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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000007791 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000007791 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s457:159158:178306:1 gene:EMLSAG00000007791 transcript:EMLSAT00000007791 description:"snap_masked-LSalAtl2s457-processed-gene-2.9") HSP 1 Score: 152.14 bits (383), Expect = 3.267e-49 Identity = 75/75 (100.00%), Postives = 75/75 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIVIFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD 75
MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIVIFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD
Sbjct: 1 MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIVIFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD 75
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000007791 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000007791 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000007791 | 3.267e-49 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s457:15915... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s457 | supercontig | LSalAtl2s457:159158..178306 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | snap_masked-LSalAtl2s457-processed-gene-2.9 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000007791-690557 ID=EMLSAG00000007791-690557|Name=EMLSAG00000007791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=19149bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCTTATTAAATATATAGAGGTAGGTACATGTATTAAAGAGATAAATTA
CTAAATTCTGACAATGGACTTAATAATTAAAACTTAATATATTTGTCCTT
TCAAAAATGAACAGTACATTGTACATGATAGCTTTACACTTTCAATCTAG
AACCTTATCAAGATGTATTTCAACAACTAGCTGTAATAAGGTATAAAATA
AAAATAACTCATATGATGTCATGGCTACCCTTATCAATGATGTAGCCCAA
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ATTCACCCAAAAAGTGAAGTCCAATGGGGTAGCATCTGGTGAGAAAGGCA
AGTTGTCCTCCAACCACTTCTGGTCCTTTTTGGACATGTGTGCAGGCGCA
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GGAACAAAATTCGTTTGTCAAGTTCAGATGCCATTTTCTCGGTATCTTAG
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ACAATGCGAAATGTTATTGAAAAAACTTTAAGCAATTAATCTTGCCAAGA
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TCCCAGCCTTGCTTTCTAAGACGCTACACAGACTGAGGTCGAGGAAATTG
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GTGCTCCTTCCAGAAGTTACGTGTCTTCAAGGACGTATGGGTGGGGACAC
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CTCATTGGACTTGAAGAAGAAGGGATCCATTTTCTTCCCATCAGAGGCCA
CAACTCTCAAGTACATTTTTTTTTGGTAGGATGTTTTGTTCTGAAGGTGC
CCTGGACTTCCTCAGGTGATGCTGCTATAAATTTGTCGTTTCTGCAGTTA
AAAACCTGGTGGACTGTGAAAACATTCTTGGCTGATAAGATCTTCATAGT
CGACAGATGACTCTTTAAGTAATTACGGACTTTTTTGCCTCTCTCAAGTC
TTAATCCTGTCGGTGAGGAGAGGTCTTAGAGTTCTGACAAAGCTCTTAAG
GCCAAGTTCATCATGAACTGCCCTCCTGATGGTGATCTCATTCATGTTAA
ACATGTCATACAAGCGGCGTATTGATGCTGTTAAATGTTCCTTGATCTTG
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ACTTCCTGCCTTCATGTTTACTCCTTTCCCATTCTCTTTGGCCACCCTGA
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GATCAATAACCACGTCGAGAAGATCGGAAACCTTTTTCCTTTTTGATTCC
TGTTCACTAATTTTTTGGCCGATTTTGATCAAATCAAAACAATGCGCAAG
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TTTTTAGCGTAAAAAAATAATTTTAATGACGCAGAAAATTTCCCTGTCGT
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TGTTCCGGCTTTGTAAATTTGCGTGAGCTCATAAACCATGAATATTTGTT
GCAGACTTATAATTTGAAGTCATTGTTGGACTCAAAATAAATCTGAGGAC
TGACATCTGAGTAGTTCTTGTATATCTCCTTGTTTTTTCCCCTTGTTATT
ACAGCTAAGCTCCTCCAAATTATTCTTCAAATTACCAGGGCTATTATGCT
GATTTTTGGTTTCTTTCCTTTTAACATTCCCAAAATACTCTGACTTAGCA
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AATTGTTAGAGAAATATTAGTAAATTGGTTAAATTTTTTAAAGAGTGAGA
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TCTGAAAATTATGTGAGAATTTATTCTGATAAACTTAAAGAAAGAAGTAT
AAAAGTCAGTGTCTCCAATTATATTGTTTGAATGATCGATTTGGAAAAGT
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CAAATAAGAGGGGTCTCTATATAACAAATGTATACTATTAAAATTCCAGA
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GTTATACTATTGTGGTTTTTTTTTCCTTCAATTATCTATTAATTTTATTG
CCATTCCTTTAATTGTTTCATAGTTTTTTTAATCATATTTAGGATCTGCT
AATGTGCTTTGTTGTAACTAATGTCTGTTTTTCTAGGAAAGTATTTTTAA
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AATAATATTTTCAACATGTCATTAGTAACCAATTCTGAGCACATATTACA
AATAATTTGTAAAAATAATCTACTTTCAAATTCAAAACTTATACCTTTAT
GATCCCTTTAAATATACTAATAAATTAACTTTCAATTATATTTTATAGCT
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TAATAGTTTCTTTTATCGTGATGGATTAAAATATATAGATTCATTTCCTA
CAAAAATTATACCAACTGAAAAGGAAGAAAAAATATTATGAATTTTGGAA
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GTCACTATATTGGGGGTTTAAGTAGAGTATCATGTTCAATTTCTTTAAAA
AAATGTATCGAGCTCAGTTGAAGTTCTCTGATTTCTTTCGAGTTCATTAC
GTGTACATAATTATACCTATAATTTGTTTTAACCTTTAGGCTTTTCTTGA
GTTTGGAATAAATTAGTAATTATAAATAAAAAGTAATGGATAAGATCAAA
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ACATATTATATTTCGTATGTGGTTTTAATTTGCACATTTTGACATAAATG
TTCAACTCCTGTACATAAAATTTCAATCATACTTTCTTACAGGCCAAATT
AGTAATACTATAGAGTTTGGTGACATCATTTCTCTTTTACCTATTTGATT
TTTATTTCATCATATAATTGAATCTATTTGGCTATCATTATGTCCTCCGA
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TACATATAGTATATTTCTTTCTCTAGGAATCACCGGGGTACGAACGTACA
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TGGCGATTCCATGTGATTCTCTCTGTTTTTCATGAGCACACTCACACGTA
GTTACTCAATACTTAGACGTTCTCGCCTCAAGAATAGAAAAATTATAATA
GCAACATTATAATTTAAAAAAAATTGATTTGATGAGTCAATGAGCACTTT
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ATAAAGTACTTCCCTTTCCAACTCTTTTAATATGAGTTGAACTAGGGACC
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NNNNNNNNNNNNNGTTTATTAAATAAAGAAGACATTACTAAACTTCAGTT
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TGCTGTCCAGTCATAATTACAGTCCCCTTAGGTAATTCTTGACCTGTATT
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TCTTTAATTTCTGTACTGAAGTTTAATCATGTCTATTATATTTTATAAAC
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GCTTCATACATGTTTAGAAATTGCAATTGTGCTATGTGTAAACGTTAACC
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GTTTTTATTATAACCTCCATTATTACCGTTTTCTTTTTTTTATAGTACAG
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GTAGGAATATGAAATACCTTAAAAGTGTGTCAAATAAGCAGTTCATTTAT
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ACATTTTATAAGTTTACCCAACTGACATACTTTCTCATTCATCTTAAAAT
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AAACTTTTTCTTTTTAATATTGCTATAAAAAAAAGACAAATAAATATTTT
TCAACAATTTTTATTTTATTTGAAAGCCTCAACATTCCGGTTAATAATGG
AACACCACTTTATTCATATGACCACCGTCGCTGGCCTTACAGTAGCCCCT
TTTGTATTTTCGATTTCATGAGCTTCAATAGCTCCAAGGGCGACTCCAAT
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CCTTGACGGTTTCCCACAAAAAATAGTCCAACGGAGTCAAATCGCAGCTA
CGAGGTGGGCAGTTGACGTTGCCGTTTCGGCTTATGATGCGATTGTCGAA
GACAATGTGCAAAAGATCTACTGTAACGTTGGCTGTGTGGCACGTAGCGC
CATCCTGTTGGAATCAAATGTCGTCGATGTCTTCTTTTTCCATTTGAGGA
AACAAAAAATCTTCCAACATGGCCCGATAGCGCTCACCATTGATCGTAAC
GGCAGCTCCTTGCTCTTTTTCTCGCTTTCGGCAAAAGCAGCAATGTTTTC
GATTGAACGCACTGGTCGAACGCAAGAACACGTTGTTTTATCCATTAACG
AACCAGTTTTGCGCACACGCTTCACAAATTTATCCACAAACTGCCTGGAA
GGCGCTTTATTTCTACCGACGTAATTTTCTTGCAGTTTCGTTTGAAGACT
CTCCATTTTGGAAGTAAGTCTTCAGTATTTCCTAATTTTGTTCGAGCGTA
AACTTAACCATCTCGTAACCCGGAGACCTTTTAAAAAATATTAGACACAA
TGAGAATGTTACTACAGCTGTCAAGCGTCAAAAAAGTGGTAGTTCAAAAT
GCAATCGCTAGATTGGGTTATGAAAAGGTTCTGTGATTATTTTTTGATAT
TCTGTTACCACCGTCTTTTTACATCAACAAACAATACAAATCGTTTAGTC
ATTTCATTATCATGAGCGAGCTACAAGCAAAAAGGCAGTGCATCCAATAT
CTCTTAGATGCAAGAGTTGATTTAATGAAGATTACGGACATTTTTATGTG
TTCTAGAAGCCTGGTTTTTAAGTTGGCCAAGATGAAAAAAAGAAAAGAAA
AAGAATACATCTTCAGGATGTCAGAAAGTGGAGGGKCAAATTTAAAGAGG
GATACGAAATTTTTGTAAAAGTTGGAGAAGAATATAAAGGAGGATCCGAT
TAAGTTGATGACTCGCCTCACCAACGACTTCTCTGTGGCTCCTAGGACCA
TTGGGAGGCCTATAAAGCACAACTTAGGATTAGTTTATCTCACAAGGATC
CCACTTCACCTTCTGTCAGAGGCTTCTTCAGAGCCAGGAGGGTCGAGAGG
TGCAGAAAAATCCCCCCATGGATCAAGTCAAATTGGTCAATTGTGAAAAC
ATTTCTAGGACAAGAAGATTTTCATAAACGCCGGAACGACTGCTGGCTTC
CAGAAACAAAAGAAGAGGTACAAAGGGTTTACCACACCCAATATCTGGCC
CAAACAATGTTCCTCGGCGTTGTGCCTTCAATAGAAAGAAGATACTTCCG
TTCTTTTTCAAGGCTGGTGTGAAAATCAGCCGAGAGGCCTACTATAAGGT
GCTTAGGTACACCATCTTACCATGGCTGAAGACCAACTAACAGGAGGATA
ACAAATGTGTGGACTCAGAACGGCGCCCATTCTCACACACAAGGGTCAAA
AGTTATGTTCAGATAACATGGCTCGATTCTGGTCCAAAGAGATATGGTCT
AGATTTGAACCCACTGGACTTTTCTATATGGGAGACTTTGGAGNAGGGAA
ACCAACAGGATCTCACACACAAATGTATATGCTGTGATTGATATTGAAAT
TGGCCATATTGAGAGCAATTTTTTTTTTGCAAAAACCTTGTCTACATGTT
TTGTTTACATTATTTCTAAATCCATCTCTCAAGTCCACATTTTGCCCTAC
CCTGTATCTGTATAGTAATTATTCTGTTTCATGGGCTAATGGATTTGACT
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GTTCATGGTAGATACAAGAAAAAGTCCTACTGCGGTACTTAATGAGATGT
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TCCCACCCTCCAAGAATACTTCATTAGAGACAAAGTCATAATCTCTTCCA
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CCGAATATCTCAAAAAAGTCAAAATCCCTATTCTTGTAATCAAAAAATAT
ATTCTTCGCTTTGAGAAGTTATTTCCTTATTATTAAAATTTTGCAATAAT
GCATTTCAACGATCCCCTGTCTTCAATTTCGAGATAGAAAGATAAAGTAT
GACCGCAGGCAAACTTATACAATGTATCCAATTTGTTAAATAAGTATATT
AATTAGTAAATATAATAATTGTAATAAAACTACATACAATGGAATAAAAA
ATCCTATTCCTCTTCTTTTGCATATGATGTACAAATTTTACTCCTCTACA
AAATTTCATTTTTTAGTCCTTGGATTGAGATGATGTGTTTCTGATTGTTA
TGAAAAATATGAAAAGGACCTTTATAACAGGAAATTTCTGCTTTTGTTGT
CTACTAAGTGCTTTTTGAAAAATATTTCTTCACTACATTTACATGATTTA
ATGTTATATTTCGCCTTGAAAGAAAGCACACTATATATTTTGTAGTTAGA
TATTTCCAGATTCAATACACTTTTCTATCTTTTTATTAAGCGGAGAAAAT
GCCTTGTTAGTGGAAAAAAATGACGAGAAAGTGAGTTACCTTTTCTATGG
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GTTTTAAAGTGAAGACAATAAAGAACACATTAAAAATGCTTGATTTGTTG
TTTGGAAAACTTTTTTCCCCTATTTATAAACAGGGGATGACAAAAAATTA
GAAAACATTTCGACGCCATATTCAATTCTACATGTTTTAATTTTACGCCA
TTCTTATGGCAAACTTTTGAATTAAAAGTTAGTAATTCAACAATTTTCTA
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GTTGTTCCACTTTTTGGTAATTATGGCCTTCAGGGCATCGACATTCGAGT
GATAAGTCTTGTTCGTCTTGCTCTCCAAGGCGCACTAAACAGAGAAGTCC
GGGGGGTTCACGACAGTTGAGGACGAAGGCTAGAGGTCTACCGACCAGAA
GGTAGGCATTTTCTCCCTGCAGAAATGCTACACCTACTTGGACTAGTTTT
CCAGGGCGCCGTCTTGGGTAAACACATAGTTGTCTATGGAGAACGTGCTT
TTTAACAGTGGCAAGTCATGATATCTGAGGACCTTGTAGTAGATGTTCGT
GTTGACTTTTTTGGTGGCCTTGAAGAAGTAGGGATGCATCTTGCTGCCGT
GGCATGGCACGAAGCCAAGTGCCATGACCTGAGCTGTATGTTTTGTTCTG
AAGATTCTCACGACCTGAGCTCTTGAGTAAGACAAGAAGCGATCATTTCT
CCTGTCCAGAGCAGCATCCACTGTGATCTTCTTGTCGGAGATCACACAAA
CAAGGCAAACCTCAAATTGTAGATTCTTGTCAGCTCTTTTGAATGACACC
AAGTATAAAATAGTCTGACTTTTAGAACTGAGGCTAYTCAGMCTCTWAGA
TGATTCTAATTTTGAGTCCTCACCCTGTAGGAATCGAGGTTTGACTAGAG
ATTTTGGGTAATAAAGATTATTTTCATACTTTTCGGAGTAAAAGCAATCA
GAAACATACCAAATCCATCCAATTCAAGCGCAAAAGTTTTATTATTTAAT
AGTTCATTTTTGGATATGAAACTCATAATCTATATTATAGAGTAGTAACT
GAGTATATACAGCTTCTTTCCTAAGCATAAGTACATAGATTTCATTGTTA
CCTAGTTTCTTGTAAGAGGATGTATGTTGTTACTTGTGTATATGCAATCC
AAGCATTTCTATTGAAAATATAAGGGTAATAATCATTTCTCAAATGAGTA
TCCTTAGTACATAGTTTTGTGCAGTCCTTATTGGTCCATTCCAGTCTTAC
AACCGGTCCTATCAATCCTTAGTACCTTTCCTTAAAACTGTAGGCCCTTC
GGACTGTCAGTAATAAAAGTGATTTTAAAAAGAGATAATTTGAGTGACGT
CATCAAGGACCGCACTTTATAAGTTTTAAGACTGAGCTGGACAGGACTGA
GAGTGAACTGGATGGGGCTGCAGTTCTCAGTCCTAAATAAGGATTGACAC
AACACTAATTCCTAGTGCAAATAAATCAAGTCTGGATCCTTCAAAATACA
GACTCGAGTCCAAAGCTCTCATTTCTGTTTTTTTTAACTCAAATAATCCA
TATCAACCTGTATGTCTGACCCTATTTTAAACTGTTTTTACATTCAATAT
CAAAACCAGTTTTGACTACTTGGTTGTGGTTTTATAGTCAAAAATAAAAA
CTGGTTACATTAACCACATTTTTTGAGTACTAATTAAAACATACCTATAT
CAATGCAAGTATTTTCTCTTTTGTGTCTGTTATATGAAAAATATAGAAAT
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