EMLSAT00000007791, EMLSAT00000007791-703638 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007791
Unique NameEMLSAT00000007791-703638
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s457supercontigLSalAtl2s457:159158..178306 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007791 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007791EMLSAG00000007791-690557Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000034447EMLSAE00000034447-743375Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034448EMLSAE00000034448-743376Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034449EMLSAE00000034449-743377Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000034450EMLSAE00000034450-743378Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773528auto773528Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007791EMLSAP00000007791Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007791

>EMLSAP00000007791 ID=EMLSAP00000007791|Name=EMLSAP00000007791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=75bp
MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIV
IFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007791-703638 ID=EMLSAT00000007791-703638|Name=EMLSAT00000007791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19149bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCTTATTAAATATATAGAGGTAGGTACATGTATTAAAGAGATAAATTA CTAAATTCTGACAATGGACTTAATAATTAAAACTTAATATATTTGTCCTT TCAAAAATGAACAGTACATTGTACATGATAGCTTTACACTTTCAATCTAG AACCTTATCAAGATGTATTTCAACAACTAGCTGTAATAAGGTATAAAATA AAAATAACTCATATGATGTCATGGCTACCCTTATCAATGATGTAGCCCAA CGTGGCAGCAATGATGGCTTCCAAGCGGCCACGGAAGGNGTTGTACCCAT AGCAGATGTAGTTCTCTGACATGAGATCTCAGGGCTGTTTGACGGTGTCC TTGAGGTTGTTGATATTTGGGTGACGAAAGGTGTAGGCCTTGGACTCAAC ATTCACCCAAAAAGTGAAGTCCAATGGGGTAGCATCTGGTGAGAAAGGCA AGTTGTCCTCCAACCACTTCTGGTCCTTTTTGGACATGTGTGCAGGCGCA CCATTCTACTAGAACACCACGTTCATGTCCAAGTTCATGTTGGAGATCCC CAACTGCTTTGCAACCTTTGTTAGTTTCTCGCCAGTGTTCAAAAGGGAAC GGAACAAAATTCGTTTGTCAAGTTCAGATGCCATTTTCTCGGTATCTTAG ACACTTATCTATTTTTTTATTTATTTCATTTTTTGTTTATTTTTGTAATT GACCAGAACAATTTTACCGCATTACCAAAAAAAATGATTTATATAGCAAA AGCGAAGTGTAATTTTTCCGCCACACCCGGTATATAGAGAATATAATGTT TTCAAATGATAAATATATGAATATATTTAAATGTTAATTTGTAATAAATG TTATTATTTAAATTTTTTAAATAAAATATCTAAATTTATAGCTATTCCCA AAAAAATTGCAAAATCCATAGCCTTTGTATAAAAAATTAAAATGTTAAAC TTTTAGGAAAAAATTTCAAAAATCCAAAGCTGTTCACAAAAAAAAAACAG CAATTTTTTGGAAAAAAATTCAAAAATCCCAAAAAAAAAGTGCATAAATC TACAGCTGTTCTCAAATAATTAAATTTTTGGGAAACAAATTTGAAAAATT ATATTTCAAATGTGAATTTTTGGAGAAAAATTAAAAAAATCCATAGATAT TTATAGAAAATGAAATTTCTTGCAAAAAAAGTTGGAAAATTTAATCTGAT TTCAAAAATTAAATTTTCTAGTAGAAAGCAAAAACAACCCCTCAAACCCA CACCCTGTGGACGACCCTGCAAAACTGTAATAAAAACAAATTATCAAACA GATCTCTGGAAGTTAAAATATGATAACTTGGATTCTTGGACAATTTGAGA AAAAATAAATGGGATTATTTATAAATCCTATTATGTTGTTCAAATTGTGA AAGTATAAAACTTTAGTTATTTACGACAAATTGAATTTCTTGGTTGTATC AAATATTAAAAAAATATCCTAAAATGATTTTCTTAAATGGTGTAAGCAGT TCCCCTCTAAATGATTCTTCAAATTGTCAGGATTACCATGTTGATTTTTG GTTTCTTTTTTTTTACATGCCCAAAATACACGTGATTTTCATCACTAGTC ATGAATTTTATCAAAATTGTGATGGTAGTGTAAGATAAAATGTAAAATAT AATAACTTAAAATTGCTTTTTTTTAAACGAAGATATAACAGCATTGGAAT TTTTTATTTTTTTTAAGCTCCTGGAATTGAACTTAATCCTCATATAAAAA AGAATATCAACCCTAAACTCTATTGTTTACATATCTTGTAAAAACCGATG AAATAAGTTACTTTTAATTAATACTCTTAGTTAAAGTACTTGGTAATTGC GAAAAAGTCAACATGCCTTTTATGAAGACGTGCACAGTACATCTAAAGAT 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CAATTAACCCTTTAAAGAGTATATCTCGTGTTCAATACTTACTTCTTCCT TTTTGTGCCAGACCCGATATCTTGTCTTAAAAGAAAAAATTAAGATTTTT TTTTCTGGGAGCTTAGACTTGGAATGAGGCAGCTGGTATAGATTGAATTG AAATTAATTGATAAATTAGAGTAGGTTTGGACTACAAAGCGATTGAGAGT TCTTAAACTTTGGGACTCTTTGAATCCATGGTCATATTGATTTCGATAGA GATTAACAAAAGGTGTAACCTTCTCAGAGGATCGATCAATTCACTGATAT AAGATCCGTGGGTCTTCTTCATAATACTTCTCTCACAAGAGCATGATGAT ACTTCCCCTCTTCCAGATGAAAAATATATATTAATTTCCGTTTTTAGGTA ATGTCCAAAAGTTAGATGCTCCTTCGTTTGGTTAAATTTGAAAATATATA GTACATAATATGTAAAATACTGGTTTCTTTCTTTGATTATTTTAACAGGT TTAAAATTTCATAACTCCTTGTTTTTTTCTACTATGAAGAATTGTGTTGT GAGTAGATCATATGATTTCTAATAATAGGAATCCTCCTTGTTCAAATATC AGATGATTATAATATTATGTTTGTACGTAAAGTAACAAAAATACCTTAGT AGAAGGTTAAATAATTATGTTACTAACAAAATAACAAATTGAACTTTATC AAAGTTAGATAATTTTTAAACAGACAAGAATACATTTTAAATCTATTTAT ATAATTTAATTTACATGTCTGTGCATGAAACAAATTCGTTTANNNNNNNN NNNNNNCCATATCTATTAAATCAATTGTATACATAACCTTAAAAGTTTGA CTCCGAAAGTGTATACTAATAATAAAGTTATTATTTAAATTTATAAGAGT TAATACATTTACTTTTTTATCATTATCAGACTTAACTGTTCTTTTATTGA 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CAGAACTTGGCGCAGGTTACCACAATATAATTGGCGTACATATTGCCCCA TTGCTTCTTGATGCTGGCCTTGAGCTCTTGCACATTTATGTGTGATGCCT TCCCAGCCTTGCTTTCTAAGACGCTACACAGACTGAGGTCGAGGAAATTG AGGTCAGGACTGGAAGAGGGCCAGAAGGGATTGTCCCAGAAGTCAACAAA GTGCTCCTTCCAGAAGTTACGTGTCTTCAAGGACGTATGGGTGGGGACAC CGTATTGGGCCCACACATAGTTGTTCCCAGGATAGTTAACCTTCAGCCAG GGCAAGATTTTCAACCTCAGTACCTTATAATAGTCCTCAGCCCCGATTTT CTCATTGGACTTGAAGAAGAAGGGATCCATTTTCTTCCCATCAGAGGCCA CAACTCTCAAGTACATTTTTTTTTGGTAGGATGTTTTGTTCTGAAGGTGC CCTGGACTTCCTCAGGTGATGCTGCTATAAATTTGTCGTTTCTGCAGTTA AAAACCTGGTGGACTGTGAAAACATTCTTGGCTGATAAGATCTTCATAGT CGACAGATGACTCTTTAAGTAATTACGGACTTTTTTGCCTCTCTCAAGTC TTAATCCTGTCGGTGAGGAGAGGTCTTAGAGTTCTGACAAAGCTCTTAAG GCCAAGTTCATCATGAACTGCCCTCCTGATGGTGATCTCATTCATGTTAA ACATGTCATACAAGCGGCGTATTGATGCTGTTAAATGTTCCTTGATCTTG GCCTCTAGGGACTTTCAAAATGTTTAATCTCACTTCAAACCATTTCCTCC ACTTCCTGCCTTCATGTTTACTCCTTTCCCATTCTCTTTGGCCACCCTGA TACTCCGGACTGCCCTCACGATTACGTCAATTATAACTAAATTCTTTTTG GATCAATAACCACGTCGAGAAGATCGGAAACCTTTTTCCTTTTTGATTCC 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TCTCAAATTGCTAAGTAGCATATCATTTATCATTAACTTATTTCATTCCT ACATATTATATTTCGTATGTGGTTTTAATTTGCACATTTTGACATAAATG TTCAACTCCTGTACATAAAATTTCAATCATACTTTCTTACAGGCCAAATT AGTAATACTATAGAGTTTGGTGACATCATTTCTCTTTTACCTATTTGATT TTTATTTCATCATATAATTGAATCTATTTGGCTATCATTATGTCCTCCGA GAAGTCGTAAAAAAGTACTGTTTTATACTAGCAATATGGTGAAATCCATA TACATATAGTATATTTCTTTCTCTAGGAATCACCGGGGTACGAACGTACA CACATCTCAAGTTTAAGAGAACAACTCTCGATTGTGCTGTCCATGAGCTA TGGCGATTCCATGTGATTCTCTCTGTTTTTCATGAGCACACTCACACGTA GTTACTCAATACTTAGACGTTCTCGCCTCAAGAATAGAAAAATTATAATA GCAACATTATAATTTAAAAAAAATTGATTTGATGAGTCAATGAGCACTTT AGCTCGTTGCTAAACCTCATCTAAAATTTTATTCATTTTTTAAATTATAA ATAAAGTACTTCCCTTTCCAACTCTTTTAATATGAGTTGAACTAGGGACC TGCAGGATTTCATTCATTCTTACATCCCAGTGCTTTGTATTGTATAAAAC TCTTAATGTATACTTTTAAAAACAATTATGATATTCATCTGAGAGCAATA CGGTGTTTCCTGTATATTAAAATCTCTTTTTCTTCTTTATACTGCAAATG ATATATATCAGGGATCACTTTATAGAATTCATCCTGTCTACACATTCAAT TCGACTTGCAAAACGCCTGCAAAACATGATTAATATGACTATATTGTTAT TTCTTAAATCAAAAATATATCTATGATATACATTAGGGAGATGCAATTGT 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AAGTTAGTAATTTATATTTCATTTTTGTAGCTTCTTGATGAAAGCTGATT ATTAATTGTACTGATTGTTTACTCCGAAAAAATCGATGACAAGTTGAAGG GTTTTTATTATAACCTCCATTATTACCGTTTTCTTTTTTTTATAGTACAG AATATATACTCTATATCTGCCCAAGTTGAGTTTCAAGTATCTAGTTCAAG TCCTTGTTTCTGGAATCATTTAACGAATATATTCCGAAAATATACTTTTT GTAGGAATATGAAATACCTTAAAAGTGTGTCAAATAAGCAGTTCATTTAT ATGTATTTAAAATAATATTGAATTCGTTTGGTCAGGTAGATTTGCTGGGT ACATTTTATAAGTTTACCCAACTGACATACTTTCTCATTCATCTTAAAAT TAGAGACAAACGTAGACTCTTATTTTCTCATTACTAAAGAGTGGCCCACG AAACTTTTTCTTTTTAATATTGCTATAAAAAAAAGACAAATAAATATTTT TCAACAATTTTTATTTTATTTGAAAGCCTCAACATTCCGGTTAATAATGG AACACCACTTTATTCATATGACCACCGTCGCTGGCCTTACAGTAGCCCCT TTTGTATTTTCGATTTCATGAGCTTCAATAGCTCCAAGGGCGACTCCAAT TTGGTGTTTCAAATCGTCAATCGCCTCTGGATGGTTGTTGTAACATGTAT CCTTGACGGTTTCCCACAAAAAATAGTCCAACGGAGTCAAATCGCAGCTA CGAGGTGGGCAGTTGACGTTGCCGTTTCGGCTTATGATGCGATTGTCGAA GACAATGTGCAAAAGATCTACTGTAACGTTGGCTGTGTGGCACGTAGCGC CATCCTGTTGGAATCAAATGTCGTCGATGTCTTCTTTTTCCATTTGAGGA AACAAAAAATCTTCCAACATGGCCCGATAGCGCTCACCATTGATCGTAAC 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