EMLSAT00000007748, EMLSAT00000007748-703595 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007748
Unique NameEMLSAT00000007748-703595
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s450supercontigLSalAtl2s450:397890..414341 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007748 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007748EMLSAG00000007748-690514Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000034201EMLSAE00000034201-743129Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034202EMLSAE00000034202-743130Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034203EMLSAE00000034203-743131Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034204EMLSAE00000034204-743132Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034205EMLSAE00000034205-743133Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034206EMLSAE00000034206-743134Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034207EMLSAE00000034207-743135Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034208EMLSAE00000034208-743136Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034209EMLSAE00000034209-743137Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034210EMLSAE00000034210-743138Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034211EMLSAE00000034211-743139Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034212EMLSAE00000034212-743140Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777276auto777276Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007748EMLSAP00000007748Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007748

>EMLSAP00000007748 ID=EMLSAP00000007748|Name=EMLSAP00000007748|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=857bp
MKLYNFSQIRHYGRGSLYSERRVLGYSAEEMFTVVSQVERYSEFVPWCTS
SKVTSTSLCGLRADLVIGFPPLIKESYTSDVTMFEPNLVTAVSNDLKLFT
FLKTVWKFDSQLGVPDVARSCALDFAVHFKFRSPIYAQFSSLFFDEVVKR
NVNAFLDEANKRFGPESIPRRKPQIIDLDIPNELNDKKDIINMKKDSLPR
VTCRVLFTYSPVQEDELELNINDIIECSGEAEDGWWKGNLNGKFGVFPSN
FVEVIHQKEEQQVADKNKRNKELHPPNQAISGLGNILNQNQEIEVPSGRG
DSSIPRLPPKPVKEQCVVQFPYEAQNEDELTLGEGRVVNIISKDSEDKGW
WRGELDGKIGISSGNKKNRTHSPNRDSGNFEKGSKEKISNNLNYHLNHHQ
HTESTKSSPTKKGSFSKSKTPAKPKAPCPTKISYSSSNSKPVSSAVNIGQ
PSKGGFLSSFKPSLSKNSSNRSSFSNSNSSNNKSVLGMMSSSPEPDSTQA
KSLSKSLPTNVDESFDPSSSSHMLPDGQKSGKDFDEVERSEKLAHPTADR
VKGPKRRPPSSIFTKDMIALEDGTSTIDSSTTTNSIEINNSNSTVKENKD
VQEKEDPSSEPILRNNDDFLYNNNNNNTITSPNSKSSSPVHAFKEELQNR
LESNNENDVSQAKKPDWLEELSRKQANRKSGFFNDKVPGSRSSAPIILXK
PQLPTKPSQIRDDIRKLNKRATNIEASGGSDKENSKPNRPSCIEDSFLNS
ETNNIIAHQSSVVPVEKYSRISDESLKKNQLKKHSYSEPNKKLSKSSDDY
ENEGTNENLVERVRNLESALAFMESSYSERLNALEASLREEKILRLKLQD
ELDYLRQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s450:397890..414341+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007748-703595 ID=EMLSAT00000007748-703595|Name=EMLSAT00000007748|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16452bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s450:397890..414341+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCCCCCTTTCGTAGTACTGAGCAGGCCTAATGTTCTTTTCCTCTTTCTTA TCAAAGGGACCTTGTCTTTTTTTTAAACAAGGCTACAAAGTTCATAGCGC ACTCAACCTTTTATCTTTACTCACGTTTTTTACATATTCATTATCGTTAT TAATTGACAAGTATATTTTTAGAGTGGTTTTTAATTCATTTTTTTTTACA AAATTTCTTCCCATTCATTATTAGCATATTTGTTCATACAAAAGCCTCTG ATATTATTCAGCAATGATCTAATTAGATAATTATTTATTTTTAGTAAGGT TGCAAGGAGACATGCTCTAAAAGGTCCAGTTTTTTCACTAATTTATATGC TCTACTCTAAAATTATATAAATATTGACATGGGTCCATATTATCTACGCC TCACCAAACTTATTTGAATTCCAGAATTGAATTATTTTTTTGGCATAGTG ATATGAATTATGATATTACTTATTAGTCTGACTGGTGTGCAAGGTGTCAT TGAACAGTGACATATACAATTCTTGAACTGTTTACATGTTTTCAAGGACG TTCTAATGAAACTATACAATTTTTCTCAAATCCGTCACTATGGGCGTGGA AGTCTCTATTCGGAGCGGAGAGTTTTGGGATATTCTGCAGAGGAAATGTT CACTGTAGTATCTCAAGTGGAGCGATACTCTGAATTTGTTCCATGGTGTA CGTCCTCCAAAGTTACTTCGACGAGTCTTTGTGGACTTCGAGCAGATCTA GTCATTGGCTTCCCACCACTCATTAAGGTTTAGGCAGTATTTACTTATGA GTTGCATTGACTCTCTGAGTTCACTTGTTTGGAACTTTTAACTGTTTTTT ATTACAAATAATGCAGTTGCTAAGGAATTGGCTTTAAAAAAAAACGAAAA AAACTGATAATGAATTGCGTTTCTATTTTTTCTAATTCTTTTATTACATT TTGGGAAAAAAAAACAACAATTTATTTATGTAACATACGGTTTTATATTC TAATTTATGATTAAAGTACTTCAATAGTCCTTAACTCCAATATCACTTTT CATCAATCAATGCACAATCACTGAGTAAATTCTGTTTTTCTCAATCCATA CATAAAGGAATCATACACTTCAGATGTAACGATGTTTGAGCCCAATCTCG TCACAGCCGTCTCCAACGATTTAAAACTCTTTACATTTCTTAAAACTGTT TGGAAATTTGACTCTCAACTTGGTGTTCCGGATGTTGCTCGCTCTTGTGC TCTAGACTTTGCAGTTCATTTCAAGTTCCGCTCTCCCATCTACGCTCAGT TTTCATCCTTATTCTTTGACGAAGTCGTCAAAAGAAATGTAAATGCGTTC TTGGATGAGGCTAACAAAAGATTTGGACCAGAGAGTATACCTCGACGAAA GCCTCAAGTGATGATGTGTAAATGAATTTATATTGACATTTGTTAGATTC TTTCATTGTTTATTCTTTGAATTTTATGTAAGCGTGACGATGATCAATAT GATAGAGACCCCATGAATTGATCTATTATTTGCTATAAAATTAAACCTGC TCCTGCCTTGTTGACTCATTTTGCGTTCGAATTCATTCGTAGCGGAAATA AATTGACTTCATGATATGTGTTCAGTTTTGTCTGTGTATGTATTGGTGAT ATTAGTTCTTAGTGAATAATAACGTAGGACACAATATTCCCTCTCTGTAA GTAAAACATATTTTAACATTTATAAAACCGTGATTCTAATGTGACAAACA TTAGTTGTTTGAGTGTTAAGACTTACCATTATGTCTGTCACATTTTGTTT TTTATGCATCTATTTAATAGTATGTATTTGTAAGAATAATACGGAATTTA TTCCTTTTAATAATATGCCTAAAGCCACAAACGTGATATTGTAAACGTAA 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AAGCATGGATTATATCTTTAAGAGCTTACATAGTAGAAGTGAGATCAAGT CAACAAATGCTGAGTTAATTCTATAAATCTCAAATGCCAGTACACAGATT AATTCAAATGATCAAAATTCCTTATTTGTCTAAAAAGATCTTTATTTATT AACAGAACCTKCRCCAGCCAAAATAATTTATAAAATACAGAATACGGCAA GATAGCCTCTTTTTTCCAAAAGGCAATGAAACAAGATTTAAAAATAAGTA AATAATATTTTGATTTCATAATGATAGTACACATTTTAAGTTTTGTTTAA CATAGTTTTGAAAATAATATCAGATAGGTGAAGTACACATTGTCCATACA ATGAATCAACCGAACTTCAATATTTTAATTACCGGGGATTTTTTTCCAAT TTTTTTTGCTTCTTTTTAAATAACTATTAATTGAGAAGTTTATATGGATT ATTATTTTATACAAAAAGAGCCAAGTTTTAAGGGGCAGCATATCTTATTT TATAATTCTGGAATATTAGATAATCATTTATTGAGACAATTCTAAAAATG TCGGTTTTCCGGATTAAATCCGGCTTCAACTACCCAATTTGAACAAACTG CACTAATTTAGAATTATTATTTGCGTTCAAATAATTTAGCAAATTCCAAA TTATGAAAATCTATTTAAAAAATCGTTTTTTCTATATTAAAAATAGAAGC AATTAACTGATTTTCATAAATCACAACATTAAAAACTCAGGAGCTAAATT AAAATTAGTTTAATTTTATAAAATATTATGTCAAACCATTCTTTGGGAAT ATTTATTTCCGACGGCTAACACAGGTTCCTCACTACTCCAAAGCATGGTA GCTCCTGACTGTATTTATCAGAAAACTTTAGAATCTTGCCTCTTTAATGA TATCACGCCTGCCCCAGAACTATTTATGCAGCCAGATTCCTACGCATTAT AAAAAAGGTAGTTATTAGTGTTGAAACTCGGTCCAGCACCGGGTTTTTTT TTTTCAGTTTTTTTCCTTTTGGTTCGGTCTTAAGTTATTTTCTGTTGCCC GACTTTTTGGTCCAGACTGCCGTCTCAGACAATGGACTTATTTTTTTTCT GTCTCACTTTATGTATCGATTTTTTCGGTCTTAGTCTATGGACCGATTTT TTTCCGTCTCAAATATTATAATTTTTTTTGTACATCAACCTTCATTGATT TTTTCCAAAAAATCTCAAAAGTACACAATTCCATATATACAATTGCTAAG GGTCATTCTTAATTCATTAAGACCGAAAGAAGTGGACTTCTGTGTTCTCC AAGAGTTAGGACCAAAGGAAGATACTTGATCATCAATCTCAAGAAATCAT CGAATTCCGTATTCCACGAGAGACGATGGGATTAAAATTCATCTGATCTA TCTCTTTTGAAACATCGTATGACGTCATAGTATTTGAAAATACATATGAT GTCATGTTATTAACAATTTATGTGTAAAATTCGGCGATCTATATTGTATA GGTTCGGTGGTAAAATCGGACTAGACCGATTTTTTTGTGACAGAACTGGG CCGAATTTTTCCTTTGAACCGGTCCAGACCGAAACCCAACACTAGTAATT ATGTTCATGCACCCTATATTTAAGAAGTATGTAAGGATGGGTCCTTGCTT TAATCAACCAAAAGTATGCCAATATATATTTAATTAAATAATGAACAACC ACTCAAAATGTTATTATCATTTTTATTTTTTTTAAATTATACTCATTCGG AAGTTGTAGCAGAGGTCAATTACATATATTGCAAATACAACGATTGTATC TACAAACCTTTTCTTTCCTTGCAAGCACTTTCTTCTCAAAAAGCACAAGT CAAGTCATCAAATAAAACCCAAAGTCCACAGTATTTAATTTCAAGTCAGG 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TTATTTCATAAAATATGATAAATGGTTGACATATAGGCTTTTAAACTTAC ATTATGTCATTTTAGTGATTTATCAGTTCTTCTACACCATTTGTAGCGGG TGTGTTTGAGCCTTCTCTTACAGCTTTATAGTATTATATGCAATGATGTC AATCCGGAGTGTTTTTTAGCTGGCCCATTAATTTGTAATTGGTAGTTTAA AGAAGGAATGTTCTTTTCCTTGGCAATTATTATTTAATTCCTGAGTAGTG AACATCCCCTTCTAAATAGATTCAATAATATGCAAAACCTGATTGAGCGT TCGTATGTGTACGAAACCATGATGAGTTGTTACGGAGTTAAGTCCTTGTT GGACTCAGACTAGAATTGGAGATGGACATGGGAGTGATTCTAGCTAATGT CCTTATTTATATCTTATTCTCCTTCCTCTCTTGTCACAGCTGATTGTAGT TAATCTAATGAAAAGTCATGAGCATTATTGTTTATCTCCTCCAAAACATT CTTCAAATTGTCAGGGTTACAATGTTAATTTCCGTTTTTTTAAAATGGCC ATTTTACACTGGATTTTCATCATTGATTATATGTATTGAGTAACTACGTG GGACTGCGCTCATGAAAAAGGGAGAATAAAAAATATGATTTTTTGGATAG TTATCTTCATTATTTTTTAGGGAAAGTTTGTCTGTTCGACGACGCCTGAA AACTCTGGGCAATGTCGTGCACTAACGCTAGTAGTTTAATAAAATAATAA TAGCCTTTGCTTACTTTAAAGGTAAAAATGGACACACCCATTTCCAATGA TACTATAATTCCGAACAGTATTTCATTTTGAACACTACCTTAAAATGGAA TATTTCCACTATCTACCTATACATTTACTTCATCAAATTGTGCTTTAATG AGACTTAAAGTATGTACTTTTTTTTTAAAAACCACTGTTACTCGTATCAT GCTTTTGTTTTATTAATTATTAATCAAAATAAATTATGAGTTGTGTGTCA TAAAATGATTTTATCGAATGAATTTTTTTGGTGGAGGGGGGGGGGGGRGG GATAATTAAGATAATTCGTGGTTCCTACGTCACTGAACCAAGTATACCCC ATGAGTAATTATCAGATCTATACATTCATTGTGAAAATCAGTTCAACAAC TGTTATTTCTGAGTAATTGGATTGAAACCTTATTAATGCTTTATACATTG ACAATGAATAAACCCTTTCCAGTAATGTCACGTTGAGAGAAATATATATC TACATACATACTGGCTCAATGGTACTTCTAATATTTAGAGTATTATTTCA GTCTTTATTTATTCAGTCCAGTCTTAAAACCGATACAATCAGGGTTTGGC ATTGGTCCTTAAGACCGTCGATCCTTCGGACTGTTAGTACTAGAACTGAT TGTAAAAAAAGAAGAAATAATTTTAAGTGACGTCATCAAGGACCAAATTT TATCCGTTTTAAGACTGAACTGGATCGGACCAAGAAAATGAAACAAAAGT TATTCCTACTTTTTTAGGTCAACGTAAATTTTAATCTACATTTTGCTTAT ATCTTGGGGTTGATGACGGGACTGAGATATTCAATAATTAATTAGTCTGT AGACCGATCTAGTGAACCACTTCACTATTGTCAGCACAAAAGACATCTTG AGCAATATTCAAGATATGAGATAAATTCACTTTTTATTATTTTACTTCAT AAATGTAAACAGCTCAATATTTCGTTGACAACTAATTTAGGATATGAGTT GAGATAGCAGGAAGATTGGAGAGTTGAGGATTACTTTCAGTCTACGCATG CATAGTACACGTGTTTCGGATAAAGGGGGCCTCAGCTAAAAATGTATTAG TGTAGGGGAGCCTTGGCATTGTAAAGTATGAGAAACCCCGGCTTAAAAAT ATAATAGTTATCATATTATAGGGCCCTGAGAAGCTTAGTAGCGGACCTGG ATCCATAATCAACCATATCCCTTCCCTCATATATTTACACCCTCTGGTGC CTAAAACCACTTTTTCAGATCCATAAGAAGCCCTTTGCTATTTGGAACTC AGATACAACTGTATCACCCTAACGGCGTAAAAAAGTGATTAGAAAACGCT GAAGTTCCACACAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCAAAAATTGACTTATTGA TTAAAGCACATATAAGCTATATATTAGGGTTCGGTTCGACATTGTTAGTC TAGCAGTTCAAGAACCGGAACCGCTAGACCGATAAGGGCGACAACCTCGG GTATAACTATTGATGAAATAAATATGATGATGGAAGAGGTTTTGCCACTA TCATCATTCAGCTGACACAAGTAGACCTTGTTTCATTGTGGATACTGGCT AATTTCTATAGAATAATGAATATCCCTCTCTCTCAAACCGAGAAATCGAA TTTATGTTGTCTTTCACAGCCACCAATATGTGTCAGGGTATTTATTTATA TTTTTATTGTGCCTCTCACAAAATCAAAGGTAAAGAACAGCCGGAAAGTA GCTTTAAATGCACTCTGCGTGTCAGCCTCTCACCCATTCAACCACAACTA GCAAGCCCAAGTGTATCACAGAGTAGAATATGAATTTTGGTCATTACATC TGACAGTTGGGCAACACATTTTTGCTCATATATTTGGGAAGATGTGCCTC GGAAATTTTTCCACAATCACAAGTCTACATTCAGTTGCAAGAGATTAAGA ATCCCTATTTTAAGGTATTATAAAACCAAATAAACAAACATAAAGACTGT GACATTTGAAGAAAATACATAAATGAAGGTGTATAATTTATAGCCATTGT TGTTAAGTACAGAGTAAGGACTATTGTTTGTTATTAAAGGAAATGAGATG TTATTGATGGATGGAACCATCACAATTCATAGAGCAACAGTCCACATTAA CATTAACAGGCGTGTATGTATATACAATATAATAAGGGACGTTTTACAAA CAACACAACGCGTGGGAAAACGGGTTGTTAGCAATCAATTTTTGAATCAA GGAATTGTAACAGCCAAATCCCTCATAATTATTACTATTACTTGTATTTA CTCAGGTTAACTCCATCCCCTCGACAAGTCAATAGGAGTGTGACGATTCT ATCTACTACAATTAAGGAAGAATATTGTATTGTGTTAGTAGAACATACTG AATACTTAGTTTCGGAGACTCTCAGCCTTAACGGTATAAGCATGATTATT TTTGTTCTTGAATCATATATATAGTAATAATAACGGAGAGTCCGTCATTT GTTTCTTTTAGCTACTTTTGTCCATACACTATGTAGGGGGGGGGGCGATT CAAACCACAGATGATGGACATGGACTTTTAAAAAATAGTTGTTGTTTAAG AAGACAAGAATCAACCATGATTCTAAGCGCACAATTAGCAAGAGTATTAA TACATATATTATAGAAATTAGAGCGTGAATAAAGAAATGGAAACACAATC TTAGGTGAAACGTCACATGTTTATCACTAATAATAGGCCTGTGTTTTTAT ACATCGAGGGTTGATTCCAGATGATGCATTTTAATAAATAATAATTAATT AGGCAGAGTACTGAAATGAACATGAAACACGCTCTTTTTTTATGTTTGAC GGGAGTGCAAAATGACTTTATAGTTTTCATAAGGTAAATGAAACTATTCT AGCTTTTAATATCTTAGCAATTTGAAATAATTATTAATTTTTCTTATAGA AAGTTGAATTATCATGTTAATGCTATGGAATATGTATTATATATCGTTAA TTTAACCCAATTTATACAATGAAACAACTTTATTATGAAMAATAGATACT 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