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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s388 | supercontig | LSalAtl2s388:127216..153492 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006854 >EMLSAP00000006854 ID=EMLSAP00000006854|Name=EMLSAP00000006854|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=382bp
MLICVLVLIFVVDEALPFDNESEETSRQLTHQLLDLNLGYNVFSTDVLKR FNDSPFESDYGXXHDSDVAFRDPQNNDDGLGENDFFLHASSEQRHPRDFE NSGRGGEDLWTSESFWPARPARRPRFFQGFPRYRRRFRPHTKTFVGDQHK CGSGSCEFFLFCWLTGGLIEGGCGGFLFACCQRPSAEGTQLIVEKDKTTR PELEYGPIQNEPTCGLSNNNHNVAQRRIVGGDEAGFGSFPWQAYIRIGTS RCGGSLVNEWXXITAGHCVARASANQIRVTLGEYVLKSHAEPLPGRTYGA SRIKVHPYFKFTPQADRFDVAVVRLNRRVDYAPHISPICLPPKNMEMSNY HGWASGWGALEAGSRLRPKTLQVVDVPMIANR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s388:127216..153492+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006854-702701 ID=EMLSAT00000006854-702701|Name=EMLSAT00000006854|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26277bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s388:127216..153492+ (Lepeophtheirus salmonis) GTCAAAATAATAATAATAATTATTATATTATTTTCTGTGTGTCCCACTGA
CAAATTTGTATTACAAATCATCAATAATTTATTTGGTTATTAAAGCATAA
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GAAGATTATTTAGTAGGGCAGCTATCATGACATTTAATTAGATTAGCTAT
AATCAGCTGTGACTAGTGGTAGAAGGAAATAAATAATGATATTGACAATA
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GAACACCTATAACAAGAGATCCTTTGAACTCAACCAATCCATGTTGTTCA
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TTTTCTTTTTGAAGGAGTAAAGCTTACAATATAGATACTAAGTGTATTTG
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TTTTTATTCCTTTTCTTTTCTTCTTATCTGTGTATATTATTCCTTGGTAT
TTATCAAGGTCTTTCAGACAAAAAAAACGAAAATTGCTTCCTCATTGCTC
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TTCCAGATTTAATATCTACTTTGTTTCAAAAAATATATGTATTTGTAATG
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AGCTGTCTGCATTGACCGGGGCTTCGGAGTAAGTCATCAAAAAGTCCGTC
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AAGCTACATTTAATGATATTCAATTWTTTATAATCAAAYCCGCCTCTCTT
GATGATGTCGTCCACACGGTTCCAGAAGCTTTAGGAGGCCAGGGCAACCT
CGTGCATATCCTGTATTTTAATTTTAATTGACAAAAAAAAAAGAACTTTT
GTGGCCTTTCAAATTTTGAAATAGATTTGCTACCTAAAGATGGCATCGNA
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CCCCCCYCCCCYCCMCSMCCTTTTACCCACWAACATTTCAYTCTTGAGCC
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GAAAAAAATTTAAAAATTATATTTCAAATATAAATTTTTTGGGGAAATTT
GAAAAATCCATAGCTATTCAAAATAAGATTAAATTCTTATACAAATAAAA
TTTCCAAAAATTAAATTAAATTTGAAATATTWAATWTCRTAAATTAACTT
AAATTTGAAATATTTCATTTTTTGGAAAAAAATGTGATATTAAATTAAAT
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CCAGCCCACACTTTGCGGACGCCCTTTATTATTGAGTAGTTCAGTTGCTA
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CCCCTGACAAAACATTGAGTATCCTTATGTTATTTTAAACAATAAATTTA
AGGATATATCTTTGAAAGAGTATGTACATGACATAATAAATGTCTGAGAA
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AAAAGTAAATGTTTAAATTGGTGAGTTATGTATTACTTCAACATTTCTAA
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CGTACTGGAAAGTTTCAAAATACGGACATAGATACATATCATTGATTATT
TGATGAGAAAAAAAAAAACTCGGTCTGGACCGGTCTCATATAAAAATTCG
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AAAATCGGTATAGTTCGGTACCAAAAAAAAATCGGCCTNNNNNNNNNNNN
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TTTTTTTTATGGTAACAACAACAGCTGGAATAACAAAGTTACCAACTATG
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TTTAGTACGAGGTGTATGGCTAAAACATATTACTATTCGTTCTAGATATT
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ATTTCTTCTTTCCAAAAAAAAAGAAGCTAATTGGGGCAAGTTTTGGAGGA
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GATGCATTTACAAAAATATAATTAAACATTATAGTTTAAAATTTATTCAG
TAGATTATGGCCTACAAACATAGAATATTTATATATCTAAATTAAAAACA
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CTTTTAAACCAACAACTAGCCTTTATATGTCTGTTATTATTTGAATTTAT
TTATAGATTACACTTTCAAAAACAAATATTTAATGAGAGTTTGATACTCT
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GCGAGCCCAAAATGGCTGAAACTTTGGTGATGAACTGTTAATAGATGTTA
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GACATTTCACCTCATAAACCTTGACTCTTTTCGTGTTAACCCAATAGTTA
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TTACATAAAATAATATTGATAGACATTTTTTTAATCAATATAAAAAGTGT
AAAAACAGTTTTTTCTAAAATTGTCCTATGAACAATTTGAGAAAAAATTT
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TGATGATTTTTAATCCTTATTGATGAAATAAATAACTTTTGTGTCCTTTC
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TAAAGAATATTATTATCTTAGAGTTATGCGTCGCTTGCGAGAAATAATAC
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GATAATGCCCCTCCTCACTCATCTTTGCTTGTGACAGATTTTTTGGTCAA
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CATGTGACTTTTTCTTCCTCACAAAACAAAAAGATCTATGAAAGGAGGGA
GATTTTCAAAGATTAAGTAGACAAAGACTCTATTGCTGGAAGAACTTAAT
GCTATACCAAAAAGTACTTATGAGAAGTGCTTTGAAGATTGGAAAATGCG
TTTGCACAAGTGTATTGCATTTTAGTGGAATTACTGTCAAGGGGAGAACA
TCAATATTGATAATAAATAAATACATCTTCCTAAAAATACAAAGTCACCT
TACTTTTTGAACACGCCTAGTATACTGGGTGTGGCGAAAAAAAACTTTAC
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GTCCAGAAAGGAAAGTTGTCCTCCAAACAGTTCTTGGCCTTTTTGGACCT
GTATGCAGGTGCACCATCCTGCTGGATCTCCACATTGATGTACAGGTTCA
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TCTAAAAGTCCTCGAACCGAATTTCGTTGGTATTTGGCTTGGATTTAAGA
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TATTCTTTCGGATTTTTTTTTGTTGTTGTTGAAAATATAATTTTCTTGAA
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ATACATATTTGTATTAAACCATTATTTACAATTGATAAATAAGAATAATA
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GTTTTGTTACATCGTAAGTGTAATCAGTAATTTATTTATTAAATATTGAT
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TATTGATATATGTAGGTAATAGGAGAGTTGAATATCTATTGCAGCTTTGC
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ACTTAATTTTCCAATGACAGAAGAGACTCACAAGTAATACTGGTATCGGA
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GTCTTGTTGATGCGAGKCCTTAAGTGTACATCAATGACACTTAAGGACTC
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GGATAAGCTGGAGATGAAGTCACGTTGTTCCTCAATGTACATTTCATTGC
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AATTATTCCATAAAAGATATAGACCCAGGGATATGTATTTGAACAAATGG
ACGATAAAGTAACCAATTTGGATGTTACAAGACATCTCCCCAATGAATGA
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TCTAAAGAGATGAGATCCCTGAACATACTGAATATCCTAATTTTTTAAAA
GATATGAATGGAATGGAATTATGAGTTGAATCAGATCCATATATCCGGAT
GTTCTGTGAAAAAGATCCATCCAAACCATCTTTATTGTCTTAAAAGTAAT
TAATTTGATATATCACTATTGTGACCAAAGTTTATCACACCAACTATTTT
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TTTTATTATTTCTATAAATAATTTTTGGCTATCATATACAAATACGTTTG
TAAAGCTACACTTTTAATAAAATATTACTAAGCAATACATATTTTAAATT
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TCATTTTAAAAATTGGGTAGAAATAATATGACATTGGTACGATTGACTTC
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GAGAAAAGGCTGCGTTATACCATAAAGGTATACGTCAGACTAAATAAAAT
AATTTAGATGGTAACTTTATATTTGAATAAAGTTGAAATATAGCTGAAAA
GGTTTATGAGCAGTTATGGAAAAAAACACTTCTTCATTTCAATAAAATAT
ATTTATTTGAAATTATTGTCAAATGTTCAATTATAGTCAAATAAGATAAA
ATGTTACCCGATATATATAATTCAAAAGAAGTCCTCCTTGCTCGCATCAA
AGATATAAATTACTCACTAAATATTAATGTTTTGACTTCTTGTGCCTTTC
TTCTTCATAATTGTACGGCTTTAAGAATAATGCAACTCTTTGATGATTAA
TGAGCTAATTATTACTTATTATTCGTTTTTTTGCAGATTTTACGGGTGAA
AGCTTTCGGAATGATGAAAAAGAAAATGTCCTTTTAATCAAAAATATCAT
CCTTTTGGAGTTCAGTGCAATTAAATTATTTAGAGACGAAGTACTATTAA
CCACAAGACTGCCTGTACTGTATTGCCATACAGTGTATCCCACGCCAAGT
CAGAGACTCAGATATATCAAAATATCATCACGTCATTTTTACAAATCATG
TTGATTTGTGTCCTTGTATTGATATTCGTGGTGGATGAGGCATTGCCTTT
TGACAATGAGAGTGAAGAGACGTCACGTCAGTTGACTCATCAGCTCCTAG
ACTTAAATTTGGGCTACAACGTCTTTAGCACAGACGTTCTCAAACGCTTT
AACGACTCTCCTTTCGAGTCAGATTACGGCTAMAWCCATGACTCGGATGT
AGCTTTCAGGGATCCGCAAAACAATGATGATGGGCTCGGCGAGAATGACT
TTTTCCTTCACGCCTCTTCTGAGCAGCGTCATCCCAGAGACTTCGAAAAC
AGCGGGAGGGGTGGTGAGGATCTGTGGACATCAGAAAGCTTTTGGCCTGC
CAGACCAGCTAGACGACCCAGGTTTTTTCAAGGGTTTCCAAGATATCGTC
GACGATTTCGACCTCATACAAAGACTTTTGTAGGTGACCAGCACAAATGT
GGAAGTGGGAGTTGTGAATTTTTCCTCTTTTGTTGGCTTACTGGGGGTCT
AATAGAAGGGGGCTGTGGGGGGTTCCTTTTTGCTTGCTGTCAGAGGCCGA
GTGCTGAAGGAACACAACTCATCGTTGAGAAGGTGAGTTTCAAAGAAAAA
AAACACAAAAGAAAACGAAATGAAAACAATGAGAAATTTAATTCAAAATG
TTTTTTGATTTTTTTTTTTAAATCTTCCTTAAATATTTTTTTTTCTAATA
CTCTTTTTTTCACAAGGGTCAGAAATTGATGATAATTAGTGTTGGGTCGG
TCTAAAAATACTAAAAATACTGCAGTTCTATCAGTCCGGCCATAATAAAA
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AGCTAAAATGACGTAGTTACTGACTATGTCCTTTCAGTTGTTCAACATAA
CCTCTTTCAGAGAGACTAGATAGCTTATATTTAAAGTAGGAGTTCTGTGA
CTAGAACTTCTTATTATAGGTTCTAGCTATTATTTATTATTTTCTTCGTT
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GCGCCCCCTACAAATGGGGGTAGAAGAACTGAGAAGTTACTACAAAGACA
TAACATAAGATTATGAGGCCATTCGTTAACCCTTTGCCATATTTTTATTA
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TTTTCTTTACATATACCATATAGGAACCTCAAGATGTGGCGGRTCCCTCG
TAAATGAATGGKACGKAATCACAGCTGGACACTGTGTGGCCCGTGCAAGT
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AGAGCCACTTCCAGGACGAACCTACGGAGCTTCACGAATCAAAGTACACC
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CGTTTAAACCGTCGTGTGGACTACGCACCACATATAAGCCCAATCTGTTT
ACCACCAAAGAACATGGAAATGTCAAATTATCATGGTTGGGCCTCTGGTT
GGGGAGCTCTTGAGGCAGGTAGTCGCCTTCGTCCAAAGACGCTTCAAGTC
GTGGATGTTCCTATGATTGCAAATCGA back to top
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