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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s457 | supercontig | LSalAtl2s457:159158..178306 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007791 >EMLSAP00000007791 ID=EMLSAP00000007791|Name=EMLSAP00000007791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=75bp
MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIV IFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007791-703638 ID=EMLSAT00000007791-703638|Name=EMLSAT00000007791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19149bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGCTTATTAAATATATAGAGGTAGGTACATGTATTAAAGAGATAAATTA
CTAAATTCTGACAATGGACTTAATAATTAAAACTTAATATATTTGTCCTT
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GTACATAATATGTAAAATACTGGTTTCTTTCTTTGATTATTTTAACAGGT
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GTGCATCAATGAACATATCGGAGCATACAATAAGGCCTTGTAAAGTTATA
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NNNNNNNNCCAATTATACAGATTTTAAAGTTGTACACAAATGCTTTCAAT
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ACAATGCGAAATGTTATTGAAAAAACTTTAAGCAATTAATCTTGCCAAGA
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TTGCTTCTTGATGCTGGCCTTGAGCTCTTGCACATTTATGTGTGATGCCT
TCCCAGCCTTGCTTTCTAAGACGCTACACAGACTGAGGTCGAGGAAATTG
AGGTCAGGACTGGAAGAGGGCCAGAAGGGATTGTCCCAGAAGTCAACAAA
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CTCATTGGACTTGAAGAAGAAGGGATCCATTTTCTTCCCATCAGAGGCCA
CAACTCTCAAGTACATTTTTTTTTGGTAGGATGTTTTGTTCTGAAGGTGC
CCTGGACTTCCTCAGGTGATGCTGCTATAAATTTGTCGTTTCTGCAGTTA
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CGACAGATGACTCTTTAAGTAATTACGGACTTTTTTGCCTCTCTCAAGTC
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GCCAAGTTCATCATGAACTGCCCTCCTGATGGTGATCTCATTCATGTTAA
ACATGTCATACAAGCGGCGTATTGATGCTGTTAAATGTTCCTTGATCTTG
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ACTTCCTGCCTTCATGTTTACTCCTTTCCCATTCTCTTTGGCCACCCTGA
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GATCAATAACCACGTCGAGAAGATCGGAAACCTTTTTCCTTTTTGATTCC
TGTTCACTAATTTTTTGGCCGATTTTGATCAAATCAAAACAATGCGCAAG
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TTTTTAGCGTAAAAAAATAATTTTAATGACGCAGAAAATTTCCCTGTCGT
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TGTTCCGGCTTTGTAAATTTGCGTGAGCTCATAAACCATGAATATTTGTT
GCAGACTTATAATTTGAAGTCATTGTTGGACTCAAAATAAATCTGAGGAC
TGACATCTGAGTAGTTCTTGTATATCTCCTTGTTTTTTCCCCTTGTTATT
ACAGCTAAGCTCCTCCAAATTATTCTTCAAATTACCAGGGCTATTATGCT
GATTTTTGGTTTCTTTCCTTTTAACATTCCCAAAATACTCTGACTTAGCA
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AATAGAAAGACTAAAAAAACATTTTTATGGAATGGTGAATATTTCAAGAA
AAAAGAAACAAATCGAATGATGTATCTAGAAAAACACGTTTAAACTAAAG
TTCAACAGAATATCATACCTGTTAACCGATGTATAATATCGAGTTTTATA
AATTGTTAGAGAAATATTAGTAAATTGGTTAAATTTTTTAAAGAGTGAGA
CAAACAATTTAACATGTTTTTAATTTATATACTTTTAGTAGTTGTGAAGC
TCTGAAAATTATGTGAGAATTTATTCTGATAAACTTAAAGAAAGAAGTAT
AAAAGTCAGTGTCTCCAATTATATTGTTTGAATGATCGATTTGGAAAAGT
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CAAATAAGAGGGGTCTCTATATAACAAATGTATACTATTAAAATTCCAGA
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AGATATTTGAAGGTTTTGTATAAAATTATTCTCAATTTGAAAAGTTCTAA
TTTTGAAAAACAGATTAGTCTTTTTGTTCTTTTTTTAGTGCTGTTTTTAT
GTTATACTATTGTGGTTTTTTTTTCCTTCAATTATCTATTAATTTTATTG
CCATTCCTTTAATTGTTTCATAGTTTTTTTAATCATATTTAGGATCTGCT
AATGTGCTTTGTTGTAACTAATGTCTGTTTTTCTAGGAAAGTATTTTTAA
AACTTATATGTTTATTTACACATACCAAAATAAGATGGAACTTTTCCAGA
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AATAATATTTTCAACATGTCATTAGTAACCAATTCTGAGCACATATTACA
AATAATTTGTAAAAATAATCTACTTTCAAATTCAAAACTTATACCTTTAT
GATCCCTTTAAATATACTAATAAATTAACTTTCAATTATATTTTATAGCT
TATATTTAATTTCTAACATATTCAAATCAGATAAACCCTCATAAAATCTA
TAATAGTTTCTTTTATCGTGATGGATTAAAATATATAGATTCATTTCCTA
CAAAAATTATACCAACTGAAAAGGAAGAAAAAATATTATGAATTTTGGAA
TATTTTGGAACCAAAATCCGTAGTCTGTAATTTTTCAGATACGATAGAAA
GTCACTATATTGGGGGTTTAAGTAGAGTATCATGTTCAATTTCTTTAAAA
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GTGTACATAATTATACCTATAATTTGTTTTAACCTTTAGGCTTTTCTTGA
GTTTGGAATAAATTAGTAATTATAAATAAAAAGTAATGGATAAGATCAAA
TCTCAAATTGCTAAGTAGCATATCATTTATCATTAACTTATTTCATTCCT
ACATATTATATTTCGTATGTGGTTTTAATTTGCACATTTTGACATAAATG
TTCAACTCCTGTACATAAAATTTCAATCATACTTTCTTACAGGCCAAATT
AGTAATACTATAGAGTTTGGTGACATCATTTCTCTTTTACCTATTTGATT
TTTATTTCATCATATAATTGAATCTATTTGGCTATCATTATGTCCTCCGA
GAAGTCGTAAAAAAGTACTGTTTTATACTAGCAATATGGTGAAATCCATA
TACATATAGTATATTTCTTTCTCTAGGAATCACCGGGGTACGAACGTACA
CACATCTCAAGTTTAAGAGAACAACTCTCGATTGTGCTGTCCATGAGCTA
TGGCGATTCCATGTGATTCTCTCTGTTTTTCATGAGCACACTCACACGTA
GTTACTCAATACTTAGACGTTCTCGCCTCAAGAATAGAAAAATTATAATA
GCAACATTATAATTTAAAAAAAATTGATTTGATGAGTCAATGAGCACTTT
AGCTCGTTGCTAAACCTCATCTAAAATTTTATTCATTTTTTAAATTATAA
ATAAAGTACTTCCCTTTCCAACTCTTTTAATATGAGTTGAACTAGGGACC
TGCAGGATTTCATTCATTCTTACATCCCAGTGCTTTGTATTGTATAAAAC
TCTTAATGTATACTTTTAAAAACAATTATGATATTCATCTGAGAGCAATA
CGGTGTTTCCTGTATATTAAAATCTCTTTTTCTTCTTTATACTGCAAATG
ATATATATCAGGGATCACTTTATAGAATTCATCCTGTCTACACATTCAAT
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TTCTTAAATCAAAAATATATCTATGATATACATTAGGGAGATGCAATTGT
CCCAAAATTGTCAGTATAACTTAATTTTGGCTCTACAGCTCGGTAAATTA
GACACAATTTCAAAATTTTAGCAAATTTGGTAAAAATTTATTTCTAGCAC
AATTGAAATTTGTAAACGTATCTAAAGCAAAACTTTTTTATTATGGGTTT
TTATAATAAACATGTTTTGAAAAATAACATATTTTTATAATCAAATAAAG
ATTATCTTGTTTTATAAATTTTTTTATCACTTCACTTTCCTTGGTTGTAT
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TTTGAGTTATTTTCTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNGTTTATTAAATAAAGAAGACATTACTAAACTTCAGTT
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TGTTTGACTAACTATCATCTCTATATAATTGCAATTAAATTAGTGACTCC
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GCCATGCTTATTGCTGCAGAGTTTTTGTTTTAAAGTCAGTAAYTTCGATR
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GTTATTCCCTTAGGTACCCCAAATGTGCTGAGAATACCATTATTGCTGCA
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TATGAGATCATTCAAAGGTGCTGGTGAAGGAAGTGGAGCTGTAAGCCACC
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TGCTGTCCAGTCATAATTACAGTCCCCTTAGGTAATTCTTGACCTGTATT
TTTGGTGAGCAGATCTATTTTTTTACCATGCATGAGCTTAAACATCCACC
TTACCTTGTATTATGCATCAGGTCAGATGAACTGTCAAAATCTTTAATTA
CGAGCATTTTACAATCCCATCCAACAAAAATATAAGTGGACAACATTTTC
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GATAATTAAGGTCCTTCATATCACAACAAAATAATGACTTAGCCTTGAAA
AATAGTTTAACCCAACAATCAAATATTGACCAATGCTACTAATGAACAAA
GCGTGCCCTCTGAAATTATGTCAATCAGTAATACCTACTTGAAACAAAAA
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GTTTTTATTATAACCTCCATTATTACCGTTTTCTTTTTTTTATAGTACAG
AATATATACTCTATATCTGCCCAAGTTGAGTTTCAAGTATCTAGTTCAAG
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AAACTTTTTCTTTTTAATATTGCTATAAAAAAAAGACAAATAAATATTTT
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AACACCACTTTATTCATATGACCACCGTCGCTGGCCTTACAGTAGCCCCT
TTTGTATTTTCGATTTCATGAGCTTCAATAGCTCCAAGGGCGACTCCAAT
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CGAGGTGGGCAGTTGACGTTGCCGTTTCGGCTTATGATGCGATTGTCGAA
GACAATGTGCAAAAGATCTACTGTAACGTTGGCTGTGTGGCACGTAGCGC
CATCCTGTTGGAATCAAATGTCGTCGATGTCTTCTTTTTCCATTTGAGGA
AACAAAAAATCTTCCAACATGGCCCGATAGCGCTCACCATTGATCGTAAC
GGCAGCTCCTTGCTCTTTTTCTCGCTTTCGGCAAAAGCAGCAATGTTTTC
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AACCAGTTTTGCGCACACGCTTCACAAATTTATCCACAAACTGCCTGGAA
GGCGCTTTATTTCTACCGACGTAATTTTCTTGCAGTTTCGTTTGAAGACT
CTCCATTTTGGAAGTAAGTCTTCAGTATTTCCTAATTTTGTTCGAGCGTA
AACTTAACCATCTCGTAACCCGGAGACCTTTTAAAAAATATTAGACACAA
TGAGAATGTTACTACAGCTGTCAAGCGTCAAAAAAGTGGTAGTTCAAAAT
GCAATCGCTAGATTGGGTTATGAAAAGGTTCTGTGATTATTTTTTGATAT
TCTGTTACCACCGTCTTTTTACATCAACAAACAATACAAATCGTTTAGTC
ATTTCATTATCATGAGCGAGCTACAAGCAAAAAGGCAGTGCATCCAATAT
CTCTTAGATGCAAGAGTTGATTTAATGAAGATTACGGACATTTTTATGTG
TTCTAGAAGCCTGGTTTTTAAGTTGGCCAAGATGAAAAAAAGAAAAGAAA
AAGAATACATCTTCAGGATGTCAGAAAGTGGAGGGKCAAATTTAAAGAGG
GATACGAAATTTTTGTAAAAGTTGGAGAAGAATATAAAGGAGGATCCGAT
TAAGTTGATGACTCGCCTCACCAACGACTTCTCTGTGGCTCCTAGGACCA
TTGGGAGGCCTATAAAGCACAACTTAGGATTAGTTTATCTCACAAGGATC
CCACTTCACCTTCTGTCAGAGGCTTCTTCAGAGCCAGGAGGGTCGAGAGG
TGCAGAAAAATCCCCCCATGGATCAAGTCAAATTGGTCAATTGTGAAAAC
ATTTCTAGGACAAGAAGATTTTCATAAACGCCGGAACGACTGCTGGCTTC
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CAAACAATGTTCCTCGGCGTTGTGCCTTCAATAGAAAGAAGATACTTCCG
TTCTTTTTCAAGGCTGGTGTGAAAATCAGCCGAGAGGCCTACTATAAGGT
GCTTAGGTACACCATCTTACCATGGCTGAAGACCAACTAACAGGAGGATA
ACAAATGTGTGGACTCAGAACGGCGCCCATTCTCACACACAAGGGTCAAA
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AGATTTGAACCCACTGGACTTTTCTATATGGGAGACTTTGGAGNAGGGAA
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TGGCCATATTGAGAGCAATTTTTTTTTTGCAAAAACCTTGTCTACATGTT
TTGTTTACATTATTTCTAAATCCATCTCTCAAGTCCACATTTTGCCCTAC
CCTGTATCTGTATAGTAATTATTCTGTTTCATGGGCTAATGGATTTGACT
ACATAGAAGTTCCTTACTAATTGTGTTCATCCTGTAATTATACTGTAATG
GTTCATGGTAGATACAAGAAAAAGTCCTACTGCGGTACTTAATGAGATGT
GATCTCCGCCGGCCACGTCCCTCAGTCGACCGATCTACTCCGAGCCCCCC
TCCCACCCTCCAAGAATACTTCATTAGAGACAAAGTCATAATCTCTTCCA
CATGATGATACCTTCCATTTACTTTCCTGATCCTCTAATCTGTTAATTGT
CCGAATATCTCAAAAAAGTCAAAATCCCTATTCTTGTAATCAAAAAATAT
ATTCTTCGCTTTGAGAAGTTATTTCCTTATTATTAAAATTTTGCAATAAT
GCATTTCAACGATCCCCTGTCTTCAATTTCGAGATAGAAAGATAAAGTAT
GACCGCAGGCAAACTTATACAATGTATCCAATTTGTTAAATAAGTATATT
AATTAGTAAATATAATAATTGTAATAAAACTACATACAATGGAATAAAAA
ATCCTATTCCTCTTCTTTTGCATATGATGTACAAATTTTACTCCTCTACA
AAATTTCATTTTTTAGTCCTTGGATTGAGATGATGTGTTTCTGATTGTTA
TGAAAAATATGAAAAGGACCTTTATAACAGGAAATTTCTGCTTTTGTTGT
CTACTAAGTGCTTTTTGAAAAATATTTCTTCACTACATTTACATGATTTA
ATGTTATATTTCGCCTTGAAAGAAAGCACACTATATATTTTGTAGTTAGA
TATTTCCAGATTCAATACACTTTTCTATCTTTTTATTAAGCGGAGAAAAT
GCCTTGTTAGTGGAAAAAAATGACGAGAAAGTGAGTTACCTTTTCTATGG
AAGGCCAAGAAATTCTTCATTTTTGATCAGAGTGATCAAAATCATAGTTT
GTTTTAAAGTGAAGACAATAAAGAACACATTAAAAATGCTTGATTTGTTG
TTTGGAAAACTTTTTTCCCCTATTTATAAACAGGGGATGACAAAAAATTA
GAAAACATTTCGACGCCATATTCAATTCTACATGTTTTAATTTTACGCCA
TTCTTATGGCAAACTTTTGAATTAAAAGTTAGTAATTCAACAATTTTCTA
CATACACTTTTTATTCAATATGTCCACCTCAATTCTGAATGATGGCTTCA
ATACGGGGACGATCAGAAGAACAGCTGGCCTGGATGAAGTTCGAGGTCAA
GTTGTTCCACTTTTTGGTAATTATGGCCTTCAGGGCATCGACATTCGAGT
GATAAGTCTTGTTCGTCTTGCTCTCCAAGGCGCACTAAACAGAGAAGTCC
GGGGGGTTCACGACAGTTGAGGACGAAGGCTAGAGGTCTACCGACCAGAA
GGTAGGCATTTTCTCCCTGCAGAAATGCTACACCTACTTGGACTAGTTTT
CCAGGGCGCCGTCTTGGGTAAACACATAGTTGTCTATGGAGAACGTGCTT
TTTAACAGTGGCAAGTCATGATATCTGAGGACCTTGTAGTAGATGTTCGT
GTTGACTTTTTTGGTGGCCTTGAAGAAGTAGGGATGCATCTTGCTGCCGT
GGCATGGCACGAAGCCAAGTGCCATGACCTGAGCTGTATGTTTTGTTCTG
AAGATTCTCACGACCTGAGCTCTTGAGTAAGACAAGAAGCGATCATTTCT
CCTGTCCAGAGCAGCATCCACTGTGATCTTCTTGTCGGAGATCACACAAA
CAAGGCAAACCTCAAATTGTAGATTCTTGTCAGCTCTTTTGAATGACACC
AAGTATAAAATAGTCTGACTTTTAGAACTGAGGCTAYTCAGMCTCTWAGA
TGATTCTAATTTTGAGTCCTCACCCTGTAGGAATCGAGGTTTGACTAGAG
ATTTTGGGTAATAAAGATTATTTTCATACTTTTCGGAGTAAAAGCAATCA
GAAACATACCAAATCCATCCAATTCAAGCGCAAAAGTTTTATTATTTAAT
AGTTCATTTTTGGATATGAAACTCATAATCTATATTATAGAGTAGTAACT
GAGTATATACAGCTTCTTTCCTAAGCATAAGTACATAGATTTCATTGTTA
CCTAGTTTCTTGTAAGAGGATGTATGTTGTTACTTGTGTATATGCAATCC
AAGCATTTCTATTGAAAATATAAGGGTAATAATCATTTCTCAAATGAGTA
TCCTTAGTACATAGTTTTGTGCAGTCCTTATTGGTCCATTCCAGTCTTAC
AACCGGTCCTATCAATCCTTAGTACCTTTCCTTAAAACTGTAGGCCCTTC
GGACTGTCAGTAATAAAAGTGATTTTAAAAAGAGATAATTTGAGTGACGT
CATCAAGGACCGCACTTTATAAGTTTTAAGACTGAGCTGGACAGGACTGA
GAGTGAACTGGATGGGGCTGCAGTTCTCAGTCCTAAATAAGGATTGACAC
AACACTAATTCCTAGTGCAAATAAATCAAGTCTGGATCCTTCAAAATACA
GACTCGAGTCCAAAGCTCTCATTTCTGTTTTTTTTAACTCAAATAATCCA
TATCAACCTGTATGTCTGACCCTATTTTAAACTGTTTTTACATTCAATAT
CAAAACCAGTTTTGACTACTTGGTTGTGGTTTTATAGTCAAAAATAAAAA
CTGGTTACATTAACCACATTTTTTGAGTACTAATTAAAACATACCTATAT
CAATGCAAGTATTTTCTCTTTTGTGTCTGTTATATGAAAAATATAGAAAT
CATTCAACGTGTATTGTTTAAACTTCTTCTTCTTGAGGATAATGAAATTG
TTCGAGAGTTAAAGAAGATTGAACATTACTCAAATCCACATTAACTTATA
ATACCAATGATGGCCTAATAGTCAAAATACATTAAAGTACGATAAATAAA
AAAAAGCCAAAGTAAATTTAATTTAAGGATAAAATAAGAGCAAAATACTC
AGATAACATGGCTTMTGGYCTGCAAACGTCAGTCTTCAAATTGAGMATCT
ATGATTMTGAAAAAATTTAATTCTTTTAGTAACATTTTGCAACTATGGAC
GTTGATGCTTGCCATGATGCTCCCCGCTGGTATAGTTATTTTTGCAAAGC
AAGTTCTGATTGGAAAACAAACGCTTCTCTGTCATGGAATTCCTATTGTT
AATCCAGGATATTATTGTATATACGTAGGCTGCTTTAAATATTTCTAACC
TAATAATGAAAATGCGAATATTTATCATCAAAAATGGTTTTATTGTTTTT
CAAAGTATTCTCCAGAATGATTTATACACTTTTGCATGCGCTCAAACCAA
TTTTCGAAGCTCTTTTTCCACTCCGATTGAGACACCTACAAAACATAGTT
TTAAACGCTTCAATAGCATCTTTTGGCGACGAAAATCGTTGACCACGGAT
TTTTTTCTTGATGTGCGGGAATAAAAAGAAGTCATTGGGTGCCCAGTCAG
GGCTGTACGGCGGYTGACACATCAATTCGACGTTTTAGGACGGTCAAAAA
GGCGCTGGTTTGATCCGATTTGTGATTGTCATGGCGAACAATGATTCGTC
TTCTCTTGTTCGTTTTTCGAATTTCTCCAAAGACTTCTAGCAAACAAATT
GTGATGTACCGCTCAGAATTGGCTGTCCTACGATACTCAAGTGGAACAGT
CACCACATGACCAGTATTGCCGAAGAAACAGGTGACTATTTGCTTCGAAG
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