCATATTATTGTTTTTCCTTTCACCCATATTA
GATATATGTAAGGATAGTGTTATATTTAGTTAGAATGTTTTGTTTTTTTA
TAACTCAGAATTATCAATATAGGCATGACTGTTAGGCTTTAAAAAAATTA
AATATTTTTCTCTGGAAACTACCAAGGTTCAAACCTACGCACATTCAGTT
TTAGAGAATCATTTCTCCCGATCGCGTTATCCACTGAACTGTATCGTTCC
ATCATGAGTTTCAATGTTTTTGTATTTCAAGTGGCATATCGTTAGGACAT
AATTTGAGGATGAGGGCCCGCATGCAATTAGCAATGACATTATATTTTTT
TGTGAGGAGTGGGAGGCTTGTGCCCCCCCCCTCCCCCACAAAAGGGGGMA
TCCAAGTACAATGTAGGTACATAGTCAAATGATTTAATAAATAAGCAGGC
AAGATATGTCGATGTAAAAATATACTCAACCTTAAATGGAACAGGAATAC
ATTTAATGTAATCCTTCAGCATTTAATTTACATATTGTAATACTAAAAAC
ATATCTGCAAATAATTCATTATTAATCTACTTTTTTCAAATTTAAGCAAT
AAAAAACACATATTTAGACATAGTAGACCTGTTAATGAGTACCTACTCTT
GTTAGCTTTCGGTCTCAAAATCATATACGGCTCTGAGACAGTTACGATTT
TTTGCAAATCGAAGTAATTCAGTTATTTAATCCTTTTTTAGTGAACTGTG
ATTTTCATTACCACTAATTTTATAAATTTTATTCAAATTAGTTTAAAATA
GATTTTATTGCCGCAACTATTATAAATGGTACTTAAACATCGTTTAAAAT
AAATGCAAGTTTTTCTTGTCGTAAAAATTTATTTTATTGTAAATTTTGCA
ATTTTTAATATAGATCGGTAAATTTCTTTTTTCCTTTTGTCAGATATACT
GGTTATTATTAACTCAATATTTTATATATGACACTCAACTTCATCAAAAT
TAATTAATCCATTTTTAATATCTAAAAATCCTTAAAAATAATTAATACTT
TATAAAAAATTTCATCAAAATAAAATATTACTCTGTTAACTACGAATATA
ATAATCACAAGTTCAATTTCGCTATTATAATTTATATACAAACTAATGTT
TTTTAAGCATTTTAATTAATAATTACAAGTGCAAAATGTATTAAATAGTT
TGGAAATTATTATCAATATAGGCTTTGGGGTAAATTTTTCCCCAGGCCAC
TTATTAAATAAAAAAGATGTTCACCAGCAGGGGGTGAAAGAAGTTTGCTT
TGAATTGGTTTCATTTTAAATTCCATCTAGACCAATTCTATAGATGATTT
TTGATGACTTTAGTTGTGCTTCAAAATTATGAACATAGGTAGAATAACGT
TATATCAAATCTGATACGGTTAATAAAAATAACTTAAGACCAAACTGAAG
ATATATATGTATTTCTATATTCGGTCTTGGACCAAGTCTCAGCTCTAGCT
CATAAACCTGCATATACATATATTCTATAAGTTAATTATATTTAATCTTC
TTATTTAGACAAAATACCTTTCAAAAATTATCATTTAATTAAAGTACTTG
TTTTCAACACTGAAAAAAAAGGTTATTTTGAAGTGCATGAAATGATCGAA
TGTGAGATTTATACCTACTTATGTGTAAGTGATGAGACTCAGACCAGAGT
TTTGTTCTTTTTGGTTTCATTTAAATGATTTTTTCGTTTGTTTTTTCGAA
ATTTGATTGTTTTCAAACTCCAAACCAATTCATTTCAATTTCCGTCTATG
GAGCAATTTTCTTCCCTATCCTGATCTATTAATTGTACAAATAATAAAGC
AGCAAGAGATGTGCCCCAAATGCTGGAGTTATCTCTAGGTGGAGCTACCC
ATCAAAGTACGTTTGATCCTCACGGAAGTGGAAACAATCTCTGCAGAAAT
TGCAGCAGATGTCCTGGGTTCTAACCTACTAATAAATAAGATGGCAAACA
TAATTTTCGCGCAAAATTTGGAAAATTTATAGGTGCCCAAAGACCAGTAG
TTCCTTTTCAGATGAGAGCTTCTTTGATGTCGTCTACATCTGAAATTACA
AGATGTTTTAAAAAGCCAACCATGTCCTCTTTTCTAGGGTACCTGGATAT
GAGAGAAATAAAAAGAGATGTAGACGGTGGTATTAAAGCTATGAAAAACA
AATATTTGTGAGCGGCTGAAAAAAGGTTTAAGTATTGCTTACTTTCTGAA
ACACTGGAGATGTGTTCAAAGTTTTATAAGGATCGAGGGGCTTTTGTACT
TTTTGCAATTTAGTTAGTGAAARGATGGATCATCTCTTTTGGTAGTGTGA
GATATTGAAACATTTGTATGTGAGAGTTTCACAGTTTTTATTTGATACAT
TTAAGGTCAAGACTAGGCGTGATGAGTATTTAGGTTATTATAGTGGAAAA
GAAAAATATTTTATTAGCGCCAAATTATATATGCAAAGAGGACCCAAGGA
GACATACTCCTCCGAAGAGCCCCTCTATCGAATTATATAGCAAAGTGTTA
AAGGGACTCAGATGACTTATTTTATTTTTGTTTTTATCTTTTAAATTATT
TAAATTTGTGTGTTTGAATTTTTACTGTGTTTTTAATTGTTCTACATTGA
TTTAATTTCAAATATGTATAGATATATGCTCTTAAATTTGTTTTATAAAT
TATAAAAATGAATTGTAAATAAAGCTTTTCCTTTAGGCCAAGAAAAAAAA
TTGTACAGATATGATTAAAGCAACACATTAAATTTGAAATGACGGTACTG
TGCCGATGTTTATAATTTTGAAACACAGATGACGTCATCATTAATCCATC
TATGGAATCGATCTAGAGCTATTTTTAAATGAGACCGATCCAGACAGATT
TTTTGGGGGGAAAATTGGGAGTGAATTTTTCTTTGACATCGGTCCAGACA
GAACTTTTTCAGAAGAAGTAATTAGTTTCTTAATGGATTTTCAGACCAAA
ACTCAAAAACATATACTTCTTACTACCTACCTAGAATTGACTAAATAGAA
GAACTCAACATAATCAATTATGTTTAAGGGATGCATAACTTCCTTCATTA
TTCATTGGCTGCGATCTGCTCTAGAGAATCCATACACTATAAAAAACATA
GCACCATATGCGATTAACATTTTCAGTATTGCATATAGAACTAACGGGCG
TGTACCTGACATTGCTTGTATTATTTGATAAACTATAAAATAATTTTTTT
AAAGCCTTTGTTACCCACATTCATTGTTTATTTAATTTGAAAAAAATTCC
CTTTTGTATGTATATATGTTTATAAATAATTATGCCCAAGTTTAAATTTA
AACATTTATTTAAAAAGTAAAAATCGTTTTACTGAAGGCATAATTTATTA
TTAAATTCTAGAAAATTCTAAATGTTACAAGCACCGCTACTAAAGAACTA
ATTTTAAAACAATAACTGTTGTATTACCGTCTTGCTTTAAGATATAACAT
CACTTTTTAACATCAACTAATCATTCAACGTATAATAAATCTTGATTTAT
ATTGATTTTTTAAATTATTTTATCTTCTTTTTTTTATGGGCCACTGAGTG
CCACACACGCCCGATCATTATTATTTTTTAGATCACACAGTTCTTAGATA
TTAAGAGCACACACAAAAATGAGCCCACCACAGACAAAGTTTGATTTATT
GATATATATATTCTAATCAATAGCCCAAGTAAGCCCAAGTGAAGGGACAT
ACCAGCATTAATAGTCATTGAGACATGCTAATAAGATGTCAAATCTAATA
ATTACATACATTAAAAACGCATATAACCTGAATATGTAGTTCAAGGATTA
TCAAATAGGTTTGGGGAAAAATAAATACCAAAAGTTTCTTCCAGGACAAA
CTCTCAAGACAAAATTTCCCTCGGACAACCGTTCTCCTACATAAACAATC
CTCCGTGCCCCCGGCTCCTTTTAGTTTAAGCAAGGCCTGGGCCAAGATAA
ATGTGCGGGGCTCTATTTCTTTTCAAATGACTTATTTTAAATAAAAGAAA
TTAAATTCGGGGGGTTTTTAAATACCATTTTTAAGTTACGAGTTCTTTCT
ATTTTTAAAACAGGTAAATCTTTTTTTCTATTTTAGTGATCTTTCTATAA
AATTTTATACTTTGAGTTTTTACACTTTAGCAAGATTATATTTAGTCCGG
GGCTTCCAGTAAAGAGTAAGTCATGGGGCAAGTACCCCCATTCAATGCCG
ATTAAAAACTTTTCTCTAGATATTTCGTCTCACTTTTGGCATTTTAAGAG
CTAAATCATTGTAAGCTCTTGTCAAGTATTATGAAAAAAATGCTAAACTT
TGAGTTTTCTCCGTGTATGGATTTGTGAAAAAATGTTTTATAGCAAATGA
AAATGACTGACTTCACGTTATAAGGTTTGAATTTGTATCATAAGATGTAA
TTAAGAACCAACCCAATGATATAATCGTAAAAATATTATTTGGGTATATG
TATTTAATGTATAAACGATTGAAGTCACTTCATTTCAACTACAAGAGGTC
ATCACAAAACGTGGGTCCAAACAAATCGGATTTTGCATAACGCAGTAATA
GGAATTATTCTCACTCCCTGTGTAGTGCAGTATATTCTCCACATATTGTG
TTCTTTTAGGTAATTATTTATTATACAAACTTGCAATTAAAAATTATTCT
GAATAAATTTTGTTCAGTTCAGATTATTTTAATTTTACAGAGTGAAATGA
CCGGATTAAAAATCAAGGGATGACTGGATAAAGACATAATTCCACAATTA
TTTTTACAAGATTGTTGTCTGGAATACATTATTCATCATACTTGATTATG
AATAAAATGTTTTTAAATTCCTAAACCATACTTTAAAAAAAAAAAAAGGA
AAAAATCTAAAAAGWAGACATTGAAAAATGAAATATCTCCCATTTTACGA
ATTTTAGTACTAAAAAAGTACCCATAGAACGAGGATTTTATATAACACAA
GATTTCTTCTTCCCAAAAACACAATGTATCTAGGGATGGGGATGATTTCG
TTATTATATAATCATCCAAGATAACTAACATAACTAAGAGTTAACATTTT
AGTAAGGGAAAAAAGAGAGCAAGGAGAAGGTGGGAGCAAGACATATGGTA
CTACTGAATTAAGACTTTTGTTAACCTTACCTGCCTTTTATATGACTTTC
GGCCAGAAAATGAATTACTGCTATTAATAAGAGAACCTCCTACATTTTCA
ATAGTATTTGTTCGGAAAAATATTGTAATTAAATTTCAATTTATATATAT
TATTTTATCATTATTCACTTTTTATACAATTTACATCAAAAATAGGGGAA
AATACTTATTCTAAAGGGAGTTGTTAACACCACAATGCCCTATTAAAAAG
GAACAAAAGTTTAAAAAACAAAAGAACAATTGTTTATCTCTTTCTAATTT
TTAAACGATTTTGTTACAAATTTTTAGAAGAATGTCTAGGAAGGGAGAAA
AAATAATGTTCATAACATTTCCTTAGATTAGTTACAATCAGTTGTAAGAA
AGAAAGAAGGAAAAAAGGATATAAGCTAGGACATTTGCTAGAATTACTCC
GATGCCGATCCCAATTCTACTCTGAGTCCATAAAGGACTTACAATTACAA
CTCTGCAACAAATATTTAGGGTAACACTCCATCTTTAATGAGCACCCACG
AATATTCAATCAGGCATTGAATATAATTAAATCTATTTAGGAAAGGATGT
TCACTACCAGGAATTAAATAATCATAACAACTGCTAAGGAAAATAAATTT
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CTGTATATCGACCTCCTTGACTGGTATAGTTCCGCTATTATTACGTATGA
CGTAATATCTGTCAGTCGTGCCCAGCAGTCGGTAACAACATCAAATTGAA
ATTTCTAGCAAGTACAATTAAATGATGACATAACCTTGTATTTATATTGT
CCTTGGTTACAATTAAAGACACCTTTGTTGTGTGTGTTTTTCTTATTTTT
AATGGGCCGTCGTGGTAGTAACTTATGTCCCTGAAGTCAGTGGTATTACC
TATCTTTGAAATAAGTTGTTTTGAAAACGTTTTTGTATAAATGTAGCCTA
AGATTWTTTATCGAAATGTAAAAACTCCCTCCCCCCCCCCCCTCTGCCAA
TTAAGGCCCGCACTTTTATTAGAAACACAAAAACTTATCTCATTTTGTAT
TCTTATACTATTTTTAATCATATTAAAAACAAATAACTTTTTTAAAAAGA
AAAAAATATATAAATATAATTAGTTTTTAACTAAATGCAAACATACTCCT
TATAAAAAGCCTCTCTTTAATAATGAAAAACGAAAAAAAAAAAGCTTATA
ATTGTTTTAGCGTAGTTAAAATCAAAGATAATTTAAATTTAATTTTAAAA
TTTGGAATTATTCTTTAACTCCTTTCTTTTCTTCTATTGCATACATGTAT
TGTGCTTTAAAAAAATATCCTTGGAGACAGTTTATGTTTTGTCTATGACT
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TATTTGGATGAAAGATAATCTATAGAATCACAAACGCAATTTCCTCTCCT
GTCAAATAATTTTTGGATTACGTAGTGCGGCATCAGTCGTTAAACACTTT
TTAACCTTTCATTTATGTTTTAATAGAAAGTTGTGAGGTATGTCTCAAAA
CTATTAATTATTTATGCATTTTTTGACTATTTTTTTTAAATAAATTGTTG
CAAAAAATAAATATTAAAACTACAATGTTAAAATGGAAATTTTAGTGGGA
AAATCATTGTGCATCTTTTAGTTGGAGACCCACCTTATGACATTTCCATC
CGGTACTGCATCTCTAGAGGTTCCATTTAGGACATTAAAAATATCTATGA
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TTGTTCGATCCAATCCAAGGACTTTGTTACTTTTTTCAAGTCTAAGATAT
CTTAAAATCCACAAATTTCAATATGAGATTTATCAAGACAGCTGGAAGTA
TCAGAGGCAACTTCAGGGAAATATGTTGCCTCTCCCACACGTCTAACACC
ACCTAGCTGTATATTAGCAAAAAAGTTTGCGTCTATCGGATTTTGGAATA
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GAAAAGGCTTGCAGGAATGGACAAAGACTTCAAAGATGTTCTGAGAAGGA
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GCATCCAGTGAAGGTTTGCATCGAGACAAAGGGATGAGACTTAGGAATAA
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TAGTCTTCCCTGTTCTAATTTGTTTTTGAGTTGTATAAATTCAGTCGATC
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GGATTTTCAAAATCATTTTCCGAAAAATTTGAAATTTTTTCGAAAAAAAT
TTATTTTTTGAAAATAGCTATGGATTTTGAAATTTTTTGAGAATGGTTAT
GGATATTGATTTTGTTTTTTCAAAAAATGAATGAATTTTGGTGATTTGCT
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GAATTAGCATGGCGAAAATAATGTTTAAATTGCAATTGCAATTCTTATTT
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TATGCTATTTACTAAAAAATTTAATTGGATTTTTCAAACAAATTTCAAAA
TTTTTTATTTTCTTTTTATAACTATGTATTTGTTAAATTTCTCTTCAAAA
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AATTTAATTTCTATTTTTGAATATTTATTTTTTTTAAATGTTTTTATATT
AAAAATTTAGTTTTAATTTAATACAAACTATCAATATTTTTCTGATATCC
TCTCGGGATTTTGAAATCTTTTTCCAAAAAAAAATTAATATTTGATTTTG
ATTTTTTTTAAATTTAATATATGAAATTTAATAAAATTTAATGTAGACTA
TAAATATTTTTTTGATAACAGCTGGGGATTTTGAAATCTTTTTCCAACAA
ATTTAAAAAATAGAATTTTTTTTTACAGCTGAGGATTAAACCCCCTACAA
ATTAATCTATTGATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNCGTCATACAGAAAAAAAAGTTATATATGTATGTTCTTTGCAGT
TTATAGATTTTTAACAACTAGTCCAGTCTTTTTCTTAACAAAACTTGATT
ATGTTCTTTTATAAACAATGTTACTTTCAAGAAAAGTAGAACTTTAGTTC
ATTCACTGTTTGTCTGTCAGAATTAGAGAAAATAAAGACTTTAGAAAGTA
TTGCCAATTTATTTATGGGTTGATTTATGATGTTATATTGTCAATTGTAA
TTATCTTTCTTTCATGTTCTATTTTTTTTTTTTTGACAAGTCGTCAAATG
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