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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s410 | supercontig | LSalAtl2s410:645031..652161 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007312 >EMLSAP00000007312 ID=EMLSAP00000007312|Name=EMLSAP00000007312|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=295bp
MWGFIAVLLPFHILLNPLPIHAVNIQSTGDEAVLRCEISGTWDTCRWKHT
FVKENTDTQSLFYCSIIQGTASNTCDPENVDTDYKRRIKIEAKSSSCELK
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QAEYYMAENEDNVQRVTTRVIGNSSRRIIASGIMILVVSCFVAFF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s410:645031..652161+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007312-703159 ID=EMLSAT00000007312-703159|Name=EMLSAT00000007312|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7131bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s410:645031..652161+ (Lepeophtheirus salmonis)
CACATACAAGTCTTATCTTATCTTCTATTTTAAGCAAATGTTCCCTTAAT
AACAATGATTACTTCAACTTTGTTTTTTATAGTTTGTTTTATTGGAGTGA
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TCCACGCAGTCAATATTCAAAGTATGTCTATTTCAGGTCTAGGTGAAACT
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ATACACATAAGAAACCCTAGGTACTGGAGATGAAGCCGTTCTCCGATGCG
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AGTTAATATTTTTCGAACTCTTTATAACCAGTGCTGTGTCGGTCCTTATT
TAGGACCGAGCAAGGACCAATAGGACAGGTATGTATGTAACTATCGATCC
TTGGAATTTTTCATAAAAATATCAATGGTTTGTTAAGCCAAATAAGGTTT
AGTGCTAAGACTGAACTGAACCGAATAAATAAGGACCGACACAACCCTAT
TTATAACACATGTCCTGAAAAGTCCCTTAAGAAAAAAAAACATTTTTTTA
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GGTGCGTCAATAATCTTGACCAAAAATCATTACAAGGAGAAAATCCCAAT
TAATTTATTTACTTCACATAAACATACAGCTTAATATTCAATATACATAA
ATGAGTCTATTCAAGGCTTTACTGAGTGGCCCATTAAAATCTGAGCCCTT
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TAACAAATCAATACCATAAATAGATGTGTGTATGAGCTCTCATAACCATG
AATGGTGCCGCAATGATTACTTTTCTCGACTTGTCCGTAAGCTAAAGAGC
TTAGGGTTGTTTTGTTACTAATTGTTTATTCTTTAATTTATATAAATATG
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TTATTTCGTTACATTTAGAAATTCCGACTGTGGAACGAAATTTCCTTATC
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GGGCCAGACAGATTTATTTAAAGTTGTAGCGGTCAAAGACTGGTCTTGGA
TTTTTTGACGAAAATCTAATTCTTAAATTGAACTTGTATACAAATACAAA
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TTACGGTACACTTTTGATGAGGATACTACAATTATAAATAATTAGTTTAA
TGTTNNNNNGGTTGGTAAGGAGTTGCACTGATAAATCATACGAAAACATT
GAGGTAGTACAATTACTCCATCTAACCCAGGAATCTTGGTGTAAAGTACA
TATACATACATATAGTATATTTCTTTCTCTAGGAATCAACTGGGTCCATA
CCTACGCAGTTAATTCATGGACAACGCGCTCGAGGAGAAATTATTCTCTT
GAACTCAATGTGTCTATAATATAAGGTTCACTTACACTTAATCAGTGTAA
ATCCATCTGACCAGTTAAAGGAATATAAAAATAGATGAACCTGATTTGAA
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AAATAATTTGAAAGGTCCGTGCAAAGTCCAAGAGACGGCACTACTGGTTC
GTATCGAGGTTATTTTTAGTTAGTAGCATCTCTTGGAAGAACACACATCA
ATTTTCAGCCAGATTGGTCTGTCTCTTTCTGTTTGACATTTGTTTGAATG
AAAATTACTAATTGTGCATCAGTATTTTTATGCACAACATGACAAATCAG
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CGTTTGTTTTCAACTTTTTTCGAATTTCGATTCCGGCTAGTGCAGAAAAG
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AATATTATTKTAAAGGTGACCTAGGGAACAAAAAGAAAAAAATGGTGCAG
GTTATACGTTAAATGTTGRAAATATATTTTATAGGTGAAAAAATGATTTA
TTACAAAATAACTGAAAATGCCTTCTTAGTATCTTATTTGACTTAAAATG
AGTACTTCGTCTTTTGCCATATCGAATTTGATCGAGATGTGCGACTATAA
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ACAACTTTTCTGCGCTAGCCATAATCAAAATTTAAAAAAAGTTGAAAACA
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TCAGTTTTTTATCTAGGACTGTGACTGTAGTCCCGTCCAATACAGTCTGG
ATCTAGTCTAGTTCAGTCCTGAATATCAGTCCTAAGAACCTATAAAGTTT
GGTCCTGGATTATGTTACTTAACTTTATTTTTACTTGTGTATAGTATAAG
AACCTCGAGACTGACTTGACTTGGATTCCAAAGCTGATCCTCACCTTTAC
CCACCTCTCCAAAACTAAATTATCTAGGTTCTTACCAATTTCAGTCCTTA
TTGAGCAATGAAGACTGGACTTCCGTCCCTTTTCGGTTATGTTACTTAAC
GTCAATCAAATGTATTTCTTCTTTTTTTAATCACTTCTATTKCCGCCAGT
CCCAAGGACTGGCGGMCTTWAGAAATTGTCCCAGAGACTGAACAGCTGGT
CCTTTGACTGGMCTGGTCAAATAAATAAGGAGTGGCACAACAAGCGTAGG
AACTTGGACTCGAGACTTGCGACTCGACATGAACTCGAGTCCCCATTTTG
AAGACTTATGCCTCAACTTGATCATACAATAAAAGACTCGAGACTTGACT
TGGATTCCAAAGCTGATCCTTGCCTTTCCCCACCTCTCCAAACATTCTAA
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TCCAAAACGTTACAGTTGTTTTTGGAAGTCAAGGAGACTAGATAAGGGGG
TTGAGTTATAAATTAAAAAGTGACTCGCGTTTCAAAAACAATTAATTAAA
TGACGAAGTTTTTTGAATTTATTGAAAATCAAAAAGATATGGGCAAAATA
AGAAATCAGTGAAATTTGGAGTTTCATTTTTTTATTATGTGCAAAAAAAT
GTATTTACAATGGACTACTGTATTCCTAGATACAATAAAGGTTTCACAAA
TTTATCTGTTTGCATATAAAATTGACACATAAAAATTGGTGCTTAATTAA
AATATCTGCCACTTTCTTACTAATTTTTCCATTTTTTTAATTTTTTTTTA
TTTTCTTCTCTTTTTTTTAATTTAACGTCATTTTTTAATTTTTTTAAGAA
AAAATACAACAAAACGATGAATTTTCTACATCATTTTAGTTTCTTATTTT
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TATTTGCACAAATTAACCATTTATCGACGACATTATTGTCTATAACTTAT
TTGCTTTTTCAAGTGTGAAAACAAAATTGGTAGGTTTGTGTTCCTCTTTG
CAATGCCAAAAATATTTCTTAAACTTTTGTTACAAAATTAGTAAAAAAAT
CGTTTTTCCAATTTTCTTTGCAAATTTGGATGTGGCGTTTTTTGTTCTTT
TAGATATTTATTAACAAAAATTAAAGTTGGAATTTTACTCTAGACAGATT
TGTTCATTCATAAATGTTGATGTGTTATTTGAAGTTCATAGCACATTTTT
TTTTAAATTCATAATAATACATATATTAATAATGTTGTCCCGCACCGAAG
GTGTCCAAATATTAAGAAGAAATCACATTGACCATTGCCAATGTGATTTC
TTGCTCCATTCTTGGCTCSAGCATCTCCGGGTAACCCCTGGCTAGTATAT
AATATATATATAACATGTCAAAATTTGGATGATTAGAAATTTAGATTAAT
CAATATTAACATATTTAGAAAGAGAATACTGATACACAAAGCCTTTTCTA
CTGCTCAATTATCCAAGGGACAGCCTCGAATACATGCGACCCAGAAAATG
TCGACACGGACTATAAAAGGAGGTAAAAATAAATTATTGTTTTAGGTTGT
CTAAAAAATATAAATCATACGTTTGTACATCTAACTTAGAATCAAAATTG
AAGCCAAATCATCTTCCTGCGAGCTGAAAATCAGTAATCCCAACTATTTG
GATAGTGGCGAATGGGAATGTTATGTATCAGGGGGTGCAGAATCCAATTT
TATACGGGGGTTAGTTCATATATTAATCGTCAATAAATGGTTCTACTCCA
CTCTAATAAGTGGAGTTGTAAATTCTAAACACTGCCGGTATATACGAGGG
TTGTTTGAAAAGTTTGTAAAAAGACCGAAGATGGCACCTACTAGCACGTA
TTGAGATTATTTTTAGTTAGTAGCATCTCCTGGAAGAACAAAAATCAACT
TTCAGCCAAATTAGTCTATATTACTCTGTTTGGAATTCGTTTGAATCGAA
GAATCAGGCTGAAAGATTAGGGGGACTGTCTTTTGAATTCACAAGGACAA
ATCAAAGTCGGAATAGGAATCTGGAATAGGGTCAAACTATTACATGTGTA
TGTTGTTAATCCTTATTGGACCATTTGCAAATCGAGCTTCAAAAAAATGC
CCKCAATTGACCCCCCCCCCCCAAAAAAAACACACATTTTCCATCACGAC
AATGCACCAGCTCACACCTCAGCAATTTTGGTTGCAAAATTAATGGAAAT
AGGGGTTTAACTCGAGACGCACACAGCACTAACAACCTTACACACCTTCA
TTCTTCTTTCGTCCATCACCATATCACGGATTTTATCAATGATTTCTGGA
ATAATAACCTAAACAAAGCGTACATAACGTTCAGCGTCACTTGTGCCCAT
ATGGCCACTCCAAAAACTTTGAAACATCTTATATATTGTTCTAATCGAAA
GTACAAAGTTCCTCATAGTTTACACAAACTTTTCAAACGAACCTCTTAAA
TAAAAAAAAGTAAGCGAAAACATTGACATTGTAACCCTGACAATTTGAAG
AATGTTTGGGAAGAGCACAGCTTAGTTGTCATGACGTTTTATCAGATTAG
CTGCAAGCAGTTATAAGAGGATGGAGAGAAACAAAAATCCCACTTCGTAT
CTACTATGAGCATCGATAATAATAACTCCGATTTGTCGATCCTCAATTTC
AATCCAAGTCCAACAAATCCACAGTGTTATTTTCCATTTTTCATGATTAC
ACGCCCTTCATACATAGATGTTATCTTCTCAAGAATAAAGAATTATAATT
TTTGGGTCATTTAAAAACGACGTGATCATTTTTTTACATAATGTTTACCC
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GGGCCTAATTTAACGTTTTTTTTATCCAAAAAAAAAAAATTTTAAGACAA
AGATCGATCCTTTTCTTCAATTTACGTCTCATTATCCATATGACGTCTTT
ATACCACATTTACCTATTATTCAGGTATACAATGTTTTAATTAGACCCCC
TCCTTAACGAGGATAGACGTGTTTTTAAGTCTTACCCTTCCCTCAGGTGC
ACACTTGGTTAGTGAATGTCTCTTAACAGCTATGGAAATTACAAAACACT
GTTCAAATTGTCAACTACAAAAAATATCGGGCACTAAAAAATCCTTCGAA
TTTACAACTCTACAGTAACATGGTGTATTTTTAATTGCTAACATTATTTT
CTATTGTAGAACAACTGAGATTTTTGTATCAAGACGGGCAGAACTATACA
TTTCAGAACCTGATATGGAAACAAATAGCAATCAGTACATCGTACTTGAT
ATGGRAAGTAGTCGACCCAAGTTGTACGCAAAATGCCGAGCTTATCACGC
CATTCCATACCCTCAATTCCGTTGGTATGTGAATGAGGTCAATCCAAGGA
GTGAAATCAAGGGTCAGGATGCTCAAATCAGTTTACGACCACCACGAACA
GACTCAAGGGGGCAATATACTGAAGGTTCATTGGATTGGGGTCCAAAAGA
TCTTTGTCAAAATTACAATATTGAAGCAGATCTTTGCAAAAAAGAAGAAT
TTGAATTCGATTTACTTTGTATCATCGATCAAGCAGAATACTATATGGCT
GAGAACGAAGATAATGTTCAAAGGGTAATGGGAAATTGTTATATGTCTCT
ATGAAATTGTTATAAATTGTAATTTTATATTTAGGTTACAACAAGAGTTA
TTGGAAACTCGAGCAGGAGGATCATTGCTTCTGGGATCATGATATTGGTT
GTCTCATGCTTCGTAGCCTTTTTTTAATTAATTACTAATCTTTAAAGACA
TTTATCTTGGTCCTTTTTTTCTCAATAGGCAGTAAACAATAAAAATATTT
GTAATAATATTAAAGCAATATATTATTAAATGTTCAATTTCTTAGACAAT
TTTGAATTTAAATAGTAAAAGTATATTATTA back to top
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