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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s430 | supercontig | LSalAtl2s430:288057..377591 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007498 >EMLSAP00000007498 ID=EMLSAP00000007498|Name=EMLSAP00000007498|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=721bp
MRTKVLLIYLFCFVPSVVLPNAIPLEAXFQGRCENGHPCDQNCFNIHNGM YECDCNEGYVLLANGYNCRHINGTSNPSQDSLSPLSYSVSRSSSRNKIPS SKEEYASKTSSSSNSSIAIQIEVDIDPPQRGKNDLSEAEMKSLGLPSHHV HYTSSSIETLGSSSPIKEELLEPGDIQVTYENDDDKSEEGRLNEGEEEEF YRDKMFEIDAYCNMDCGDRGSCFMERVQKEEEVIMKRCLCPLGKHGEKCR RGGAGYFRNYGHYLGVETGFSGCIKRLEINNKVYDFRSKEHGGDSQFGMD ITECPEDNCVLIPCQHNGKCVPLESGHNIWWAINCGTLSISLRKGIISKN VPSFNGTSYLVYTGIGDSSPLWTEIELVFQSSAEDGLIFYNGQRNDGTDD FIAILLSRNYVEFAYDLGDGITVVRSASPISLHVWYTVVISRTGRLAEME VIRGKREDPLKMPVSSRVSNGAFSQLTLEQNLYLGGVPTFDLVSAYLPIR RSFFGCIQKLTINDVEINLVNSAISGVDVGSCDHPCNTPSSSSSNEFPQH PCGVHGNCKPVLDGFKCDCPHGLTGNSCQKITGESNNPLPRFKKSKNALI FWAGNGRNFKKGIVGDYIALGIYNGRLQLKYNLGSGEASITYNWTRINDG KWHRIRLTRNELTASLRMDNGPIYTTMSPGKLKQLNANGEVYLGXYSFLY HNRSKSKGRRDKTVKFIIIKN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s430:288057..377591+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007498-703345 ID=EMLSAT00000007498-703345|Name=EMLSAT00000007498|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=89535bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s430:288057..377591+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGGACCAAAGTCTTATTGATATACTTATTTTGCTTTGTTCCTTCAGT
CGTCCTACCCAATGCTATTCCATTAGAGGCAMCATTTCAAGGTAAGCTAA
TGAAACGTTTCTTCTTTGTGTAATACCTGCTCATGAAGAATAGTATATAA
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GGGAGAGGTGATCTCACCTTTCCCATGGCACTGACTCTGAGCTACACATT
GGGATTTTCTTTTAGAACCCTCAGAAGGTGAAAAGTTCTGTTATAATAAT
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AGAATCGGCATTAAAAAAATCACTTAACAGCAAGCGAATACAAAATGTTT
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TATTGACCGATAATCAATAAACATATATCTATATATGGATATCGATGTTA
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ATAGTACATATATGAATATGAAAGGTTGTGTTATTCAACTTTGTATTGTA
TAGTGGAAACTGGGAGATATTTTATCATGGAGTACATAAGAGAAGAATGC
AGTAAGAAGAGAAAATATTTTTCTGTGTGCTATAGTCTAGTTGTTAAACT
TAAACTTAACTTAACATATATACATACTCCCTTGAATAATGTAAGATTGA
GAAGGTTAATTATTATAAGAGCTGTTTCACTCTTAAAATTGATTAAACTT
TGATTTTTGTGGGAGCACATTGTATTGCTCCGTGATATAGAACAGGTTAT
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AAGAAATCTGAACTGCTGAATTACATAAAATATGTAATAGAGGTCATCAG
AAATATGTATATGTATGTTGGTTTTTTTTGGAAGTAATTTTTATGAAATA
CGTTTTGAAAAACCATATCCTCCAAATATTATCTATGAATTAAGAAAATA
ATCAATCTTTATTCGCTGCTGCCACTACTCATCAAATGGAGGTAAAAAAT
CAAAATATCAAGGAAAATACCCATTTGGTCATAATTTCTGTAACAAAGCA
AATATAATTACTAGGAAAATGGTCTCTGTATCATGATACATTTTGTTACA
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TTGGGCATATTTTAGATAAGTCTAATATTATTGGTTAAAATTGTTTCTAT
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ATTCAATTTTTTGTTAGTTGTTAATGTTATTAGTTAATTCAGCCTCTATT
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ATTACTTCACTCATCAGTGATGGTTTATATAATATACTCTTATAGCATTC
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TAATGGTTTTAAAGGTAACCATTTTTTTAAAATTCCTGCTTATACCCTTG
ATAAATACGGAGTAGTGGGATTTGTGTTTATTTCCTTCTTCTCTAGCTGC
TCACAGCTAATCTAATCAAAAAAAAATTCGAATGGTCAAGATTACGTTGT
TTTTTTTTTAGTACATATAACAGAAGGACATATTTCTTACAAAGATTTAT
TTCTTCCCACTTCTCTTACTTTGATGATATAATTAGATAATGTTTTTATC
TAAAAAAGAAATGTTTTTGTCGCTTGAATTTACATAATTTTCTATTTTAT
TATAAATATATTTACAAAATAATAATTAAAGCAGTTTGAAAACCTCAGCT
ATCTTGAATGTAAAAATATAATCNNNNNNNNNTATAATCGACACTTATGT
TGTATACTTCACATTTACTATTATGAAAGAAAAACACGTGAATAGATCCA
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ATAGCTTTTATTTTATTTTATTTTTATAACCATTTATATTATGAAATATT
CCATCTTTTCTACTACCTATTGTAAGGATTTGTATTCACTCCATCTTTAG
TTATTTTTTCAAGATGACGACGTGTAAAAAGGATTGGCGTATAAATACAT
ACTTATGTAGAAATTTAGAAAAAGAAAGAATCAAATCAGATTTTCATCAC
TTGCATAATAACATAATKCCTACCATATTTATTAGGGTGGTTCTTATTGT
GTACTTCAAAAATTAATTTTTGTGATGTCCTTTTATGAACCTTTCAATCA
GTTCATTATAAAAATATATTTCATGCTTAAAATTGTAATATTTCAGCCAC
ATTTAGAGGCTACCCTTTGCTCCTAAACTTTCTTCTGAAGTTTTAAATTT
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TTACGTTATTATATATTGAATCTTTTTACGCCTAATTTTTCATTTTAATA
TGTAAAAATTGCATTTTAATTAAAGTCAAAAATGTTTTGCAAAGTGGAGA
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AAATATCTATATTCTATTCTATTATTCATATATATACATACATTTTGAAT
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TCATTTAAATCAACTTTGTTATATTTTTAACATTTGCCTAGTGTTGAAGA
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TATATCGATGTTATAGTTTGATATTTCATTATTTTTAATAAAACCCCAAA
TCATTGGGCACATCTTAGGCCCTTTAAATGATTGAAAACAAGGATAATCA
GTTAATTTTTAACTGATTAACCGTTACAAGAGACCGAAAAATGACCAATT
TTTACCCAAAACACTATTTTTCATAACTAAAAAAAACAGTCCTTTAATTG
TCTTTAGTTGAAAAGGTTTTTGTACAGAAGGGTTTTTTAAGGCAGTACAG
TACAGTCTAATCTATACTGTACATATGTATATTTGGAGCTAAACAATATA
CACAGGTAGAAAGAAAGAAATACGAAGAGGTATAAGTATAATATATAGTA
ATGAAGGGATTGCATGAGCAGACAAACACTAAAATAAATACTCAAAGAGT
AAGAGAGAGAGGGAGGGGGGGGGGGAGCAAAATGATTAAAATGAATTGAA
AAGGTTGTTATTATGTATGTACGGAGTGGTCCAGAATCATTGTTCTATTA
ATTTTAACGTCTGTAATCAAAAGTATCAATTATGTGTAGAGATTTCGTTA
CCCTTTTGTTGGAAAGATTCCAAAAACAGGTCGGGATCCCAGACATACCA
CAAACAAGTTTTGAACACTTTTACAACCAACATTTTTTTATTCAAGTGAT
ATCAACTACTTTGAATTTAGTATGTTTGAAGGGGAGGCCCAGGTAGTTCA
CAGGCTCAAGAAAAACTCCCTGTCGAAAGAAAATTTTCACGCAACGTTGT
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ATTCTGGACCACCCTGTATGTACATTATACCTATAATTTGGTTGTAAAAA
GAAAAGGGTAGAGTAAAGTGGAGAAATAGAGAGAATCACTCACTCAGGAA
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ACCTGCTTTCTTTTTACTCTCTCCCTACTTATTTTGTCTACATAAATGAG
ATGACAGGTGGATATACGAAAAAGTACTAGGAAATGTCTTACTACTTTTT
TTACTATAATAAAATATACTTAGGGATATGTATTTTATTGGGCCTCTAAT
ATCATTTTCATTATTCCTGTGATGTCTTTTTGTATGTAATGTTCATATGT
ATATGGGATGTAGGGCCTAAACGGGAGATAAAGAGAAAGGGTCATACAAT
CCATGTGTCCTAAGAACCGTTCTGTTTATGTAGTTAAATTATTTATTTAT
TTCTTATTTCCAATATACATTTATTTAAGAAACAATATTTTATTGTTTTG
ACCTATTAAAAGTGTTTCCCTAGAAACACTTTTGATGGGTCATCTAATTA
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CCCCCCGGTATTTATCATATATATATATATATATCATTATTGAAAGTTAA
TTCAAACATTCCCCTCAATGTTGTCATACATGGGACACACAATCTTTGGT
TTCTTTCCTTCTAAATCATCACTAGAGGCACCGGTAACATATTCAAAAGT
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TCATGAAGTATCAAACCTGCCTTTTTAAAAGTAAAATTTAACAAAAAACT
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TATATATCTTGTATAAGAGATAACATTTTATATGTGGATAACTAATTTAC
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TTCCTTGAAGGGAAAAGCTATATTCACTTTATACTCTGATTTGTTTCCCT
CCCCATCTAAATTTTATAACAAATATAAATTGTGGTATTAATTTTCATTC
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GACAAGGAGAGTTAGCCATAAATTTTTTTACGGCGCCAATAAGAGTTGAT
CTAAGGAAGATACATTTAATTTATCTTCGTCTCTGCATTTATGTGATGTA
TAAACCAAATATGTACAACTAATAAGACAAGCAGATAGGGAAAAAATTAG
TCAATATATGGAGACCGAAAAATTCGTCAATGATTCTATAACTATTTAAT
TTCTGTCTACGATCCTTGATTTTGTTCAGGACGGAAACATCAGTCCAAAT
CGATCAAGTAAAAATTATTAKAWAAAACRCTATTGAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAATACAGTCTCAGACCGATTCTCAACACTAGTAAAACCAAAG
AAAGAGTATTAKAATGAGATACGAGGGCCACAACATTCAAAATTTTATTA
AGATTAGAGCTGTTCCAGAGCTGACAAAGCTACACAAAATCCACTTCAAG
TTTAACTATTTTTGAGGTATTTCTTCTGGGATATATTCCTTTTGACTTAC
GGCTCCAGTCCAAGAATGAAGCAAGCTTGTATATCAAGTGTATATTATTT
TATCTTAGAGTATAAAAGTGTGTTATAGTTCCAACGTTAGCTAAAGGTAA
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CTCTAGTAGTAATTTCTCGTTAATGCTTAATTTAAGGTGTAAAAAAAATC
CAAATTTGACGTCATGTTATACCTCTTTGGTCGGCTGATACTTTAACTCA
ATCATTCGCACATATTGTTGCCTCTAGCTAACAGAATAATTTCTCTATGG
TTACATCCATTACTAGTCCTATACACTCATCATCTTTAAATAAAGTTTCA
TAAATAGGCTCATTATGCATTGTTTTGTATATGTGACGGAAGGAAGTGAG
ATAGGAGGGAGGGGGGGGGCAGATTCCTGTTAATTAATGGGGCTTAAAAG
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TGACTAAGTATTCATTCCCTTTTATAATAATGAGTAGTTAAAAGAGTAAA
TGGGTAGTAATAAAAAAAATCTATTGAGTGGAATTGTTTAATAGKTTTTT
CTGTAAAATTTATGTTTTTATATTAACAAAGTCACTTTAGAAATGAGGGA
AATAATTAATATTAGGAAAAGAAAAATTAAAGTGAATTTAAAGATTGAAT
GATCACTTTTGTTAATGGATCAGACTTTTAGTAAATTGTTTACCAGATGG
ATGTGTAGAATATCACTATTATTTATATGATCCCTCTTAAGTTATTACTA
AAACAAAGTAAATTATCAATTAAGAGTATAAAAAATTGGTATTTATTTGA
GCATTATAATATATTTAATAAAATCATTTAAAAAAATAAATGTGACTGTT
TCATTAGCCCAATCATAAGACAGGAAACTTCATTAGGGATGGCCATTCCA
AACGGTTTTAGTAATTCCGGGATTTCGGGATAATTACTATATTCGGAGTT
GGTTTGTATTTATTTCCTTGCAGCTGCTTGAGGCTAATATAATAAACATC
ATAACAGCTAAGCTGCTTCCATCCTAAAAAATTTTAAATTGTCAGGATGA
TCACGTATATTTTCGGTCTTTTCATTTTAACTAGACCGGTATGACAAGTC
ATATCTTATACATCTCTAGTTAAAGGCTTAAAAATATGACCTTAGACAAG
TGCAAACCTTTTTGTAGTCGCAACTTGAATAGGTGTGTTTATTGCTTAAT
GCTGTTATCATTGTTCTTTCATTCTTGAGGAGGAAACTTCTAAGTATAAA
TTGTGTGAGCGACTCACGGAGAGAGGGACACTACAGATTGGTTGTAGAGT
TATTTGTGTAAGTCCGTGTTGAACTTGGAGTAAAGTTGAGGATCTACTGG
GATTAATTCCACTCTATATCTTTCCTAGATACAAAGTGGGATTTCTGCTC
AATCCTTCCTTTCACGGATGATTTCATTATTAACACTAATAAGAATATAC
GCTAGACAATCAAACCTTTTATTAAGCGTTCAGGAAAGGAGATTTGAAAA
AAGTGCCCTCTTAGTGCAGGTGACCTTATGAAGGAAGTTACCCATTTTGT
AACAGATCTTAATAATAAAAAATAGATACATCCCCTTAGTCTGGCCCAGG
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ATCACATATTAATGAAGTCTCATAAATGTTGATTAGAATATCTACTCTCA
TGTCGAGGAGGGATAATTCTAAGTCTTGTTGAACTCAGAGTATAATTGAA
AATCTACATCAGAGTAGTTCCAGCCTATATGTCCTTGCTATATAACGATT
GAGGTTTGTGGGTTTTTTTTAATAGGTGCTTGCAGTTAATTTAATGAAAC
GACATGACAGTTAAGCTGCTCTCTTCCCCAACATTCTTCAAATTGTCAGG
GTGATAACGTTGATGTTCCGTCTCTTTTTTTACTATACAGATTTCCACAT
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CAGTTTGATCCCAGTTTCCAAACATTTGTCTTGAAGTAATAACATTGTGT
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ATTTTATGAGTCCATGTGCATGCGATAGTTTACGAAGACTCGTGCTTACT
AATAAATATAAATAAAAGATGACTATGGTTATTTAATAAAAATTCTATGT
AATATCGCAGTTAAGTTATACAAGAATGTATTAATCCTTTGTTTTAAAAC
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TGCAAAGTCATCCATATATTTTATATTATATTACATTGTATATGATTTTT
CTCAATTTCTTCTTCTTTTTCTATTTTTCTGTGGGGACCCCTATGAAGTA
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ATCAAACAAGGGCATTAGTGTTGGATCAGCCCCGGGACTGATCGCCTTAT
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CTTTCGGTCCTAGCTATCTTTTTATTTTTGTAACTCATAGAAGAACATAA
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GTCAGCGTCTTTTTAATTCAGCAGTACAGTGACTCATGGTTCCACTATAT
TCTTAGATGTTCTCGCATCAAGGATGAAAGAATAATAATAGCAGATTTAG
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TTACTAGACACGGAACTTGGGATTTGTATATATTTCCTTCCTCTTACGAC
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TATTTTTTCATAGAGGCAGTACTCTACTAATGAATATTAAACTACTATGT
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TTGTAAAATAAAACAATCTTATGATTACCATGGAAAAAAAACTTGAATGC
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TTTCAAAGTTATTAGAATAATCTTTGATCACTCACTAGCGCACCCGCAAA
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TATTTATAAAATGCTTCTCACCTCCTAAACATTCTTTAAGTTGACAAATT
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TTATACAAACCTACATATGTACATAATTACTAATGTTGGATTATGGTCTG
GAAATTCTATATCAATCTGAGCCCCATATACTTCATTCAGTCTAGGTTCT
GTCTGAACCAATCTCTTCATAAAATATCGGTCTATAAAAATTGGGTTTTA
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CTCCCTCCCTCTTTTCCATTTTTTGTTCTTATTAAATAGAACAGTTTCCT
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TATGAAAGTCTTTTCTAAAGAAAAATGTTGATTTTTTTAGTGATTAAAAT
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TAAAAAACAATTTGAAAAATAGATAAAGGATCGACTTTTTCATAAGAAGT
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TTAAAAATTAAACAAAAGAATAATAATACGTAGGTTTTTTATTTGGGGGG
TAAAACTATGTGAAAAAAGAACAACGTGGATATCCCCCCCCCCCTTCGAT
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ATCTCAACTCATCCAAGAAATTTAAAAAGTTGTAAAGCCTATAATGAACT
GAAATATGTCTATGAAATCCTGGGATTAGGAATAAAGGGTGTGACTTTAT
TATGCTTATCACATTTTAATCAGTTATTACGGCTAAATGCGCGGACAATG
TGAATTTTTATTAGGTGATCCCCAGTTGACTTATATAAAGGGCTCTCTTA
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AAGCAAGATTATCCATTTGTTAAACGCAGAAATTTCAACAGGGAAAATTT
ACCGAATAGGTGTCGCCAATAAGACTCTTACAGAAGTGATTACAGGAAGG
GGGTAAGAAAGCATAATCGAAATAACCCCTATCCTCCCCTGATCTAAATC
CCTTGGATTTCTATTTTTGACGTGAAATCAAGAGGAGGCTTCCCGTAATC
ATACAAATATTAATTACCTCNAAGACTGATATCTCGAAAAATTGGCTAAA
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CAAAAAATATGTCATTGAAAAATGTGTATATTTAATTTTTAATTAATTAT
CCATCATTTATAGTTAAAAGATCCAATATCTCTATTAAGGGAGCTCATTT
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AAAAAAAAAACAACTGTAAATATTAATGAAATACTTATTGCTATGGGCAA
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ATATGTTTACATTTATAGCTCCTCAACACCACCTAATACTTCATCAGCAC
ACACACGCGTCGTTACACTTTATAGTTTGATTTTCTCTCCTCAACAATGA
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