EMLSAT00000006499, EMLSAT00000006499-702346 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006499
Unique NameEMLSAT00000006499-702346
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s356supercontigLSalAtl2s356:474162..500791 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006499 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006499EMLSAG00000006499-689265Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000028387EMLSAE00000028387-737315Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028388EMLSAE00000028388-737316Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028389EMLSAE00000028389-737317Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028390EMLSAE00000028390-737318Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028391EMLSAE00000028391-737319Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028392EMLSAE00000028392-737320Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028393EMLSAE00000028393-737321Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777986auto777986Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006499EMLSAP00000006499Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006499

>EMLSAP00000006499 ID=EMLSAP00000006499|Name=EMLSAP00000006499|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=319bp
MYLTLWKGMYLKYSAIIWTYIALLMEVSLSEAKDYTNYKLLKVEPDSSFD
RTRIYHMLVDDVDFWTEPSALKSELQFMVGPHQLSDVMELLDSLNISSTV
LMENIQEVINKQLTETQDLRISPRTHFQNIDVIHDFLYETARINPSIASV
FSIGKSYEGRDLLILKVGTPSPQGNXXPAIFIEGGIHAREWISPAATTYM
IKEFVFNYKKNKEILEAIDLYILPVMNPDGFGQKVTYPWSYTKAKVGTSS
EVQYRSSGGADDFAKGALGIKWVYLIELPDRGRHGFLLPANLINPVSFSV
FQGIREFARRIAKSQFRGQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s356:474162..500791+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006499-702346 ID=EMLSAT00000006499-702346|Name=EMLSAT00000006499|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26630bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s356:474162..500791+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGCTGGGATATTTGAAATTATTACATTACCATAAAGGGAGGAAAAGATCC TTCCTCGACGTCTCTCTCAGTGTGGTGTAACTTTTTGTGTGGATTGGAGC AAGGAAATATTAGATGTACTTGACTCTATGGAAAGGAATGTATTTAAAGT ATTCTGCGATAATATGGACCTATATTGCATTGTTAATGGAGGTGAGCCTC TCAGAAGCAAAGGACTACACCAATTATAAACTCCTTAAAGTAGAGCCGGA CTCCAGCTTTGATAGAACTCGAATTTATCATATGTTAGTTGATGGTAAGT AGTTTTAAACGGAATGGTGTCCTTTATTTTGCTTATGTGTATTGGCCTTC ACCTTTTCAATTACATTCGCAGTGCAGGGATGACAGAATCCATGACCTTG ATTACAAACCATTTTAGCTTATATCTTATTTGTTAAAATATGATAATAAA ATCATTTAAGGCTACTAAATTCGTTATTATGTATGTATTGACAGGAAGGA TCCTTCTAAGGTCCTTGACCAATTTATAGTATATTAATAGGGAACAAGCA TTATTTTTAAACCTGACATGAAAATCTTATAATTTAGTTGTATATCCAGA CTATAGAGTGTTGGCGTGTGACATCGGCATTATGGTCCTAAATAACCTAG TTTTAAGATAATAAAAACCTTTTTTTTAAATTTAGATTGAGGGAAATAAA TAACTATTGCCGTTTATATAGATAGATGTCGAAATGGGCTAACGAATCAA CGAATAACTGTCTATCAAAATATTTATCTCTAAAGTTTAGCTATATTTTT AGATCCTAATAACGAGTTATATCATTATATATTCATAAATTAACGATAAG ATATGAGTAAATTAGCAAGGATCATATATTTGTCTCTTTCCTAATTCATC CAGTGCTTTGCTAATTGTACACATCTAGTCATTTCAAGGGAATTTTCAGT GAAATTCACTATTTCTCTATAGTATCAAGAACTATCCAATAAAAGGGTTA ATTTAATGTCATTTTATGAGATATCTTTATGGTTTTTTAGAAATGCATTA ATTGAATTTCATAAATATATCCAATATTGGCCTTCAAGATGGCGTCGCCC TCAATTATGAGGCAGTTATTTATCCTTGTGTGCAAATAACCGTTATACAA TGAGTTAAATTGATTCTAACTAATGGACCAAACGATGAAAAAAACAGGAA TCTTGGAAATCAAATTGTAAAATTATTGTGTTTAAGTGATTTCCCAAAAT GGGAAATATGACAGTTTAACTAAAAAACATTTMGTAGAATTACGAAATAA AAATATAAACAAGCACTAGAGATGATATTGTGGGGGTTCATAGTTGATTT TTTTTTTTACAATGGAAAACGGACAAATTTCCAATAAATCTTTGTGAAAC TTCATCTAATGTCTTTAAGAATCAAAATAGATGGAACATTTGCATGGAAT ACTAATTGATGTCAATGATAAACGGTGATATTTCAATAAAATCAAACTAA TATCTATTTAAAATCCCTTAAAATGTCTAGATTTTTAAATGAATTTTATT TTATAAATCGATTAGGAACGAAAAAATTAGATCATTAGAGAAAAATATGT CTCTGTTTTCATTGAAATAGTTAATACATCATCTACCCTATGGAAATAGG ATTGTATACCTAATAATAAAACTAGTCAATAGAAGAATATATTTTTGATA GACAGTAAGTTTAAAGACCTTTTACATGTTAATTGCATTTTGTTATCCAA TAATTTACTATTTTCCTTAATATTGATACAACAAAACCATTTTAATTATG TGTCTTGTTTAGGCCTCCAAAATGGTTGACGTCACATAAAATACTTGAAG TTAAATTTCTTCATTACCCAATACTAAAATCATTCTTTAAAAAAAATAAA CCTGAACAAACTGTAGCTATTCTACACACAAAAAGATGACAAAGGATAAT ATGACAACAATAAAATAAGGCATTACCAATCAACCGTACATAATTTTCCA TCATATGGGCACCCCAATGTCCTTAATAGCCCTTATTCATATTCATAATA TTCTAATAAAAATTAGGTTATTGAAGGGTATCAAGGGTATGTACTAGAAA GTGGGTGCGGTTTTTTTTACTTGGTAATTTGAACGGCCATTTTTTTTTCA AAGCTGTTATCATTTTTATTTAATTCTTGAGAAGGGAACATCTAAATATA TAACAATAGCCAGTGTTACCAAGTAATGCGTTACTTGGTAACGCGTTACT CTAATCCCACTACTTTTTTAGAGTGGCGAGTAATCTAACGAGCTACTATT TTCAAAGATTAAAATTACTTACAGTTCATGGTGCGTTACTATCATTGTCA TTTTCCTTCGAAAGTATCCTTTCCCGTTTAAATAGTCTAATGAAACATAT ACAATTAATCATCAGAGGGCAGCCTAACGTTTCTTTGACATTTGGCGTAT ACACTCTATCGAACTCAGCATTATCTGTCATGGGGGTAATTATGACTGCA TCACGATTGAATGTTTAAATGGATTGGAGCGCATTGCTGCCATACACTCA CAAAATCAAATTTTATTTTATGTGCTGCATAGATTTTCTTATGAGCTGAC AATGTTCGAGCAATGCGCAAATGCGCAAAACTTAAGATAAAAACAAGTAT TTATGGTAAATTTAAAGAAAGACGGGGAGGGGGGTCAGCTGCTGAATGTA ACTAATAAAGTAATTTGTAGTCATACTCAGTTACTTTGGAAATCTGATAA TTACTAGTATGTATGTTTGTTTATGGAAGACGGAGAGKAACAATAAAGGT TTGCTCCGGAATTATAAGGTAAAGTCCTTGTTGGACTTGAGTAGAATTGA 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AACTTAATTGTTTATAACATGACAGTTATATATTTTCAAGTACCAGAAAT AGCTTGGATGAATTATAATTCCCTCGTCTCTCTTGGAATACTAATTTCTG AATAGGAGCATCTTTTGAGATGGATGATCAAGTTAAAAGCAGTTTCTTTC GATTCCCTCTAACTTTCCTTAGTCCTAACTCTTGGAGAACATAGAAGTTC CCTTCTTCCTTTTTTAATGAAATGAAAATGATGTTAGGCCATAGCAATTA TATATATCGTGTACTCTTGAGATTGTTTACAAAAAAATTAATGACGGTTG AAATAGAAAAAAATAAGTCCCCAGGTTAAAACCGAAAAAATTTGGTCCAT AGGGCAAGAGAAAAAAATATGTCCATAAGGTAAGACCAAACAAAAATCGG TTTACAAAGTGAGACCGAAAAAAATTTGTCCACGGTCTGAGACTGCGGTC TGGGCCGAAAAATTGGTCTAGAAAAAATCAATTAAGACCGAACCGGAAAA AAAAATCGCTTCTGCACCGACAATAGTCGTTAACTTTAATGTATCTTGCA AACTTTTTTCCGCAAAGAAAAGACAAAACGGTCCAAAATCACAACTTAAC AGTGTTCAGAAGAATAATTGGGAGGGATGAAAGAGAAATATCTTCACCTG ACAACAAAATACATTATAATTGTGGCGCAATTGAGGTTACGCTGTGCGAG AGGAAAGAAATAGTCAAATGTTATCTCGCAAGAAATTATGAAGAAATTTC GCAGATCTTGATCCCTTGTTAGACGAGCAAGGACTTGCCTTTATAAGCGT GCGTGTACACGATGATCGAAAGGACCTAAGCACACAACAGTATTCTAATT TAGGACTGAATACAAAATTTCTCCAAAAAGAAATAGAAAAAAGGCCCGAT ATCATCTGGTAGTTAGCCAAATAAGTCAATAATACCAACTGATGGTAATT TCGTAAATACTTCCAGACTATCATTCTTAGAATATTTCTTCAAAATCCGA TATTGCATTATAATATTGCTCAGTAATAACTTTTTAAAGCGTAGCAATAC ATTTGTATTTATATAGCCAAAAAAATTTCATAGAAATAATGAAAGGCCAA TATATATATAACGCCTACGAGGGATCAGCAAGAAATTGTATTCCTGTCGT TTTGGAAACGGAGCATAGGTATTCATTACTTATTACTTCGTTAAATTATG AAAAAGAATAAATTATGAAATGGTCATGACGTATCAAGTGAGAAGACGTA ATTGAGAGCTTTAGGGTATTTTTGTGTCACTGAGGTATGAAGACAGCTGT CCCATTCAGTCCAGTCTTGGTACGGTCCAGTGAAGTCCTGCATATTAGTC CTTAAAAAAATAATGTTCGGTATTTGATGACGTTAGTCAACTTTATGTCT TCTCTTTTATCAGTTCTGGTACCGAGAGTCCGAAGGAAGACCGTACTGAA CTGAAAAATAAGGACTGACAAATTTAAGGTGGGAAGATTAATCTTAATCG GAGGGTCGGCTATTTTTTCTGATTTAATATTAGAAATTTAGTTTTCGAAT TTTTTTTCCAAAAAGCTTAATTTTTTGAGAATAGGCCTGAGTTTTTGATA TTTTTTTCATAAAATTTAATTTTTTGTGAAGAGTTGTTGATTTTGGAAAG AAATATATATATATGTATATAAAATTGTATATTTGAAATTTTTTTTCAAA AAATTGAATATTGAAATGTAATTTTTGATTTTTTTTTGTATTTGAATTTT GGATTTTTGTATTCCAAAAACATTGCCCTCTCGAAATCTAATCCTGTCGA CGCCCCTTATAGAAAAATGATATTTTTTTAAATATTAATTAAAATATTAA AGAATTGGGATTTTTTTTTTAATCGTCCCATCTAATTGCCTTCAAACAAT 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