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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s3 | supercontig | LSalAtl2s3:1220121..1234349 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007048 >EMLSAP00000007048 ID=EMLSAP00000007048|Name=EMLSAP00000007048|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1037bp
MLGGPPVPQYLHHQNNANSTNNMGYRYPMDPNLRLSMGSLIETGDLHNTT QYCGAHTLQRYSSTSQXPSSVHIGPPLPATNYYGVSHPMSGNYSIPHGYY PVYSSKEGISDNRTQPNTPDLLIHRRQQNLMESSANSGETSKSLERLIDN GMMHPPPPPPLSTLPNQNSSTADCIYGDTLITQEMARQVQMISEGVQTNG IPKPPPPYNPPPPPVRGKQISPHVASQTPGYKLQVYEIDSAPFQNNKIEQ QIQTTETPLQPASPPSSPLPQLSSSPPPPVPLSPPPTQMIAYTAAEKRNK FQKSLSEGEILEGKQSHSSSHNFSLSQNNLTSSFMQAVDDGEDSDRELPE LVSIDISMKKEIKPFEEILSPHSFSSSQECFTPTPLNSSNSPENEVTKEP IITPTNECPILEKTSADIIINDTCSKRKQEMTLNLETPPISGKPKTNGTH TGTVSENSLIWQRGISNGEVKKKKKALEEQIQITSKPLIKTQTSLDSPCL VRSPAMHEGFKVENYIVERTPIHTPEEFPTEEEVLHLESPVQVEIVNLES TKKLKDFKLGERTTSLVEPPTDFADSPIRVYHKSPEEENIKITEVIVEDS DNVKSPPVVATIRRVRSRSRSRSKERLLAKMAGAAEAPIVSFNEEDDIQG CYVGSYSKTSWAFIGEPPKQMARSSSIDSTQSERDFKRRHQAITHRMVHR RSSALMYSRILERSFECNKTVTVQRIRGEFGFRIHGSRPVVISAIEPDTP AQRSGLEVGDIILSINGVNVLDLPHTEVVRTAQTGSDELELGLARVNEES PISYTEKSMEKLDESLKVVNSGYLWKMSRDETKRWIRRWFDSRPLGVYLL ADSTLHQGNQETHEKTSSYSFKVSWNVSGVVNVLDLAAESQEELDKWNQA ISSVSKKTIEEDFWFDIVNQRLSLPCQEFPGKIDASGYLLKLDTDSKSWK KRYCLLCDSCLYLYSDTNSKFALASLCLHGYKVQSTASLGGNKRHAFELM PPLKSLRYFYFVAETETEKKRWLASLEYSLDFWIKVS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s3:1220121..1234349- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007048-702895 ID=EMLSAT00000007048-702895|Name=EMLSAT00000007048|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14229bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s3:1220121..1234349- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTTAGGAGGTCCTCCTGTTCCTCAGTATCTCCATCATCAAAACAACGC
TAATAGCACTAATAACATGGGATATCGATACCCAATGGATCCGAATCTAC
GACTCTCAATGGGATCACTTATTGAAACCGGGGATTTACATAATACAACG
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TAAAATAGAGTCTTTAAAAAATTAAAAAGTAAATAATGTTAAGTCTATTT
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TAAAATATATTTTAAGAATAAATAAGAAACCATTATATCTCCATAATATC
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CATGCCTCTAAATAGTTATCCGTTTAATTTAAACAACATATTTCTCACTA
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TGGAGAATAGTATTCTTTTTTGCAAAATTTTGTAATTGAATTACGCAACA
TTTCACCCAAAAAGAAATCAAAAATATCTTAAATCACTTGAAAATTACTC
AAATAAGTCAATCYTACCAATTATTATTTATCTTTAAAGTATTCCCAGAG
TATGATTGTCGTATTCTTTTTCACAATTTTTAAACAGAATTACATATATT
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TTGTTCACCCAACCTTGCTTCCAAAAAGAAACAGAAAAATTCCCGAAATT
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CTCTTTTATAGAACGGGGCGTTACCTCACTAACATCAAAATTTATAATTT
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TTTTTATTAATTTGAGTCATGTTAGTATGATCCTAGAGCTTATAAAAACT
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GGGAAAACAGTCTCACAGCTCAAGTCACAACTTCTCTCTATCACAAAATA
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AGCAAATTCAAATTACATCGAAGCCATTGATAAAGACTCAAACATCTCTT
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AGAAAACTACATCGTTGAAAGAACGCCCATCCATACACCAGAAGAATTTC
CTACAGAAGAAGAAGTCCTTCATTTAGAGTCCCCAGTTCAAGTAGAAATT
GTAAATTTAGAATCTACGAAGAAATTAAAAGACTTCAAGTTAGGGGAGAG
AACCACAAGTTTGGTGGAACCTCCAACAGACTTTGCTGACTCTCCAATAA
GAGTATATCATAAATCTCCCGAGGAAGAAAATATTAAAATTACGGAGGTA
ATCGTCGAGGATAGTGATAATGTTAAGAGTCCTCCTGTGGTAGCAACTAT
TCGAAGAGTACGATCTCGTAGTCGAAGTAGATCAAAGGAAAGACTGTTAG
CAAAGATGGCTGGTGCGGCAGAGGCTCCAATTGTTTCTTTTAACGAAGAA
GATGATATTCAAGGTGAATTAATTAATGTATCATAAATTTAGATATACTT
GTCTCTGTCAATTTAATAATACGTTTATATTGTCTCACATTATATTTATT
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TCATTGGTGGTATGAATAAGTCATATATGGAAGGMAAGGTTTAGGGTTAT
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TCCAATTATAATCTGTTCCATGCATGGTTACCTCTCTAATTTTCATAATT
ACATATTCTTTCTCTTCATATATATCTACATTTAGAATGTAACAAAACAG
TCACTGTTCAACGCATTAGAGGAGAATTTGGATTTCGTATTCACGGCTCA
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CGGACTTGAAGTGGGAGATATCATTCTATCTATTAATGGAGTTAATGTTT
TGGATTTGCCCCATACTGAAGTGGTTCGAACAGCACAAACTGGTAAATGG
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TCATTGTTACTAAACTTAACTAAAGTTACATAATATACGCACAATTTCAT
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AGAAGCTCTTGTACCGCAATTTGAGAAGAACAGCTTTAAAGCATTATTAT
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CGTTCAAAACTTCAAAACCTGTTCGCAAGCCCATTATAAGTAAACTCATG
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TATACATTTATGGAACTTTATAAAAGTTAAGCTCTTAATGAAACAAATCA
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GGATTCTCGTCCATTGGGAGTGTATTTATTAGCGGACTCGACACTACATC
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TCTTGGAATGTATCTGGAGTTGTTAATGTTTTGGATTTGGCGGCTGAGAG
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GTATAAAGCTTTAGGAAATAATAAAAAAGGGATGCGATCTTTGTGTAGAA
CTATTTTATTTTTGTTTAGTTCAACATTTACATATATTTAATTAATATTT
AAGCACGAACATATTATTCAAATGTCGAATTTTATTTATTCTCTCATTTT
TATAGGAAGACTTTTGGTTTGATATCGTAAATCAACGGCTTTCTTTGCCA
TGTCAGGAATTCCCAGGGAAAATTGACGCCTCAGGTTATTTACTGAAATT
GGATACAGACTCCAAATCCTGGAAAAAAAGATACTGCCTCCTTTGTGATT
CATGTTTGTACTTGTATTCAGACACAAATTCCAAATTTGCTCTAGGTAAC
AAATTAGTAATGTGTATTCATTAATATATCTGCATTTCAATTTATAGCAT
CCCTTTGCCTACATGGTTATAAGGTCCAATCCACAGCTAGTCTTGGGGGA
AATAAGCGACATGCTTTCGAACTTATGCCTCCATTGAAGAGTCTTCGATA
TTTTTATTTTGTAGCTGAGACAGAAACGGAAAAGAAAAGGTGCGTTTAAT
GTTGTTTTAAGTGCTTAAAAGTTACGTCACTTTTGAGAAATACTAAAGAA
TAAAGTCATTAGATTTCAAAATAGGAATTATATATATATATGTTAAAAAT
AAGCTTATAATTGTTTTAACATTTATTCTTTTTTGGTCAGATGGATTACA
TAAGAACATATTTTTTATTTCTTTCAGATGGTTAGCCTCACTCGAATACT
CTTTGGATTTTTGGATTAAAGTATCGTAA back to top
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