EMLSAT00000008018, EMLSAT00000008018-703865 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008018
Unique NameEMLSAT00000008018-703865
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s477supercontigLSalAtl2s477:443370..451932 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008018 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008018EMLSAG00000008018-690784Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000035462EMLSAE00000035462-744390Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035463EMLSAE00000035463-744391Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035464EMLSAE00000035464-744392Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035465EMLSAE00000035465-744393Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777726auto777726Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008018EMLSAP00000008018Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008018

>EMLSAP00000008018 ID=EMLSAP00000008018|Name=EMLSAP00000008018|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=384bp
MMMKVWTMSLTHVVIMVSFIVNNVNGNNSYCRISPQHTMCRYQGINSKCG
NVISREVMSQAERNEIVNLHNQARSKVALGKETRGRNGPQPPAANMFELV
WDNELANVAQRWADQCRFGHDSNRDVDRFRVGQNVHISYETGSFIDPNHV
DWRKAVVSFYDEVALLDNKNVQSYKFDHSTGHYTQMVWSSTNKIGCGKIV
YRKGKTLNKYLVCNYGAAGNILNTPMYRIGSSCSACPFGCAGKGLCSAPR
GNMMSGGGFNSKPANNLFTNNNNPIVPTLNFNFPNHFNPQNLPQLQSPIT
SLISSGSPHITSNNNPSMSNIPPSSTSLNRPLRPQSGFNPFMGLTNAFKK
PSQTFLRPQSPFGGMIGFLNLNNMPFNFGNIRFP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s477:443370..451932-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008018-703865 ID=EMLSAT00000008018-703865|Name=EMLSAT00000008018|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8563bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s477:443370..451932- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATGATGAAAGTTTGGACAATGAGTTTAACACATGTTGTTATCATGGT TTCCTTTATTGTAAATAACGTGAATGGGAATAATTCATATTGCAGAATAT CTCCACAGCACACAATGTGTCGATACCAAGTAAGAACCCTTTGATTACTC ATTACTATATACATATATTATGCAAATTTAAAACTTTTGAATCAATGAAA TCCCTTTAAAAAATGACATGCCACATTTTCACTAATTTTGCAGAATCATG CAGTAAGCTTTTATTTATTAACCACATATTATATTGATGAAAGTCCTTTT TATCTCCTAAATATCTAATAGTCAACTTACTCTCCAGGCAATGATTGTAT TTTTGATTGTTTTGTGTGTATAATGTCATTTAAATGGATATGAGTTGTTA ATCAGTATCTACTATAAACTGGAATGATGTAATTAGTGTTTGAGTTAACA ATATCGGTGGTCAAATTAAGTTTGGTTAAATTATCTTCAGTGACTAGTTA CATTTTTGACATTATAAGGATATAATTTTATAAATTGCCAGGTCGGAAAT TCCAAAAGAGTCTTCATAATATTAATATCTATTTAATTCCATCCAATCCT GTCATGAACTATAATATAATCAAAACAACATTAACTAATAATCGTTAATT AAATAACATTGATTTATTATGGTATAATACCATTTCATCTATAATTTAAT TTCTTATCAAAAATTTGAATTCAGGTTATATTATGTACTCACGTTTTTAA TATATAATTGTGTAGTATCTTGTATTTTATGACTCATACCATAACAGGTT GTTTTAAATTTTCTTATACATCAAGTGCAAATAATATGTACTTCAATACT TAATTCATAGCATAACCTCTTTTTTTAGGACCCTATAAAGAGAGTATATT GAATATATCTTAACTATTAGAAATAACTATAAGAACCAATTGTAACAATT TAGTTACAAAATATACTTCATGGTATTAAAATAAAAAAATCTATGAATAA AGGTTTAGTCTAAAAAATAAATACTTAATCTATTTTTCACTACATACTTT ATAATAAATGCTTTTATATATGGAGATTGTAGATCTTAATTTTATTTCTC TCATGAATTGAAAGAACAATTTGTTCCATTTATAAAAAGGTGTATAATTA AGGATGTGTTTAATATAATTTAATTAATTATGTTTGAAATTTGTATATAC ATTTCATTACTGGTTCTTTGGAGTCAACAAACTTATTAACTCAAGTGTAA CTGTAATTCATTTAGGTGGATCATTAATTTTTGTTTTGTTTTATACTAAA TATATATTTTGAATAAACCAGGTCCACCAAAAATGTGAATTCGCAATCAA GGCATCTAGATCTAGTATGAGTAATTTGAGTAAATTGGCTATATTTGAAA ATAAAATATTCCGCAATTTATGAAAAGAGTAAGTGGAACAAATAATTGAT AATTTTTTCAACTTTTTTAACAAGAATTCTTTCTAATCGATCCTTGACTT TTACAGCCTTTGAGACCTTCCACCAGGAGGGTCTCACATCATTTGTTAAT CTTATGTGTGAGTGACATTGAAGGCATCTCTTGGAGTTTATATTTACCTC ATCACTGACCCCATTTAATTAGTAATTACACACTCATTAAGAATAATTCT TGCCGCAGTTATATAAAATATACTTTTTAAAGTTAAAAAACTCTCCATTT TTTATATTAATATACCATTTTCGTAAATAATAGAATCCCTTCTTTCAATG ATATCAAATTGGACTACTCATACAAGAGCTAGAAGCTTGGTTGAGAACCC AAATGTTTGGTGGCCTCTCTATTAAATAAATAGTTAGTTGATGTTGTTTA AGTTTTTTTGACCGCATTCCCCTCCAGTTCACTCTCGACCCGGTCCAGTT CAGTCTTGCATATCAGTCCTAAAAACTTATATAGATCGGTCCTTGATGAC GTCGCTCAACCGTTCAAAGACTGGACTGGACCAAGTAAATAAAGGCTAGT AGTATACTAGTTACTAAATAATACTAGTTAGTTATATTACATATTCCTAG AGCTCCTTTAATTCAAAATTATTTTAAAATATCAAAAAATATGGATTGAT TTAATAACTGTGTAAATATTGAATAATGAAAATTGTGAAATGTTCTTTTA CTTAAAATAAGTATTTTCTCATTTTTTTCTCAAAGTACAGTAAATTAAAA CTCTCGATAAATTGGAATTGTTATACTATATGTATGTATTTCCTGAAGAT ATTATTGTATTGCATTTATGTATATCTATATTTTATTTTTTGGCCTGCCT ATAATTTTTTCAACTACAAAAGAATGACCTCACATGTTTAATAACACTGA TGAGACATTCCTTAACTACTCATATTTTTAAATCTTAAAGACCACTTGAA TGAATTTAAGGTTTGGGTAAAATTATCTAATGTCGTAAAAAAAAAAATAA ACAAGTTTGAAAATACAATGGTAATTATCTGATATTAGTGAATTAGTATT AGTTAACGAGTAGGATCTTGATCTTCATCTACTTATAGAATAAAAATAAT TCAAAAATTGCTTAATTTATCCTAGCAATAGGTCATTAAATTGAAGTAAA CAGTATATTATTCGTTCTAAACATGGAGATAAATAAATATTAATTTTTAC AGCTATCTATTTGTAAACGCCCAAGAGATGCTGATTAATAAAGAATATTA GACCAAAGATCCATCTTTAAAAAAAAAAAAGATGATATAGATCTCTCCTC TTATAAATTTTTGTCAAATACAAATGTATATATCAAAAATTGATTTATCA ACTGCTAAGACCCTCAGCGTAGAGGCTAAACATCCCTATAGATCAAACAA TAAATAATGCTTCTTCTTCGTTCATATCCAATATCATGGTATTTCATGTT TATGAATTAAAGCAAAAGAGGAACTCTGCATTCGGTACATCTATGAATTT GTCTCAAAACAACTAGCCAATGATTAAATAAATCCTTTTTAAAAAAAATT GTATTCTAGACATTATCCTGTGGTATAAGGAGCGTTGTTTTGTTTCCTTT TTTCGGTTCAGTTCAGTCTTAAGACCGATCCTATCAGTCATTGGGAGGAT TGAACTGTACCGAACTGAGAGTGAACTAGACGGGACTAGAGTATTCAGTT CTAAATAAGGACTGACACAACACTAGTTGTAAGGGAGCGTCAGATAGGAT TGCAATGCTACAGAATCCCTAAACATAGGGAATTCCGAACTATTTTATAC CTTCATTTATTTCTAATCTTGTGTACTGACCTTGGAATTTTGAGTTCTGC CACTGACAATGAATGGCCTTTTCATAATTGAGCCCAATAAAGAAATTTAT GTATCATTGTGAAATATAAATCTTTAGTATTCCTTGATACTTTATTAAGA SCATCCACTGAAATTGTGCATTAGAAATGGAATTCGAATGAGGGTATTGT TTATAAATGTCAAGGGTCCTTTTAAATTTATGTATATTTACTGTACTGTA AATTCATAGATTCACAGTGCTATCAGNATTTAATATTTATTGATTATAGA TTTAATTCTGACATTTTAACTACCATCACCATGATAAAACAGGATTTAAG TCTGACAAAATGTGGGTGTCAATAACAGTACACATACATTTTTTAAATAT TACATACTTTGATAAAATAATTGCAAAGTATTAAATGACGCTCTTTTTTG CTTCTTATATCTTACATACTATTATAGCCCCATGAAGGACTCAAAGTTAA GTTAATCCTCTATGTCATCAAATTAGTATTAGGATTCCCTTGTGCAAACT ATCATGTAAGTCAGTATGCACCTACATAAAATATGGATGTTACTCATCTA TTCAATTTGCATATAGATTCATTATGTTCATGTCTTGATTACGATGTATG CATGATTATTTGATACTTGAATCTTAAAAGTACATGCCTATTACACATTC TAAGCTTAACAAAAAGAACACGGCCTTATCTCACTCATTATTTTTTTGCT TCTTTTACTCTTGTCAGTATTCTGAGCGTTGCTTTGTTGAATTCGAATAA GCTCTTATTAAGCTCACAACCATTTACAAGAATAATTATTAAATAATATT TCGATAGTTGGAAGGAATGACCTAACTACCAATTCTTTTTGAGCCCCCTA CCTGTTTCTTTTTGGAGGAAAGGTTCTGAGGTACAATGAAGGCAAGGACG TGCAAAATATCTTAGTTAGCTATTTCTTTACAAATTATACCTAATTGCAA GGGGTATTAACGGTCAATCTGTTCAATAAGCTAAAGAGTTATACACAAAC TCAAGTCAATAACCAAGTAAATGGTTTGAGTCATAATTCTGATATTGTGA ATGAAATTAATTATTTTATTTTGTCCGAGTATAACGTTACTGAAACTTGA GTGTACAAGTGGTTATAAGGCAACTACTAGGCATGTAGAGAGTAATGTTA TCCATTAATACATATATTTTTTTGGAGGGTAAATGATGGCATAAGATTTG CGTATGACCTCAACAACAAATTCTTCCTAACAAAAACTGGTTTTATTCGT TTTTAGCTTGTGCAATTCATTTACTTTAACAGTCATGCCTCTTTTACGAG TTTTTCATGCTATGAACAAACCTGCGTAAATATTTGACGACAATGTTTAG AAGCCTCATTTAAATAATTTTATGCTGCGGAAAACATGAAGAAATAAAAT TCCCTTTTGCGGTACTTGCTATCTTTCTAAGTAGGTAAACGTTTTCCCGA AGGATAATTGGAACCTGATATCACTGCTCACATCTTGGTATGTACATAAT ATGTACTTTGAAAGTATAACAGGAAGGAGAAGAGACACTACATAATATTA TATTGTATGTACTGACTAAATGCCCCTCATACCTTCAGTTTTAGGTACAG CAAGCGTGACCACAATTATATCTACCCTTCATGTATAGTAATACGAGTAC CTATAAAGAGGAAGTTGATTACTGCAAAAATTATGCACCTACACTCTTGC TAATATTACTATCCCTTGTAACATTGTGTATACTCCTGGATAGTATGATT TTGACGAGCAGTTTTCCTTGTGTCAAACTTTTTTTAAAGAAATGTTCTGA CATGTTCCAATATCATGCAAGTCCCTAAAATGATGTTTAAAATCATTGCC TTTTATGCAATCTCTTCATTTGCATTTAGATTTGGATGTTTTCTGGTTCT AGTTAACTTTGTCGAGTACATTTTCCCCCGCTGGTAATTTTAGATCAAGG AGATTTTGCTGCATGTCATATTCGCTGCATTTTTATGTTTTTATATTATC GTTTCGAACTTAAATGAAAATTGTATCTTGATTAGATTAATTATATAACT AAGAAAAGAAGGAAAATAATATTAATAGGATTGATAGGATCCTCTATCAA CCATTGATTAATTAATTTTATGGTAGGCCCTGACTTTTTCTTTGATTTTA AATTCTATATATTCATTCAATCCATCTTTTTTTAAATATTATCCCAAAAA AGGAAGAGTTCCCACGTCATGTTGATATAAAATTACAACTAGACTACGAC AAATATTAGATATATTATTAACCTTGTACAATTATAAAGCTATATCACGG CGTTATCTTACTAACAAAAAAATGCCTTATGTATTTTGTCGTCAGCTGTC GATTCTCTCGTCTTCTTTTATACGTTATGGCTATTTCATAATGAATTCTT TTCCATAAATTCACAATGTAATTAGTTATTCTATACATTTGCTCCGTTTT CAAAAGAACAGGAATAGAATTTCCTGTTGATCCATCGTCGTTTATATAAT ATCCCTATATAGTGTGGCCATTTAATTATTTCTATGAATACATTTTGCCT ATTTCTTCTTGGAAATAATATAATAACTTATCATAGCTACTCTTTTAATC AAATATTACTAAGGAATATTATAATAGAGTATGGAATCAAATATGTCAAT GTAAAATCAATTTAGATTTTAATAATATTTAATTTATTTTAAAAATGGTG AAGAAATGATATGACAGTGATAGTCTGAGAGTTATAAGAGATATATAGCA GTTGGTATGATTGACTTATTCGGCTAACTACAAATAACGGGACTTTTTTC TGTTTCTTTTTGTATAAAAGGTTGTGTGATACAATAAAGATAAGGACGTG ATATATAGCTTTCTAATTGTACAAAGTTGATATGAGTTTGATGTTTCTCG CCACATCAGCTTGTGCTTCTTCAGATAGTATTGAAACCATAAATGTATGA CTATAACTCATTGACTAAATTCATTTTTTTTTTTGACAATTATATTTCTT TTTTCTTCTTCTTGTAGCTATATAATTAATCTGATCCAGATACAACATTA AAGTTCGAATTGATGGTATAAAAACATAAAAAGGCGGCTAATATGTCATG TGGCGAAAATGTTTGTGTCAAAAGTAACGGTCACGGTTAATTCTATTTCA TCAATGTAGTGGTCATACACCTATCATTACATTGTAGTAGAGATATGCAA CATTATCTTTCTACAACATCATTTTAAATGCGTTACTATAATGAAGTTAG ATATAGTCCAATTATTCCACTCCTTTTGGTACAATATATAATTTTTCACA GGGCAAAAAAAAAAATGTTGAACTGATTAAAAATGAGTAATAAAAAAAGA TCACTCCCTACATATGTTCCTGTACATAATATGTAGTCTACCTATGTAGT CATAGGTAAAGCTGGCCCCAAATCGTCTATCAAAACTAATAATAATAAAT TCATTTATATTTTGCAAGTAATATTATGTACGTGAAAAGGATTCATTTTG CTTAACTCAAAACAGGTTATACATAATAGTTATGATATCATTAAATAGGC AACTAACAAAACAATTATTATTATATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAACTTAAAATAT GCTATTCAATTCATTGTTCTAAATAGTTATTGTAGATAATTAGGATGCTA CTACCAATAATGGGTAAGCAGCCGGATTATGTACATATATATATATATAT ATATATTATTATTATTTTTTTGGGAGAAGGGCCRTTGCAATTCTTTTGAA AAAAAAAAATTCAATACATATATTTTTTTTAACTTTTAACATTTTTTGGA AAAAAATGAGAATTTTTCTCCTAAACACATTGTTCAAGCCATTCCATTTA CTTAATTCCTAATGTGTATTATTTGAATAGGGAATAAATTCTAAATGTGG GAATGTGATTTCCCGTGAAGTAATGAGTCAAGCTGAAAGGAATGAAATCG TTAATTTACACAATCAAGCTCGTTCGAAAGTAGCACTTGGAAAAGAAACT CGTGGACGGAATGGGCCTCAACCACCAGCAGCAAATATGTTTGAATTGGT TTGGGATAATGAATTAGCAAATGTGGCTCAGCGATGGGCGGATCAATGTC GATTTGGACATGATTCAAATCGTGATGTAGATCGCTTTCGAGTGGGTCAA AATGTTCATATATCCTACGAAACTGGATCTTTTATTGATCCTAATCATGT AGATTGGAGAAAGGCAGTCGTCTCATTTTATGATGAAGTTGCACTTTTAG ACAATAAAAATGTACAGAGCTATAAGTATGGAAGGCATAAATCAATCTAT TGATTTGTAACTTTTTTCTTTTATATAAAAAAAATTAGATTTGATCATTC AACCGGACATTATACGCAAATGGTTTGGTCATCTACCAATAAGATTGGAT GTGGAAAGATTGTTTATAGAAAGGGCAAAACTCTTAACAAATATTTGGTT TGTAATTATGGAGCAGCAGGAAACATATTGAATACACCTATGTACAGGAT AGGATCATCATGCTCTGCATGCCCTTTTGGTTGTGCTGGAAAAGGGCTTT GCTCAGGTAATTCATTATGATTATGATTATAGAAAATATTTATTTTGTCA CAGACAATCGGTTACAAGTCTGTGACAAAATAAATGTAACAAAGAGTCCA CATTTTTATTTAGTTGGAATTTGTTGTGTGACAAAAAATCTTTGTAGAAT TGATTTTCAGTATACTTTTTCTAAATCTTTTTCATCTATTTCTTTTGCAG CTCCAAGAGGAAATATGATGAGTGGCGGAGGCTTCAACTCCAAACCAGCA AATAACTTATTCACAAATAATAATAACCCCATCGTTCCTACTCTTAACTT TAATTTCCCTAATCATTTCAACCCTCAAAATCTTCCTCAATTACAATCTC CTATTACCTCATTGATTTCTTCTGGATCGCCGCATATCACTTCTAACAAT AATCCCTCAATGAGCAATATCCCACCTAGCAGCACTTCACTTAATCGACC CTTGAGGCCTCAAAGTGGATTTAACCCTTTCATGGGACTAACAAATGCCT TTAAAAAGCCAAGCCAAACATTTTTACGCCCTCAAAGCCCGTTTGGAGGA ATGATAGGATTTCTGAATTTAAATAATATGCCCTTCAATTTTGGAAACAT TCGCTTCCCTTGA
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