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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s443 | supercontig | LSalAtl2s443:197164..252846 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007644 >EMLSAP00000007644 ID=EMLSAP00000007644|Name=EMLSAP00000007644|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=817bp
MLLCLIVISALSSAKGWSSDIRIGAIFTDDQKDSPSELAFKYAIYSLNKK DDIMLNKTITYDIQYVQKEDSFRTTQKVCELLDNGIVSLFGPTDLLLGSH IQNLCDALDIPHLEASRMDIEDSFKEFSINLHPSQDVMNKAYKDLMVFLN WTNXAILYEDDFGLVRLQDLVRSSTQSRKLDLYIRQTNPTNYRNVLKEIK KKRIFNIVIDTDSKNIQYLFRVILQLQMNNQKYHYTFTSFDVETFDLEDF KYNHVNLTSFRLVDPESIRAKKVFDEMVALSPIRRSILNSTNIILTEPAL IYDSVMAFAKGLENVSALGSLISMPKISCNDELPWEGGSILFNYISSVKF YGLTGPIRFLEAKRSGLKMDLLKLKAGKMTKVGEWKQEIGLNITDMYAFV QGRPPNITLKVLSRIERPFVMFKKTKEGWNNKWQGNDRFEGFCVDLLQQI SEQVGFNYVIELVDDNNYGALNLSTGIWNGLVKELIEGNAMWKFMESRNP SVFVDNYDTGINSVKNGGYAFLMESTMLDYVVQAEMCIKELSSDVRKISK IVIADVSILSTPIITNLFSAPWDFSLLSKLEDIKLICETSSNMNRAESEY PISTSIVYGDIKIEELRDCNLTQVGGLLDSKGYGIGTPKGSLWRDHLSLA ILELQEKGTIQMLYNKWWKNTGDVCTRQDKSKDSKAHPLSVKNIGGVFVV LLCGLTIAIIVAILEFCWNSRKNALSDRQSLCSEMTEELRFAIRCYGSRQ KPALRRSCSQCSPDDTYVPVIEDFSNTSQSENKISNSAILYGLESFSLND QCHHFQYHINKKHLTTK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s443:197164..252846+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007644-703491 ID=EMLSAT00000007644-703491|Name=EMLSAT00000007644|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=55683bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s443:197164..252846+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAGGTTTTCATCTGTTATTATACCAGTAAAGAACTAAAAGTATTTGCTG
TTTTAAAGTTTAATGAATCAATACAGTCAAAAATGTTATTATGTTTAATA
GTTATTAGTGCGTTATCAAGTGCAAAAGGATGGTCATCTGATATACGAAT
TGGTGCAATATTTACAGGTATGTTTTTATATATTTTTATAATTTTTATAT
TTTATGTAGGTGATTACTGATAATTATTAACAGTTGAAAATCTAAAAATA
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GCATGAAAAATTTTATATTAATATTTTTATATCCTTGTCTAACTATTTAA
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TTTCTTATATTCTTCTATCCTCGCTTGGAGCTTAGAAAAACCTGTTGTAC
AATTTCTACTTGTTAAAGCTGAAGCAGGACTTCTTGAGGCTCTTAAAAGC
ATTAGTACTGTAATTAATTCGGCCTCCTCTTGTCGGTCAAGCACACTGCA
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GACAGGTGGCTTGCGGAGGATACCAAAGACCTGTTTCTCATAGACAAAAC
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GCGATCCGACACTGATAGTTCATTTTCAAAAGTTATGAAAAATATAAAAC
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TTGTCCCAGTACAAAATCTTAATCTTAGTTCTGAAAAAATTACTAATTAT
GTTAATATCGTAAAAACCCTTGCCTTCGTTGCAGCATACTCAAAAATGTA
TCTGCTACATTATCTAATGCCCACTGGAAGCCCAGAGCTAAGGTTGATAA
TGGTTTTAACCCGTCTTGAGAAAGGATGACAAAAAAGCTGAAAAGTATTT
AAAATTGAATATTTTCTCCCACAATTAAGTCAAAGGGATTGTGATGATGA
TCGTTGCAAGTCTTCTCCAATTTAATTAAAAAAATTGAAGCCAAAAAGTT
ATTTACAAACAATAAATTATTACAAATACTCACAAATGTGTAACAACTTC
TTGAATATAAGACTAAGAACATGTAAAAAGCAATATTTACTATGTTCAAT
GAAATTTATTTGTTTGTGTTCCTTCCTGCTCTTTTCCCTCAGCTAAAGTA
CACCATTAAAAAAACGGTTTGAATTCATTATAATAAGAAACAACAGTTAT
TTCATATAAATTACTACAAAATGCCATATTTTAATAATTAATTACAAATC
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AAATGTTAGTCTATTAGTCTTCATAAAGTAAAAAATAACTTAACGTAATA
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TTTATATATTTGATTTTAACGTTAACAACTGTTCAAGCCCGTTCGACACA
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ATGATTTTATTTAGAAATAATTGTTTTTTATAAATAAACAATTGCCAATT
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ATAACATAGGATTTTGATTGTTATATAAATTATTTCCATCGAAACTTTCG
TTTAGAATTCGTGTCATATATACTAAGATAAAAAAAATAGTATACTTATT
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TGTATTCATTACACAACTATAATCTAAGACAAATTTCAAAATATCCAGCA
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ATTTTTGATATTCTGTTTCCACCGTGCTTTTTACATAAGCAAATCATACT
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CATTGTTATGTGTTCTAGGATGTCAAGAAGTGGAGGGCATAATTTAAAAA
GGGATACGAAGTTCTTGTTAAGTTTGGAGAAGAATATAATAGGGTCCCAC
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AAAAGAAGAGGCCCAAGGGGTTTACCACTCTAAATATCTAACCCAAATAA
TGGTCCTCGGCGTTGTGGCCTCTGATGGAAAGAAGATGCCTCCGCTCTTC
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ACACCATATTGCCATGGAGGGTAACTACGCGTGGAGTCAGGACGGTGTCC
CCTCTCACACGTCAGCCAAGTACCAAAAATTCTGCACACATAACATGGCT
CSATTCTGGTCCAAAAAGATATGGCCCCCTCCTCACCAAATTTGAAACTA
CTATCCTTTTTTATATGGGGCACTTTAGAGAGGGAAACTAATAGGACCTC
ACACCCAAATGTGGACTCACTGAAGTCCTCCATAATGGCTGSTTTGAACA
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TCCATCTCTGGAGTCCACGTTTTGTTGTATGTCAATCTAAAAAAATTAAA
TCGCGTTATCATTTAGAAAACTTACTTGAATCAAATCTTGAACTGGTTAT
CACAATTCTAAATAACCTTTAAATAAAGAAGATAATTTTCAAAGCAAAAT
AAATTTTATACTGAACAGTGGATCAATATATCAAAACCAAAACAGAGGAG
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TCCTCATGTATATAGAAGGATTGTATATGATAGCTTTTTTTGTATGCCAA
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ATATCCTCTTCCATAAGCACATGTCTCAAGTCCTGGTTCAAGTCACTTCA
TTCAGAACATCGAAAAGTAACAATAATTTTTGATGAAGTATGTTCTTCTA
GACGCATTGTGTTTATTGGTAGAAATTTTTATGGAGCAGAAACTGATGGC
ACTCCTACAAGGACGATCATAATTATAAAGACTACTTTGTCTTTATTGCA
TTAAAATTTTCCAATTTCAGAGGAAAAAAATTAATCATTGAAGCCAACAG
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AATTACATTCATAATCTTAAATTTTTATCGATTTTATTTCAATAAAGTAT
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ATCCTTGTAAATAGTCGCTATTTGAATTGATGTCTCTTTATCACTTAATG
CACTCACTATATGTTAAGAGTGGAATTAAACTTAAATAATGTTAAAAATT
AATTATTAATGTTTACTAGATGTAATTATGTTCCACTTTATTACAATGAC
TTGTTCTTTAATTCCGGAAGTGAAGAAGTAACACGATCTTTTGTTATATT
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GAAGAAGGCTGATGATAATTGATAGTCKCCCTAACCAAATGKCAGCCAAT
ACAAATTAATAATTACAATACATATGGATTGCCTATATTTGGTCTTGATA
GAATTGATGATGACATAATTTAACACAGAATAAGGTTTATATTTGATTTC
CCTAATATATTTGAGTGAAATTAGACAGTCTTCTTTGTTCCTCGCTGCAG
TCCACTATGGAAAAGTGATCCACTTGATAAACTGAGACTTAGCTTCATAT
GCTTTATTAGGACGTAGATGATCCTGAATGGGGTTGAATGTCTTTAATAG
AATGAAAACTTTGTCAAATTGTAGAATCAAGAATGTAGATTATTGAAACA
GACCCAGAGGAAAGGGCCTCTGGATCCTAATTCTTTAAAATATAGGAACA
TTGATAAATATATTTTTTTTTTATGATAGCCCAGCCCAAAAGACGAACGT
CCTTAGCTTTAATAGCGGAAATAAGGATTCCTTATGTCCCAAAACTCGGA
GTAGATGATGAGGATGGATGAAATAGATGACTGAATATCAAGGTATATTT
CTTGAAAACCTTCAAATATAGATGGAACCGCATCATTCTTCAAGATACGG
GGAGAGAGAATCTGTTCATTCCCATTTATAGTCTTCTTGTCTAAAATGTT
TGTTACGTAATCGTACATATTTAATCAGTTCCTAATCTTTCCTATAAGTA
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AATAGAAAGAGAATGGAGTAAATGGTAATCGCTAAGAAATCTTAAAATTT
AATGATATCTTGTTATAGCCTTGATTCAACACTGAAGGAGCGTTTTATTT
TTCATAGGTAGGCTTTGACAAAAAAATGTTGTCTTGTTTGAATTGACGGA
GTAACCTAATTTTGCACTTTGGAGATCAACATGTAGAATTAAGATTTAAA
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CAGGCGATAGTAATATTTTTCCATACATAACAGTAGTCAGCAAATATCAG
TAGTAAGTCCCCTTTTTTTTATATCCCAGACTAATATACAGATATGAATA
TTATATGTCCTCAAAAGCGGGAGTGGGTTTTTGCAGTTGATAATCCTTAT
AATACTAGAAGCTGTCATCATTATTTTTCATCCTTGAGGAGAAAACATAT
CAAAATTTATGATGATTAATCATATATAAATAATTAAAATGTAACTATGA
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GTGATGAAGTTTGAGATAGAGTATTGACTTGAAATTTGGTTTTGTAAGTA
CGATAATTCATTACGTTTCTTGTGTTGTGTTGGATGGTCCTTTAGATGGT
TATTTTTTGGGTCGTTCTTATCTCATTAATTTGGAAAATATAKCCACAGC
CGACAATAAAACTATTACAAGTGTTGCCGTAAAAAATATCAGCAACGGTC
TTGGCTCAGATTGAAGGTTTTCATTACCGACAGAGCTTTATATTGAATTA
CAGAAGCCGAAAAGCTTAAAAAACATTTTCCACTGATGTTGCATGTCACT
TGTCTAGCTCATGGTCTTAACAAAATAGCAACGCTCTGTTCTGTTTATTT
CGAAAATACAAACACTCTCATCTCTGAACTGAAGAAATATTTTTTAATTC
AGGTGATAGAAAACGTAAATTTACTGCTTTATGCCAAGTTCTCCTCCCAC
CAGCAATGACATAGTACTAATATTGGACTTGTAAGTACATTTAAAAGTGC
CTTTGAATAAACACAATTGTTTTTTGTTTTTTTAAATATATGTATTAGTG
GTATTATATGATAACCTTTTTTATTTATTTTAACATGCATAAAGGAAGAT
TACAAACTATAAATTAACATAAGATCTATTTTTAACTATTACAGTAAACA
ATTTCATTTATGTTTATATGAAACTCGAGTAAATATGTGACATTAATAAA
AATTTAAATAACATTTTTATAATTTTGTTTGTCTCAACTATAACACAATG
GAAATTATTTATGATGCACTTCATGATAATGAATCCGATTCTTGGCAATA
ACAATTTTGCAATGAAGAAGAACTAAATTATTAATGGTATCATGCGTTTA
ATACATTGTTTTTGTACAGCTACTGAATCCTAAGCTATCCATTTGACAGT
TGTCGTCAAATAATACGTATTCTAGTTGACAGAGGTATGGAAACAAATCT
CGTAATGGTAATAGGTACTTAATGATCTATATATCTACTCACCTTTAATA
TATACCCAACAAAATCTCAGAAGCTCACCCTTTTATATAAATAATAACGA
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GTATTAAAGAGCATAAGAAGCTTCTTGTCATCAATTTCCTAGCAAAAATG
GAGAACTTTGAAAGTAGAAATTTATGTATTGTTTTATATAATAATATCAA
AAATTAAATTATTAAAAAAAACCACTTTATTATACAATATGATAGTTTGT
GGTAATTGTTCTTTAAAATTGTTATATAAAGTCAAAAATTTTTAACATAT
TTGTATAGCATCTATACAAATATATACAACTGTAAAATCATACATTTAAT
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TTGGTCCTTATGGATTGCTTATAGTGGGAGGACTTAATATAAAATTTTCA
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GTATAAAAATGAGCCCTTATTCTTGTGACTCATGAGGATACCAATTTCTT
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AATGTTACTTTTTTTGTAACCATCCTTTGAGCTAATCGTGGACGTTTTTA
TTTATGGTACGGTAATATAGGGACTTTAGATCATAGAAAGACAGAAAAAC
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CAGATCTATGTGATCAACACCAACAAAATCGAGAACATTGTTAACATGGA
AATGTTATTAGTATTTTAAAAAATGGGGTGACAACAAGATTAAGAATTAT
TAATGATGTCTCAATCACATGGACTACATATTCAAGTAAAAAAAGTTGGG
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CCATTAGGAAAAAAAAGAAGAAGAAGGGAGTTCATAAACCTTATAACCTT
CCTTCTTTTGGTACTATGAAGGAAGGGATAACATTATTTCTGTAAATTGG
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CTTTTTCCTTTCTTTTGCTTATGTTAAAAATTTACAATTCAGAGACTATT
TATTCTCATTACTTGAAAAATGAGGTCACACATAAAGAACATCAGTGGCC
TGGAAATTTTAATTAGAATCTACTTAAGGATTATGGTATTTTTGGAAGAT
TTGTATCTCAATATGATCTCAAAGCCATTCGCTTCCCAAGTCATTGGAAT
AGAGAAGTCTTATATAATAAGTATAAAATACAATTATGTTAGGATAGGAG
TACGATAACTATTACATTAGACTAACTTTTATATTTTGAACTGTCATTAA
AGGACTGTATTGGGTATAATGGATCGGTGCTACGATATTTGCCATTTTTT
ATCTTTATTCTTAAGAATTAGTAACGTAGTTGAGAAAATTTCTACAAATT
AATCATTTGGATGATTGGTCATTGAATATCAATGATAATTTTTAAGGAGC
ACTAGCAAAAAACTTGTCTTAACTGAACGCAGAAATTGGAATACGAGTAT
TGAATACCCAAAAAAATCTTCAAAAATTAAAAATATCATTTAAATTACAT
AAATTCCAACRCCGCCACAACAGGTATTATGTACTTAATATGAAAACTTG
CATCATATAATTTAAGTAGATAGTTTGGGTGTTAGGAATATGATGTTATC
CATTCCTGACGTATAAGATCTTTGTTATATGGAAATTTGTACGCAGAATT
AAAATGTGTACTAATGAATGAGGCCGTTGTCAAGGTTAATAGAAATACAA
AGTTAGACCATCATGTAATCAGGCGCGTTAGAATTTTCTATTTGATTTGT
TGTACAGACTGCTTGAAAAGGCAAACTTTGACAAAACACGCAACCAATAA
CATTCTATGACATCCCTATTTTTGAATTTTCAATTTGATGTATTGCACTG
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AACTATGACGTCACTATTAAAAAGCGGGGTCGCCGAGGATATCATTAGTA
AAGCATACATAGTACAATCGGTATAGGAAACCAAATATTAAGATATATAT
TTGATAATATACTTGTATCACTATTTTGAATCTGATTAATTATATATACT
CTTCATATTCCATAAATAATTACAAATTGTAATTCGTAAATATAATTAAA
GGAAAAGTAAAGACACATTAGATCCATTACCGAGAGCTGTATTTAGGCCC
ACCTTTTCAGTGTTCATGTAAATTCCAAGTACTCGTGCTCCGGATCCATG
GAAAAATAAGTGATGTCCGGATTAATTTCAGTATTCACTTTCGTCTTTAT
GACGAAATCTTAACTCTCACAGAATATTCCAAAGATTAATGTTATAATTA
ATAGGTACCATTAATTACTTCATAACTTATATTTTGAAACTCAATGATGT
TATCATCATTGCTTCCAACTGAATTTATGGGTACGAACCGAACTTAATGA
TATTAAATCGTCAAAGCACCGTACTGAACAAATGACTTGATAGTCAATTT
GTTATGTCTCTTTTTCTATTCTGCCCTTCATTCGTTCTTCAGAGGAAAGA
GGGCTAGTTCTAGACAAAGAACTTGGAGTGATGTCATGAAGGAAAGGTTA
TGTTAAAAAAAATGATCTGAAGGAAAGGATGACTATAGTATTTGGAAGTT
CATCACTGCGTCACCTTTTACACAAAAATACCCTATGTATTTGGTTGTCA
GCTGTCGATTCCCTTGTCTCACATGATATGTCAGGGCTATTTCATTTTTT
TCCTTTTTCATAAATAAACGATCTAATAAGAAATATTTACTGATGAAAAT
CGTGTTTTTTTAGGACATGAAAAAAAAAAAAAAAGAAGATTCTGAAAATC
AACATGGTAGGMGGAAAGAAAAGAAATAGTAACTAAAACAATTTTATTAG
AAAAAGGTTCGCCAGCAAAAAATTACAAGGCAAACACAAAATTAATATTT
CTGATGAAATCATAACGAAACTTTCTTAGTTCAATGTAATACAGAAAAAG
TAAAAAAATGCGGTTTAAAAGTTGTCGAAGAAGAAATTGATGGACATTAA
ATGCATTTAACCACATCAAACCTAATAATGTTGAACTTATCAAAATTGAA
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TCTTTTATAACTTTTCTTTCGGCTTTCTTTCGCCATAGTTCAAAATTTAT
TCGCTAATCAAATGAAAGGACATAGTAAAAATGAGTAAATCTCCTGATAG
GGCAAAGAAACCTTCTTTTCCCCATTACATATTAACCATTTTGGCTTTAA
AATCTCCATCTCATACTTAAAGACTACACGGAAAATTATACGAGCAGTCC
GTGCATTTTTCGTAAAAATAAAAAGATTAATTAATATAATAATATTGTGA
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TTTATAAGAAGTGTTACAATCATCCGATATAAGTAAAGTAGGCCCTGTTC
TGTTNNNNNNNNNNNTTGCAATCGAGAATCCAACTTCATAATACCATTTT
CGTAGAAGCCCTTGTCGCTATTGGCAAAAAACCATTGACGATCAATTTTC
ACAGGAATCTATTGTTGCCAAATTTGTAATCCCATTTGTGTTGGCCATAG
ATAGAAACAGGTAGTTGTCGCTCAGTGCAAGGTCTGGACTGTAGGGTGGC
TGCATAAGAACTTCCTATCTGAGCTTCTGGCGCGTCATCGAAGATGTGTA
CGGCCTGGTGTTGTCTTGATGATGTCTTGTTGTCTCCTATTCCCAAATGC
TGTCCTTTTCTGTTCAATCGCCAGCTTCAAACGGTTGAATTGTTCACAGT
AGAAGCCGAATTGAGCGAAAAAAGATATCGTTCGAACCATTGTTGTGCAT
CACGAACTGAAAAAATATTACCCCCACATAAATGGTAAATTTTCTTGGTT
TGCTTTTTTCTATTCAGTTAGTAAAAATGTAAAATATGGCAAATTTCTTC
ATTTGACACATCCATACTCGACGCACGATAATTCACGACTGAACCGGCCG
AGCGCAATTCTATCGACAAAAGACTTTATAGTATACACTCATACGTTTAC
AATGATTTATCGTATGATCCGTTGTGATCAATAATGAGCCAGATATACTT
AGTTTAAAAAAAGGACGGATAATACGAAATTATTTTTCCCACAACCTAGT
ATTCTTTTCCACCTAGAATATAGTTTGGAATGACTTTGTTCCATCCTAAA
CTCTACCCCAAAAAACACTCTTCAATTTACGAACAACCAAAAACTCATAC
GCTAAAAAGGGATAGGATTGAAATCGCTATATAATTGTAAGTTATTTTTA
GAATTTGAGTAAAAATGAGTATCGAAATTGAATTAATTCATTCATATTTC
ATTGCTAGATATGGAGTGGAATTTTTTTAAATTTCCTTCCCTCTTTTACT
CGATTGCAACTAATCTAATTAACTTTCTCGACAGCTAAGCTACTTTTCTC
CCGAGCATTATTCAAAACTGTCAAGGTTAAAATTTTAATTTTTGGTTTAT
TTTTTTATACATATCAAAAATGCTTTTAATTTATTAACTCTACATATTCT
ATGAATGAAGTTTCTTACATTTCTTCATGCCTCAACCAAGTTCATGACAA
TGAGTAAGGAGCCAATAGTCAACAATATATTTCAAAATAGACTCATGACC
CTTCATTTGTGATTCCTTAATCCTACATTTCTATAGATTATAGATAAGCC
AGCAGTAAACATGTGATATCTACAGCAAGAGGTCGTAGATGGTAAATTTA
TCAAAGTTAAAAATGTTATTGGCAATGTTAGCGATCACGGACAGGAGGAG
TTATAAGATATGAAATATGATTTTTATTTTTTATAGTTCTCCATGAAATT
TTTATTTTATATTGCTTAGACTTATTTTNATTAAATTATTTACATTACAA
CGGATCCCAATAAAGTTATGGTTTACTTTCAAATGTTGCTTATTACGAAA
CAAAAAAATATAGACTGTAGATTTTTCAAAACTTATAATATCTCTCATAA
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TACGTTCAAAAGGAAGATTCATTTAGAACTACACAGAAGGTAAATGTTAT
TTAAGTATACATGTAAATGGAAAACTATTTTAATCTGTAATTTTTTGTAA
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TGGTTTCACACATTAACCGACGTTTCATAAACCTATGTATTATAATGCTT
CTCATGAACATACTTACAAATATTAAATTTCTGCCCCAACAGTTTAATGA
AATGTATGTTTTATTTTTTATATTATACTTCCCATGAATATATTTACAAG
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GGAAATCAATCATTAGTTATTCATTTTTAAATTTATAATGTCAGGAAAAA
GACTAAATGTTCACGAAATAGTTCAAATTCTTGACAATATTAATTTATAG
CAGACAAATTGGTATATTCACACAGTAGTTCAATTAGGGAAAGTTACGAT
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