EMLSAT00000007789, EMLSAT00000007789-703636 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007789
Unique NameEMLSAT00000007789-703636
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s457supercontigLSalAtl2s457:148963..163475 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007789 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007789EMLSAG00000007789-690555Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000034434EMLSAE00000034434-743362Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034435EMLSAE00000034435-743363Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034436EMLSAE00000034436-743364Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034437EMLSAE00000034437-743365Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773297auto773297Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007789EMLSAP00000007789Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007789

>EMLSAP00000007789 ID=EMLSAP00000007789|Name=EMLSAP00000007789|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=101bp
MNMLNIYNNPLFALEELWCYKKETKNAYQKVTQHSDLQETSKDKNDENDK
PMPVPSMKIELDHSQLIKANKTLTAHPINIHQQDKVEALIDKLIKGGIMS
F
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mRNA from alignment at LSalAtl2s457:148963..163475-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007789-703636 ID=EMLSAT00000007789-703636|Name=EMLSAT00000007789|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14513bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s457:148963..163475- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATATGTTAAATATTTACAATAATCCTCTGTAAGTTTGATGGAGGCA TCAAAAGAAAAACCAACCAATGCACATTGTATATTATATATACAACAACA TGTCGAAGAAGCTATCAAACCCTATATCAAAAACGCTTTTAACAATGGAC TTTACTGCAGTTTTTAATGCAAAATAAAATATGATAATGCAGTATAGAGG AGTTCTTATATAAAGTTCATAAATCCGYRTAATCAAATAAAAATCAATAA AAGGTACTGTGATAAATTATTGAAAGCATTTGTGTACAACTTTAAAATCT GTATAATTGGNNNNNNNNATTTACGGTTTGTAAAAAAGAAAAGAAAATCG ACGCAAGATAATTTTAGACTGAGCCACTTTACCGCAATACTGTCAAAAAA GTCATTTTCGTATACACTTATAACTTTACAAGGCCTTATTGTATGCTCCG ATATGTTCATTGATGCACAAGATGACGGCCATTTACAGATTGTTTGGATT TTTTGTTGTTCCAAACATTCAATAAAAGAACAGTTAAGTCTGATAATGAT AAAAAAGTAAATGTATTAACTCTTATAAATTTAAATAATAACTTTATTAT TAGTATACACTTTCGGAGTCAAACTTTTAAGGTTATGTATACAATTGATT TAATAGATATGGNNNNNNNNNNNNNNTAAACGAATTTGTTTCATGCACAG ACATGTAAATTAAATTATATAAATAGATTTAAAATGTATTCTTGTCTGTT TAAAAATTATCTAACTTTGATAAAGTTCAATTTGTTATTTTGTTAGTAAC ATAATTATTTAACCTTCTACTAAGGTATTTTTGTTACTTTACGTACAAAC ATAATATTATAATCATCTGATATTTGAACAAGGAGGATTCCTATTATTAG AAATCATATGATCTACTCACAACACAATTCTTCATAGTAGAAAAAAACAA GGAGTTATGAAATTTTAAACCTGTTAAAATAATCAAAGAAAGAAACCAGT ATTTTACATATTATGTACTATATATTTTCAAATTTAACCAAACGAAGGAG CATCTAACTTTTGGACATTACCTAAAAACGGAAATTAATATATATTTTTC ATCTGGAAGAGGGGAAGTATCATCATGCTCTTGTGAGAGAAGTATTATGA AGAAGACCCACGGATCTTATATCAGTGAATTGATCGATCCTCTGAGAAGG TTACACCTTTTGTTAATCTCTATCGAAATCAATATGACCATGGATTCAAA GAGTCCCAAAGTTTAAGAACTCTCAATCGCTTTGTAGTCCAAACCTACTC TAATTTATCAATTAATTTCAATTCAATCTATACCAGCTGCCTCATTCCAA GTCTAAGCTCCCAGAAAAAAAAATCTTAATTTTTTCTTTTAAGACAAGAT ATCGGGTCTGGCACAAAAAGGAAGAAGTAAGTATTGAACACGAGATATAC TCTTTAAAGGGTTAATTGAAAATTACGAGTCTTCTTTCATTGTCATGTGA TAAAGTTTAATATTGACATCTTATGTGATCTCTGGCCACTTGAAAATGAT TTTTATTTCATTGAAGACTGATGAAGTCAAAAAAAGATATAAATCTGTTG TTTTTTTTACTTTGAATTGTACAAAAACTCAAATTTTATATTTTTATCAA TTTTGGCTACTGATGTGTATTTAATCATCAGACTTAAACTATAAAAAATC GATATTAAGGCTTATAATTAATCTTTAATGCCTGTTTATTTTTATTTTAA ACAAAACATTAAATGGTTTATTTTATTTTTATTATCAAATAAAATCATAG TGTCTGATTTTTGCAAATATTTCGGGAAATATTGTAAGGTGAGAAATGTG GTCCGTTTAGGTTTGCGATTATTTATTTTAAATGCAATTTTGAAGAACAA 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GATATTTTTTTAATATTTGATACAACCAAGAAATTCAATTTGTCGTAAAT AACTAAAGTTTTATACTTTCACAATTTGAACAACATAATAGGATTTATAA ATAATCCCATTTATTTTTTCTCAAATTGTCCAAGAATCCAAGTTATCATA TTTTAACTTCCAGAGATCTGTTTGATAATTTGTTTTTATTACAGTTTTGC AGGGTCGTCCACAGGGTGTGGGTTTGAGGGGTTGTTTTTGCTTTCTACTA GAAAATTTAATTTTTGAAATCAGATTAAATTTTCCAACTTTTTTTGCAAG AAATTTCATTTTCTATAAATATCTATGGATTTTTTTAATTTTTCTCCAAA AATTCACATTTGAAATATAATTTTTCAAATTTGTTTCCCAAAAATTTAAT TATTTGAGAACAGCTGTAGATTTATGCACTTTTTTTTTGGGATTTTTGAA TTTTTTTCCAAAAAATTGCTGTTTTTTTTTTGTGAACAGCTTTGGATTTT TGAAATTTTTTCCTAAAAGTTTAACATTTTAATTTTTTATACAAAGGCTA TGGATTTTGCAATTTTTTTGGGAATAGCTATAAATTTAGATATTTTATTT AAAAAATTTAAATAATAACATTTATTACAAATTAACATTTAAATATATTC ATATATTTATCATTTGAAAACATTATATTCTCTATATACCGGGTGTGGCG GAAAAATTACACTTCGCTTTTGCTATATAAATCATTTTTTTTGGTAATGC GGTAAAATTGTTCTGGTCAATTACAAAAATAAACAAAAAATGAAATAAAT AAAAAAATAGATAAGTGTCTAAGATACCGAGAAAATGGCATCTGAACTTG ACAAACGAATTTTGTTCCGTTCCCTTTTGAACACTGGCGAGAAACTAACA AAGGTTGCAAAGCAGTTGGGGATCTCCAACATGAACTTGGACATGAACGT 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CCCGCGTATTGGTTTAATCAAATGTAACGTTTATATTTACTATTAGTATT AAGTAATATTCAATACAAGTGTAGGTGTTTTTTTGTGTGTTTTTTTTAAG CCTTTTGATGAAGTTTCATCAATATTTATTGGAAATTTGTCAATTTTAAT TAATAATATATTAACTATGAGTCCTCCATAAAATAGGTGTAGTAAAGAGA AATCGATTAATTTTTGAGTAGAAGTTTTTGTAATGTGTATATTGTTTTGT ATCAGTGCGATCGGTTTACGCTGGAAGACGTTAGACAGATAAGATTTCGT ACTAAAAAAACTTTTGGGCTTCCTAGACAATTTTTAAACCACGGTTTCTT AGCTTTTCTTCTCGAATTCTCCACTTTTTAGTGAGCAATTCTCAATTTCT TATCACAGCATTGGTCTTTGATTTTAACCCAGGCAGTGTTTTAGTACGTA AATGTACGCTTTGCTTTTTTGTCCCATTTTACTCTCTGAGTTTTGTTTGC ATATATTATATGTTTTTACTAACATTTATTATTTGGAAATAAGCCCCATA TGAAAAGATTCTTCCTTTTTTTTTTTGTAATTAATTTGGCAAATAAAAAC ATCCAAATATGGAACGCTAGACGCATACAMCTTAATGAGACTTTGCATTT GTTTTCCCTTGACGAGTGCCTCAATGTTCTGTTCCACTTTTAAATTGACG TAGATTGCAAATCAGATTCAAAGTCGATCATGCAGTTTTGCGATTTGGTT TTGATCTCAACCATGCTCGAAAACGCAGTGTTGCCACGTTACCTAAACAT GACGTACAATACCTCATAGATTGGGGTTTTTTTTTGTTTTTAAAGCAGTT TGTAAAGGGTGTGATTGGAAATTTGGTTGGAAATTAGTAAAAATTGAAAT TGGTGAAATTTTGAAGCAGTGGTTCTTCTATCCGTCCGGCCATTCCCAAC CTGTGGGAAATTCCCATCAGGCTAAGAAACACTTTGTTAAACTCAGTACT GTTTGAGCGCACGTCAAAGGTGGACACCAGAAAAGAGAAAATAGGTCATA TTTTTCAGTTTTTTCTTCAAWAAAGGCGAAAACGKAAGCCAGTCGTCTGA TAATTTGAATAATGTTTATGGTCCAGATACTGTAACTGCTAATCACGCGG TATTTTGGTTTTGTCGATTCCTTCCCAGTAATTTTATGTCAAAAATACAC CACGTCCTCGAAAGCCAATTGTCGAAAATGTGGATAAAATAATGGAAATT GTTGAGTCCGACGAAAGCGATAAACATTAATAGATTTTTTATTTTTAAAA TCCACTACAAATTTATTATTACTACAGCTTATAATATAACACATAAGGTT GTGAAATTACAACTAATAAATGTTTAGTCATTTTGTGCTTAAAATATGTT ATTTGGTCTAATTTTCTTCATTTCTAACTCATACTTGATTTTTTTAACTA TTGCTCCAGCAATAGAAAATTAATATCTAGCTTTGTTAAAAAATGCAAAA CAATTACAATGTATGGCGTGAGAACATCAAATATGCTAAAAATTTGTAAA ATTGGAGAGGCCTGGGTAGTTAAATAAATATAACGTTTGAAGATATTATA TTTTTAAATATAAATTTTTAGAAATGCGTATCAAAAAGTGACTCAACACT CAGACCTACAAGAGACTTCAAAAGATAAAAATGATGAAAGTAAGAACTTG AAAAGAGATCTCGAAAAATGCAAACATTATGGGAGCATTTGTTTACTATT TAATGTTTTTACATTATACAGAAAATGCATGTGAAATATACATAATAAGG CTTAGACTTTGGTTGAAAGGAATCCGTTATTCAAACATAAAGTAAAATAA CTAGAATTATTAGTCATTTACTTATAAGTGGTTCCGATGAATTTGTTAAT GTAAGTATAAAATTATTATTAAAATTGTTATTTTAAGTGTTTCGAAGACA CTGCCGGAAAAAATAATAAATAAAAATGATGAAAATGCATGCTGCAATAG TATAAAATTTATGATTCCCATTCATATATCTCCAATTTTAAAAGACAAAA TACTCTATAAAGAGTTTGTCATGAATTGCAGTAATTAATTGTATAACAAA AATCACGGCTTTACCTCGCTAACGCTAAGAAAAAAATTATATTATAGACA CTATCTCTATAATTTAAGCCAATTGAGATTCAACTAGATTTTTCATTTAT TTTTGTTTTGGAACTTTTATGTATACCCTATTTATATTTGTATACGCATT CTTTAGATGTAAAATTATGTCACGTAGAGCTCAAATTTAGTATTATATTC AAAAAATCAAGACTTGATTGATGATATATGTACAAGGATTTATTCTACAC TTGGATATGTAAAATTTGATGATGTTGCATAATATCATAATTTACAAACA AATTAAATATATATGTATGCATAGTAAATTGAGTGTAGAACACACCTGGG TAGAAAAAGTACTGAGACTTGTCTCTAAGAAGTCATTAAAATACTCATAA TTGATCAGGATGATGTCGTAAATAGAACATTTTATTTTATAATATTTTTT ACTATAATAATGCACATTAATTATGAATCTGGTCTGCATCAGTCTCAATA ACGGCCTCTAAACGCCTCCGGAACCCCTTGCACACATTGGAAATGTAGTC CTTTTTCATGATCCTCTACTGCTGGTTAACAGAGATATTCAGGGCCTCAA TATTCGAATGATGGACTTTGCAAGCCTTCTTCTCTATTTGACCAAAAAAA AAAGAAGTAATCCAATTCATTCAAATCTTGGCTCTGAGGGGGGCAAAGGT TCTTGGACCAGAAGTTCATGTTGCTATCTATCTACTCTTGTACAGTATTA GCAGTATGGGTATACGCGACTAGCCTTGTTGGACTTCTTCTTTGGTCTTG GTGATCTATGGGACCACATTTTCCTTCAACACAATCAAGAAGTCGGCCAT AGGTAACCGGTATCCAACAGGAAACAAAATTGAATGCATTTTTTCTCCAG TCGATACCACAGCCCCCAGCATCATCACAGAGGCCGGATGTTTGGTCTTG GTGACTGTCCTGATGCAGTTGTCGGCCTTGTCAAAGCATAGCACCAGATC ATTTTGCTTGTTGTGGACGGGGTAAACGGTAAAGGTCCTTTGATAAAAGA AAAAAATTACCCTGTTGCTGTTGTGCTTCAAATCATTCAAGAGTTGTTGA CCTCGCTGAAGACGGAGTTCTTTTTGACGTTGGGACAGGAATGGCCTCTC GATTCTTCTAATCAGCCAAACGATTTCGGACACTAAAAACTGTAGCCTTG ATGACGTTTAAGGCCTTCATTATTTCCTAGGTGGTCTTTTGGGCGCAGAT TAAATTGGCTATGATGGTTTTTCTTGTCTCCATCACGACATATGCAGAAT TTTTGTTTAATCAAATCAAATCTATCAAAGGCTTAGAATCTAAGCTATTC AAGAATAATCAGAACTTTAAGAATTAATCAACAACAACTATTCTAAACTA TATTTTTAGAAGATCTCATTACTTTTTCTACACGCTATAATTATAAATTC CATTACACAATTGCAAATTTGTCTTCTTTTAAATAATTTACGAATTAAGG ACTTTCTTTTCTGTAAACTATTTGATTAATTCCGTGTTTTATAAAGATAA TATTCCTTATTTTTTTTTTTGAGAGACATTTCTGTGGTTTCTTAAATAAC CATCAGTAGCAGAGTTGTTAAAGTAGAATGAAAAATTAGGGAATTTCTTT TTAAAGAAAGAATTTTTTTTTGAAGCAACTTTTTTTATTAAGTAAATCAG 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GAAGGGTTTCCAAATGTTTTAGTGAACAAGTTCAATGCTTAAATAAAGAG ATGGATAAAATCATGGAAGAATTTTAAAATATATTCAGTGACTCTCTAGA CGATAAACCAATGCCTGTACCATCTATGAAAATTGAGTTGGATCACTCTC AACTTATAAAAGCAAACAAAACTTTGACGGCACATCCAATAAACATACAT CAACAAGATAAAGTAGAGGCACTTATCGATAAATTAATTAAAGGTGGTAT TATGAGTTTCTAA
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