EMLSAT00000007474, EMLSAT00000007474-703321 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007474
Unique NameEMLSAT00000007474-703321
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s429supercontigLSalAtl2s429:306852..321763 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007474 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007474EMLSAG00000007474-690240Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000032813EMLSAE00000032813-741741Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032814EMLSAE00000032814-741742Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032815EMLSAE00000032815-741743Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032816EMLSAE00000032816-741744Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032817EMLSAE00000032817-741745Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032818EMLSAE00000032818-741746Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032819EMLSAE00000032819-741747Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032820EMLSAE00000032820-741748Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032821EMLSAE00000032821-741749Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032822EMLSAE00000032822-741750Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032823EMLSAE00000032823-741751Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032824EMLSAE00000032824-741752Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032825EMLSAE00000032825-741753Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032826EMLSAE00000032826-741754Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032827EMLSAE00000032827-741755Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032828EMLSAE00000032828-741756Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032829EMLSAE00000032829-741757Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776151auto776151Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007474EMLSAP00000007474Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007474

>EMLSAP00000007474 ID=EMLSAP00000007474|Name=EMLSAP00000007474|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1031bp
MLVKAGLNEKTGGNRSNRAESDNPFFKDIDSMPPEFRPRRKSIPLVSELK
LHVYKKXLQALIYPISSAAEKSSKHGADDKANTIIIAMKERMKERERERP
EIFELIRNIFSISPDNHIELMNQGEQTVLDGTSKWSCKIACTVICAQGLI
AKDKTGTSDPYVTVQVGKSKKRTKTVPQELNPEWNEKFYFECHNSSDRIK
VRVWDEDNDLKSKLRQKFTRESDDFLGQTIIEVRTLSGEMDVWYNLEKRS
DKSSVSGAIRLQISVEIKGEEKVAPYHVQYTCLHENLFHYLCEKNGGNVS
LPEARGEDAWKIYFDENEQEIVDEFALRYGVESIFQAMTHFHCLSSKYLC
PGVPAQMSTLLANINAFYAHTTATTNVDPNEAKRDSEDTGPRLDDLEFWH
KLIALITSVIEEDKNSYGPVLNQFPQELNVGQLSAATIWGLFAVDKKYAL
EEHEQSRLCKSSTYLNCHFRVKWLHKTYVSSVPPYKGQVPEYPAWFEPFV
MQWLNENDDVSLEFLHSAYARDKKDKFQKNTEHSNFSNSVVDVFTQLTQC
FEVLQKLECQDPEIWKRYMKRFAKTIVKVLTAYANILKGDFHNHVKDEPT
ACVLMNNIQQTRIQLEKTYNAMGGQELEEDAASVLNQLQSTLNGVLDELA
HLFAMSFNRRVDASVISMGKLLWEVKGGGQGQAISKSEVQAAADGILQPL
MDLLDGSLSMYAEICDKSVLKRLLKELWKIVMKSLEKNIVLPPTTDKSAA
IKNLAGDVKNMAEKTKKVEDVTGFFKSFGGKQDVKSSVMSVVSDISKEGE
RSLSPKQCSVLEAALEVIKQYFHAGGIGLKMSYVNKSEELKSLQHALSLY
TQTTDALIKTYVSSQTHQDSSSSEEGSVGEVSVQVDLFTHPGTGEHKVTV
KVILIGPHLSDKKRLQKTKSKNANWSPKYNEIFSFIIGNEDQIGSYELHI
CVKDYCFGRDDRLIGVSVVQLKDIQDQGSCACWLSLGRRIQMDETGWTIL
RILSQRTNDEVAKEFVKLKSEVRGEDPLQGQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s429:306852..321763-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007474-703321 ID=EMLSAT00000007474-703321|Name=EMLSAT00000007474|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14912bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s429:306852..321763- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTAGTCAAAGCTGGTTTGAACGTGAGTGGGACCCCTTCGAAGCCCTG ATTAGGACTATGTCTAGCTCCAGTTTTTTTATTGATGTATTTTTAATTTA GTTTTAATACAAAAATTGAGAAGTTATAACAAACTTATCACGCGTAAATT ACTTCGCATTTAAATAATATAATTATATTTTTTACTTTATAAAAATAAAA GCCCTAAATACCATTAAAATTAAAAGGTTTATCAGTGACTGACTTGTTTC TAAAACGTCCTTCTTCCAATAACTTCTTCACATAAGCAATTACAGGGGCG TCCGCAGAATTATATAAATATATTTTTGAGAGGGTCGGTTTTTGAAATAT TTTGGAAAAAAATCCATAGCTATTTTATAGAAATTATTTTTTTTTTGNNN NNNNNNNNNNAAAAAAAAAATATTCTGTAAAAAATTTGAAAAAATCCATA GACACTCCCGTAAAATTGAAGTTTATGGCAAAAGATTTCAGAATAAAATT TCAAATATTAAATTCAAAATGTAAATCCATAGTTATTAACAAAATTTTCA TAAATTTAATTTCAAATACTACAATTTTTCGAACAAAATTTTTAAAATCT ATTGCTATTCATAAAAATAAAGTTTTTTGGGAAAAAATTAAAAATTTATT ACTATTCATAAAAATTAAATTTTATGTAAAAAAATTTCTAAATGAAATTT CAAGTATAAATTTTTTGAAGAAAAATCAAAATCCACAATTTTTGAAAAAA TTTCCAAAATCCACATCTATTCACAAAAAAAATCAAAAGATTAATTTCAA ATAGTAAATTTTTTTGGAAAAAGAAACAAAAATCCATAGTTATTCATAAA ATTAATTTTTTTCGGAAAAAAAATCAAAAGTTCATTTGCTATTCACAAAA AATTTCAAAAATTAAAATACTAAATTTTTAGCTTTGCTGCATAATTGGCC 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TGTTTGGGTTCTTCTAGACTATATGGGGTTGTAATGGACTTTTTGATGTT TTAGGCAGTCCAAATGGAGATGTCAACGGTTCTTCTCAGCAATTACCAGC GTTGCTCTCACATTTCTACACTTTGAGACATGTTATAAAAATAAAACACG TTTATTTTTGTTTCAGCTGTCATTTGGTGGCCTAATAAAACATGCTAAGA AAATAAAAAACGTAATTAATTGATATTGCAAATTTTTGGTCCCCATTCTG TATACCCAAAAGTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTAATCTAGTGCCAGTAGAA ATGGGTGTAGGGAATAGTTATTTCCGCCCATATATGAGCATATACATGGT ATACTTAAGTGGGAAGCACGTTCTGGGGTTATTGGCATATTTGTTATTGT ATTTAGAATAGAGATAATTATATGTGTAGCAGTACTGTACATAATTATTA TTTAATGATAAATGAGGTGATATTGACTCACTTCATGAAAGAATCATGTC AAGTAGATACACAACAAAGCTTTGAGGGTAAAATCAAAAGAAATAGTCAC GTCCCAAATTTTTTATTATTACTTTTCTTTTGTCATTGAAGTGAGTTATT TTCCATTTCTTTTTTTTATCCTCCTTTTTCCTACAAAGATTTTTATCTAC TTCTAAGGCTAGAATAAAATATTGCTTTTGGTATTTCTTGGAAGTAAAAT ATTATCAAATCTTTTGAATCTCATGGAAATATTGATAAGGATTTATTTTA TGTCTACAAATATACAATGTATGTAAATATAGAGTACTAAAACGTATTTC TTCATATCTAACGAGAAAATATAGCAATTCAATGAATCTGTAGTACAATA AATAGATGTGAACATTTACTTCAATATCCAAATAGTAATCCTAAAGAATC CGGGTTTTTTTTATATTACGAATTCAATTATCATTCGATGCTCAAATTAT 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TCTTAAAATACTTGATTCAGCTCAAGAAAAGGATGTAAAATACATTTTCG TTTTATATTAATTTTAACAATAATAACTTGGGGTATCAAGAAGATATAAT TCGGGTTTATTATAGTTGAGATAAAATATCATAATTTCCTTTTTGGTATA AATTTCCAAAAAATAATAATTAATTCTAACGAATTTTAGCTACCCAAAAA GTACTCATTAATTTTAATGAGATTCAGTATGATATATAGAATAACAGCGG ATATATCTTTTATAGCATCGTTGTAAATAAATAAAAAACAAAACAACGAC TGAAAAGTGAAAAAATTAATCAAATTCACTAAACCTATATTAGAAATTGA AAAATTTGCGAATTAATGTTTACAGCAGCAAAAATTGCATTTATTCTTAA GGATGTTTCATGAGAATACTATAGATTCGTGATGATAAAATTTATTTTAA ACAGATTTAAAGCATTTTTTAATGAAATTAATGCTACGAAAACTCCCAGT TCACTAACGAAGGTTTAAAGACAAATTGAGGCCTATACATGGTAGAATTA AACAATACGAATACTTTTTGCTTGGTGACAAAACAAATGACATTAAAATA CAAGTATTAATTGCGTATAATTAGGAAATGTTGATAGATTACTAATTCAT ATCAGACTGGCATTAATCTATTCGTCAATAGATATAGTATACATATTGGG AATAGAGATTTATTTTGTCTCACTCATATATTCAAAAATATTTTTTATAG GTGCTGCCGAAAAGAGTTCTAAGCATGGTGCAGATGACAAGGCCAATACA ATCATTATTGCCATGAAGGAGCGAATGAAGGAACGTGAACGAGAAAGGCC AGAAATTTTTGAATTGATTCGGTAAGTATTTGCCAAATAAGCTTAAGTAC ATAAGGATTTTTTTCCATGGTAAAAAAAAAACCTGCTTGAAAGCAACATA 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