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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s404 | supercontig | LSalAtl2s404:347783..355385 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007190 >EMLSAP00000007190 ID=EMLSAP00000007190|Name=EMLSAP00000007190|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=539bp
MSRHRDWDISCKVYIGNLGNSASKYELEDAFSKYGPLKNVWVARNPPGFA
FVEFEDPRDAEDSVRGLDGXRVCGQRVRVEMSSGQSRNGGSRRDGRGSGR
RRDDRVRRGDSAERVRRRRRSPSYRSINVLMMLRLLTVTLFVSCSLGMQE
PLLRVARKTGFTDCSNTDGINMCDYESHEELVYKLKELSIRFPELCEIGT
IGQSEEGRLLVYAKLGLRPRGLGKPLFKYVGNMHGNEVIGRQVLLYLTEF
LLENYGINKRVTRLLDSTEIWIIPSLNPDGYETSVEGSCSRGPGRTNANR
VDLNRDFPKQFDEPQRVSFERLARGRAKETIAIMRLLQVVPFVLSAXLHG
GAVVASYPFDDSKAHITGLYSASPDDDVLFSFQELMQVITNLCPEEIYAV
IISQMELQMEHNGMMFLEECRTTITCCKHPTKDNLVQEWINNKDALLSYM
ESVHTGVHGLVIDRYTRAPIRNTMIHVKGNPKSIKGTNRGEYWRLLVPGS
YEIIASAPGYYPQMKTISIDSIKPYSSKVLHFSLQQRDS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s404:347783..355385+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007190-703037 ID=EMLSAT00000007190-703037|Name=EMLSAT00000007190|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7603bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s404:347783..355385+ (Lepeophtheirus salmonis)
GCCTAAGCTACTAAAATATTCAAACTCTCTCAGGGCCTTCCGTATAAAAA
CTTCCCTTTCTCTATTTTTCTCTTTCTTATTAATTATTTGTTAGTGTGCG
TGTAGCTGGACGCTCTATTTTGTTGACCCGCCTTCTTTTCTCTTTTTGTT
GTTCCTCTCCCTCCTACTTCTAAGTTTCTAGGAGGATTTGGCTTTATCAT
TTTTGTTCAAAATCTTCCTTGGGTTCGAGACGTAGTGATCAACGTTTGAG
TCTTGTTTGTTTCCTTCAATTTGTGGAGTCTAAAAGTGTAAGTATTCCCC
ATCATATACAATATATATATTGAAGGATCGAGATATATTTGTATGTATAT
GGATATATAATTGAAGTCCTAATGGGACCCGACTCGTGCAGCTTGTGGTC
CCCACGTTTGTTTGTTGTTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTTATTAAATTTGA
CTGACGCCATTTTGTATTTTTGGACTAAGTTGTAATAAATTTGGGGAATG
ACTGTAATAGAGATGTTATGATAAATGAGGGCAATGAAGTCGCCCCTTTT
ATGATTGCCATGCTATAATGGCAGGGTGTACGTCAATGATTAATTAATTA
ATGAATGATGCTTAAAATGAGTAATAAATGAATGTGCTCCCTCAGTTTCT
TTTTATGTTGAAAAAAGCGGAAAGAGTCATTTTATAAACTTTGTTAATTT
TTTTAAACAGAATTAGAAATCTTCTCTCCTTCTTCCTTTGGTTGCTGCCA
TGCTGCTTACTCTTACTTCTCTACTCTGCTACTTACATAGTCTCAAGTAT
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TTCTACTCAACTTGCCACTCACACCTCATCCCTCCTTCAACAGTAGAACT
AGAGATTTCATTCTCATTTAAACTACTCAAACTTAATATGGCCATGTCCG
TCAACCATGTACTAAGGCCAGCAAAGCCAAGCACAGGCAACAACCATCTC
GCAACCAATAATGCTTATTATTATTGCAATTGCAAGATCCAAAAAATTAT
CTGTAAATCCACTTGGAATATTTTTCATCCCTTCCACAAGCCTGAGTTGT
GTCGTAGCAGCAGCCGCCACCAGCAGTACCACCTCCCCATATCTCTTGAG
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AGAATCATTGCAATTCATAGAGAGAACACTTCCTTTTATACACATAAAAG
GGTAGTCAATCACACTAAACGTAATTACATACAGCATCTACACTCTATCA
TCTCAGACGGAGGATTCATATATATAGAAATCTCTGCTATAGGATGATCT
TCTTCTCTTCCGACAACAAACACACATTGCTTCGAATTTTTTTATTGCAA
TGTAATGCATATATATTAATACAATATCATATGTTCGTTCCATTAAGTGG
TCTTGAATTATATGATATCACACTCCTCATCAGAAAGAGTAACTCCTCTC
CCCTCCTTCACATCGMGAGAGAGGTTRGTWTCCCKCTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTCTCTCTCATAAGAATCCACCACGAATGAATTAATTTAAAGTAA
CATTATTTTTTTGTTTAAAAAAAAAAAAATATTTATATATACTACTTTTT
TGAGTGAGCATTTGAGAAAGAGAGCGAGCGAGAGAGAAAGAGTGATACAG
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GTATTGTACCTAATGATTTCCCTCCTAACAATTTCTCCTTACAACTCCTT
ACAGAAAAATAAAAAATGTCGCGCCATCGGGATTGGGATATTTCTTGTAA
GGTATATATTGGCAACTTGGGCAATAGTGCCTCAAAATACGAATTGGAAG
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CCACCAGGATTCGCTTTTGTTGAATTTGAGGATCCACGTGATGCGGAAGA
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CATTTACAGCAGAGAGTTCGAGTGGAAATGTCGAGTGGGCAAAGTCGCAA
CGGTGGTAGTAGAAGAGATGGACGAGGCTCCGGTAGAAGAAGAGACGATC
GAGTTAGGAGAGGGGACAGTGCTGAGCGTGTTCGCAGACGTCGTAGATCT
CCTTCTTATAGATCCATGTCTCGATCTAGATCTCGTTCCTTCACTCCTCC
ATCAAGACGGCGAAGATCCTCTCGCTCTGGATCAAGATCGGAATAATTCA
TTAATTATTTAAGGGAATACTATAATACTTATTAATCWTTTCTMTTTRTA
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TMTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTCAATCTTTGAAACGGTCCTAATATT
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NNNNNCTATTAACTTTTTTTTCTTCTTCTTTATAAATCATATAATATAAT
ATCTACTTAAGTTTGTAGCATATTGTTTTAAAAGTACTTAATATATTAAA
GCAAGGAACACTCCTGTTAAGTCTTTGTTTCCCTGCGGATTGAGTGGATC
TTTCAGTAGTTGTAAGGGATATTATATATATATATAAATATATATTGAAC
TTTCTGCTGGAAAATAATAGTTTTGGGTAAGTTATTGTTTAATTAAAAGG
AGGCCTCACCTGTTACTGGATTATAATGCCTCTTAGTATAGCTCGATTGA
CGACGTATCGAATGCCTTATATTGGCTTTCGGCACAAAAAGGTTAACTTT
CTTTCTCAGTGGTAGAGGGTACTGAAGAGAGGAGAAAGTCTGTCTCCTTA
TAAAAAAAGTGAGGACGTCATTGCTAAAAAGATTCATACAATCCCTTCGC
TCACTCATAAGTTGAAGGACGAAGGAAATGGTGCAATTTTGTGCATTAAG
GATAAAATGCGTGAGGATTGACAGGTAATGTGTTCGTGTTCCACAGGTGT
CTTTGTATCCAGTTATTTATTAGAATACCTACTCAGATTTCCTTAGGACC
CATGTATTTCCTTATTATTTTACATGAAATATGTAGTAGAGAATATTAAA
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TAATGTAGCGATGAACGTTTGATAGATTGAAATCTGGGAAAAGCCCTCAG
TACCACCAGGGTTTTTTTTTTGTAATACACTAATCCTACCTGCATGACAT
ATTTGATATTATTATCTCTTTTAATTGTGTGTTTTATTGTAGTAATGTAT
TAATGATGCTAAGGCTATTGACAGTAACATTATTTGTTTCCTGCTCCCTT
GGGATGCAAGAGCCCCTTTTACGTGTTGCAAGGAAAACGGGGTTTACTGA
CTGTTCAAATACGGATGGAATTAATATGTGTGACTATGAATCTCACGAGG
AATTGGTGTATAAACTCAAGGAATTATCAATACGCTTTCCTGAATTATGT
GAAATCGGAACCATCGGCCAATCTGAGGAGGTAATAATTAAACATATGGA
AATAAAATGATCAAACATCCTAAAATACTCTTGTAAATCTCTCAAATTTT
GTAGGGCAGACTACTTGTATACGCAAAACTCGGACTTAGGCCAAGAGGCC
TTGGTAAACCTTTGTTCAAATATGTTGGTAATATGCATGGAAATGAAGTA
ATTGGGCGTCAAGTCCTTCTATACCTGACTGAGTTTCTCTTGGAAAATTA
TGGAATTAATAAAAGAGTTACTCGTTTGTTGGATTCAACCGAAATTTGGA
TAATTCCATCATTAAACCCAGACGGTTATGAAACTTCAGTCGAAGGTTCT
TGTTCTCGTGGTCCAGGTCGTACGAATGCAAATAGAGTAGACTTGAATAG
GGATTTCCCAAAACAGTTTGATGAGCCACAACGTGTAAGTTTTGAAAGGT
TGGCTCGAGGACGTGCCAAAGAAACAATCGCTATAATGCGATTGTTGCAA
GTTGTTCCTTTCGTTTTATCGGCTAAWCTTCATGGAGGKGCTGTTGTGGC
ATCATATCCTTTTGATGATTCCAAGGCACATATTACGGGCCTTTATTCTG
CCTCTCCAGATGATGATGTTTTGTTTTCATTTCAAGAACTTATGCAAGTA
ATCACAAATTTATGTCCAGAGGAAATTTATGCGGTGATAATTTCACAAAT
GGAATTACAAATGGAGCACAATGGTATGATGTTCCTGGAGGAATGCAGGA
CTACAATTACGTACATTCCAATTGCTTTGAAATAACTCTGGAATTGTCGT
AAGTATTTTATTCTATACTTACTGTATCTAATTGCATAAGTATACTTATC
TTTGTGTTTAATATAGATGCTGTAAACATCCCACCAAGGATAATTTAGTA
CAGGTAATAATTACTCAATTTGTAATTTATTTTTAAAATAAATTATAATA
TGGATTAATCCTAGGAATGGATTAACAACAAAGATGCTTTACTCAGTTAT
ATGGAGTCTGTACATACGGGTGTTCATGGTTTAGTTATTGACAGGTATAC
GCGTGCCCCAATTAGAAATACAATGGTAATTATTAAAAATACTCCCAAAT
AATCGTTAGAGATGGTAAAAAAGCTGTAAATTTTTCATTTCAGATTCATG
TGAAGGGAAATCCCAAGAGCATTAAAGGCACGAATCGTGGTGAATACTGG
CGACTCCTTGTACCAGGGAGCTATGAAATAATTGCTTCAGCTCCTGGATA
CTACCCTCAAATGAAAACTATCTCTATCGATTCTATAAAACCTTACTCAT
CAAAAGTTCTGCACTTTTCTCTTCAACAGAGAGACTCATAAATCCTCACC
TATAGTCCCCATCACGTATTATCATATTTAGTGTAATATTTATCAGATTT
ATGTATAATATATGTACGAGAGAGCAAGTCATTAATTAAATAAATAAATT
TATTTGCAATCAACATAAAAATTTAAAAAAAAACCGCATACTTATTAAAG
AAAAAGAAAGGAAGAATAAAGTGTAAATTAGATGTATAGCCATTGTCTAC
TTTTTTTATCCTAAATATAACTCCCTAACTTGTCTGTTTTATAATCGAGT
CTCAATTGAATCCAATTATCAATGATAGTCCTGTCAAGATTAGCAAGCTG
GGGCCCCTGAGTAGCTCCACGAAGATTATTAGGAGGAAGAATAAGTAGAT
TACACATTGCGTGAAGAGTATCAAAAAGGTTCGAGACTAAGGGAACTTTG
AACGTTGCCATGACTTTTCGATATTCGTTGACATCACAAATAACGGACAT
AGCCCCGGTTGAAGAGTAATTAAATGACTGTAAATGCTCAAAAATAGTGC
GATGGAGTCGAGTTCCCAATTCTAGAAGAACGATCTCAATATTCTTTCCA
TCCATACTCTCCTTTATTTTCTCAACTTGAGCGCTTATGAAACGAACAGT
TCTAAAATAGAAATGAATCATTCATAGGTACTAATGCAGGAACAAGGAAC
CAACTTACTTTAAACATGCCGATGAAGAGTTCACAACACACTCAGAGGAT
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AACTAAGGCGCTCAATGTACGGTCCAACCCTGCGTCCAGTTTTTGCTCTA
ATTTCTCTAATTCCTTCTTTTTTATTTGAAGGCACTCATCGTATTTTGGA
GTAGAGGCAACAAGAGGTACTAGAGAGTCACTGAATTGTTTTTCTAACAA
GTGAACTATGGCATTGGCCTGTCCTATGACGTCGAAAAAATAGAGCTCCG
GAGAGATTTTGCACTCTGGCAGTGGTATACCCTATNATATGAAAACGTAA
ATATTCCCGAAAAAAAAGAACGCTAGTAATTACCTGAAGAGCGATTTCTA
CAGCATAGTCTATATGTTCATGAATTAAAAATGAAATAAGAATATTAAAT
ATTTCCATAGCGTTGCTTGGGAGTTCAGTGGAAGTAGAGAGGACTTGGCA
TCGACGGAACGCCATTTTTGTAAGTTGAAGTATATTGATGGCTACTTCCT
CACTTAGAAATGTTTCTCCACCATAGGAGTCCATTTCTATATTGATATTT
GCTTTGGATGCAATAACACCTTGAAACTCACGTTTGAGGTCTCTAAAACC
AAGAGCATTCCCACTCAGGGACTTTTTGGTGTGTCCCTTGGCTTCGTAAT
ATTTTTGAAGAATACGTGCACATCGATCGTTTAGGAATTTACATTGAGTA
CTTATATAAGTTTCTAAATAGCGCTTAAAGAGTCCTTTATTAAGATTAGT
CAAAAAGAGATGATCGGAGCCGCCAAGATTAAAACGAGCTAGCTCAGTAG
TTAATTGCGAGGTTTTTGAATAGACAGTAAACAAATTATTCAAGTATGCC
TCTTCCTGACTTTTATCTCCTAATTCTTCTTCGATATGATCCTTGAGTTT
ACTATGATATATATTCAGGATGAATTTCCCCATCACTTGTTGTGGATTCG
GGAAGACCTAGATTTGATTAAGGTAGAATGTTAATCAATTATTAAAGACT
TGAATTAACAAATTAATATTCACTTGTTTAATAACTGTCCAACTGGATTC
ACAAAGGGGCACAATATGCTTAAAAATATCCTTTCCTCTAAACTTTTTGA
GTTGTATTTGCTCAATAAATGAATCCACACATTCATTGTAGCCCTTAAAC
GAACTAAGAATCACAGTCAAATCCTTCATTCTCTCCTTGTCATTGGATCT
ATGTGATTTTATAAACTCTTCAATGAGAGAATTTTCTATTTCCGAATGTT
TTGCATCAATTCTAGCTTTAGCATCTTCAAATTTCTTCGGAGGAAGATCT
TGAGCAATGAGTTGAAGCTTTTGAATGATCTCTGCTGCTTCATGAAGTCG
TGACCTATATATATTTATATATTCAAATGAAACATCAAAAAGAATATGAG
TATTTAGAAATATTAGGGTCCTTATTTGGAATGTGAACGTACTTATCAGT
GAAGAGAGGAGAAAGTGAATCTCCAGACTGAATGAACGAATGAAAATGTC
GCATGAGATTAAGAGCGGCCACGTCACGCGATCTAGGAACATTGACAGCT
TCCAATTGATCGCCTAAATGAACTACTTTGGTAGCAACAGAATTAATCTT
TTCATCTAAACTACGATAGGTCATAGCTGCGGATTTATTTCTATCTACGA
GAGTCGTTGTCCTTTTNCAATGAATGGTTTCCTCTTCTCGAAGGGAGGTC
TCTAATTCCTTGACTTTAATTGCTTGGGACTCTTGCATACGATTCAACTC
CCGAATCGCTTCAGAGAAGGCAGAATCCAGAGCCTCGGCATCAAACTCAT
TGGCTCCAACAGATCGCCACGCTAATCTCTCTACAAATTCTTCTGGATCA
AAAGACTCCTGCTCCACATCTCTCCAATACGATGAAGTCGTTGACATTTC
CGATTTATTAAAATTAACTATTCTATTAATAATTAATAATAACTATTAAT
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