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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s415 | supercontig | LSalAtl2s415:301718..345428 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007344 >EMLSAP00000007344 ID=EMLSAP00000007344|Name=EMLSAP00000007344|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=182bp
MVFWKASRDGCGRFVKLSLIVVNFLTLFGGLSVLGIGLWTLIDKFYIEIL
LRNHLYMFSTYITMIVGVVIIFVSILGCYGAQKDTKYILLTYFITIFFLS
VVLIIGGVLSYVFRDQVKHNLKPEMLHTINIYRPKDTRSDITEAWDATQR
NLKCCGLAKDGMENTPWLAWKMNKLLNPIDAP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s415:301718..345428+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007344-703191 ID=EMLSAT00000007344-703191|Name=EMLSAT00000007344|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=43711bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s415:301718..345428+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTGAGAGTGCGATGAAACGCTTCTTCTTCTTCTCTTTGCTTCTTCTTCA
GTCTTCACCATCATTCTTTTTGATTCTAAGAATTTTACTATATCTATTCA
CTCTTAAGTCAATGTTTGGCATTGAGTCCAGGTGGACTACTGTTTCAAGT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAARTATYTWTTTTKAAA
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GTTATAAGTATACAATATACATATATAGAGACCAAGACAGATAAGCAAAA
GGTATTTGGACGTCGTCATATGACCGACGCCTCTTTTAATAAGGAGTGGA
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ATGTATTTGAATTAAAGTATTTTTGAGAATTCTTACTTCGAGACAATAGA
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TTTTATGATGATTTATGCTCAAAATCTTTAGTGTTGAGATTTGCTCAGAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AATAATTCAAAGGGTAAGGTAAGTAAATAAAGTCTTATTAAATATACCTT
GGTTTTCAAAGGAATAACTTTATGGAAATATCCTTTTACATATGACCCAA
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GTTGATTTTTATTTTTTTTTTCAAATTGCAAATGTGCATATTTTTATGAA
ATTATATCTTTTTCCTAAAGATTAATGAAATAAATAGTAGGTAGTACATC
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AAAAACCTAGGGATGTGAACATTGGCTAAATTGCGGTAAGCGTAAATTTA
AAAAAATATATTTTGATAAGAATGAATGATCTAATTAATTATTCCTCCCT
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ATATTCTCTCAGCGTAGTTTTTACGCTCACCGCAATTTCGACAATAAGTC
CATCTCTACTAATGAGGTGACTATCGTGTTTTTTTTTTTAAAGTATTACC
TTTGATTTTCTTGGGCGGTACCCACCACCAATACAAGGAATTCGATTAAT
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TATTTCTGATGAAATGTAAACAAAAGAAAACTATGCATGAATCGCTTTAA
CGTAATGGCTACACCTCATTTTTKATCCATTCGAATGTTGTCTTTCATAT
ATATATATATATGTATATATTATGTAATTATTCTCTTTTTACCTTCAAAA
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TATATTACAAATAAGTTATCTTTCAAAACCATTGACATTACTTTATAGAC
AAAAAATACAAGTTCCTCCCAACCTCAGGTGAATGCCCTTCAATATAATA
ATATAAACATAAATTGATATGAAGATTTGATTGATTCGAAATCTATTTTA
AAATTACTAACAACAACAAGACCCACAAACAGTCGAACATGATATTTAAG
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AAAAACATAAATATTTATTCGTATATCAATGTAATTTAATTTAATTATAG
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CTCACTCTATGAACCGATTTTCTCCCTTAACTTAATTTATGATTTGTACA
AATATGATTCATGTAATTATATAGGATTTTTTAGCTTCATACGATTTTAT
TGTAGATAGATATTCATAATTTTGAAACACATATGACGTAATCAACCATT
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CTTTCTCAGGCCAGTCTAAGAAGAAAAACCCAGCAATTAACATATATATA
TAAATATATACAGGTACTTATTAACAATTTAATAATATCATGACATCTTG
CAACAGTAATAATAACAACCTTGAAAGATGTTTTGCATTTGAATTGAAAC
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AAATGGATTATCCCTTTACTTTGATATAAATATATTTTGGGCTTAAATGT
AAATATTCTTTATATTTAATATTTGAAGCTTAATACTCGTGTATTTATAA
CCTAATGGATGAATTGAATCTGGTAAAAAGTCCATCATATGCTAGGAGTA
AGCTTATTGATTTGCTTCAATGGCTACAGTCTTTTAGTGTTACAACAATT
TATACTATATAATATACAAGTATATTATATAGGATTTTTTTAGTTATACC
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GTTCCACTTTATTCCTACTTGGGGATACTCGAATGGAAAATAAATTATAA
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CTATTCATGGTTAGGGCTTTGAACTATGATAAATGTGTTTATATAATATA
GCTTAGTTTGTGGGTAGTATTTAAAAATTCATGATGTATAAATATATATT
ATACTATGTACATTATGAAGTGATAAGTTCATCACTAATCCATAGTAATC
CATGCCTATGTTCCTGCTAGATACAAAGTAGGATTTGTGTTTATTTATTT
CCCCTGACAACTGCTTACAGCTGATCTCATAAAACGTCATGTCATCTTAG
CTGATTTCTTCAAAAACATTGTTCAAATTGTCAGGAGGACTACGATTATT
TTCTGTTTCTTTTATTTTTACACACTGGTAGATCATATTTTATACAACAC
TATGGATGTAGCTGTTTAAAATAAAGACAAAAACTTCACTTTCGATAGGG
ATATAACGGTCCCAAAAATTTTGACGCCCTATTCTTTCCTGTCCTAGATC
TTAAAGATGCATCCGAATCGTACGTACAAGTCGTACCATATCACAATCTT
TGCTCAATGACGTCAAAATCATAGATCATAGAACCAGTGATGGCATAATT
AATCAATGTCACCCATCAAGGATCTCATGTTTATAAGAACAATTAATAAA
TGCTTTGAATTATCCTAAATTATACAAGAATAATGACTGTGTTTATATTA
AAGATACTTAAGGATTTAGTATACGACATAGTTCAATTGAAAAATTGAGG
TACTTTACTATATTAAGTATTTTTGAAGATCATTGCTTGTAGTGGGCGCT
TTAAAATTTTGAACGTTTTTCAATAACCGATATTATAAATTTTTTACAGG
ATTTTAAATTTAATATTAAGGACCAACTATGCATAAAAGTCATTATTCTG
CTAGTCCAAGTTGAGTCTAAAGTTTTAGGTTACAAGTCCTTCAATATTTT
TTCGAGTCCAGTACGAGTACTCCGATGTCTTTTGAATTCATTTCAAGTCC
ATAATTATAAAATAGAATTCATAGTGGTATGTAGTGTTGAGACCTGTTTT
TTTTTGTTTGTTTTTTTTGCTTCGGCCCTAATTTATTTTAATTATACGAA
AATCCAACATTAGTGTTATGGCTTTTCTTGAGTTGATTGTAAAATAGTTT
TTGAGTGAATTCGAGTTACAAATTTTTACTAGGGAGTTCAAGGCAAGTCA
AAATATTTACTAATGTCTAAGTCGAGTAGAAAGTATGTAGTCCAACTCCC
TACCTGATTGAAAGGAGAAGCACGAACCTAATTCAAATCCATTAAAAAAT
AATGATTGCACTACTATTCGCTCAGCTATTGGTCGTTAGCTTTTAATATG
GCTTATTTAACTCCAATTGTCCCTTAGTTCTTAGCCCAAAATGCATAATT
GTGCATCTAAGCATGTATGTATAATGTATACTGTGGGATACATTTATGCA
ATTATTTATTTATAGATAGATAAAAACGATTCCTGGATGTTGACGACGAG
TGCATACTATACAAAATACATACCTAATTGCGTATATTATAAGTGTGCAG
TTCCTATATCTACTTATAATTGTAATATAACATCTTTCAGTAAAAACAAA
GTTGCNNTCTTAACATACTATACAATATAAAATAAAAAGTGTTGAGACTC
AGTGCAAGACAGAATTCATTTTTCGGTTCATTCCTAAGTGATTTTTTCTA
GACGGATTTGGACCGATATTTCAGTCCAGGTAGCAATCTCAGGCGGTAGA
CCGATTTTCTTCGTGCTTAATCTATGTAGCGATTTCCTCCGCTCAGAATC
TATAGATCATTTTTTCTTTATCCTGATTTGTACAAATGTGTTTTATTCAA
CACTTTTAACTTCATCACTGTTCACAATTTTAAAATACACATGACACAAC
AATTCATATATATAATTGATCTACGCCAAATTTTAAATGAAACCGATATT
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AGACGGGTCAAGGATTTTTAGTCCAAAACCCAGCACTAATTATAGCTATG
TAGAATGTACATATGCACTTCAATTGTTATAACTGTATTTCAATAAGTAA
GAGAGATTTTCTGGATTTGGGAAATAAGGTAGGATTTAAGTAGTTAAATA
TATTTATTTAAGATGTGGAAAATGATTCGTAACAGGAATAATATAGATAT
TAAGGAGAGGGAGGCTAGTTGACACGTTGGTATGTTGATGCATCTTAAAT
ATCTAGCACGTTTGTACAAATGATTCTTCGGTGCCTTCCTGGAATAACCA
CTAACTTGTAAGGATAAGCAAAATGTAGATAAAAAGAACAGTTCTAAGAT
TAAAAAAGAAAAAAACGGTTGGTGCTATCGTTCTTTTTTCTTTTTTTCTT
TTTTTTTTTGTGTGTGTGTATGTTCATTCTTTAATTGATCGTCGTGGTAC
TAACATCTCTCTCTGAATACTAATTTCCAGGATACTTTTGCTGTTAATTT
TTTGTATCAGGCACAGTCTTATTGTGAAAATGAATATATACTCTGTATGT
ATTTTTGTCAGCACTTATTAATATACTGGACACAAGTTAAATCTTGTCAG
ACAATAAATATCTCAATAACTAAATAAGGAAAAATTCAACAGGCCGGCGT
AATTTACCAACTTCCAGTTAATTCAGAGCATTTTTTCATTCTCCTTTTGG
AGAAAAGGTTAAAATATACAATGAAAATATCTATTTGTGACGAACAATTT
TATAAATTTGTCATTAATTTGATCAGTTATGTTGAAAAAAAGTAAGGGCT
AATATTACCTAGCAGTATAAAAGATAGTTTTTCTTAACGTTCTCAATTTT
TTCTTTCTCATCCCAACTCTCTTCAAACTGGTTTTCATACAAACACACAC
TAACGGAGAATAGTCCGGTACAAATGTCACTCAACCACGTCAGTTGCACA
TTATGCTTCCTTTCGATAACATACCACTGTCTTCTTTTAATCTGGATCCC
AAATGTATTGCTATTTTGAAAAAGCATATGGCTTYTCCATTTTTCTTGTT
TCAACTGTAAATTATTATTTAGAGAATATTTGTTACCTCTACTAACGAAG
TTGGATGGAAGTTATATAATCGCCTCCGTTTTTGTTGGGTTTTTTGTCTG
TTTGTAAGCAAAAAATCGGGAAAACTCATAAAAAGTAAGACATTGAAGGA
AAATTATACTTGTTAACAATAAGAAACTGTTAATATTATTTTTTTAGAGA
GGCATAATCGACTATAACTTTGGAACAAGTTTCGATGAATAACTCATTTT
AGTTATAATTATTTAGGTATAACATGGACACTTTTGCGGAGGTTTGCACT
TTATCGAGCGCCCATTCTAGTTGACTATTAGATACATTGTATTGATCATT
TTATCAATGACTGTGCATAAAATGATCCAAAATTTAAACAAAATGACAAA
TAACATCTTTTTATTCTCAACTAAATATAACTTAGTATAAAAATCTAAAT
CCTATGTAATACTTGTTTCAGTTCATAATACATAGAATCATTGAATCATG
CAAGAGGTAACTCATAAAAATAAATTAATAAAGCTGCATTGAAGTTTATT
TCAAAAAGCTGATCGTCATAAAAAATGGGTTTTGTTTTCTAACTTATAAA
CTTGAGTCAATTCTTAAAAACGCGACTCAAAACCATACAACATTAATTTA
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AGATTATAGTTAAGTAACCAAGAGCTTGTTATAGACCTATATACATACAC
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CTTCCGCCATTTTTCAATCTTTAATGTTGGGTCAGCCCACTGCATGTATG
TTGATAATGCATACWTGGTAGTGGTAGTTGCAATATTTCATTATTGTGTT
TGAGTCAATGGAGCGTTTGCTCTAAATTAGCATACCTAACTCATACTCTG
CGTTCCAATGTATATACGTACTTCAATAAAATGCACTCTTCTCTACATGC
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GATTTTTAAGTACACAGTCCTAGAACTTCTATTACCAATAATATTCTTTT
GAAGATATTAGACTCTCAAATAATTAATAACTAATAAAGAGAGAATAAAA
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TTATTGCAGAGGACATCATTTAAGCCTTCTTTTAACTTATATGAAATGTC
AAAAAACCTCACTATGTCTCTTTTCTATTAGAGTTGGAAAAAAGTAAAGA
GAGTTCTTTAAAAATAAAAATAATAGTACAACTTGTCTTTAAAGAGAGAT
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TAAAATGTGTCTTCCTTGTAGGAGTGGAAATTCCATGATAAATTCAATTT
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ATAGACCACTTCAAAATAGACATGTTTCATCGAACAAATTTAACTTGATA
TTATTCTCATTTTTCAAGGTCATAACTAACTAAATATATCAATTAATTTT
ATTTTGGGTGTTAGTTTTTTTACTTTTGTCAAAAACGCTACAAATTAGTT
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TTTTTTACCACATTATATGCTATAGCATCATCCTATGGGAAGCTACAGTT
AAAACAAGGACATAATATCCCAAATTCATAAAACTAAATGGCTCTTGAGG
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TAGACATTGGAGAATATCAGCAATAATATCAGTTTGCATAAGTTTGACGT
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AACTCATATTAATATTGATAATCGGGCATTATAGATGAAAGATATCTGAA
ATCCTACTGTTTTAAAGAACATAATCGTATCGTTTCTTATTTTAGCTTTT
GATATCAACTGCCATATTTAAATTTGATCATTATATAGGAATTCATAAGA
TTTGTTCTCCAAGCCTGCTTGAAATAATCAGTAGTTGCATGGTTATCTTT
CGTACAACTATCAGTATGAACATTAATTATAATTATTTTAAATATCCAAA
GATAAGTTAGTCCTTTTATGTGTATAGAGGTATATACATACATACAAATG
ACAAAGGGTAAGTGGCGGKTAATATGTATGTATATAATATGCCTACATAC
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AAACATAATGATAGATAAAAAGGTGTAAATTATTTACTTCTCTCTAGAGA
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TATGTATTTTTCATGTTTACCATGGGCTATGCTTATGCCTATTGTCGAAA
AGTGGAAAATGAGTACACATTCTACACTAAAAGGGCTCTTATTATCTACA
TATTTAAAAACCCATGTTTTTCTTTTCTTTCTCTCACTCACCCTCTCAAT
CGGTTCTAAGTGTGAAAATATGCTTCTGTACCAAAAATTGTAATATGAGA
GAAACACTCAAAATTGGTTATAAAACTTTTGACTAATTTTGTAAATGTAT
CAACATTTGTGTACGTTTTTAATTTTAAACACAAATGAAACGTAGATTAA
ATCAATATTTCACCACAACCGAGAAGAGAAGAGTGCACAAAATAATTATT
CGTTTTGCAGATAAAGTGCTTTGTAATACAATAAATAATAAATTATCTAA
TGGATCCTTTAGTATGGATGGCATATTGAAACTACTAAGTATTGGCATAA
ATATAAATTTATTTTTGCTTACACAGAAAGTTGCTATTTTACATAACTTT
ATTTTATTAGAAAAAATTGGATAAATCTAAAAAAAAATCCCACTAATTTT
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TAAAGTCATAAATACTTTCCACAACAAAGTTTGATTGTGAAGGGTTCAAA
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ATGGATTAAATGAATTTATTATACAATTCCAAATCAGGCATATTTGTATA
GTACTTAAAACTTCAAAGACTTCCATCTTGTCTCATTCCATCTTTCAATC
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ATTATATCTTTAAGATATTCAAGATGTATCGATGAAGATATCACTGGTTG
ATATCATCCTATGATGAGTAAAAATAATTATTAAATGAACAAAGATTAAT
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GGTAGAATGTATTAACATATTTATAGAAAAGTAAAGAAAGTATTGCCGTA
AAACAAAAAGGAGAATGCATAGTGCATATATCTTCAAATATATAATTAAA
TGGAACTTATTATTATGTATATATATATATATTACGGCTTATAATTCAGG
ACTCTTGAGTTCTTTTGAATAATAATCCATTATTTCAGACCTTGAAACAT
AAAATCAACAGACGTATACATTGACTTACACCRTGGATTATGAATTGACC
ACACCTCCAATTCCATTTGTATATTTTATCAGTGAGAAACATGCATATAT
GTACACCTATAGCCGAGTATGTATTCATTTTAATTTTAATGTTATCTAAA
TCTTGATTATATTTCATAGAGTATGTGAAGGAATAAGTATCATGAATGTG
GATAATATCCTCCTTTTTAGTCATGGGACTATGGATATAAATTTGTAGTA
TAATTATTTAAAAATAATATATATGTGTATTTACACTTTGACATTTTCAT
TAACCTATAAAATTGTTTAGCTAATCAGTCTTATTTTTTATCAGTCCGAT
CTTTTTTGGCACCGATACCCCAGTCCTTCATTCCTACGGACTGAATAGTA
TAAAAATAACAAATGCTAGCTAGAACATATAATAATAAGTTCTATCCACA
CACCTCCTACTATAAACTTCAGCTATCTTGTCACTTGAAAGAGGTTATGT
TGAATATCTGAAAGGTCATAGTTAGTAGGTAAATCATTTCAGCTGTTGTA
GTTACCATAAAAGAATGATAAGGGCCATTCCTATGACTGAAAAATTTTAT
TAGGACCAGTCTTTTCAGTTTTTTTTTACCGATCCAACACTACCTATTCA
TCAGTTTTTTATTCTGTCCAACTGTTCGTCTTATAACTAGAGAGCATTTT
TATACCATAGATAATATAATAAACCGAATAATAACGTCATGTAGGGGACA
TACGAGTAGTTGTTGATATAGACACTAAACAGAATAGACAAATTTGCAAC
AAATCTAATGGAAATCTCATTTAATGGCTTTAAAACTGAAAAAACTTAAC
TTTTATATATGTGTCACTGCATTTTCTACTTGACTAAATATATATACAGT
GTTCATAGAGTACTAGTTAAGATAACGTTAGTTAAGATAAGACAACATAG
GCAATCTTTTGGTAATTCCCAACAGTTAATGCCGTCAGATGTGATTTATC
TTTGATGAAGACATTAATTTTTAATTTGGCAGCATTAGTTATCAACTAAG
TCAGATCATCTATTTGTTAAAAAATCAATGACCTCTTCGAAAATGACATG
TGAGATAAAGCTTTCAAATTTTTAAGCCAAAGGTGAAAAGTTCAAAAGAA
TTAATTAATCTTATTTTTATTTATTCACCACACAGTGTAATTTCTTCTCC
ATTTTGAAGTTTAACGCAATTTGGGCTCGGAATATTCACATATTATCTCC
GTTTGAATGTTTGCCGTGTCTTAATATTTTTTGTTCCTTATATGGCATTC
AAATAGACAGCTATAATCCACTATTTGTCTTAATTAAAACAGAGCAAGGT
TTTTTATTCATATAAACTTTGGTTGCTAATGTCTCTAAGATGACCTATCT
CAGAAATTTTAGCGTCACTTGAATACGTATATACTATATTTATTAGAAAA
TATATGTCCATTAATAACATAGCCAATTATAATTTGAACTCAACAAATCA
ATGTTCAGAAAGGGGCAAAAGTAGATAAATGAAATATGTCAGCTCTTCAC
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ATAAGGAGAAACATTTACAGCTGGACCCAAAATACAGTGTAAATTTTTGT
GGTAGTGAGGTAACGTGGTGATATATGAACATTTGTTTTGTTTTTTCAAA
AATACTATAATTAACAATATTACATCATTTCCGCAGTTTACTCAATAAAT
AATTGTACATATACATACTCTATATTGAAGGGGATTGCAAAATGCCATTA
TCTATCTATATAAAGTGATTTGATATATTTATTCAAGTATAAAGATAAAA
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AATCTATTGACAATAGAAGAACAAAAATCCCAAACGATGCAAAAACAAAA
ATAAAGAGAGCGCATGAACTTTAAATTTTCTTTGTTTGCATATAAAGGCG
GCAAAAAGTATGTAAAGAATTATGATTACTGAGCATGTGATGAGGAGTAC
AACAAACAAACATACTTATATAGTACATTTACCATTAATAAATATCATTA
TTGTATATAGTCCTTTCAAAACATATTCAAGTCTAGTCATGCTTTGGAAT
AAATAATGGATTCATTCTTTATTGAGTACTATACGTAATATTTTTGCACT
CTATCTGTAGTGTAATAGTGCATATGAAGTAAATATATAAATAGGGATTT
TCTTATTTTCTTGATTTTTGTTCAATATATTTTTTATATTGACGCACTAC
ATGTTAAAAATATTCCTTCCATAGTCATAAGTCATACATATGAGCCATAT
CTATAAGTTTCTTGATACAAACTATTAACMCCTCATGTATATGTGTGTGT
ATTAGGGTGCATCCGACMCCCTCCCCCCCCCCTTCCCTTTGCGGTATGAT
AAAAATGTTCTACCCCTAATAAAAACTCACCGTATGAAATATTTTTAAAT
TCGAATAAATTCTACCGGGTCCGCATAGGACATCTTGTCTTATGAAAGCA
TCAAAGTATTTTTTGTCGAATTTCCACATGCATAGTTTTCTTGCCATGAG
CAAATAAACATATGTTAGGACATGGGCCTAAGACCATTTCTCTTTCTACA
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ATAGGTATTGGAAGGAAATAAGGAAGTAAATTTCAGCTATTTCAAAATAG
ACCCTTTAGTGTATATACGTAATATGGGTATGCAGTGGTTAAATCAATTA
CATAATATCCAATATTTGTATTAGTTAGAATGTTATAGTTATATGTACAT
TATACATATATTATGATGGGTTCAATGAAAGTTCATAATCTAAAATGTAA
CCTTCAGTGCATGTTTTTATGTTCATATTCATACCTCTGTACATTGAAAA
GCCCTACCTATTTTGGAGGGGAATTTATTTATTTACGCTCTTCATGTAAT
AATGACCAAGCCTTGCTATTGATCTTCATCAAAAATGCATAAATCAGGAT
TTAAATACATGCTACAAAATTACACATCATTGATTAAATGTAAGAAATAT
TCAGATCGAAAACATTATATATCTATGAATGTTTTGTGTGTTTTGTAAAA
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TTGAAATAAATATGTGAGGTGTCAGCATAAAAACAATCTTGAACGAAAAT
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