|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s469 | supercontig | LSalAtl2s469:405663..413724 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007944 >EMLSAP00000007944 ID=EMLSAP00000007944|Name=EMLSAP00000007944|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=228bp
MENNRLIFSFQEEELRASSDPKYQHLNEELHVEITAFAPPAEAHARIAYA
LTEVRKYLIPDSNDEIRLEQMREIEILAANGGDSLXIAALAAAAASEPKR
GQTTNTLHAAAAAGGLTLAAANLRPQPTAALLRSPGTPFLGNTGIRNPLT
PTSSTFPPLVHKIVSTSSSCSSSSTSSISSVSSSSTTNNAVAPKNGPHGL
IMGGDGGAEFLHMESACREDGXIWVLYD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s469:405663..413724- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007944-703791 ID=EMLSAT00000007944-703791|Name=EMLSAT00000007944|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8062bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s469:405663..413724- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAAAATAATAGACTAATCTTTTCTTTTCAGGAAGAGGAACTACGAGC
CTCCTCGGATCCCAAGTACCAGCATCTCAACGAGGAACTCCATGTAGAAA
TCACTGCATTTGCTCCACCTGCTGAAGCACATGCTCGCATTGCATATGCT
CTCACTGAGGTTCGAAAGTATCTCATTCCAGACTCTAATGATGAGATTCG
GCTAGAACAAATGAGAGAAATTGAAATTCTCGCAGCCAATGGAGGAGACT
CTCTAKCTATTGCTGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCCTCTGARCCAAAAAGA
GGGCAGACAACGAATACKCTCCATGCAGCAGCTGCGGCTGGTGGACTCAC
ATTAGCTGCAGCTAATCTTCGACCTCAACCTACTGCTGCTTTACTAAGGA
GTCCTGGAACTCCTTTCCTAGGAAACACGGGAATTCGAAATCCACTTACT
CCCACCTCGAGTACATTCCCTCCTTTAGTTCATAAGATTGTTTCGACTTC
CTCTTCTTGCTCCTCGTCATCTACTTCTTCCATCTCCTCAGTCTCCTCCT
CGTCCACTACCAATAATGCTGTAGCACCCAAGAATGGCCCACACGGATTA
ATAATGGGTGGTGATGGAGGGGCAGAGTTCCTACATATGGAGTCTGCGTG
TCGAGAGGATGGGMAAATATGTATTTTATTACATCTTTAGCCAGTTTGGG
TCTGTTACATATTTGGATCCGCAACTAAGGTTTTTAGCTCTAGTATGAAT
AGCCTAATTGTTGTAAACTTGATATCAGGGGATCGAAAGAACAAATCCCC
CTATGTACAAATATCATGTATTTCTTTTAATTGGATTTGTTTTCTTAGCT
TTTTTAACATGTTTACTCATATCAGGGCTAGAAATTCTTGTCTAGCAGGA
ATCATTCAATGCCGAAATCTCCCTTTTCATTCGTACCCTAAATGAATTTA
TTTATTCCTAAATATGTATGATTACTATAATGTTTATGGTTTTTAAGCCA
TTGATTTGATAATGTTTTTTCCATTTCAACGTCATCTATCAATAAAATAA
AACATCTTTATTATACGTGATTTATATTAACAATCCACAGTTATAAATTT
ATTATCAGAAAATTATGTGTAAAATGTCTCCAAATCTTTGCAGATGAGTA
TTTTTATTTCTATGCACGCTGTTACTACACCAACACAAACAATTACGCTA
TATTTTGCTGTCAGCTATCGACGGTTCTACTTCTTTAGCCCTTATCAGTA
CTCTAAACGTGATTGGTTAAATTTGAATGAACTATTGTTAAACTATGAAC
AACTCCCAACAATTATCAAATAATATTTGCCTATTTGGAAAGAATTGGCT
AACTACTACCAACTGATTTTGGGTCTTTTTAAGTTATTTGTTTACGAAAG
GTTGCGTGATACAATAAAATAATCTACATTTGTGGTGATTATAAATGTTT
TTAAAACGTACGAAGAAATGATGATACTTAAAATCTTGTGTGATTTGTAT
AGCTGAATTACTCAAGAATCTTTTTTATAGTTATTATCTTGTGGAACCTG
AGAGATATCTTTGGCTAGGATTATATGCCCTTGATTATTTTTATTAGCCT
CTACAGTGAAAAGCTTTTCGCCCAAGAAACCCAATTCCCAACTCACGTGA
CTTTTTTTAGGATATTTGGAATTCTTTCTCGTCGTTTCCATCTGGAATCG
TTAGAAAGTTGATGCTGGTGACTGGGTCTGTAGCAATTGATCTTAAGATC
CTTCTTGACAAGGTTAATAGAAATATAAGGTTATACCATAACGACTGTAC
GACTTATGTTTGACTTCCACCACGCTTTCTAATATTGACATCATAGTGTA
TGAGTGGGTGTGTGGGTTGTCAAAATCTTTTTTTCTTGCCCAACATTTGG
CAGGATATACTAAATTGAACATTCTGGCAATAGTAACGTCATAGACTATG
AGTGGTTGCGTTTTTTGTCAAAATCTGCGTGCCTTGCGCAGCAGTCGGAA
CGATACATCAAATTGAAAATTCTTTCTACCAAGCCCGAATACATGATGGT
CTAAACTTGTATTTCTAATAACCTTGTTCCTTGACAATTTTCCTCAATGT
TTTAAGACTCATTAGCCATAAAATGAGCAATCTTATTCATTGACTGAACA
CAATTTCGATAAATTCATTCTCACATATTTAACCACTTCAGGGGTTCTCT
TTTTACTAGGCTTTGATTGAGAACTTCCAGTGTCCTGATAACGTTTCAGG
AATTTATAAATGTCCCTTATACTTATAAGTTTATCTAAGATCCAAAATAT
TTTAGAAGGCTTATTTTCTTCTTGATATAAGGAAATGACAGCTTCCCTTT
GATTGATTTCCAATCATGATTTAAAAAGTATTTTTAAGAGTCAAATTTTT
TTAGACAATTTCAGTGGGATAGTATTAAGTGTCATCACTTAATTTGTGGT
GCCAAAATTTTGTCACTAACTCAAAATTTGTTAAATATTTATATCAGTGT
GCACGCTTATTGACCTAATACTGTACATTTTATATTAAAATAATGATATC
ATTCAGGGAGTTGTATTACTTTACTACACTCTATTTTGCTTTGCTTACAA
ATTAATATAAGTAAACAAAGCTCGGGCCCCATTAGTTATTTGTTTTTGTT
TTATTTTGTTTTTCTCACAAAAAAATTAATATAATGTCGGTATCTTTATT
TTATACTGAAGCCTTTCCTTCCAATAGAAATAGAAAAAAATGTCGAAAAT
AAGCCGTTAATAGTTAGGCAAAACAGGAAACTATTATTCAATGATTGTTG
GGAATTGTTCGCAGATTAATAGGACCTCATTCCAATCCAACCAATAAAAA
TAACGTTAAGAACATTGATAAGGAGAAAAGAAGCAGAAACATCGATAACT
GACAACAAAATACAAATTATATTTTATTGTAAGCGTAGTAACGCCCTGAT
ATATGATATATATCGAATCTTATATTACATCTTTTTAAAGCTGTCTTATA
GACATTTTTAAAAGTAAATATTTCTAAATCTTCAAAGCTTGCTCATCTAT
TATGTAAAAGTACTTATATTTCGACACTAAAAGTGATTTTTCAAAATTGC
TAAATCTTTATAATGAAAAAGTGTCATAAAATCCTTATTTTATATGGGAA
TTACTTTTTTGCTTCATTCTTATAGCGATATGCTCAAATACGTAAAAAAA
AAAGCTGCTTTGGGATAAATTGGCTAAGTGATAGCATCTTTGTTTAATTC
ATATCTTATTTACAAACTATACAGTAAGGCCACTCAACTGGCAGTCCACA
CTCCAAATTCGGAACTTATCACTAGCAGTAGTAGTATATATTTTTCTAAT
GAGTCCAATCTTTTTCTTCCATGAAAAGTGAACATTAAACAGTCCTAAAT
TGAGATAACACTCCTTAGGATTTATCCCAAGATCTAGGGAATTTTTGTTA
CGTTAGGAAGGATTTCTATCAAAATGTCGAAATAAAATGTTTATCCAACA
ATAATTGATTACATTAATTATATCTTCAAACTTTATTTATCGAAAGTCTT
AAGCTGAAATAAATCCTCGACTGATTAGTCAGTTCCTTGGTTCCGAGCTG
GGACTGAAGAAAATAGTTAATTATAGCTAAATCAATTAATACTAGAGAAT
AAATTTTGGCTATTTTAATCATACTAATTCCTTATTTATAAGTGATGTAA
TTCGATTAAATTAAAAATGATTAAATGAGTGTTGTGTATTGTGATTAAGT
CTTTATCCCTCTCAATCCCTTTAGTATTTTAAGCCGTTTTATATATGTAT
TATATAGAGTTTACTATGTAACATTGTCACTTATAAATAGCCTGGCAGGC
GAGTAACAGTACATGTATTGAGGTTTTCATCTCTCTTGGTCTGATTTGGT
TTCCAATGAAGTTGTGTCKCTCCGCCTCGCCACGTCACAACAATTTGAAC
ATATATCATGAGGGAATAGTCAACATTCGTTACGTAAATTTAAAAAAAAA
AAAAATTAATCAATCAATTAATGAGCTAGGTATTCACTATGTTTCTGACC
AGTCTTTTCTCACATGCCTACCCCTTTTCATTCATTCTTTTTTCTAATCG
GTACAATATTTGTCTCCAATTCAACAGTCCTAAGACTGACTAGTAGGTTA
ACTGGTGCTAGCTAGGACTAAAGAAAATAATTACTGATAGTTTAATATAA
TACTAGAGTAGTATGTGACTAGACAGACACAACATTTATTTCAATATCTT
GTATGTTCTTGTAATGAATGATGATCGCAGCTTTTGATGAAACTTCAAGA
GTTGAGGGGGCGTAGTACTAAAAGTCTGATAAAGTTCCACCCTAGGATTC
ACAAGATTAATCAGGACAGGTATGAGAGGACTGCGGTCTTTGTAGGTTTT
TATAACGGTCCAAATAATATAATCAATTCTTGTTTTAGAGATGTGAACAA
TTATCAAAAATTAGAGAATAATAAATCCATTTTTGGAGTTAACTTAGGAT
CCTTTTGCAGTTTCTTTTTTTTTTTTAAATGAAAGGTTCCGATATAGAGA
CAGAGCGGGTCCTCGGGCAAAGATAAAGCCATTTCTTCCCTTCCTTTTTC
AAAATTTTAATTCAAGTTTGGTTTAATTTAGTATTTTTAAAGAAAAGAAA
ATGGGTGGCCTTTAGACCTTTAATATTTATTTGTTTTATATGAATTTAAC
TCCGGCGAGACACACAGCCCCCTCTACCTCCCCTAAAACTGGTACTGACG
ACGTGACTTATGTTTAGAAGGGATCATTTACTAAAATATAAATATATTTT
AGTTGTAAATCGAAAGATTTTTTTTGTATGTAAAAATAACCCTTACTATT
TGAAGGATGCTTGGGAGGAGAGAAGATTAGTGTTCATGGTATTTCATTCA
ATTAGCTGGAAGCATCTATGGAAGGAAGGATTAAATACAAATCCACCTAC
GCTTCAAGCAATGACATAGGGTGGAATTATTCATACTCTTAGTCCAATAA
GCACTTATATCTTTAAATTCCCCAACGAATCCTCAGTACTTCTAGGGTCC
TTCATGAGCACATGGACTGGTAATGACTTTATAATTAGATCTTCTCTCTT
CAAGAATTAAGAAATAATGACAACATTTTTAGAAGATTAAAAACACTGTT
TAGTAGGGTGGGTCTTTTTAAAAAGGGGATATCGGCAAAAGTTGAGTGTT
GGTACAAAAATAGTTTGTGTTTAATTTGAGCTCAAGGGAGTGGGTTTAAG
AGATTCCTCAATGCATATATATCTGTATGTTTTTATATAATTGATTTAAT
TTGTGAGGATGACTAAGCCCATTCACTCAATCGTAAAAACAATATGACCC
TACTTATTTTTATGAGAAGTAACTATTAACTATTGATGATGATTAATAAT
AATAGTTAGTAGAAAAAATGGATATTAATGATTTTGCTCTTGATGCATAA
AAAAATCTAATAACATCATATTTAACATAAAATATAAAAATTGATTTGTA
GGGCATGTAACTTTTTCAATAAGAGGAAAACTTGAACCATTTGATTATTA
TTATGGATTAAAAATGCCCGTGATGTTTCTCTATAAATCAAATTTCTGAC
TAAAATCGGTAATAATGAGAAAATTAATTAAAAAATCTACAGAATATGGA
GAAATAAAGTTTCAGCTGAATTGGGAAACCTCCAAAATGTGTTTACTTCC
ACTAAAATTTGATATGAAATAGTCAGTCATAGTATCAGGGCCGTAATCAC
ATGGGGTGAGCCCTTCCATATTTCTAAATTTTTGATTTACACTCTACCGT
TTAGGTTGCCAACTAAAAAAAAAAGAATGTACGACTTCAGTAATGCGAAT
GACTAAAAATAAGATACGAAATGCTTTTTTTAAAGTATATACATACAATA
TATGTTCAATGTACATGCATTGATATGTATTTTATGGTCAAGTCTCTCAG
TGAAAAATAAAGGAGAATTAAAAGGGAAACATTCATTTTATGAAACGGTC
CATTTGTAACTGAAGAACACGTGCAAAATGATCCTATGTCATCCATCTTT
TAAATAATAATAAAATATGTACTAAAATAACTCATTTTGTAGGAATTAAT
AGTGAATTCATTTTTGCTAATTTAACTCGTTAGAATTATAATTCGAAATA
GATTCATTGTTATTATGTAGGTATTTGTGAATCCACATTAAATGTAAGAA
ATATGTACAAAAAAATGCGACGTCATATTTTTGTGTCAGTTGATATGTTT
GCTTAATTATTCTTGCATTTTGTTGGCTCAATGTATTTTTCTCTCTTAGG
TAGAAAATATACCTAACGAATGAAAATCAAATTCCTTTAATAAATTCATA
TTAAAGTTGTTAATCATCATTAAGGATGTGAGTGTAAATCAAAAAGAAGA
GTATATGTTGGCAACTTTGATAGACGATATATTTATTTTCAGGGATCACC
AGAAAAACTAAAGTACTCCTTGCTTGCTAATAGGTTTGAATTTTTAAAAT
AAGGAGAAATAATTAATAAGAGTACTTATATCTTGCAAGATACCATATAT
ACCACATTTTTTAAAAGAATGCTCACAAGGATTTCGACAGTTTTCACATC
CCTTATCATCATCATTGATGAATAATGATGAAAATCTTGTACATTTTTTT
AGCTGCCCCTTTAATTTGTAATTAGTTATATAAAAAAGGAATTTTCTTTT
CCTTAGTAGTTTTCATTATTATTTAATTCCTTAATAGTGAAAATCCTTCC
CTAAATAGATTCAATAATATTCAAAACCTCGTGCGTACTCATAAAAGACA
GACTGTAACCCTGAGGATTTGTTGCGGAGTAATAATTGCAAGTCCTTGTT
GGACTTAGAGTAGAATTAGGGATCGACATCGAAGCAATTCTACAAATGCA
TTTGTTTATATCCTTTTATCCTTCCTCTCATGTCACAGCTAGTTGTAGCT
GATCTAACGAAACGTCATGGGCATTATTCTTTCTGTTCTCCTAAACATTC
TTCAAATTATCAGGGTAACTACTTTGATTCCCCGGTTTCTTTTATTAGCA
TGCCCATTCTACTCAGGATTTTCATCATTATTGATTAAAATAATATTATT
TAGCTTTTTGTAATGGCACCCTCAATTTATATTTCCCTAAGCCGCTATCA
TTATTTTTATATTCTTGAAGAGAGAAAATATAAGTATAAAGTAATTAATA
GTGCATCAAATACAAAAAGTGACACTGAGGATTGTGTCTACTTTGGAGAT
AAAAAAAGAAAGGATCCTTATCTTTGCTTAGTCAGACTACATAAATACAT
ATTAGTTACATACATCATAGGCAATAAATCATTCGTTTTTATCTCAAATA
CTAATGTATATGGAGTCTTAGGTGTGTTCCTCCATGGAAATATAAATCAT
TCAGCAACAGAACCTCAAATACACATATTAAATGAATAGTATTTATGTCA
GACATATTAAACATGATTAATATAGACAGTATTAATTTGAAGTCCCATTT
ACAAGGCCAGTTTTAGGGAAAAGATCTTCAATCCCAGTGGAATCGCTCAT
GATTTTGGCCCTTGGTATATACTGAAAAGAATTTTTTTATTCTTGTCCGT
TTCTAAAAACAAACATGTTTTGGTTCTTTTTTAGAATCTTTGTGATCGAG
ATTTTTTTAAATTGATGTTTTTATAGAAAAATCAATTATTTTTTCTACAT
GTAAAACTGAAAAAAAGCTAAAAAATCTAACAAAAACCGCTTTATTGTTA
GGGCATACTTTACACACCTGTAAGTATAACACACAATTTGTTAGAAAAGG
GTGTTGCGTGATAATATGGGCTTATATATGTAAAACATATTTTAATTATT
ACTTAAAATCTTTTATTATTGGATACATGTTTTGTGATTGACTTTTATTT
TGAAGAACAAGTTAATTAAGTACTCGTACATACCTACACATATCAAATGT
GCCATACATTATGAAGGTTTAAAAATATATATTTAAAGTGTATATTTTAT
GATGAGTGAGTTGAAAAAAAAAAATTAAATTCCTTTAAAATATAGGGGTT
CTCTATGATTGA back to top
|
