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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s3 | supercontig | LSalAtl2s3:1098277..1107147 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007044 >EMLSAP00000007044 ID=EMLSAP00000007044|Name=EMLSAP00000007044|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1636bp
PEFYLDQHEDTPKERTISHNSLGDKNINSILQKGAHFLQNLAATVIKDPE AADLMVPGTSYKAISKFIISDDVHGLREFLDXSHVNIEDRDEDGSTLLHF AASKGNKDIVSVLLNHSADVQAEDFQKCNPLHVAAREGHNDVVHELIDAG SFINQIDMGMWTPFMWACYYGRTDTASVLIDCGCEINVRGQQQVSPLNWA AGRGHENIVRLLLEKNMIVDLGDKYGTTALIWAARKGYMEIVRLLLRHGA NVDAVGMYSWTPLLVATAGNFIQVVDLILEKNPNVNKVDKDGLTALAIAC KEGYTEIAFKLISFGAYINLQDKYGDTNLMYAAKGGHKSIVDALLKKHAD INMRGKDNRTCLHCAIDKGHTSIVKSILNVNPDLELRTIDGDTALLRAVK CRNEDIVQMLXXKKAKLXATDTKQDTVLHIAMRARSKAIVEILLRNPKHS QLLYRPNRSGETPYTIDINSNKSILGQVFGARKLNTNEDGENMLGYDLYS SSLADILTEPSLSMPITVGLYAKWGSGKSFLLGKLRDEMKSFSREWVDPS FHNSPLLFAIILHIAAFIGITTLIISYTASSLGNTSGLVGLIVALSTIVL SYIFILIIRQGSYKFNWLSFNITIASKFNSLKLILQVMFCHPPGQEFINS VIEVQPLRLLFTEQTKVITSAGGQNSVTPMIGSLYDAVEKQYGKFASRLF RAFRPTPVKNTSPIRWKKVCCIPYIVIYFICFFLILAGVVLIMIELMYTN NSVQMNFNSPKIFDHPVASTKSAFELKDDDEMEDDENEEDDRRRIDLFEL DIEEEFTTEKIIVGLLIFMAIMLLIIIVGNFYNIVRGIHALIFSQRQHFH RTVSKVDLVKSEGYLQAVKGEVQLLQEMVKGLDAFTGQQSRMVVVVDGLD SCEQGKVLSVLDAMHMLFSDRGSPFIIILAIDPHVITKAIELNLNRAFID TSIGGNAYLRNLVHLPFFLQNAGLRKVKVAQKVANKLKSMYGSSVLIEEV QGDRRTSVDSVSTSKTKKTSKCHLRKVESVASSLGSRVLATPGEPSDLTK ILLSDDYFSDVNPRSLKRLMNVIYVMGRLLKAFHIDFNWHRLSSWVNITE QWPYHASWITIFVELNEDHLDDLTPLKSIYNIIKGIIPTQKDLEPLLEMD RDEKKFETFLSLHKKNLAVLDVKIFLPFTINLDPYLRKIIKDEIHNMEEM GIEVPTLEGSSNVAPSSTPAPTLTRRQATELSRKMSHHDLGNLGGNTPGV PFPSYPIYTXPXSRYSAPXASGQNSNTQPGKFYDIYHRPLEEKSQSLIQL PSDLTEQNLSQQSTEEICEWVRTFKGLSTNKLDEYCSKIIAENVSGQVLK SCNLDELKVVMGMNFGDWEIFKNVVLALRNHEKKNKIVKFSLEDSTDHVQ LLKNRQEPPITPIPTQQKKVHHQDKFEKQVTLEDAMISGLLSTLNEDAQE DVLSEEISSFKGSMGQLSHLNLSPSIGSMNGVEVEYNKVNPPPHRSRTQS ENEASVIYLSHASPLSTSKLEAHMDIEKGSRPRNLSGIPSWASQGDVPVM VSVPTTPITDDLQPNLHLDISLDNSRNLSGSSIMRTKIVDDTDPYSWLSS TAPTSPSYKRKVNEGLKELGISYFKHPRGEACKASN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s3:1098277..1107147- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007044-702891 ID=EMLSAT00000007044-702891|Name=EMLSAT00000007044|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8871bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s3:1098277..1107147- (Lepeophtheirus salmonis) CCGGAATTTTATTTGGATCAACATGAGGATACTCCAAAGGAAAGAACAAT
TTCCCATAACTCCCTTGGGGATAAAAATATCAATTCAATCCTTCAGAAAG
GAGCGCACTTTCTCCAAAATCTTGCAGCTACTGTAATCAAGGTAAATTAT
GTTCAAATTTAGTTCAAAATTCAATTCTTTCGTGTACCTACATAGTCCTG
GAATCCACTGAATATATGAACCTTAATCTTATATATTTTAGTTCATTTTT
GAAATAACTATTTCCAATAAAATGTTACTTATGAACCACATAAGACATTG
GGTTAAGAGTGAGCAAAGTTTAATTGAAATACATTCACATATTTTTAAAT
AATTATTTGGTCCTGATAATTCGATTATATGTAAAGTATAATTTCAGTTA
TCTCAATATAACCGGTTAAAAGCCTGGATAATTGTTAAATGTAATTAATC
TTCATAAATACGTAGAACGTTTAAAAAATGAAGTCCCACAAATAGAAAAT
GCTATCATACCTATATATTCCTGTGGAAATCAATTATTTATTTGACATAA
TAAACCATGGATTACATTTGATATTTAGTTTTCATGCATGTACATACGTA
TAATATATACTTCATTTATCGGATTATCACCCTTGTTACATATAAAAAAT
AGTAATGGAATCCATTCCTCTAACGCTGAAAGATATTCTTAAATCTCGTG
TTGCAAGTTTGAAATTGATTTTGATTCGTGATTTTTTTGTAATCGTGAAT
CGGATCATCCCTAGTCTGACCATATAAATATTTTTAAAAACATATGTTAG
GAACACTGTTTGACTTGGAATATGAACTAGATACCAATTATAATCAATTG
CAGTATTGTTATAGTAATGCATGCATCCCACTGCCACCCCTCAGCTACGT
CCCTGTATTGTATGATTTTTATTTATTTTTGAGTATTTTTCATTCTTATG
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TTGTAATGACTAATTAGCATCATCCTTGTTAAAAAAAGGAGGGTGTATTC
TTCGTAAAGTTGACCCTTGGAATCGCTTTATTCTGCTTCATATTATTATG
TATGTGCTTATTTCCAATAAACAAGATTTGTTCGTCTAGATACAGCGATA
ATAAGTCCAATTGTTTCAAAAACGGATGTTTGAAAAAAGTTCAGCTCTCT
GACGTATGCATTTTGATTTAGTTTCCATTGCCAAGAAAAGTAACTGAAGT
ATTAAGTAGGAATTGATGTGTTAGTAAAAAAAGAAGATGATCAAAGAGAA
ACATCATAGTTCAACAATTATCTTTGTTTAAAGCGCAAACAACATAATTA
AATCAATTTTTTTATCATCAGTAACAGTACAATGGACGTCAAACGGCTAT
GGCAACCAAAAGAGCTCCTGTTATAAAAATAGGAACTGTTGTACAGTCCA
AAGTTGTAACTCTAATTCCAGTATCTAAGGTATTTTTTTTTTAAACAAGA
AATTAAATCATTCAGTTATTATAATCAATAATATAAACGATGCCTTTATA
AACTCGTTTAATGAAGCTCAAGAATGAAATAGAATCACCTTGACAAGTAA
TTAACATTAAGCGAATCTATAGACGTGTTCTTACCCGTTCGACTTTCCAA
AATTAAATTTTTATTCTCTGGATTAAGGATTGTTAATAGATACATTCTAC
AAGATCATGAAATACCACAGGCAGTTCCTTACCACGTCGGATCTAAACTC
TATGTCCAACCATCTTAGACTTTCATGGCGCTCACTCAATTCTAAATCGG
TATAGATGTGGAATATTGACGAAGACTAACTCAAAAAAATTAATGTTTAT
GTTCATGTACCTATATACATATATGAACAAAGTTTAAATGTTTTAGATGA
TTATAATACATATATATTAAGACGGAGTGTAATATTGGCTATGAGTTTAA
TATGCTATTAACTTGTTATTAGTGATATACCTAAGTACTAACCTACGTTT
TTTATAGATGACTTGGTCTTTTGATTATAGGTTTCTTAATTTATGCATTT
AATTGAACGTTTAGGATCCTGAAGCAGCAGACCTTATGGTTCCTGGAACA
AGTTATAAAGCCATTTCTAAATTTATAATATCTGATGATGTACATGGGCT
TCGAGAGTTTTTAGATARTAGCCATGTTAATATCGAAGATAGAGATGAGG
TATTAAATGACCTGATCAAACCCTCATTTTATTTTAATGCTCTGTTTTTT
TTTCAGGATGGAAGTACATTACTTCATTTTGCTGCCAGCAAAGGTAACAA
GGATATTGTTTCAGTACTTCTGAATCATTCTGCAGATGTTCAAGCCGAAG
ACTTTCAAAAGTGCAATCCTTTACATGTTGCTGCTCGAGAAGGCCATAAT
GATGTAGTACATGAATTAATCGATGCAGGGAGTTTCATCAATCAAATAGA
TATGGGAATGTGGACTCCATTCATGTGGGCTTGTTATTATGGCCGAACTG
ATACAGCTTCTGTTTTAATCGATTGTGGATGTGAAATTAATGTTAGGGGT
CAGCAGCAGGTATCGCCATTGAACTGGGCAGCAGGAAGAGGTCATGAAAA
TATTGTGAGACTTCTTCTTGAAAAGAATATGATAGTGGATTTAGGCGATA
AATATGGAACAACTGCTCTAATTTGGGCCGCTAGAAAAGGCTACATGGAA
ATAGTTCGACTCCTTTTAAGACATGGTGCAAATGTAGATGCAGTTGGAAT
GTATTCTTGGACTCCATTACTCGTGGCTACCGCTGGAAATTTTATTCAGG
TTGTTGATTTAATCCTGGAAAAAAATCCTAATGTCAATAAAGTTGATAAG
GACGGACTTACAGCTTTGGCAATCGCATGTAAAGAGGGATATACGGAAAT
AGCTTTTAAACTGATTTCCTTTGGTGCATACATCAATTTGCAAGATAAAT
ATGGGGACACAAATCTCATGTATGCAGCTAAAGGTAAAAAAACAAAACTT
TAAAGATGCATAATTTTAATATTTCATATAGGGGGTCATAAATCCATTGT
CGATGCACTATTGAAAAAGCATGCTGATATAAATATGAGAGGGAAAGATA
ATCGGACGTGTTTACATTGTGCCATTGATAAAGGTCATACATCAATTGTC
AAGTCAATACTTAATGTAAATCCTGATTTGGAACTTAGAACCATTGATGG
TGATACTGCTTTACTCCGAGCAGTCAAATGTAGAAACGAAGATATTGTTC
AAATGCTTCWAGAWAAAAAGGCAAAACTARCCGCAACAGATACAAAACAA
GATACTGTTCTTCATATAGCCATGCGAGCCCGGTATTGTATAATTATATA
TTATTATAAATAAATACATTGATTTTTTTTTTTTTCAATTTTAGATCTAA
AGCAATAGTAGAAATACTACTTCGCAACCCGAAGCATAGTCAACTATTGT
ATAGGCCAAATAGATCAGGAGAAACTCCTTACACAATTGATATAAATAGC
AATAAATCGATTTTGGGTCAAGTGTTTGGTGCTCGTAAATTAAACACAAA
TGAGGATGGGGAAAATATGTTAGGATATGATTTATACTCTAGCTCTCTGG
CAGATATTCTAACCGAACCATCACTTTCAATGCCAATAACCGTAGGGCTT
TATGCTAAGTGGGGATCGGGAAAAAGTTTTTTGCTTGGTAAACTCCGGGA
TGAAATGAAATCATTTAGCAGAGAGTGGGTGGATCCTTCTTTTCACAACT
CTCCTCTTCTTTTTGCAATTATTTTACATATAGCAGCCTTTATTGGCATT
ACAACCTTGATAATTTCGTATACAGCTTCTTCATTAGGAAATACTAGTGG
ATTAGTTGGACTTATTGTCGCACTTTCCACGATTGTGCTGTCTTATATAT
TCATTTTAATCATTCGTCAAGGTTCCTATAAATTTAATTGGCTCTCTTTT
AATATCACCATTGCATCAAAGTTTAATTCGTTGAAACTAATATTACAAGT
CATGTTTTGTCATCCTCCTGGACAAGAATTCATCAATTCTGTCATTGAGG
TTCAACCATTGAGACTTTTGTTTACGGAGCAGACTAAAGGTATGAAAATA
CAATTGTAAATTCATATTAAGTAGATATTTGAACTTTACATAGATGTATT
TTTGTGTTTCTTATTATTTTCAAATTATATTTATAGTGATTACCTCAGCT
GGTGGTCAAAATTCAGTGACTCCAATGATTGGTTCGCTGTACGATGCCGT
TGAAAAACAATATGGAAAATTTGCTAGTCGGCTTTTTCGAGCATTTCGGC
CAACGCCTGTTAAAAATACTTCACCTATTAGATGGAAAAAAGTTTGCTGC
ATTCCTTATATTGTAATCTATTTCATTTGCTTCTTCCTTATTCTTGCTGG
AGTTGTTTTAATTATGATTGAGCTTATGTACACAAACAATTCAGTTCAAA
TGAATTTCAATAGTCCAAAGATATTTGATCATCCAGTAGCTTCAACTAAG
AGTGCATTTGAATTAAAAGACGATGATGAAATGGAAGATGATGAGAACGA
GGAAGATGATAGAAGACGTATAGATCTATTTGAGCTGGACATTGAAGAAG
AATTTACTACTGAAAAAATTATTGTTGGTTTGCTGATATTCATGGCGATT
ATGCTCCTAATTATCATAGTCGGCAATTTTTACAACATTGTACGAGGCAT
CCATGCATTGATATTTTCTCAAAGACAGCATTTCCATCGGACTGTATCAA
AAGTGGATTTAGTTAAAAGTGAGGGTTATCTGCAAGCTGTTAAGGGTGAA
GTTCAACTTCTACAGGAGATGGTAAAAGGTTTAGATGCTTTTACTGGTCA
GCAATCTCGAATGGTAGTTGTAGTAGATGGTTTAGACAGTTGTGAGCAAG
GAAAAGTATTGTCAGTATTAGATGCTATGCATATGTTGTTTTCCGATAGG
GTAAGTTCTTATACATATAATTTTTATAAAAGCTATACCTACCCTTTGCA
CATATTAATCGTATACTGTTCTTATTCTGTAGGGATCTCCTTTCATTATA
ATTCTGGCTATTGATCCTCACGTTATTACAAAAGCCATTGAATTGAATCT
GAATAGAGCTTTCATTGACACTAGTATCGGTGGAAACGCATATTTACGCA
ATTTGGTACATCTTCCATTCTTTTTGCAAAATGCAGGGCTCCGCAAAGTT
AAAGTGGCTCAAAAAGTTGCAAATAAACTTAAGAGTATGTATGGTTCTTC
AGTATTAATTGAAGAGGTCCAAGGTGATAGAAGAACTTCAGTAGACTCTG
TATCTACTTCAAAAACCAAAAAAACTAGTAAATGTCATCTTAGAAAGGTT
GAAAGTGTTGCAAGCAGCCTTGGTAGTAGAGTTCTAGCTACACCTGGAGA
ACCGTCTGATCTCACTAAAATTCTCCTTAGTGACGATTATTTCTCGGATG
TAAATCCTAGGAGTTTGAAACGTCTCATGAATGTTATTTATGTTATGGGA
AGATTGCTCAAAGCATTCCACATTGATTTTAATTGGCACAGGTTATCGTC
GTGGGTTAATATCACGGAACAATGGCCTTATCATGCTAGTTGGATAACAA
TATTTGTAGAATTAAATGAAGGTGAATTTATAATACTTCTCGAATTATTC
TTATTGTTTTTTTTTCAAATAATTAATAGATCACCTTGATGACCTTACTC
CTTTGAAATCAATTTACAATATAATTAAAGGTATAATTCCCACTCAAAAA
GATTTAGAACCATTATTAGAAATGGATCGTGATGAGAAAAAGTTTGAAAC
TTTCCTTTCATTGCACAAAAAGAATTTGGCAGTTTTGGATGTCAAGATTT
TTTTGCCTTTTACAATTAATCTGGACCCCTATTTAAGAAAGATAATAAAG
GATGAAATTCATAACATGGAGGAAATGGGTATTGAAGTTCCTACTTTAGA
AGGTTCTAGTAATGTTGCTCCGTCGTCGACTCCAGCTCCTACCTTGACAA
GGCGACAAGCGACAGAGTTAAGTAGAAAAATGTCACATCATGATTTAGGT
AACCTCGGTGGTAATACTCCTGGAGTTCCCTTTCCAAGCTACCCAATTTA
TACAKCTCCTWTTTCAAGATATTCTGCACCAKCAGCCTCTGGACAAAATT
CAAATACTCAACCAGGGAAATTTTATGACATTTATCATAGACCTTTAGAA
GAAAAAAGTCAATCTCTCATTCAACTTCCATCGGATTTAACGGAACAGAA
CTTGGTAAGATATTTATTATCAATCGTATGATATGATAATTATGAAGTTA
TGCATTATTTAGTCTCAACAATCAACTGAGGAAATTTGTGAATGGGTGAG
AACATTTAAGGGGCTCTCAACTAATAAGTTAGATGAGTATTGTTCAAAAA
TTATTGCTGAAAATGTAAGTGGTCAGGTACTCAAGTCTTGCAATTTGGAT
GAACTAAAAGTTGTGATGGGGATGAATTTTGGAGACTGGGAAATTTTTAA
GAACGTAGTTCTTGCTCTCAGAAATCACGAAAAGAAGAATAAGATTGTCA
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CAAGAACCCCCTATTACTCCTATTCCAACTCAACAAAAGAAAGTTCATCA
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GTAGTTTACCTTACTTGATTTTTAGGTAACTCTTGAGGATGCTATGATAT
CTGGCCTACTTTCAACTCTCAATGAAGATGCTCAAGAAGATGTTTTATCC
GAGGAGATTAGTAGTTTTAAGGGAAGCATGGGTCAGCTTTCCCATTTAAA
TTTGTCTCCAAGCATTGGAAGTATGAATGGTGTTGAAGTAGAATACAATA
AGGTTAATCCACCTCCTCATCGAAGTCGTACTCAGAGTGAGAATGAGGCT
AGTGTAATTTATCTATCTCACGCAAGTCCATTGTCTACTTCAAAACTTGA
GGCACATATGGACATTGAAAAAGGGTCAAGGTAGGAGTAAAAATAATTAA
ATTCAATTTTGAACCAATTACCTATATTTATAGGCCTAGAAATTTATCAG
GAATTCCCTCATGGGCTAGTCAGGGAGATGTACCTGTAATGGTCAGTGTT
CCTACGACTCCGATAACAGATGATCTCCAGCCAAATCTTCATTTAGATAT
TTCCTTGGACAATTCCAGAAATTTAAGTGGATCTTCGATAATGAGAACCA
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ATCTTCATTTTTAGAAAGTTTGGGACACAGATTCTCAATTGGCTCSTCAA
TGAATCAGGMTCTTCAGTCCCKTATTAGTTTGGAAAAAGTAAAGAAGAAA
ACAAAATCTGGAGAAAACTCACCGACGAGCTATGATTCAGACGATCCTTT
ATCTTCTCCTGAACAACTGACAGTGAGCAAACGACCCAGCTTTTCAAATT
CCAGAGGGCCTCACATTCAACAAATATTTAGCAGCCAAACAGAAAGTCAA
GATCATATTTTAACTGCCGTTCTCCCAGATGGGAAAAATTTGACAATGCC
CTCTGATCACAAGGCCTGATTTAGTTGTGTACTTGAGGAGTAGTCACTTT
TTGCGATACAGTACCCTGTAATCTAACATGAATTCTATAAAATAAATTAT
ATTTATTTATAAGCATAAGTCCGAATATGGGATGACAATTTATTCGTTAA
TATGTTTTATATATTACAAATCGCCCTCTGTTAGAGAAATCATTTAGTTT
CTAGGATAATTAATCCATGTTATACATGACAACTAATAAGCGCTCCACAG
GGACTCAATTTGTTTAAATTAGTAATAATTAAGTATCCCAAGACAGATAC
GAAGAAGCAGCTTGAGCAGATAAGCCGTAAGATTTTCGGTATTATTGGTA
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GAGAAAAATAAATATGTATTTATGCGTGCCATTATGGAAATTTGCTTCAT
TTTTATCATTTTATCTTTCCTTCTTTCCTTAATGTAACAATTTCGTCCTT
AATACTTCACAAAAAGGCATACTAGAGCTAAAATGAGTAAACTGCGAGAC
ACCTCTCCAATAATACAAGCTTGTGCTGCTAAAAACGTCACAAACAACAA
CTAATTGCCTATTCATTCATAATTCTTAAAAAAATTAGCAAATATTTTTT
GGGTTAATAAAAAGGGACACACTATAAATTCAGAATTGCGTTGAGTCTCC
ACACGTTTAGTAATATGTAATGTTAAGTTTCCTTTCTTCTCAATAAGTGA
ATGAACTTGGAATGATGCTGCTGATTGATGCTGTTTGAGTACAAGAGGAG
AATACTATCCGGCAATTCCTATTATTTTTTTTCTTATTCGACTTCGTCAC
AGAAGTTAATGATCCAAAAGATTGTCTATTAATAATAATTGTATAATATA
TATCTATAATTTTGATAGTTGGAATTTCATATTTCAAGCATCCTCGTGGC
GAAGCATGCAAAGCATCGAAC back to top
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