EMLSAT00000006457, EMLSAT00000006457-702304 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006457
Unique NameEMLSAT00000006457-702304
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s353supercontigLSalAtl2s353:270130..284407 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006457 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006457EMLSAG00000006457-689223Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000028192EMLSAE00000028192-737120Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028193EMLSAE00000028193-737121Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028194EMLSAE00000028194-737122Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028195EMLSAE00000028195-737123Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028196EMLSAE00000028196-737124Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028197EMLSAE00000028197-737125Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028198EMLSAE00000028198-737126Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028199EMLSAE00000028199-737127Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028200EMLSAE00000028200-737128Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028201EMLSAE00000028201-737129Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028202EMLSAE00000028202-737130Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028203EMLSAE00000028203-737131Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028204EMLSAE00000028204-737132Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028205EMLSAE00000028205-737133Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028206EMLSAE00000028206-737134Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028207EMLSAE00000028207-737135Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028208EMLSAE00000028208-737136Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028209EMLSAE00000028209-737137Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028210EMLSAE00000028210-737138Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775616auto775616Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006457EMLSAP00000006457Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006457

>EMLSAP00000006457 ID=EMLSAP00000006457|Name=EMLSAP00000006457|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=2583bp
MIFKYNRDKLRYFWNTISSIRECEWNWSPLNPNVGSDRERLSPQERRIYA
IQAVQACIREQIQDLLSGQNPTFYSPNRKDWNYVQYDPSYGLVPVEDSLM
ALGAVKTSLYVRGSQNKYTKIMFVLQMILKLLMDDTRATQRDMYYQRAKD
FKNQHELNESLFVISSMLQISRYDLHILTTSKGLIYGDFNYVDPDNFHLV
DCRKSVTNVPDNVLGIRQMSSNAKLCLVVEKDAVFQRLVNSNLLHIFNGE
VIIITGKGVPDVNTRQLLHRIYQCFKVGSVCMCRHRYTKSLHFVLLFTFL
YLLEMNEPDVRRCHSLLNRPYIDDFMIMQIEYMLEVNKKAEIQSESILSY
IRKRRSCSADILNSILDMLDSDPLKLYRSTIFSLARSLAKIQDVEWDRIR
DPLFSQCPSRDSVELTEKNQDALIALGIFLLESKGAWKNKIVPYLLHVES
QLYRTKVLVRKSPDGKVPVGESFSFSLNTLLSDIAVNCLDYRSDIFIAQI
TLMEKLVKIIEKGRENQNEDTHHSEYLCCTVVPVLLGTSRAMGRFSHSND
FLLNKLFPPKPQVQVPPSISTVKNYNKSHFNNFRSIIPKSLSRTFQNHRE
IINSQSVDSIVDLSFRPSLRADLMVYQSHRQSLSYQKKLAFQSQQSVQPY
DPTNYFFHKYGSSFHQIQAPLTKTCTSHGMFDTCKNKLAFPSEHIESLFR
LXKKTLNKXVLEFLDNLCVETFDLESLKQWPYKTFLEIVSLSMISVLREV
LHTSHGLSSSFIKEIQIFVKKLFLSGQTELQTKDSEINGELEEHIPSSEK
PVVNKFKLNVQTNAVCVDILVYVTRDEKGADSLVSKLTDKISTTSSHRLI
LAHMPLIMVCIEGLGKMSEKFPSLAKQSSDCLREFLTNPSPILTRLYRHN
LDYTKXLPNITXSDTESNQSTQNIAENKKVNACYVAFEKLRDCAIENLCV
CLKASLDRDYNSIPALVSAVTTRLFHPDSVKDKNWNLSSANTILALGHIA
VILRNSEDNTKAVLKFMLQWFDTSPSEQDTMLIDQMGCIAISRTAIDGIY
TEIMKKFKEIIKEASQTVYGGQHHSATDRRNKYQRCSGAVINALGNIAAN
IQGLILLNDFLIKMMELYVNIGLEVKKLSDKTERGLLKASNSAGNLGVLI
PVIAVLIRRMDDKDLSNPNNRLKKFFSDFWLYAVVFGFTKDDNGLWPQDW
YDGVSEIAAKAPKLTFSTGEKHEIRVMKVTQAISTEGVTYAELQEMKTQL
LALLDNPPVMVNLVPKYXSVSRHYNIAVDTYFIYVFFYYYYFRFPIIIYL
TSVYWLXYLRLKMVTXVSSFNKLFDYLEDKAIQVDKNGIYECISSIVTKL
FSEYCQTMAEKSKTKAXXRNLEIIAVILLIEFNNPNRNIRKRSDVFLSEL
VDKFPHLLWSKAVLFGMLNALQQLKSSINNEDSQEVEIGRIKRKVILMDX
LQERXEILLDFAQRIKQFIKTSMEWAPGTVQSHLQEYINTVTQINYYNHA
GVSLASECIQNLSSGLERSGTLRSTGLTQINSGKIDASLFLSAMTKRLSN
TSSVSALLYDKSGVKRYNVIKSFFEELKEGASLASGLDSSSDSIEKGKKQ
FHNAMWKMTASLILIKPAIDDGLLFEITRAPLKLFEEESMKTVVECWNWL
LSARPDMEMPFLQEMIAAWHSAQHANLGLFAKDDVDASSPLAPDEKMKTE
VKPIRPIVAPHDIWIRFIQERIEIAKYCNRDQIIMFTLMLQRTLAIKVGS
AECLMTRHSSTAGTRFRLLTCGMSLLQGDVLHKSLAKNVLRQRIYSVALD
YFCSDKKYPTQTGNELSEDIQIMLKFWTVMHADKKYIKSHMVGDLDGLVS
ERNFTHANAGGYSITGGSIAINSSISNYNSAYNFDNRSISSEFGRNPIVT
STIGGGAGNSNIGWMNTVPLASNGGTNTLTKRSVSRQQQRHFIANDSLVK
DYTKKRWLILSLLSVEIETLVTNQNPLIETREALASLLTNRDYGTTAVGN
VGRQYEDAMKFLDDVRNRTTDKSWKENARNAWDVSPALAVFLPSRFKSVV
LENDVTILVQAHPTEVCHLDKALDFFLTKDSIENDSSILPYILTWKRCSP
LKALSLLCPRTIPTHPLTAQYAVRVLSSYPSEAVLFYIPQLVQATRWDDL
GFVKEFIKNISKKSNLVAHQLIWNMETNMFTDEEGLEKDPEMYERLVPLR
QAIENGLSGAAKKFYTREFDFFKKVTQVSGKIKEYPKGQQRKTACVKALQ
EIVLQHGCYLPSNPEALVLDIDRTSGTPMQSAAKAPYLARFKVRRLGINK
LEQKGIEYSENEDESVISNDDQHAEYWQAAIFKVGDDCRQDMLALQVIEL
FQYIFRQAGLDLFLFPYKVVATSPGCGVIECVPDAKSRDQIGRKVNIDLH
QYFIKEFGEGQKYKKARRCFITSMAAYSVIGFILQIKDRHNGNIMVDKHG
HIIHIDFGFMFESSPGGNLAFEPDMKLTTEFVEIMGGKMEASGFRRFMXL
CVQAYLAIRPYSKDIIHLVQLMLDTELPCFRGQTIEQLRGRLQPTASDLV
ASSYMISVIKNSFLNFRTRAYDMLQYQQNSIPY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s353:270130..284407+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006457-702304 ID=EMLSAT00000006457-702304|Name=EMLSAT00000006457|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14278bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s353:270130..284407+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAATTCATGATTTTTAAGTATAATAGAGATAAATTAAGGTATTTTTGGAA TACGATTAGTAGTATACGTGAATGTGAGTGGAACTGGAGTCCATTGAACC CTAATGTTGGGAGTGACAGAGAGAGATTAAGTCCTCAAGAGCGTCGCATA TATGCTATACAAGCTGTCCAAGCTTGTATAAGGGAACAAATCCAAGATTT ACTGTCTGGKCAAAATCCAACCTTTTACTCTCCTAATAGAAAGGCATTGA CATTTCAATATTTTTCCATCATTTTTTAATGATAATTAATAGAGTGTTTT CATGTGACGTTAGCATTGTTGATGTTGTCTATTTTGGAGTCCTAAACAAC CTAGTTTTATAGCAATCAAAAACCTTTTTTCATTCTTATTTTAGGAAATT TGTGAATTATTGGATCATGTCAAAATGAGACCAAAAATAAAGACCTTAAA AGTTATCGCTCAATTGCCTTGTTTTAATATATATGTGATCCTAAAATGTA TGAAAAATATGTTATTACGTCGTTATACAGACTTATTTCCAGATTCTAGA TAAAAATTAACTATTATAATGGAAAGAATAAGATATTTTTCTTTTAATTG AAATACTTTTCTCGTCCCTAATCGATGGAAAAAGTATAAGAATTGTACAA ATTTAGACATTTCATAGGGATTTTCAGTATATGTTACCTTGATTATGTTC AAATATCCGGGTGTATCATTGACATCAAGTAGTATTCAATACGGGTGTTA GGTCTTTTTTTTTTAATTCTTACAACCATTTGTTAGAGTTTAATAAAAAT TTCTTGGATATTTGTTCATTCTATCAAGTAAATATCAACTTTGAGCCCTC AAGATGGTGTTTACTCAAATTATGATGCAATTTAAAACGTCAGTGAAAAT GTTTTATTATTATATGCACACTATGTAATTAGTAATTGAAATCTTAATCA TTCTTCATAATTAATTATGTAATACAAAAAGGATTGGAACTATGTACAAT ACGATCCTAGTTATGGTCTTGTTCCTGTCGAAGACTCTCTAATGGCATTG GGAGCTGTGAAGACTTCACTCTACGTTCGAGGCTCACAGAATAAATATAC TAAAATTATGTTTGTTTTACAAATGATTTTGAAACTTCTTATGGATGATA CGAGAGCAACTCAAAGAGATATGTACTATCAAAGAGCCAAGGATTTTAAG AATCAACGTAATTTAGCTTTTATATATTATATTAATGATGGATTAATTAT AATTAATCATTTTCATAGATGAACTGAATGAATCACTTTTTGTTATATCA TCCATGCTTCAGATTTCCCGATATGATCTTCATATATTAACCACCTCTAA AGGTCTTATTTATGGGGATTTTAACTATGTCGATCCTGATAATTTTCATC TCGTTGACTGTAGAAAATCCGTCAGTAAGACTTTTCACAAATGATATTCT AAACAAAAAATTAATTTTCATTATACATATTATTAGCCAATGTTCCAGAC AATGTTCTTGGTATTCGTCAAATGTCATCAAATGCAAAATTATGTCTGGT CGTGGAGAAAGATGCTGTATTTCAGAGACTAGTGAATAGTAACTTATTAC ATATATTCAACGGTGAAGTTATAATAATTACTGGCAAAGGTGTTCCAGAC GTAAATACAAGACAGTTATTACATAGGATTTATCAATGTTTTAAAGTGGG TAGTGTTTGTATGTGCCGACATAGATACACAAAATCCTTACATTTTGTTC TACTTTTTACTTTCCTATATGTATGTACATATAATAGTTGCCAATGTTTG CGCTGGTGGATGGAGATCCATACGGTATTGACATTATGTTTGTTTACAAA TATGGATCACTTTCGATGGCATGGTGTTGTGAAAATATGACCGTCCCTGC ACTCAAATGGATTGGGCTACATCCAACGGATTTTGAATTAATGGAGTCTA ATCAAGTAAATATATTTTATTTGATATTATTACTCTTGGATTCCTTAAAT ATGGGAGCAGGGCTGGTTAAAGGGGTATTAGGGGGAAAGTACCCCCGCTC TTGATTGACATCGGGTGTTACGTAAAATTTTAAATACCGGATGGAAACTT GAAACTTACACACTTAGGAAAAAAAAATAGTCTGCCATTCTTTAAGTGTA CATTTAACAAAAATATCTATTAATCTTTTTCTGATACATAGCCAATGGGA ATGTAATATTGATTTATTCTATTCGSCCGCCATTGGCCCCACAGATGGCG ACAAATCGCTTGTAAAAAAGAGTTACAAGTATTGCGAATGAAGTTTGGGT CCATGGCAGCCCACTCCTCGTCGAAGGAGGGCTTCAATGTTCGGGTGACG GATGCTACAGCCCCTCCTCTCGATGTCCCCATCTAGCTGAAAGTTGACGT TACCATCGGGGAAATTTGCCTGAGCCCAGAGGAGCAGGTTGGCCTTGATA ACGTCGATATACATGGATGCCGTGAGCTTGTAATCCTCTAGGAACCTCAT TATAGGCACCACAATACCACTGAAGGCATTTTTCCTGAGTCCCCTTTCCT TTCTATCGTCTCGATGTGGTCTAGCCTCTTCTTAACATTGTAGATGGTTT TACGAGCTATTCCTGTCAGCCTGGCTACCTCTGTTAGAGTGTGACCGCAT GAAGAAGAATTGATGCCCTAAGCCTTGAATCTCGCTGCGATGACATTTCT AGTCTGATTTCAAAAATTCAAAAGGCAGCAGGTGCTTGAGATATAATATT ACAGGCTTACCTCATTTCCTCATACAGGACCTCTCAAATCAACATAATAT ATGTGTCTATGTTTCAAGTTTCCAACCAGTATATACAACAAAATGAAATT TTATAAAAATTCCATAAATAATAAAAAGAAAGGTCATTATGAGAAAGTAA ATAAAAATTGTTTTTCTACAAAAATGTCAGTCAATGAAATATGCTCAAAA TTGATTTTTTTAAAAAGGCCATTTAAAAATATGCAAGGAGAGGCGCTGCA TTTATTTTCTAAAAAGTAAAATGATTTGTTTTTTAAATATTTATCTTTGC TGCAGGCTCTGCTCATGCTAAAACCGGCCCTGGATATGGAGGAGTTCCTA ATTAAAATGTACTTTTACCGAATATCAATTATAAATTCATAAGATTTAGT CAAAGGTTCTTAGCCTAGAAGCACTCTTTCTTACTATATTCCTACTTATT GGGGGAAAAATCCGACCTCCCGGCAGTTTATACTTAGAAGTGGTGTCCAC AAGGTAGCCTGGAGATCTAAAAAATAAATCAATTACCTATATAAACGTCC TATTTACATAAATATTTCTAATTAGGATGACCAATTGTCCTCTTTTCTCC GAACATGTCCTCTTTTTATATCCTACCCTGCTACTTTTTTATAATTTGTT GAAATGTCTTGTTTTCTAGATTATGTCGATTTTCATTCGATTTAATATAA AATTCAAATTACCATAATTAAAAAAATAAGATTTAAAATATGATCACCCT AATATAAATAAATTGATATTGTGATTTGTTAATCTATTCAGCTATTGGAA ATGAATGAGCCCGATGTACGACGATGTCATAGCTTACTCAATCGACCCTA CATTGATGATTTTATGATTATGCAAATTGAATATATGCTGGAAGTAAACA AGAAGGCGGAGATACAGTCCGAATCTATATTATCATACATAGTAGAGAAA ATCAACTTTGGTGAATATATATAATTATAAGTATATAAATTATTTAACTT TGTAAAAATAGATCATGATACTTGCGACAAAGGTATAACTACGTATTAAT 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TTCAGTCCAGTAATTCTACTATTTACTCTCCTTTTCAGAATATTTATGTT GCACAGTTGTACCCGTTCTTTTGGGCACTTCCAGGGCTATGGGAAGATTT AGTCATTCCAATGATTTCTTACTCAATAAACTATTTCCTCCAAAGCCTCA AGTTCAAGTTCCCCCATCCATATCCACAGTCAAGAACTACAACAAGAGTC ATTTCAATAATTTTAGGTGAAGTTCCTTCTTTATTATATCTAGTTTCTTA GTACTTATATCATTAGTATCATTTCATATTCACTAATTTTTGAATTATGG AAGATTGAGTAGATAACTTAATTAGAAAGTAGGCTTAGGATCATCTATGT ATGTACTATTTGTGGCTTATGAATAATGTTAGTACCGAGKAATTATGATA CTTCTCAAGGCAATCATMCTCTTTCGAAGACAGGCAGCAACAACAGCAGA TACAGGATAAATCCCCTATAAATCAAAACCATATCCTAGCGAACAAAAGC CATCGACAACATCAGCATCGACATCATTTTTACTGTCATCCTTCTCATTT ATTGCTGGACAGGTTAGCTAGACCAGTAATCAGAACTTGAAGTTGCATGA CCTAAATAACATTATCCTCTTTTTCTCATTTCCCACAAATCACTATTTAA ATCTTGACCTTATTATGCACTATATACATTAGCACACGGCATACTCACGC TGTTTTGGATGACATCAAAACCAACTGATTAATTTTATTTATTTCTTTAT GACTCATTCTTTTAAATTATAATACGAAATTCTTATTAGTCCTTTGTCGC AAATTCCACTTAAAGTATCCAAAATTGATCGTCACAGTAAAATAAAATAA TATTTATATTTTATTTGAAAGGCCAATATAAGTATCTTTAACCCAATAAA TGTTAACACTAAAGCTAAAATTTATGCGGATCTAAACTCATCCCACAAAT 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ATTGACAAGATTATATCGACATAACTTGGACTATACAAAGAGMCTTCCAA ACATAACAKTATCCGATACAGAGAGTAATCAATCTACACAAAACATTGCT GAAAATAAAAAAGTCAATGCCTGCTACGTTGCATTTGAAAAATTAAGGGA CTGTGCCATAGAAAATTTATGTGTTTGTCTCAAAGCAAGTCTGGACCGTG ATTATAATAGTATACCGGCTCTTGTTAGTGCAGTAACTACCAGGTTGTTT CACCCAGATAGTGTCAAAGACAAAAATTGGAATCTAAGCTCTGCTAATAC TATTTTAGCATTAGGACATATTGCTGTCATATTAAGAAATTCTGAAGATA ATACAAAGGCTGTACTTAAATTTATGCTTCAATGGTTTGATACCAGTCCT TCAGAACAAGACACAATGTTAATAGACCAAATGGGCTGTATTGCCATATC GAGAACAGCGATTGATGGTATTTATACAGAAATAATGAAGAAGTTTAAAG AAATTATCAAGGAAGCTTCCCAAACTGTTTATGGAGGTCAACACCATTCT GCTACTGATCGTAGAAATAAATACCAACGATGTTCCGGCGCTGTAATAAA TGCTCTCGGTAATATAGCAGCAAACATTCAAGGGTTGATTCTTTTAAATG ATTTTTTGATTAAGATGATGGAACTTTATGTTAATATTGGATTAGAGGTC AAAAAGCTATCTGATAAAACTGAACGAGGTTTGCTCAAAGCCTCTAATAG TGCAGGAAATTTAGGAGTATTAATACCAGTGATTGCTGTTCTCATACGGC GGATGGATGATAAAGACTTATCAAATCCAAATAACCGTTTGAAAAAGTTT TTTAGCGACTTTTGGTTATATGCTGTTGTGTTTGGATTTACAAAAGATGA TAATGGTCTTTGGCCTCAGGATTGGTATGATGGAGTTAGTGAAATTGCTG 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