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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s382 | supercontig | LSalAtl2s382:146876..192943 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006807 >EMLSAP00000006807 ID=EMLSAP00000006807|Name=EMLSAP00000006807|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=485bp
MEGDELSIDIGNNSQMVNETYFEEWPRLQDGRLNCSICENKLCLGEEDYD VYQSYISVDKFETVLICLIALVFICGIIGNALVFIAVTTTKSMQSVTNIF IVNLAMADMLVMIFCVPPTVIWDVTNTWIFGSLMCRIVLYIQDISVSVSV LTLTFIAYDRYYAICRPLQFSSRKTKAAVXIAAIWTISAIIGIPNAISLE AVTPFDDEEQFPCLARDEIFFDLSSCKPKWGENVDFTITLLKAVVLYSLP IIFMSIAYYHIVKTLWRRNNMTGSQVTSDNRINRRTLLSKTASSMHRNGS ATASFIESSSRAGTLESPGRIHCKRNISANKNLDNQLRTRRKVAKMLIAV VIIFTINSFPVHCLPIAQYILRKQNPTVYERINWFIIQAGIFTHCMFYLN SAINPIIYYFMSAQFKAQYRRILSCRCTGXSSSPIGHSNRTYLNNGNAVL RHVTGGDYNIRRPRTSVQGHGSVHDKNRLGVGLHN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s382:146876..192943- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006807-702654 ID=EMLSAT00000006807-702654|Name=EMLSAT00000006807|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=46068bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s382:146876..192943- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAGGGAGATGAATTGAGTATTGACATTGGTAACAACTCTCAAATGGT
CAATGAAACATATTTCGAGGAGTGGCCTCGACTTCAGGATGGTCGTCTCA
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TTATTAGAGTCAATCTAAGCGTCCACATTTATTATTTTTAGTAGTAGCTT
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TTTAAAGTTACTTTTTCGCTTGGGTCTTTAAAGCTTGGGAGAGATTATTC
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TTGGACGATTAGCCTAGAGCTCATTGTCTCCAAATGTCCTTAAACTGTAT
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TTATCAAGATTGGCATNNNNNNNNNATTTGCTTGTATTGTTATATTTTCT
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TTTTTTTCAAAAATARTTAATTTATATTATATTGGACATTAAAATTCGTG
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AAGATGCTTAATATTTAATAATAGAACGACGGTGATATAGCACTTCCCTT
TGAGAACTGCTGCTTTCAAAAATGAACCAACCTATTTTTAAGCAATGCAA
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CTACTTTTTTTTTCTTTCTTGACAAATAATATTAAATAGTAGAGAACGAT
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TTTTTTAAACTACGTTTTTGGCAAGGATATATATAGACTGGAATTACTCC
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GTTATAAACTACCCATAAAAAGCGTACAATAACCATTTCCATAAAAACAT
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AATATTCGTACCAACAAAGCATCATCTCAGCTTAACTAAATGTTCTCATT
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AATGGTTTATTAGAAGTATTGCGATCATCGATTTAAGCCAAGTATACCCT
GTTCTATTAGATAACTTGTTACCAACGATAATCCAGCTTCATGATGCTTT
TCTAGTAGAAGCTTTTGCCCCTATTGGCAAAAAACTGGAACAATCAATTT
TTACTGTCCTCTATTCAGACCAAATTTTTACCAGCAAGGGTATTGGTCAT
TGACAGGGAAAAGTGGTGTTGCCACTTGGTGACAGGTCTGAACTGTAGGG
TGAATGCCGATGAACTTCCCATCTGAGCTCCAGAAGCTTCTTGCACGTCA
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TCTATACACCAATGCTGCAAATGGGCCAGCTAAAATATTCACAAGATTTA
CATCACTGCCCATCCCTCAAATCTGTCACCCTCTAGTAGGGCCCCTCTCT
CTTCTTATCAAAAACACACATGACTACTAATATCGTGAAGTTATTTACCA
GTCTGGTAAACCAGTCTGTAAACATGTATGTAAAGAAACTAAGTTATAGC
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AAACAAAAATTGAGATAACAAGGCTTTAACCTTGGCAAAATTTGCGTCTT
GACAATAAAAATGAAAGTAGATAAATATATTTTGGGGGGACTTCCRCCCC
CCCCTTTGTCGCTCKTATGTTTTTTTTTGTTATGCGTCATTTAAAAAAAA
TCTATTCATAAAAAATATGTATTATCATATAATGAATATCTTATGCTTTG
TAAAAATATTATCAAGGGATTTCCCAAGGGCTCAAGAAGCAATAAAAGCT
TGCACGCCCATTATTGATATAAAAAGTAGGTGCCTCAAAAATATACGTAT
CAATGTTAAGGTTTAATGCCTTGACAAAACTTGACACAACTTTCGTCATA
GTTAAATCTTTCCTATCTCAATTTTTATTTTTGGACGATACCCTCTATAA
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GGGGGCCCAGAAATTAAATATTAATTTTTCTAAAGTACTTGAAAGATGCT
CTTGCATCTGAAAAATGAAGCTAAGATTGAATTATATTTTAACATCCCAC
ATCCCCTACTTTAAATAAAAGCCACTATTTACATACAAAAAATATATATA
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AATAATATGCACTAATGATCATTATTCAAACAAAACATAAACACTTGTCT
GATATGATGTATTTTCGTCAATTATTGAGTATTGAATATTAATAATCCAA
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AAGATTTGAACCACATTCAACACTATGGTGGTTCGAATATAAAATGAATA
TAAAAATATTTATAAATAAAAGAACACTTATTAGTTTACATATAAATATA
GCTTAAAAACAAAACCTATTTATCATATGAAGTTGAACTGAAATATACAA
TATCAATAAATTAAATATAATTTTTTGAATGTTCTAAATGGTAATTCTGT
AAAATGTCCGTTCGCCTTATTGTCTTTTGGCAAAATGTCCGTTTGTCTAA
TTATCCTTTGGCAAAATGTCCGTTTGCCTAATTGTCCTTTGGCYTAATGT
CTTTCGGTAAAAATATTTTCTACCAAAAGTGTTTTCACGATTTTTTTTCA
TTATGTTTATCAATTAAAACCCCTATTTAAGGAGTTAAATAATATGTGCT
CAATAGTTTGGAGTTTTCTAATAAAACAATCATAAAGCACATCTTTAAAA
CAAGGTACACAATATTTTTAACTGACATACTGAATATTAAGGATATAAAA
GCTGCAACTTTTTACTACTCAAAAGCATCATATGAGACAGTACAAAAGGA
CTGAAAGTGGGCAATTATGACGCAAGAATATAATTGTTTTCCTAACTAAA
ACGCATTGTACCAGACCCAAAAATTGTTTGAGAAGTAAACTTTGTCAAAA
TCAGTTTTTTGATTGTTCCAAGCAGAATAAGTTTTACTGCTGCAGAAGGA
GGAAAATTTTAACCTGAAAATAGGACTGGTTAGTATACATATATACAATG
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ATATTTTTTTTAAATAAAAATTCGCAAATATATTTCTTGACTGTTACTGA
AAAATTTAGAAAATTAACATAAAAAATTAAAAAACTACCAAAGAAAATTT
CAATGTTTGCCTTAACAAGATCAAATATGATAAAACCTCTATAAAATCGA
AATGATATTAGTACATTTTTTTTCTCCTTATTTTTCTAATGATAAATTGT
AGCAGATTCAAATAGTATGCTTAAAAAAATCGTTACAATACGTTAAAAAC
GTCAMGTGTGCCATTTTTGAACTTGTTCTTATGAATATAGCTACAAATAT
TTCCTTTAAAAGTACTTCATGTCTAAAATATATAACAACAAGATATAATC
TTGATCATCYTTAGCAAAAACTAAAATTCAAATAAATTAAATATTCTTGG
ATATATTACATGTTTAAATTCGTATAAAAATCTAAATTTCGATTTTAAGA
GTTCCTATTAACATCAATGAACTCCAATAATCTAAAATTTTAAATTAACT
ACTTTATTTGTTTCAAATTTTATCACTGCAATTAYTTACTRATCRAATTT
TTCTCGCCCTTTAATTTGTATGTATATGATGTTATTTGATGTCTTATTTC
TTTTTATTTGCCAAAAAAAATTATCTTTTTCAATTCAAAATTATTTTGTA
TTTTATGTGTGCATTTTATTGTTCTCGTTAAAAAGTGAAAAATATAAATA
ATGTTTTTGGCAAGGAAAACATATTATCTTGAAAAGATGAGTTCAAAATA
TAACTATAGATATTGAAATATTTTATTGACATATTGCTACAATACAAAGT
ATGTACTAACGATCCATTTTTATCTATATTTTGACTATTTTTATATATAT
AAATATTTTCAGAACAATGCCATTCGCTAATACATTGATTTCAATGTTAT
TTATAGCAAAATTAATGTATGTAATTTGATATTAGTACTTTATTTGTTCA
ATTCCTTAATTTTGTATATACATGTTTGTTTTTTAATTACAGGTATTCAT
AGCCGTCACGACAACAAAAAGCATGCAATCTGTCACAAATATTTTCATAG
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ACAGTCATTTGGGATGTCACAAACACTTGGATTTTTGGATCATTAATGTG
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ATGCAAAAAATATTGATTTAATTAATATATATTTCATAGATTATTACCTC
TTTTATACGCAATGAGTCATAGAATTAAAATTTAGCTAAATGTTGGTTAT
TTCTAGGGATGTTTCCGGATGATAGTCGTACCCGGAACATTTATGTAAAT
AATCCCTACATATTATCTACAAAAACATATTACTTGTGGGTAATTGTACA
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GCAGTTGTTATTATCTTCACAATCAATTCATTTCCGGTGCATTGTCTTCC
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GAGCTTATGAATACATTTATATCTTTATGACTATTTTTTTTTTTTTGAAA
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ACCTTCGAGCAGGAAGGATTATCATATGAATAACTAATGAGTTATAAAAA
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CCATGGTATGATATTGCGTATTTTTACTAAGAGCTAGGATGAACACCTCA
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CTGTCGTCATTTTTACATAAACAAACTAAACCAATTATTTATTCATTTCA
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GGTGTCAGAAAGTGGAGAGTATAAGTAAAGGAGGGATAGAAAGTTCTTAT
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